Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция
В обзоре проанализированы новейшие данные о разнообразии эндогенных ретровирусов птиц, исследована их структура, особенности экспрессии и возможные пути эволюции. Обсуждается роль эндогенных ретровирусов в онтогенезе и возникновении патологий В огляді проаналізовано найновіші дані про різноманіття е...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Datum: | 2002 |
| Hauptverfasser: | , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russian |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2002
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153827 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция / Л.Г. Борисенко, А.В. Рындич // Біополімери і клітина. — 2002. — Т. 18, № 1. — С. 37-47. — Бібліогр.: 74 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153827 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Борисенко, Л.Г. Рындич, А.В. 2019-06-14T17:18:27Z 2019-06-14T17:18:27Z 2002 Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция / Л.Г. Борисенко, А.В. Рындич // Біополімери і клітина. — 2002. — Т. 18, № 1. — С. 37-47. — Бібліогр.: 74 назв. — рос. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005E6 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153827 578.828 В обзоре проанализированы новейшие данные о разнообразии эндогенных ретровирусов птиц, исследована их структура, особенности экспрессии и возможные пути эволюции. Обсуждается роль эндогенных ретровирусов в онтогенезе и возникновении патологий В огляді проаналізовано найновіші дані про різноманіття ендогенних ретровірусів птахів, розглянуто їхню структуру, особливості експресії та можливі шляхи еволюції. Висвітлено роль ендогенних ретровірусів в онтогенезі та у виникненні патологій. The recent data about the diversity ofavian endogenous retroviruses, their structure, peculiarity of the expression and possible ways of their evolution have been analysed in the present review. A role of endogenous retroviruses in the ontogenesis and pathology development has been shown. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Огляди Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция Avian endogenous retroviruses: structure, expression and evolution Ендогенні ретровіруси птахів: структура, експресія та еволюція Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция |
| spellingShingle |
Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция Борисенко, Л.Г. Рындич, А.В. Огляди |
| title_short |
Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция |
| title_full |
Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция |
| title_fullStr |
Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция |
| title_full_unstemmed |
Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция |
| title_sort |
эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция |
| author |
Борисенко, Л.Г. Рындич, А.В. |
| author_facet |
Борисенко, Л.Г. Рындич, А.В. |
| topic |
Огляди |
| topic_facet |
Огляди |
| publishDate |
2002 |
| language |
Russian |
| container_title |
Біополімери і клітина |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Avian endogenous retroviruses: structure, expression and evolution Ендогенні ретровіруси птахів: структура, експресія та еволюція |
| description |
В обзоре проанализированы новейшие данные о разнообразии эндогенных ретровирусов птиц, исследована их структура, особенности экспрессии и возможные пути эволюции. Обсуждается роль эндогенных ретровирусов в онтогенезе и возникновении патологий
В огляді проаналізовано найновіші дані про різноманіття ендогенних ретровірусів птахів, розглянуто їхню структуру, особливості експресії та можливі шляхи еволюції. Висвітлено роль ендогенних ретровірусів в онтогенезі та у виникненні патологій.
The recent data about the diversity ofavian endogenous retroviruses, their structure, peculiarity of the expression and possible ways of their evolution have been analysed in the present review. A role of endogenous retroviruses in the ontogenesis and pathology development has been shown.
|
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153827 |
| citation_txt |
Эндогенные ретровирусы птиц: структура, экспрессия и эволюция / Л.Г. Борисенко, А.В. Рындич // Біополімери і клітина. — 2002. — Т. 18, № 1. — С. 37-47. — Бібліогр.: 74 назв. — рос. |
| work_keys_str_mv |
AT borisenkolg éndogennyeretrovirusypticstrukturaékspressiâiévolûciâ AT ryndičav éndogennyeretrovirusypticstrukturaékspressiâiévolûciâ AT borisenkolg avianendogenousretrovirusesstructureexpressionandevolution AT ryndičav avianendogenousretrovirusesstructureexpressionandevolution AT borisenkolg endogenníretrovírusiptahívstrukturaekspresíâtaevolûcíâ AT ryndičav endogenníretrovírusiptahívstrukturaekspresíâtaevolûcíâ |
| first_indexed |
2025-11-25T20:37:13Z |
| last_indexed |
2025-11-25T20:37:13Z |
| _version_ |
1850526722467823616 |
| fulltext |
ISSN 0233-7657. Біополімери і клітина. 2002. Т. 18. № 1
Эндогенные ретровирусы птиц: структура,
экспрессия и эволюция
Л. Г. Борисенко, А. В. Рындич
Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины
Ул. Академика Заболотного, 150, Киев, 03143 , Украина
В обзоре проанализированы новейшие данные о разнообразии эндогенных ретровирусов птиц,
исследована их структура, особенности экспрессии и возможные пути эволюции. Обсуждается
роль эндогенных ретровирусов в онтогенезе и возникновении патологий.
Введение. Одной из наиболее интересных особен
ностей ретровирусов является присутствие в геном
ной ДНК неинфицированных клеток последова
тельностей, идентичных или, по крайней мере,
родственных геномам ретровирусов. Эти последова
тельности, получившие название эндогенных ре
тровирусов, найдены у более чем 25 отрядов и 6
классов позвоночных [1 ]. В отличие от экзогенных
ретровирусов, инфицирующих только соматиче
ские клетки, эндогенные ретровирусы присутству
ют в геноме как соматических, так и половых
клеток и наследуются из поколения в поколение
вместе с остальной частью генома хозяина.
В геноме птиц найдены последовательности,
родственные ретровирусам лейкоза птиц (ALV),
спумавирусам и вирусам лейкоза мышей (MLV)
[1 ], а также ретроэлементы, принадлежащие к
группе содержащих длинные концевые повторы
(LTR) (ART-CH — avian retrotransposon from chi
cken genome) и не содержащих LTR ретротранспо-
зонов (CR1 — chicken repetitive element) [2, 3] .
Ретровирусы, и особенно эндогенные ретрови
русы, традиционно являются наиболее популярной
моделью вирусного канцерогенеза [4]. Значитель
ный интерес к исследованию эндогенных ретрови
русов появился после того, как стало известно об
их роли в возникновении новых высоковирулент
ных форм ретровирусов [5, 6] . В последние годы
появление таких ретровирусов вследствие рекомби-
© Л. Г. Б О Р И С Е Н К О , А- В. Р Ы Н Д И Ч , 2 0 0 2
нации с эндогенными провирусами нанесло боль
шой урон птицеводству [7 ]. В то же время присут
ствие в геноме эндогенных ретровирусов вызывает
устойчивость к инфицированию экзогенными ре-
тровирусами, использующими для проникновения
в клетку рецептор, аналогичный или родственный
таковому эндогенного провируса [4, 8—10]. На
сегодня птичьи эндогенные ретровирусы являются
одной из наиболее интенсивно изучаемых групп
ретровирусов.
Все достаточно полно охарактеризованные эн
догенные ретровирусы птиц подразделяются на
пять семейств: 1) ALV-родственные ретровирусы
(ev); 2) EAV; 3) ретротранспозон ART-CH; 4)
HERV-родственные ретровирусы; 5) ретротранспо
зон CR1.
Разнообразие эндогенных ретровирусов птиц.
Семейство ALV-родственных провирусов было
первой открытой группой эндогенных ретровирусов
птиц. В работах [11—16] показано, что они имеют
такую же структуру, как и провирусы, интегриро
вавшие в геном в результате экзогенного инфици
рования (таблица). Сравнение нуклеотидных по
следовательностей продемонстрировало, что гены
gag и pol ev идентичны на 90 % таким же генам
ALV. Следовательно, провирусы семейства ev явля
ются группой, близкородственной экзогенным ALV.
