Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие
Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2 мкм плазмидой дрожжей Saccharomyces cerevisiae, участвует в амплификации числа копий названной плазмиды, инвертируя одну ее часть относительно другой в ходе репликации плазмиды В работе рассмотрен сложный процесс связывания белка Flp с участком Flp-ре...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Datum: | 1996 |
| Hauptverfasser: | , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russian |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1996
|
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153887 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие / Ю.А. Возиянов, А.И. Корнелюк // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 3. — С. 17-26. — Бібліогр.: 29 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153887 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Возиянов, Ю.А. Корнелюк, А.И. 2019-06-14T18:31:16Z 2019-06-14T18:31:16Z 1996 Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие / Ю.А. Возиянов, А.И. Корнелюк // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 3. — С. 17-26. — Бібліогр.: 29 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000428 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153887 577.151.45 Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2 мкм плазмидой дрожжей Saccharomyces cerevisiae, участвует в амплификации числа копий названной плазмиды, инвертируя одну ее часть относительно другой в ходе репликации плазмиды В работе рассмотрен сложный процесс связывания белка Flp с участком Flp-рекомбинации, который состоит из ряда последовательных стадий узнавания. Анализ первичной последовательности фрагмента ДИК в участке рекомбинации белка Flp, проведенный для выяснения предрасположенности участка к конформационным изменениям, вызываемым связыванием с ним белка Flp, показал нелучайность распределения в нем динуклеотидов, имеющих тенденцию к изгибанию ДИК в сторону малого желобка ДНК Вероятно, фрагмент молекулы ДИК в участке рекомбинации является не «пассивным» субстратом для реакции рекомбинации, над которым белок Flp производит специфическое действие, а субстратом, способствующим оптимальному прохождению рекомбинационного процес са. Очевидно, именно последовательный процесс взаимоиндуцированного Соответствия Flp-рекомбиназы и участка рекомбинации обеспечивает их эффективное и специфическое связывание. Сайт-специфічна рекомбіназа Flp, яка кодується 2 мкм плазмідою з Saccharomyces cerevisiae, бере участь в ампліфікації числа копій згаданої плазміди, інвертуючи одну її частину відносно другої під час реплікації плазміди. В роботі розглянуто складний процес зв'язування білка Flp з ділянкою Flp-рекомбінації, який являє собою ряд послідовних стадій впізнавання. Аналіз первинної послідовності фрагмента ДНК ділянки рекомбінації білка Flp, здійснений для з'ясування здатності цієї ділянки до згинання, яке виникає внаслідок зв'язуванням з нею білка Flp, показав невипадковість розподілу в ділянці динуклеотидів, що мають тенденцію до згинання ДНК у бік малого жолобка ДНК. Цілком імовірно, що фрагмент молекули ДНК у ділянці рекомбінації є не «пасивним» субстратом для реакції рекомбінації, а субстратом, що сприяє оптимальному проходженню рекомбінаційного процесу. Очевидно, саме послідовний процес взаємоіндукованої відповідності Flp-рекомбінази та ділянки рекомбінації забезпечує їх хрективне і специфічне зв'язування. Site-specific recombinase Flp encoded by 2 micron plasmid from Saccharomyces cerevisiae participates in amplification of copy number of 2 micron plasmid by inverting two parts of the plasmid relative to each other. In the paper a complex process of binding of Flp protein to its recombination site, which appears to be a series of consequent steps of recognition, is considered. An analysis of the primary structure of the Flp recombination site has been made in order to figure out whether there is a predisposition of the recombination site to the conformational changes upon the Flp protein binding. The analysis has revealed that the distribution of the dinucleotides that have a tendency to bend DNA either toward minor groove of DNA is not random. It has been suggested that a fragment of DNA molecule at the site of recombination is not a «passive» substrate for the recombination reaction, but a substrate that favour the protein to carry out recombination reaction in an optimal way. Apparently, it is a multistep process of substrate-enzyme adjustment of the Flp protein and the recombination site that ensures their effective and specific binding. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие Взаємодія білка Flp з ділянкою рекомбінації: индукована фермент-субстратна відповідність Interaction of Flp protein with its recombination site: substrate-enzyme molecular adjustment Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие |
| spellingShingle |
Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие Возиянов, Ю.А. Корнелюк, А.И. |
| title_short |
Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие |
| title_full |
Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие |
| title_fullStr |
Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие |
| title_full_unstemmed |
Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие |
| title_sort |
взаимодействие белка flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие |
| author |
Возиянов, Ю.А. Корнелюк, А.И. |
| author_facet |
Возиянов, Ю.А. Корнелюк, А.И. |
| publishDate |
1996 |
| language |
Russian |
| container_title |
Биополимеры и клетка |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Взаємодія білка Flp з ділянкою рекомбінації: индукована фермент-субстратна відповідність Interaction of Flp protein with its recombination site: substrate-enzyme molecular adjustment |
| description |
Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2 мкм плазмидой дрожжей Saccharomyces cerevisiae, участвует в амплификации числа копий названной плазмиды, инвертируя одну ее часть относительно другой в ходе репликации плазмиды В работе рассмотрен сложный процесс связывания белка Flp с участком Flp-рекомбинации, который состоит из ряда последовательных стадий узнавания. Анализ первичной последовательности фрагмента ДИК в участке рекомбинации белка Flp, проведенный для выяснения предрасположенности участка к конформационным изменениям, вызываемым связыванием с ним белка Flp, показал нелучайность распределения в нем динуклеотидов, имеющих тенденцию к изгибанию ДИК в сторону малого желобка ДНК Вероятно, фрагмент молекулы ДИК в участке рекомбинации является не «пассивным» субстратом для реакции рекомбинации, над которым белок Flp производит специфическое действие, а субстратом, способствующим оптимальному прохождению рекомбинационного процес са. Очевидно, именно последовательный процесс взаимоиндуцированного Соответствия Flp-рекомбиназы и участка рекомбинации обеспечивает их эффективное и специфическое связывание.