Вместе с тем ген env эндогенных ALV кодирует
белки вирусной оболочки, отличающиеся по анти
генным свойствам от аналогичных белков всех
известных экзогенных ретровирусов, выделяемых в
подгруппы A—D. Это дало основание выделить ev
37
Б О Р И С Е Н К О Л. Г. , Р Ы Н Д И Ч А. В.
Эндогенные ретровирусы птиц (по данным работ [19], [47], [51], [58], [59],
Название Предполагаемая структура Число на гаплоидный геном Размер , тыс. п. н.
ALV-родственные провирусы (ev) 0—10 - 7,7
e v - 1 , 2 LTR - gag-pol-env- LTR
ev-3 LTR-Agag-Apol-env-LTR
ev-4 gag-pol-env-LTR
ev-5, 6 pol-env-LTR
ev -7 ,8 LTR-gag-pol-env-LTR
ev-9 ?LTR-?gag-pol-env-LTR
ev-10, 11, 12 LTR-gag-pol-env-LTR
ev-13 0
ev-14 LTR-gag-pol-env-LTR
ev-15, 16 LTR
ev-17, 18, 19, 2 0 , 2 1 , 2 2 7
ART-CH LTR-Lgag-LTR 25—50 3,3
EAV 50 5,5
EAV-0, E 3 3 , E 1 3 LTR-gag-pol-Aenv-LTR
EAV-HP LTR-gag-Apol-Aenv-LTR
E51 LTR-gag-pol-env-LTR
HERV-родственные провирусы 7 7 7
CR1 ?-Lpo/-R (1—4) 100000 0 ,4—2
П р и м е ч а н и е . А — делеция; L — предполагаемый; R — повтор.
в отдельную подгруппу — Е. Еще одним отличием
экзогенных ALV и ev является непатогенность по
следних для своих хозяев.
Эндогенные ALV-родственные провирусы ха
рактеризуются разным уровнем экспрессии. Неко
торые представители семейства (ev-3, ev-6) экс-
прессируются и продуцируют функциональный бе
лок оболочки вируса, тогда как другие (например
ev-І), несмотря на отсутствие делеций, не экспрес-
сируются, что может объясняться метилированием
провируса или влиянием окружающих его последо
вательностей [17, 18]. Некоторые ev (ev-2) проду
цируют инфекционный ретровирус.
В пределах разных пород и линий кур и даже
между отдельными особями существуют различия в
количестве ev в геноме (например, у белых леггор
нов их от 1 до 10 на гаплоидный геном) [19]. Из
более чем 50 охарактеризованных до настоящего
времени ev 22 (ev-1—ev-22) найдены в геноме
белых леггорнов, несколько — в геномах других
яйценосных пород кур и большое количество — у
мясных пород [20]. Наиболее полно охарактеризо
ваны ev породы белый леггорн.
ev-І. Этот провирус характерен для всех иссле-
дованых линий белых леггорнов [11, 21 ], а также
широко распространен у других яйцекладущих по
род кур [22]. Он кодирует две РНК длиной 7,5 и
3 тыс. н., представляющие полноразмерный геном
ev-І и мРНК гена env [23]. Вирусные белки и
инфекционные вирионы ev-І не продуцирует. Про
вирус локализован на хромосоме 1 вместе с неко
торыми другими ev (ev-4,ev-5, ev-6, ev-8, ev-13)
[24].
ev-2. Продуцирует инфекционный Payc-acco-
циированный вирус (RAV-0), что свидетельствует о
структурной полноценности провируса [11, 13].
ev-2 — единственный эндогенный вирус, располага
ющийся во второй хромосоме [24]. Как и ev-І, он
кодирует малое количество РНК таких же разме
ров.
ev-З. Дефектный провирус, характеризующий
ся отсутствием части генов gag и рої [14, 23].
Несмотря на это, он имеет сравнительно высокий
уровень экспрессии трех транслируемых РНК: 6,5
тыс. н. (полный провирус с делецией в участке
gag-pot), 3 тыс. н. (ген env), 2,3 тыс. н. (ген gag)
38
Р Е Т Р О В И Р У С Ы П Т И Ц : С Т Р У К Т У Р А , Э К С П Р Е С С И Я И Э В О Л Ю Ц И Я
Семейство фазановые (Phasianidav)
Phasinanini
РодСШтіХ(ЕАУ?) PodGallu-s^^ ~ ^ o d p h a s i a n u s
G. varius G. son- G. gallus
neratti g a l l u s і
G. lafa- ee*""
etti G.
P. cholcicus
yetfi G. gallus domesticus
Рис. 1. Распространение провирусов семейств ev и EAV у птиц
[72]
[23, 25], что находит объяснение в недометилиро-
вании ev-З по сравнению с ev-1 [17 ]. Провирус ev-3
локализован на одной из микрохромосом [24], а
его сайт интеграции имеет высокую степень гомо
логии с геном тирозинкиназы мышей (Ьтк) [26].
Помимо белых леггорнов ev-З обнаружен у бройле
ров [27 ] и бурых леггорнов [28 ].
ev-4, ev-5, ev-8. Провирусы не экспрессируют-
ся. Отсутствие экспрессии может быть объяснено
только для ev-4 (отсутствие 5'LTR) и ev-5 (отсут
ствие gag или 5'LTR), но оно не находит объясне
ния в случае структурно полноценного ev-8 [14,
23].
ev-6. Как и ev-9, отвечает за синтез только
белка оболочки вируса [11, 13], что может быть
обусловлено отсутствием 5'LTR и гена gag [14, 23 ].
Такие делеции указывают на то, что провирус
транскрибируется не со своего промотора. С ev-6
транскрибируются две РНК: 5,3 тыс н. (гены рої,
env и последовательность U3), и 3 тыс. н. (ген env)
[23, 25].
ev-1. Продуцирует индуцибельный неинфекци
онный вирион, формирующийся вследствие реком
бинации из вирусной частицы, кодируемой ev-7, и
РНК, кодируемой ev-1 [11, 29]. Провирус, возмож
но, содержит делеции в гене env. Структура РНК
не исследована, ev-7 является локусом, сцеплен
ным с полом [30], что подтверждается его локали
зацией на Z-хромосоме [24 ].
ev-9. Экспрессирует две РНК: 7,5 тыс н. (пол
ный провирус) и 3 тыс. н. (участок U5 и ген env),
из которых только последняя транслируется [23].
РНК длиной 7,5 тыс. н., вероятно, имеет мутации,
влияющие на процессинг.
ev-10, ev-11, ev-12 кодируют инфекционные
вирусы в определенных линиях белых леггорнов
[13]. Подобно ev-2, производят вирусы в очень
маленьких количествах.
ev-ІЗ не производит вирусных белков и нахо
дится на хромосоме 1, как и другие «молчащие» ev
(ev-4, ev-5, ev-8) [24].
ev-14 отвечает за продуцирование вируса [31 ]
и локализован на третьей хромосоме [24 ].
ev-15, ev-16. Состоят только из LTR [14, 32].
Существуют данные о присутствии ev-15 как у
яйцекладущих пород, так и у бройлеров [33 ].
ev-17 не экспрессирует генов env и gag [34].
ev-18, ev-19, ev-20 связаны с продуцированием
инфекционного эндогенного вируса [34]. ev-18
идентичен провирусу из генома кур породы Rode
Island Red [35].
ev-21 связан со сцепленным с полом геном К,
отвечающим за редуцированное оперение [36].
Этот фенотип часто используется в селекции, поэ
тому ev-21 широко распространен среди разных
пород кур [37]. ev-21 также ассоциирован с CR1
[38 ]. Этот провирус не отвечает за продукцию
вируса [34].
ev-22 найден в одной из линий белых леггор
нов, где он может играть определенную роль в
возникновении аутоиммунных заболеваний щито
видной железы [39 ].
ALV-родственные провирусы других пород кур
также довольно часто исследовали [12, 15, 22, 28,
35, 40—45]. Однако провирусы семейства ev этих
пород охарактеризованы недостаточно полно, в ос
новном, на уровне полиморфизма длины рестрик-
ционных фрагментов. Часть этих провирусов иден
тична ev белых леггорнов, остальные являются
новыми.
Бурые леггорны содержат семь ev, два из
которых являются аналогами ev-З и ev-б белых
леггорнов [22, 28, 40, 41 ].
У итальянских куропатчатых кур найдено пять
провирусов ev, по-видимому, не имеющих аналогов
у других исследованных пород [41, 42].
Куры породы Rhode Island Red содержат 12 ev,
два из которых (ev-б и ev-18) идентичны ev белых
леггорнов, один — бройлерам, один — бурым лег
горнам [35].
У породы White Plymouth Rock количество ev в
геноме кажется больше, чем у белых леггорнов, но
эта порода характеризуется отсутствием наиболее
распространенного эндогенного ретровируса кур ev-
1 [43 ]. Более того, у кур данной породы не удалось
обнаружить ev на первой хромосоме, в то время
как у белых леггорнов на ней расположены шесть
провирусов [24]. Два провируса White Plymouth
Rock идентичны провирусам из генома бройлеров
[46].
39
Б О Р И С Б Н К О Л. Г., Р Ы Н Д И Ч А. В.
і Подгруппа Е
' Подгруппа С
j Подгруппа В
' Подгруппа D
' Подгруппа А
_ | Е-51
' Подгруппа J
Рис. 2. Взаимоотношения между SU-кодирующими последова
тельностями генов env разных подгрупп [53]
Шесть изученных пород (Нью-Гемпшир, Кали
форнийская серая, Аустралорп, Полтавская Глини
стая, Амрокс, Минорка) имеют в геноме вирус ev-L
Кроме того, рестрикционный анализ показывает,
что они могут содержать еще не описанные ev [22 ].
В геноме мясных пород из разных популяций
найден 31 провирус семейства ev [44]. Один из них
идентичен ev-З белых леггорнов, еще один несколь
ко напоминает ev-8 [27 ], два могут быть идентич
ны провирусам из генома породы White Plymouth
Rock [46 ], один — провирусу из генома Rode Is
land Red [35].
Межпородные различия провирусов семейства
ev можно объяснить либо их независимым проис
хождением, либо, что более вероятно, эволюцион
ными изменениями, появившимися за время неза
висимого ведения пород.
ART-CH — семейство эндогенных ретровиру
сов птиц, впервые идентифицированное при помо
щи полимеразной цепной реакции с праймерами к
консервативным участкам генома ALV [3]. ART-
CH имеет уникальную генетическую структуру
(таблица). Он более чем в два раза короче осталь
ных компетентных в репликации ретровирусов и не
содержит полноценных ретровирусных генов. Нук-
леотидная последовательность ART-CH имеет го
мологию с провирусами семейства ev, EAV, а также
с коротким участком ретротранспозона дрозофилы
[3, 47]. Начало U3 области ART-CH и З'-конец
после ТАТА-бокса сходны с соответствующими
участками EAV. Область U5 ART-CH также содер
жит несколько коротких участков гомологии с EAV
и ALV. Праймер-связывающий сайт для тРНК —
такой же, как и у ALV и EAV. То же касается и
полипуринового тракта, а также 5'-нетранслируе-
мого участка. Имеются различия в последователь
ности прямого повтора 1, локализованного в З'-не-
транслируемом участке ALV и внутри области U3
у EAV [48 ]; у ART-CH прямой повтор 1 представ
лен двумя копиями, одна из которых находится
перед правым LTR, а другая — в области U3.
Нетранслируемый участок возле З'-конца LTR
ART-CH имеет гомологию с соответствующими
частями ALV. Часть этого участка почти идентична
последовательности, фланкирующей З'-конец сле
дующих онкогенов: v-src у RSV штаммов Prague,
Schmidt-Ruppin, В77, 29; v-myc у МН2; v-fsp у
вируса саркомы Fujinami и PrcII; v-crk у вируса
СТ-10. Перед правым LTR ART-CH расположен
участок гомологии с фрагментом ретротранспозона
412 дрозофилы [3]. Несколько участков гомологии
с ALV локализованы в «теле» ART-CH. Эти участ
ки, даже те из них, которые пренадлежат одному
гену, распределены среди разных рамок считыва
ния. Наиболее длинный участок гомологии соответ
ствует нескольким частям гена gag; также есть два
коротких участка гомологии с генами рої и env. Все
эти участки прерываются последовательностями
неизвестного происхождения [47 ].
У 18-дневного эмбриона курицы ART-CH
транскрибируется во всех органах, кроме мозга (в
отличие от провирусов группы ev, которые на этой
стадии развития транскрибируются преимущест
венно в легких) [3 ]. Наибольшее количество мРНК
имеет длину 3 тыс. н. что сопоставимо с размерами
целого ART-CH (3,3 тыс. н.) [3]. Синтез мРНК
инициируется и терминируется в соответствующих
районах LTR, как и у других ретротранспозонов,
изученных ранее [47]. Однако ART-CH не может
кодировать белки, необходимые для формирования
вирионов. Вероятно, для упаковки РНК и обратной
транскрипции ART-CH использует вирусы-помощ
ники. Этими вирусами могут быть ALV, с которы
ми ART-CH имеет гомологию.
В опытах показано, что по сравнению с эмбри
ональными фибробластами, в которых не происхо
дит синтеза РНК ART-CH, RSV-индуцированные
саркомы содержат большое количество транскрип-
тов ART-CH [47].
Подтверждением тому, что ART-CH может
участвовать в рекомбинации как с ретровирусами,
так и с клеточными генами, служит обнаружение в
геномах нескольких остротрансформирующих
птичьих вирусов последовательностей ART-CH,
фланкирующих онкогены [3 ].
Семейство EAV. Представители семейства
впервые обнаружены в геноме кур линии 0 (линия,
не содержащая провирусов ev) при использовании
гибридизации в нежестких условиях с последова
тельностями, клонированными из RSV [49, 50].
Как показано в дальнейших исследованиях, семей
ство EAV является гетерогенной группой, содержа-
40
щей сильно дивергировавшие ретровирусные эле
менты и состоящей из ряда родственных подсе
мейств: EAV-0, Е51, Е13, ЕЗЗ, EAV-HP (таблица).
Представители подсемейства имеют около 70 %
гомологии друг с другом [48, 51 ] и представлены в
гаплоидном геноме в общем количестве 40—100
копий [51, 52]. Члены семейства не продуцируют
инфекционных ретровирусов, имеют небольшую
гомологию с RAV-0 и в некоторых случаях харак
теризуются отсутствием гена env [51 ].
Подсемейство EAV-0 — это первые обнаружен
ные элементы EAV [49]. Каждый провирус ЕА-0
имеет уникальную делецию в гене env. По мнению
некоторых авторов, эта уникальность свидетельст
вует о том, что провирусы подсемейства EAV-0
появились в результате множественных независи
мых интеграции [51 ]. LTR провирусов EAV-0 —
необычно короткий (243 тыс н.), но он содержит
все необходимые для управления транскрипцией
элементы [48 ]. Сравнение пяти LTR из разных
клонов показало, что эти элементы являются высо
ко консервативными по отношению друг к другу, а
максимальные отличия составляют только 5 нукле-
отидов между наиболее отдаленными LTR [48 ].
LTR провирусов EAV-0 активно транскрибируются
у двухдневных эмбрионов кур линии 0. Среди
четырех известных транскриптов EAV-0 (5,3; 3,2;
1,8 и 1,2 тыс. н.) три наименьших не удается
обнаружить с помощью зондов к генам gag и рої
[48].