Сайт-специфічна рекомбіназа Flp, яка кодується 2 мкм плазмідою з Saccharomyces cerevisiae, бере участь в ампліфікації числа копій згаданої плазміди, інвертуючи одну її частину відносно другої під час реплікації плазміди. В роботі розглянуто складний процес зв'язування білка Flp з ділянкою Flp-рекомбінації, який являє собою ряд послідовних стадій впізнавання. Аналіз первинної послідовності фрагмента ДНК ділянки рекомбінації білка Flp, здійснений для з'ясування здатності цієї ділянки до згинання, яке виникає внаслідок зв'язуванням з нею білка Flp, показав невипадковість розподілу в ділянці динуклеотидів, що мають тенденцію до згинання ДНК у бік малого жолобка ДНК. Цілком імовірно, що фрагмент молекули ДНК у ділянці рекомбінації є не «пасивним» субстратом для реакції рекомбінації, а субстратом, що сприяє оптимальному проходженню рекомбінаційного процесу. Очевидно, саме послідовний процес взаємоіндукованої відповідності Flp-рекомбінази та ділянки рекомбінації забезпечує їх хрективне і специфічне зв'язування.
Site-specific recombinase Flp encoded by 2 micron plasmid from Saccharomyces cerevisiae participates in amplification of copy number of 2 micron plasmid by inverting two parts of the plasmid relative to each other. In the paper a complex process of binding of Flp protein to its recombination site, which appears to be a series of consequent steps of recognition, is considered. An analysis of the primary structure of the Flp recombination site has been made in order to figure out whether there is a predisposition of the recombination site to the conformational changes upon the Flp protein binding. The analysis has revealed that the distribution of the dinucleotides that have a tendency to bend DNA either toward minor groove of DNA is not random. It has been suggested that a fragment of DNA molecule at the site of recombination is not a «passive» substrate for the recombination reaction, but a substrate that favour the protein to carry out recombination reaction in an optimal way. Apparently, it is a multistep process of substrate-enzyme adjustment of the Flp protein and the recombination site that ensures their effective and specific binding.
|
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153887 |
| citation_txt |
Взаимодействие белка Flp с участком рекомбинации: индуцированное фермент-субстратное соответствие / Ю.А. Возиянов, А.И. Корнелюк // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 3. — С. 17-26. — Бібліогр.: 29 назв. — рос. |
| work_keys_str_mv |
AT voziânovûa vzaimodeistviebelkaflpsučastkomrekombinaciiinducirovannoefermentsubstratnoesootvetstvie AT kornelûkai vzaimodeistviebelkaflpsučastkomrekombinaciiinducirovannoefermentsubstratnoesootvetstvie AT voziânovûa vzaêmodíâbílkaflpzdílânkoûrekombínacííindukovanafermentsubstratnavídpovídnístʹ AT kornelûkai vzaêmodíâbílkaflpzdílânkoûrekombínacííindukovanafermentsubstratnavídpovídnístʹ AT voziânovûa interactionofflpproteinwithitsrecombinationsitesubstrateenzymemolecularadjustment AT kornelûkai interactionofflpproteinwithitsrecombinationsitesubstrateenzymemolecularadjustment |
| first_indexed |
2025-12-07T13:12:55Z |
| last_indexed |
2025-12-07T13:12:55Z |
| _version_ |
1850855313297637376 |