П о д с е м е й с т в а Е13, ЕЗЗ, Е51. При
гибридизации геномной библиотеки цыпленка с
зондами, включающими последовательность прови-
руса EAV-0, выявлены члены еще трех подсемейств
EAV: Е13, ЕЗЗ и Е51 [51 ]. Все три подсемейства
проявляют большую гомологию друг к другу (80 %
и больше), чем к другим ретровирусам птиц (70 %
и меньше). Среди этих элементов только один —
Е51 — имеет полный ген env, хотя он и прерыва
ется небольшими делециями и не кодирует функ
ционального гликопротеина. env-целеция у Е13 на
ходится в том же положении, что и у EAV-0. LTR
у всех трех клонов длинные (360 тыс н.) и
отличаются от всех описанных ранее LTR птичьих
ретровирусов. LTR у Е51 и ЕЗЗ имеют области U3,
близкородственные к аналогичным у Е13, но их
R-участки почти идентичны таковым EAV-0. То же
касается области U5 у Е51 и ЕЗЗ, которая отлична
от U5 Е13 и имеет гомологию с U5 EAV-0. Кроме
того, участки R и U5 Е13 идентичны таким же
участкам у EAV-HP и ART-CH, а область U3
имеет высокую гомологию с ART-CH, Е13 и Е51.
Данные факты свидетельствуют о возможности ре
комбинации между несколькими птичьими ретро-
Р Е Т Р О В И Р У С Ы П Т И Ц : С Т Р У К Т У Р А , Э К С П Р Е С С И Я И Э В О Л Ю Ц И Я
вирусами [51, 52]. Некоторые авторы предполага
ют, что провирусы Е13 и ретротранспозон ART-
CH, с которым они проявляют высокую гомологию,
могут представлять собой один ретроэлемент, ин
тегрировавший в разные участки генома [52 ].
П о д с е м е й с т в о EAV-HP. Представители
этого подсемейства стали первыми известными эн
догенными ретровирусами птиц, для которых обна
ружен родственный экзогенный вирус HPRS-103
(ALV, подгруппа J) имеет ген env, более чем на
75 % идентичный Е51 [53]. Однако в связи с
дефектностью Е51 возникло предположение о том,
что HPRS-103 приобрел ген env от другого эндоген
ного ретровируса. Целенаправленный поиск такого
EAV-родственного элемента привел к открытию
провирусов подсемейства EAV-HP, имеющих ген
env, идентичный Е51 на 69 %, и HPRS-103 — на
97 % [53, 54]. Провирусы EAV-HP имеют боль
шую делецию, захватывающую часть гена gag,
целый ген рої и часть гена env [52]. С учетом
дефектности распространение EAV-HP могло про
исходить с помощью вируса-помощника. Возмож
ность существования подобного механизма показа
на для ретротранспозона ART-CH [47 ] и ретроэле-
мента мышей VL30 [55]. 5'-область EAV-HP,
состоящая из U5 и R участков LTR, нетранслируе-
мой последовательности и 5'-конца предполагаемо
го гена gag на 97 % идентична ретротранспозону
ART-CH. Оставшаяся часть гена gag проявляет
менее 60 % схожести с другими ALV [52 ].
Недавно показана возможность существования
еще одного семейства эндогенных ретровирусов
птиц — ev/j [56, 57 ]. Однако в связи с тем, что
ev/j идентичен EAV-HP, предполагается, что эти
провирусы являются одним и тем же эндогенным
элементом [52].
Ретротранспозон CR1. Члены семейства CR1
принадлежат к LTR-несодержащим ретротранспо-
зонам [2]. С момента их открытия секвенировано
около 60 этих элементов, характеризующихся раз
личной длиной. Подавляющее большинство CR1
(около 30000 геномных копий) имеет длину около
400 тыс н., около тысячи — 800 тыс. н. и 30
CR1 — 2 тыс н. [58 ]. Однако, по последним оцен
кам, общее количество CR1 в геноме может состав
лять 100000, что занимает 2 % генома [59].
3'-Концы секвенированных CR1 схожи между
собой и содержат повторы (в количестве 1—4) из 8
нуклеотидов [60]. Различная длина CR1 элементов
обусловлена разными 5'-концами. Полноразмерные
CR1, которых может быть лишь несколько в гено
ме, еще не найдены [58]. CR1 характеризуются
присутствием открытой рамки считывания и, воз
можно, кодируют обратную транскриптазу. Пред-
41
Б О Р И С Е Н К О Л. Г. , Р Ы Н Д И Ч А. В.
полагается, что полноразмерный CR1 имеет также
gag-подобную рамку считывания [58 ].
Сравнительный анализ последовательностей 52
элементов CR1 показал, что их можно сгруппиро
вать в шесть подсемейств (А—F). Существует оп
ределенная закономерность в интеграции членов
разных подсемейств. Так, подсемейство В найдено
в псевдогене вителогенине III, а подсемейство А —-
во втором интроне гена Е-глобина [59]. В целом,
CR1-элементы присутствуют только в GC-богатых
фракциях ДНК [61 ].
HERV-родственные эндогенные ретровирусы.
Как недавно показано [62 ], ретровирусы, имеющие
значительную гомологию с эндогенным человече
ским ретровирусом типа I (HERV-I), присутствуют
в геноме рыб, рептилий, птиц, млекопитающих и
составляют одну монофилетическую группу. Эти
ретровирусы наиболее близки к вирусам лейкоза
мышей (MLV).
Многочисленные экспериментальные данные
позволяют предположить, что в геноме птиц при
сутствуют и другие эндогенные ретровирусы [3,
47 ], Так, ретровирусы, отдаленно родственные спу-
мавирусам и ALV, обнаружены соответственно в
геноме тинаму (Eudromia elegans, отряд Tinami-
formis) и некоторых воробьиных (Sericulus bakeri,
отряд Passeriformis) [1 ].
Значение эндогенных ретровирусов. Для опре
деления роли ev выведена линия кур, не содержа
щая этих элементов [63]. Куры такой линии (ли
ния 0) имели нормальное развитие, на основе чего
был сделан вывод о том, что ev не играют сущест
венной роли в онтогенезе. В дальнейших исследо
ваниях выявлено определенное влияние провирусов
на продуцирование яиц (годовое продуцирование
снижается на 9 % в результате присутствия ev-10,
ev-12, ev-19) и их вес (ev-12) [64]. Негативная
роль эндогенных ретровирусов, связанная с различ
ными аутоиммунными заболеваниями [65], также
недавно была показана и для ev-провирусов кур
[66].
Сначала для MLV [67 ], а потом и для кошачь
его вируса лейкоза [68] был предложен механизм
эволюции путем рекомбинации с эндогенными ре-
тровирусными элементами. До определенного вре
мени такой механизм не был известен для ALV.
Первым примером вируса, способного эволюциони
ровать подобным образом, стал HPRS-103 (ALV,
подгруппа J), вызывающий миелоидные лейкозы у
птиц. С момента его обнаружения в Великобрита
нии [69 ] вирусы подгруппы ALV-J быстро распро
странились по всему миру и стали одной из глав
ных проблем птицеводства [7]. Показано, что в
появлении ALV-J и индукции ALV-J-ассоциирован-
ных болезней важную роль играет эндогенный
провирус из семейства EAV-EAV-HP [7, 54]. Пред
полагают, что именно ген env HPRS-103 мог воз
никнуть в результате рекомбинации с EAV-HP.
Дополнительным доказательством такого проис
хождения HPRS-103 служит присутствие в гене env
у HPRS-103 уникальной последовательности, от
сутствующей у других ALV, но представленной в
гене env у EAV-HP [54]. Для дефектного по
репликации вируса PR2257, содержащего участки
гомологии с RAV-0, также предложен механизм
эволюции путем множественных рекомбинаций с
ev-провирусами [5, 6] .
Несмотря на негативную роль, сохранность
ретровирусов в геноме указывает на существование
селективных преимуществ, которое дает присутст
вия этих провирусов. В многочисленных работах
показано, что присутствие эндогенных ретровиру
сов влияет на устойчивость к инфицированию эк
зогенными ALV [4, 8—10, 70]. Показано, что
мясные породы кур по сравнению с яйценосными
бурыми леггорнами иммунологически более устой
чивы к ALV-J, что может быть результатом экс
прессии эндогенного белка оболочки EAV-HP в
эмбриональных тканях [54]. Правда, неизвестно,
является ли разница в устойчивости разных пород
результатом присутствия разных провирусов EAV-
HP или это объясняется отличием в экспрессии
одинаковых EAV-HP.
Особая роль отмечена у ретротранспозона CR1.
Сравнение CR1-элементов из генома журавля
(Grus antigone) и эму (Dromaius novaehollandiae)
показало, что они имеют два коротких высококон
сервативных участка: один взаимодействует с ядер
ными белками, а другой участвует в регуляции
экспрессии генов [2]. В завершение этого раздела
необходимо подчеркнуть, что остался невыяснен
ным вопрос о роли количества ev в геноме. Неясно,
почему среднее число этих элементов в геноме
яйцекладущих пород кур составляет 1—3, а в
геноме мясных пород — 6—10.
Эволюция эндогенных ретровирусов птиц. Эн
догенные ретровирусы птиц разнообразны не толь
ко по структуре, но и по возрасту. Члены одних
семейств могут присутствовать только в пределах
одного рода (например рода Gallus), в то время как
другие семейства представлены в геноме многих
класов позвоночных.
Провирусы семейства ev найдены только у
домашней курицы (Gallus gallus subsp. domesticus)
и у ее предка — красной джунглевой курицы (G.
gallus subsp. gallus). Родственные последовательно
сти обнаружены также у кольчатого фазана (Pha-
sianus cholcicus). В то же время этих провирусов не
42
Р Е Т Р О В И Р У С Ы П Т И Ц : С Т Р У К Т У Р А , Э К С П Р Е С С И Я И Э В О Л Ю Ц И Я
удалось обнаружить у других джунглевых куриц из
рода Gallus: у серой (G. sonneratii), зеленой (G.
varius) и цейлонской (G. lafayetti) [12, 71] (рис. 1).
Полученные данные позволяют сделать вывод о
том, что ev являются сравнительно молодой груп
пой ретровирусов, инфицировавшей кур уже после
видообразования в роде Gallus, но до начала одо
машнивания G. gallus. Инфицирование рода Pha-
sianus, отдаленного от рода Gallus отрезком эволю
ции в 30 млн лет (для сравнения: разные виды рода
Gallus эволюционировали на протяжении 6 млн
лет), произошло, по всей видимости, независимо.
Подтверждением факта существования инфициро
вания RAV-0-родственными ретровирусами в наши
дни может служить обнаружение единичной особи
G. varius, содержащей эти провирусы [72 ].
Присутствие шести провирусов семейства ev на
хромосоме 1 у белых леггорнов, а также существо
вание значительных отличий между ev и экзоген
ными ретровирусами (подгрупповая специфич
ность гена env, уникальность области U3 LTR)
позволяют выдвинуть предположение о том, что ev,
скорее всего, происходят друг от друга, а не от
экзогенных ретровирусов [19, 31 ]. Многочислен
ные ev могли произойти в результате множествен
ных дупликаций предкового локуса (по-видимому,
ev-1), а делеции, характерные для большинства
ev, — при обратной транскрипции и интеграции в
новый сайт генома. Более того, отсутствие эндоген
ных элементов у подгрупп A—D может свидетель
ствовать о том, что эти подгруппы являются более
молодыми, чем Е [19].
ART-CH. При гибридизации ART-CH LTR с
ДНК разных пород кур удалось обнаружить лишь
незначительные межпородные отличия во фрагмен
тах, дающих сигнал [3]. Однако при использова
нии ART-CH LTR в роли зонда для гибридизации
с ДНК разных видов птиц (утка, индейка, перепел
ка и др.) гибридизационных сигналов обнаружено
не было. В связи с тем, что ART-CH не обнаружи
вается у родственных курице видов (таких, как
перепелка), сделано предположение о том, что
ART-CH — недавно образовавшийся компонент ге
нома кур [3]. Одним из доказательств в пользу
этого может служить схожесть структуры большин
ства членов семейства ART-CH, отличающихся
только в случае 3 % последовательностей. Однако
для точной оценки времени приобретения ART-CH
геномом кур необходимо проанализировать присут
ствие членов этого семейства в ДНК разных видов
рода Gallus.
ART-CH мог произойти из генома компетент
ных по репликации ALV-родственных ретровиру
сов, подвергшихся многочисленным мутациям и
делециям, на что указывает порядок гомологичных
последовательностей в геноме ART-CH, совпадаю
щий с порядком соответствующих последователь
ностей в геноме ALV. Участок гомологии с ALV
составляет 15 % последовательности ART-CH [47].
Несмотря на относительную молодость, ART-
CH представлен 25—50 копиями в геноме кур
разных пород [3 ]. Правда, в последних сообщениях
приводятся меньшие цифры [52 ].
ЕЛ V. При изучении распространения членов
подсемейства EAV-0 у восьми инбредных линий
кур (семь из них — породы белый леггорн и од
на — породы Rhode Island), а также у предка
домашней курицы — красной джунглевой курицы
и двух родственных домашней курице видов —
серой и зеленой джунглевых куриц показано, что
все исследованные виды содержат провирусы этого
подсемейства [72] (рис. 1). Последовательности,
имеющие большую гомологию с EAV-0, чем с RSV,
были найдены и в геноме японской перепелки (род
Coturnix) [49 ]. Это позволило сделать предположе
ние, что EAV-0-элементы, были приобретены об
щим предком родов Gallus и Coturnix и затем
дивергировали в пределах каждого рода.
Широко распространенными в пределах рода
Gallus оказались и члены другого подсемейства
EAV-EAV-HP, найденные у G. gallus domesticus, G.
gallus gallus и G. sonneratii. Правда, ДНК других
видов птиц не дает сигналов при гибридизации в
жестких условиях с EAV-HP-специфичными зонда
ми [54].
Для подсемейств Е51 и ЕЗЗ также показано
присутствие в геноме нескольких видов рода Gallus
[51 ].
Приведенные факты позволяют сделать вывод
о том, что семейство EAV является более древней
группой по сравнению с ev-элементами и возникло
оно еще до начала видообразования в роде Gallus,
а может быть еще и до разделения родов Gallus и
Coturnix.
Количество EAV-элементов в геноме равно в
среднем 50, что намного больше среднего числа
ev-элементов (4,9) [19]. Кроме того, геном домаш
ней курицы содержит больше копий EAV-провиру-
сов, чем геном ее предка. Причины поддержания
сравнительно большого числа EAV-элементов в
геноме и даже увеличения их количества в процес
се эволюции еще предстоит выяснить. Остаются
неясными и причины достаточно высокого консер
ватизма некоторых членов семейства EAV. Так,
EAV-HP-провирусы разных линий домашних кур,
а также джунглевых кур имеют лишь 2—3 %
отличий в нуклеотидных последовательностях [52 ].
Присутствие #£ЯК-родственных ретровирусов
43
Б О Р И С Е Н К О Л. Г. , Р Ы Н Д И Ч А. В.
в геноме большинства классов позвоночных свиде
тельствует о древности этой группы. Отдаленное
сродство с MLV указывает на то, что HERV-I
эволюционировали независимо как большая группа
близкородственных ретровирусов [62].
CR1. Большинство LTR-несодержащих ретро-
транспозонов, к которым принадлежит и CR1,
найдены у беспозвоночных и только два — у позво
ночных животных — у Xenopus и млекопитающих
[73]. Двенадцать CR1 элементов обнаружены у
нескольких видов птиц разных отрядов [2, 59 ].
Последовательности, имеющие схожесть с CR1,
идентифицированы также у рыб (Torpedo sp.) и
нескольких видов пресмыкающихся (ящерица Апо-
lis carolinensis, змея Trimeresurusflavovirides, чере
паха Geoclemys reevess) [59 ]. Так как наибольшую
схожесть CR1 имеет с последовательностями из
генома рептилий, можно предположить, что этот
элемент появился еще до разделения классов птиц
и пресмыкающихся. Однако присутствие похожих
последовательностей у рыб и земноводных предпо
лагает более продолжительную эволюцию CR1,
охватывающую 400 млн лет [58 ]. Известно, что
такие семейства CR1, как В, С, D и F, имели
каждое свой предковый элемент, от которого они и
произошли, а высокая степень отличий между под
семействами указывает на их древнее происхожде
ние. Так, некоторые подсемейства могли появиться
еще до начала видообразования в роде Gallus [59 ].
Для выявления общих закономерностей в эво
люции многочисленных эндогенных ретроэлемен-
тов птиц уместно вспомнить предположение о том,
что экзогенные ретровирусы существуют только
небольшой отрезок времени, а передаются они на
протяжении длительного периода как эндогенные
элементы [74 ]. Это поддерживает высказанное ра
нее мнение [19], что экзогенные ретровирусы
птиц, характеризующиеся подгрупповыми специ-
фичностями А, В, С, D, произошли от эндогенных
элементов с подгрупповой специфичностью Е. То
же может касаться эндогенных ретровирусов под
группы J, которые вместе с Е-ретровирусами и
EAV-родственными ретровирусами могли служить
материалом для возникновения экзогенных ретро-
вирусов (рис. 2).
Существование HERV-родственных ретровиру
сов в геноме многих классов позвоночных свиде
тельствует в пользу предположения, что эндоген
ные ретровирусы сохраняются в геноме в течение
длинных отрезков времени. В свою очередь, и
HERV-родственные провирусы могут служить ис
точником появления экзогенных ретровирусов, ко
торые, правда, до настоящего времени не обнару
жены. Ошибки, возникающие при транскрипции
вирусной РНК в ДНК-копию обратной транскрип-
тазой, могут быть материалом для дальнейшей
эволюции экзогенных ретровирусов и, как резуль
тат, возникновения новых эндогенных элементов.
В этой связи не вызывает удивления факт обнару
жения в геноме птиц групп эндогенных ретровиру
сов разного возраста: HERV-родственных ретрови
русов (характерны для большинства классов позво
ночных, наиболее древние), EAV-провирусов
(характерны для рода Gallus), ALV-родственных
ретровирусов (характерны только для домашней
курицы и ее предка, наиболее молодые).
Выводы. Более чем двадцатилетнее изучение
эндогенных ретровирусов птиц показало, что в
составе геномной ДНК присутствуют пять семейств
этих элементов. Однако некоторые данные позво
ляют предположить, что их может быть намного
больше [1, 47].
Эндогенные ретровирусы птиц являются гете
рогенной группой, состоящей из отдаленно родст
венных друг другу элементов. Отличия касаются
структуры, экспрессии, круга хозяев, эволюцион
ного возраста. Даже в пределах одного семейства
наблюдаются значительные отличия в структуре
провирусов (EAV) или в количестве их копий в
геноме (ALV-родственные провирусы).
Несмотря на то, что птичьи эндогенные ретро-
вирусы являются наряду с эндогенными ретровиру
сами млекопитающих одной из наиболее изученых
групп таких ретровирусов, остается невыясненным
много вопросов, касающихся, прежде всего, их
взаимодействия с клеткой и эволюции.
В дальнейшем изучение распространения, без
условно, приведет к открытию новых эндогенных
ретровирусов, что поможет лучше понять эволю
цию ретровирусов в целом и взаимоотношения
между разными группами эндогенных ретровиру
сов. Поскольку интегрированный эндогенный вирус
представляет собой структурный ген нормальной
клетки, способный экспрессироваться, то изучение
функции интегрированных вирусов и продуктов их
генов даст возможность понять роль эндогенных
ретровирусов в нормальном развитии клетки и
взаимодействие геномов ретровируса и хозяина в
целом. Однако среди эндогенных ретровирусов
много дефектных, содержащих значительные деле-
ции и неэкспрессирующихся. В этой связи интере
сен вопрос о причинах поддержания таких прови
русов в геноме. Неизвестно также, каким образом
распределяются эндогенные ретровирусы в геноме
хозяина. Более детального изучения требует и
выяснение роли этих элементов в онкогенезе и
возможности формирования новых инфекционных
ретровирусов.
44
Р Е Т Р О В И Р У С Ы П Т И Ц : С Т Р У К Т У Р А , Э К С П Р Е С С И Я И Э В О Л Ю Ц И Я
L. G. Borisenko, А. V. Rynditch
Avian endogenous retroviruses: structure, expression and evolution
Summary
The recent data about the diversity of avian endogenous retroviruses,
their structure, peculiarity of the expression and possible ways of
their evolution have been analysed in the present review. A role of
endogenous retroviruses in the ontogenesis and pathology develop
ment has been shown.
Л. Г. Борисенко, А. В. Риндич
Ендогенні ретровіруси птахів: структура, експресія та еволюція
Резюме
В огляді проаналізовано найновіші дані про різноманіття
ендогенних ретровірусів птахів, розглянуто їхню структуру,
особливості експресії та можливі шляхи еволюції. Висвітлено
роль ендогенних ретровірусів в онтогенезі та у виникненні
патологій.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Herniou Е., Martin /., Miller К, Cook J., Wilkinson M.,
Tristem M. Retroviral diversity and distribution in vertebrates
/ / J. Virol .—1998.—72.— P. 5955—5966 .
2. Chen Z.-Q., Ritzel R. G, Lin С. C, Hodgetts R. V. Sequence
conservation in avian CR1: an interspersed repetitive DNA
family evolving under functional constraints / / Proc. Nat.
Acad. Sci. USA.—1991 .—88.—P. 5814—5818 .
3. Gudkov A., Komarova E., Nikiforov M., Zaitsevskaya T.
ART-CH, a new chicken retrovirus-like element / / J . Virol.—
1992.—66.—P. 1726—1736.
4. Tikhonenko A., Lomovskaya O. Avian endogenous provirus
(ev-3) env gene sequencing: implication for pathogenic retro
virus origination / / Virus genes—1990.—3.—P. 251—258.
5. Geryk J., Dezelee P., Barnier /., Svoboda J., Nehyba J.,
Karakoz I.f Rynditch A., Yatsula В., Calothy G. Transduction
of the cellular src gene and 3' adjacent sequences in avian
sarcoma virus PR2257 / / J. Virol .—1989.—63.—P. 481 —
492.
6. Yatsula В., Geryk /., Briestanska J., Karakoz L, Svoboda
Rynditch A., Calothy G, Dezelee P. Origin and evolution of
the c-src-transducing avian sarcoma virus PR2257 / / J. Gen.
Virol .—1994.—75.—P. 2777—2781 .
7. Venugopal К Avian leukosis virus subgroup J: a rapidly
evolving group of oncogenic retroviruses / / Res. Vet. Sci.—
1999.—67.—P. 113—119.
8. Robinson H, Astrin S., Senior A., Salazar F. Host suscep
tibility to endogenous viruses: defective glycoprotein-expressing
proviruses interfere with infections / / J . Virol .—1981.—40.—
P. 745—751 .
9. Crittenden b, Fadley A., Smith E. Effects of endogenous
leukosis virus genes on response to infection with avian leukosis
and reticuloendotheliosis viruses / / Avian Dis .—1982 .—26.—
P. 279—294.
10. Kuhnlein U., Fair full R.f Gowe R., Kulenkamp А., Мои L,
Zadworny D. Synergism between the endogenous viral loci ev6
and ev9 in inducing immunological tolerance to avian leukosis
virus / / Brit. Poult. Sc i .—1993.—34.—P. 93—104.
11. Astrin S. Endogenous viral genes of the white leghorn chicken:
common site of residence and sites associated with specific
phenotypes of viral gene expression / / Proc. Nat. Acad. Sci.
USA.—1978.—75.—P. 5941—5945.
12. Hughes S., Payvar F., Spector D., Schimke R., Robinson H.,
Payne G., Bishop /., Varmus H. Heterogenity of genetic loci
in chickens: analysis of endogenous viral and nonviral genes by
cleavage of DNA with restriction endonucleases / / Cell.—
1979.—18.—P. 347—359 .
13. Astrin S., Robinson H, Crittenden L., Buss E., Wyban /.,
Hay ward W. Ten genetic loci in the chicken that contain
structural genes for endogenous avian leukosis viruses / / Cold
Spring Harbor Symp. Quant. B io l .—1980 .—44.—P. 1105—
1109. '
14. Hughes S., Bishop J., Varmus H. Organization of the en
dogenous proviruses of chickens: implications for origin and
expression / / Virology.—1981.—108.—P. 189—207.
15. Hughes S., Vogt P., Bishop J., Varmus H. Endogenous
proviruses of random-bred chickens and ring-necked phea
sants: analysis with restriction endonucleases / / Virology.—
1981.—108.—P. 222—229 .
16. Coffin /., Tsichlis P., Conklin F.t Senior A., Robinson H.
Genomes of endogenous and exogenous avian retroviruses / /
Virology.—1983.—126.—P. 5 1 — 7 2 .
17. Groudine M., Eisenman R., Weintraub H. Chromatin structure
of endogenous retroviral genes and activation by an inhibitor of
DNA methylation / / Nature .—1981.—292.—P. 311—317.
18. Gudkov A., Chernov M., Tikhonenko A., Obukh I., Hlozanek
I. Methylation of endogenous proviruses of brown leghorn
chickens / / Folia biol. (Praha) .—1986 — 3 2 . — P . 73—77.
19. Rovigatti V., Astrin S. Avian endogenous viral genes / / Curr.
Top. Microbiol. Immunol .—1983.—103.—P. 1—21.
20. Crittenden L., Salter D. Spontaneous mobility of subgroup A
avian leukosis virus proviruses in the genome of the chicken / /
Avian Pathol .—1998.—27.—P. 26—35 .
21. Tereba A., Astrin S. Chromosomal localization of ev-1 , a
frequently occurring endogenous retrovirus locus in White
Leghorn chickens, by in situ hybridization / / J. Virol.—
1980 .—35.—P. 888—894 .
22. Gudkov A., Obukh L, Serov S., Naroditsky B. Variety of
endogenous proviruses in the genomes of chickens of different
breeds / / J. Gen. Virol .—1981.—57.—P. 85—94.
23. Hayward W., Braverman S., Astrin S. Transcriptional products
and DNA structure of endogenous avian proviruses / / Cold
Spring Harbor Symp. Quant. Bio l .—1980.—44—P. 1111 —
1121.
24. Tereba A. Asymmetric chromosomal distribution of endogenous
retrovirus loci in chickens and mice / / Curr. Top. Microbiol.
Immunol.—1983.—107.—P. 29—50.
25. Baker В., Robinson H, Varmus H., Bishop J. Analysis of
endogenous avian retrovirus DNA and RNA: viral and cellular
determinants of retrovirus gene expression / / Virology.—
1981.—114.—P. 8—22.
26. Benkel В., Perreault J., Gagnon C, Conklin K. A rapid
PCR-based test for the endogenous viral element ev3 of
chickens / / A n i m . Genet .—1995 .—26.—P. 189—191 .
27. Grunder A., Benkel В., Chambers J., Sabour M., Gavora J.
Characterization of eight endogenous viral (ev) genes of meat
chickens in semi-congenic lines / / Poult Sc i .—1995.—74.—
P. 1506—1514.
28. Gudkov A., Korec E., Chernov M., Tikhonenko A., Obukh I.,
Hlozanek I. Genetic structure of the endogenous proviruses
and expression of the gag gene in brown leghorn chickens / /
Folia b io l .—1986.—32.—P. 65—72 .
29. Robinson H, Eisenman R., Senior A., Ripley S. Low frequen
cy production of recombinant subgroup E avian leukosis virus
by uninfected V-15 chicken cells / / Virology.—1979.—99.—
P. 21—30.
30. Crittenden JL, Astrin S., Smith E. Independent segregation of
evlO and e v i l , genetic loci for spontaneous production of
endogenous avian retroviruses / / Virology.—1983.—129.—
P. 514—516 .
45
Б О Р И С Е Н К О Л Г., Р Ы Н Д И Ч А. В.
31. Coffin J. Endogenous viruses / / RNA tumor viruses.—New
York, 1984.—P. 1109—1203.
32. Smith E., Bizub D., Scholl D., Skalka A. Characterization of
a solitary long terminal repeat of avian endogenous virus origin
/ / Virology.—1984.—143.—P. 493—496.
33. Benkel В., Smith E. Research note: a rapid method for the
detection of the Rous-associated endogenous solitary long
terminal repeat, e v l 5 / / Poult Sc i .—1993.—72.—P. 1601 —
1605.
34. Humphries E., Danhof M., Hlozanek I. Characterization of
endogenous viral loci in five lines of white leghorn chickens / /
Virology.—1984.—135.—P. 125—138.
35. Gorbovitskaia M., Coville /., Tixier-Boichard M. Molecular
characterization of endogenous viral genes of the avian leukosis
virus family in an experimental population of brown-egg layers
/ / Poult Sc i .—1998.—77.—P. 605—613.
36. Smith E., Crittenden L. Genetic cellular resistance to subgroup
E avian leukosis virus in slow-feathering dams reduces congeni
tal transmission of an endogenous retrovirus encoded at locus
ev21 / / Poult Sc i .—1988.—67.—P. 1668—1673.
37. Tixier-Boichard M., Boulliou-Robic A , Morisson M.t Co-
querelle G., Horst P., Benkel B. A deleted retroviral insertion
at the ev21-K complex locus in Indonesian chickens / / Poult
Sc i .—1997.—76.—P. 733—742 .
38. Levin I., Smith E. Association of a chicken repetitive element
with the endogenous virus-21 slow-feathering locus / / Poult
Sci .—1991.—70.—P. 1948—1956.
39. Ziemiecki A., Kromer G., Mueller R., Hala K, Wick G. ev 22,
a new endogenous avian leukosis virus locus found in chickens
with spontaneous autoimmune thyroiditis / / Arch Virol.—
1988.—100.—P. 2 6 7 — 2 7 1 .
40. Гудков А., Серов С , Обух И., Народицкий Б. Новые
ендогенные провирусы в Д Н К кур породы бурый леггорн
/ / Вопр. вирусологии.—1981.—2.—С. 225—228.
41. Гудков А., Колобков С , Обух И., Серов С , Чернов М.
Структурное разнообразие эндогенных провирусов в ге
номах позвоночных / / Вестн. АМН СССР.—1984 .—3.—
С. 3—9.
42. Chernov М., Gudkov A., Obuch I. Variations of endogenous
chicken proviruses: characterization of new loci of endogenous
proviruses in the genome of Italian Partridge chickens / / Folia
biol. (Praha) .—1984.— 3 0 . — P . 342—348.
43. Aarts H, Van Der Hulst-Van Arkel M., Beuving G., Leenstra
F. Variations in endogenous viral gene patterns in White
Leghorn, medium heavy, White Plymouth Rock, and Cornish
Chickens / / Poult Sc i .—1991.—70.—P. 1281—1286.
44. Sabour M.} Chambers J., Grunder A., Kuhnlein U., Gavora J.
Endogenous viral gene distribution in populations of meat-type
chickens / / Poult Sc i .—1992.—71.—P. 1259—1270.
45. Iraqi F.y Soller M., Beckmann J. Distribution of endogenous
viruses in some commercial chicken layer populations / / Poult
Sc i .—1991.—70.—P. 665—679 .
46. Grunder A., Benkel В., Chambers J., Sabour M., Gavora J.,
Dickie J. Characterization of four endogenous viral genes in
semi-congenic lines of meat chickens / / Poult Sci .—1999.—
78.—P. 873—877.
47. Nikiforov M.t Gudkov A. ART-CH: a VL30 in chickens? / / J.
Virol .—1994.—68.—P. 846—853 .
48. Boyce-Jacino Af., Resnick R.t Faros A. Structural and func
tional characterization of the unusually short long terminal
repeats and their adjacent regions of a novel endogenous avian
retrovirus / / Virology.—1989.—173.—P. 157—166.
49. Dunwiddie C , Faras A. Presence of retrovirus reverse trans-
criptase-related gene sequences in avian cells lacking en
dogenous avian leukosis viruses / / Proc. Nat. Acad. Sci.
USA.—1985 .—82.—P. 5097—5101 .
50. Dunwiddie C, Resnick R., Boyce-Jacino M., Alegre J., Faras
A. Molecular cloning and characterization of gag-, pol-, and
ercv-related gene sequences in the ev-chicken / / J . Virol.—
1986.—59.—P. 669—675.
51 . Boyce-Jacino M., O'donoghue K, Faras A. Multiple complex
families of endogenous retroviruses are highly conserved in the
genus Gallus II J. Virol .—1992.—66.—P. 4919—4929.
52. Sacco M.t Flannery D., Howes K, Venugopal К Avian
endogenous retrovirus EAV-HP shares regions of identity with
avian leukosis virus subgroup J and the avian retrotransposon
ART-CH / / J. Virol .—2000.—74.—P. 1296—1306.
53. Bai J., Payne L., Skinner M. HPRS-103 (exogenous avian
leukosis virus, subgroup J) has an env gene related to those of
endogenous elements EAV-0 and E51 and an E element found
previously only in sarcoma viruses / / J. Virol .—1995.—69.—
P. 779—784.
54. Smith L, Toye A., Howes K, Bumstead N., Payne L,
Venugopal К Novel endogenous retroviral sequences in the
chicken genome closely related to HPRS-103 (subgroup J)
avian leukosis virus / / J. Virol .—1999.—80.—P. 261—268.
55. Adams S.t Rathjen P., Stanway C, Fulton S., Malim M.,
Wilson W.t Ogden J., King L, Kings man S.t Kingsman A.
Complete nucleotide sequence of a mouse VL30 retroelement
/ / Мої. Cell. Bio l .—1988.—8.—P. 2989—2998.
56. Benson S.f Ruis В., Fadly A., Conklin K. The unique envelope
gene of the subgroup J avian leukosis virus derives from ev/j
proviruses, a novel family of avian endogenous viruses / / J.
Virol .—1998.—72.—P. 10157—10164.
57. Ruis В., Benson S., Conklin К Genome structure and
expression of the ev/j family of avian endogenous viruses / / J.
Virol .—1999.—73.—P. 5345—5355 .
58. Burch J., Davis D., Haas N. Chicken repeat 1 elements contain
a pol-like open reading frame and belong to the non-long
terminal repeat class of retrotransposons / / Proc. Nat. Acad.
Sci. USA.—1993 .—90.—P. 8199—8203.
59. Vandergon Т., Reitman M. Evolution of chicken repeat 1
(CRD elements: evidence for ancient subfamilies and multiple
progenitors / / Мої. Biol. Evol .—1994.—11.—P. 886—898.
60. Silva R., Burch J. Evidence that chicken CR1 elements
represent a novel family of retroposons / / Мої. Cell. Biol.—
1989.—9.—P. 3563—3566.
61. Olofsson В., Bernardi G. The distribution of CR1, an Alu-like
family of interspersed repeats, in the chicken genome / /
Biochim. et biophys. acta .—1983.—740.—P. 339—341.
62. Martin J.t Herniou E.t Cook J., O'Bneill R., Tristem M.
Human endogenous retrovirus type I-related viruses have an
apparently widespread distribution within vertebrates / / J.
Virol .—1997.—71.—P. 437—443.
63. Astrin S., Buss E.t Hayward W. Endogenous viral genes are
non-essential in the chicken / / Nature .—1979.—282.—
P. 339—341 .
64. Gavora J., Kuhnlein U., Crittenden L, Spencer J., Sabour M.
Endogenous viral genes: association with reduced egg produc
tion rate and edd size in White Leghorns / / Poult Sci.—
1991.—70.—P. 618—623 .
65. Walchner M.f Leib-Mosch C , Messer G.f Germaier H., Plewig
G., Kind P. Endogenous retroviral sequences in the patho
genesis of systemic autoimmune disease / / Arch. Dermatol.—
1997.—133.—P. 767—771 .
66. Sreekumar G., Smyth J., Ambady S.t Ponce de Leon F.
Analysis of the effect of endogenous viral genes in the Smyth
line chicken model for autoimmune vitiligo / / Amer. J.
Pathol .—2000.—156.—P. 1099—1107.
67. Stoye /., Coffin J. The four classes of endogenous murine
leukemia viruses: structural relationships and potential for
recombination / / J. Virol .—1987.—61.—P. 2659—2669.
46
68. Chakrabarti R., Hofman F., Pandey R., Mathes L, Roy-Bur-
man P. Recombination between feline exogenous and en
dogenous retroviral sequences generates tropism for cerebral
endothelial cells / / Amer. J. Pathol.—1994.—144.—P. 348—
358.
69. Payne L., Howes K., Gillespie A.f Smith JL Host range of Rous
sarcoma virus pseudotype RSV (HPRS-*103) in 12 avian
species: support for a new avian retrovirus envelope subgroup,
designated J / / J. Gen. Virol .—1992.—73.—P. 2995—2997.
70. Crittenden L., Fadly A. Responses of chickens lacking or
expressing endogenous avian leukosis virus genes to infection
with exogenous virus / / Poult Sci .—1985.—64.—P. 454—463 .
71. Frisby D., Weiss R., Roussel Af., Stehelin D. The distribution
of endogenous chicken retrovirus sequences in the DNA of
Р Е Т Р О В И Р У С Ы П Т И Ц : СТРУКТУРА' , Э К С П Р Е С С И Я И Э В О Л Ю Ц И Я
galliform birds does not coincide with avian phylogenetic
relationships / / Ce l l .—1979 .—17.—P. 623—634 .
72. Resnick R., Boyce-Jacino M., Fu Q., Faros A. Phylogenetic
distribution of the novel avian endogenous provirus family
EAV-0 / / J. Virol .—1990.—64.—P. 4640—4653 .
73. Garrett J.t Knutzon D., Carroll D. Composite transposable
elements in the Xenopus laevis genome / / Мої. Cell. Biol.—
1989.—9.—P. 3018—3027 .
74. Doolittle R.t Feng D.t Johnson M., McClure M. Origins and
evolutionary relationships of retroviruses / / Quart. Rev. Biol.—
1989.—64.—P. 1—30.
УДК 578.828
Надійшла до редакції 29.01.2001
47
|