Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом
Полиэлектролитная теория В – Z-перехода предсказывает немонотонную зависимость стабильности Z-формы от концентрации электролита. Опубликованные данные о двойном Z – В – Z-переходе с ростом концентрации соли в растворе поли [д(Г–м⁵Ц)] допускают альтернативное объяснение первого (Z – В) перехода за сч...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Datum: | 1988 |
| Hauptverfasser: | , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1988
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153937 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом / В.И. Иванов, Э.Е. Минят // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 4. — С. 171-177. — Бібліогр.: 9 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862739568449552384 |
|---|---|
| author | Иванов, В.И. Минят, Э.Е. |
| author_facet | Иванов, В.И. Минят, Э.Е. |
| citation_txt | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом / В.И. Иванов, Э.Е. Минят // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 4. — С. 171-177. — Бібліогр.: 9 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Полиэлектролитная теория В – Z-перехода предсказывает немонотонную зависимость стабильности Z-формы от концентрации электролита. Опубликованные данные о двойном Z – В – Z-переходе с ростом концентрации соли в растворе поли [д(Г–м⁵Ц)] допускают альтернативное объяснение первого (Z – В) перехода за счет вытеснения примесных ионов Mg²⁺ и Са²⁺ ионами Na⁺. Чтобы решить эту дилемму, мы провели эксперименты с поли[д(Г–м⁵Ц)], в которых наряду с электростатическим вкладом в B–Z-равновесие варьировали неэлектростатический вклад добавлением малых количеств неэлектролита (этанол). И теория, и эксперимент показывают, что максимум стабильности В-формы находится вблизи 0,1 М NaCl. Была рассчитана также энергия B/Z-границы: 3,6±0,1 ккал/моль. Таким образом, согласно нашим данным, низкоионный переход имеет чисто полиэлектролитную природу, т. е. обусловлен большей линейной плотностью заряда в В-форме по сравнению с Z-формой.
Поліелектролітна теорія В–Z-переходу передбачає немонотонну залежність стабільності Z-форми від концентрації електроліту. Опубліковані дані щодо подвійного Z–В–Z-перехіду зі зростанням концентрації солі у розчині полі [д(Г–м⁵Ц)] допускають альтернативне пояснення першого (Z–В)-переходу за рахунок витіснення домішкових іонів Mg²⁺ і Са²⁺ іонами Na⁺. Щоб вирішити цю дилему, ми провели експерименти з полі[д(Г–м⁵Ц)], у яких поряд з електростатичним внеском у B/Z-рівновагу варіювали неелектростатичний внесок додаванням малих кількостей неелектроліту (етанол). І теорія, і експеримент показують, що максимум стабільності В-форми знаходиться поблизу 0,1 М NaCl. Розраховано також енергію B/Z-межі: 3,6±0,1 ккал/моль. Таким чином, згідно з нашими даними, низькоіонний перехід має чисто поліелектролітну природу, тобто обумовлений більшою лінійної щільністю заряду у В-формі порівняно з Z-формою.
The polyelectrolyte theory for the B – Z transition has been tested with poly[d(G-m⁵C)] by changing the non-electrostatic contribution to the free energy difference between the B and Z forms. The non-electrostatic term was varied by addition of ethanol, a non-electrolyte. The experiments confirmed a bell-shaped dependence of the Z form stability on counterion concentration, the maximum B form stability being at 0.1 M NaCl. In accordance with the theory the widths of the Z-to-B transition at low ionic strengths (<0.01), when expressed in logarithms, are equal. A value of 3.6 kcal/mol was obtained for the free energy of the B/Z junction in poly[d(G-m⁵C)]. These findings make it possible to believe that an explanation of the low ionic strength reverse Z to B transition, based on an idea of pushing out the contaminating polyvalent ions by Na⁺, is unlikely.
|
| first_indexed | 2025-12-07T20:10:16Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153937 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T20:10:16Z |
| publishDate | 1988 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Иванов, В.И. Минят, Э.Е. 2019-06-14T19:03:12Z 2019-06-14T19:03:12Z 1988 Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом / В.И. Иванов, Э.Е. Минят // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 4. — С. 171-177. — Бібліогр.: 9 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000225 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153937 577.323 Полиэлектролитная теория В – Z-перехода предсказывает немонотонную зависимость стабильности Z-формы от концентрации электролита. Опубликованные данные о двойном Z – В – Z-переходе с ростом концентрации соли в растворе поли [д(Г–м⁵Ц)] допускают альтернативное объяснение первого (Z – В) перехода за счет вытеснения примесных ионов Mg²⁺ и Са²⁺ ионами Na⁺. Чтобы решить эту дилемму, мы провели эксперименты с поли[д(Г–м⁵Ц)], в которых наряду с электростатическим вкладом в B–Z-равновесие варьировали неэлектростатический вклад добавлением малых количеств неэлектролита (этанол). И теория, и эксперимент показывают, что максимум стабильности В-формы находится вблизи 0,1 М NaCl. Была рассчитана также энергия B/Z-границы: 3,6±0,1 ккал/моль. Таким образом, согласно нашим данным, низкоионный переход имеет чисто полиэлектролитную природу, т. е. обусловлен большей линейной плотностью заряда в В-форме по сравнению с Z-формой. Поліелектролітна теорія В–Z-переходу передбачає немонотонну залежність стабільності Z-форми від концентрації електроліту. Опубліковані дані щодо подвійного Z–В–Z-перехіду зі зростанням концентрації солі у розчині полі [д(Г–м⁵Ц)] допускають альтернативне пояснення першого (Z–В)-переходу за рахунок витіснення домішкових іонів Mg²⁺ і Са²⁺ іонами Na⁺. Щоб вирішити цю дилему, ми провели експерименти з полі[д(Г–м⁵Ц)], у яких поряд з електростатичним внеском у B/Z-рівновагу варіювали неелектростатичний внесок додаванням малих кількостей неелектроліту (етанол). І теорія, і експеримент показують, що максимум стабільності В-форми знаходиться поблизу 0,1 М NaCl. Розраховано також енергію B/Z-межі: 3,6±0,1 ккал/моль. Таким чином, згідно з нашими даними, низькоіонний перехід має чисто поліелектролітну природу, тобто обумовлений більшою лінійної щільністю заряду у В-формі порівняно з Z-формою. The polyelectrolyte theory for the B – Z transition has been tested with poly[d(G-m⁵C)] by changing the non-electrostatic contribution to the free energy difference between the B and Z forms. The non-electrostatic term was varied by addition of ethanol, a non-electrolyte. The experiments confirmed a bell-shaped dependence of the Z form stability on counterion concentration, the maximum B form stability being at 0.1 M NaCl. In accordance with the theory the widths of the Z-to-B transition at low ionic strengths (<0.01), when expressed in logarithms, are equal. A value of 3.6 kcal/mol was obtained for the free energy of the B/Z junction in poly[d(G-m⁵C)]. These findings make it possible to believe that an explanation of the low ionic strength reverse Z to B transition, based on an idea of pushing out the contaminating polyvalent ions by Na⁺, is unlikely. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом Зміна стабільності Z-форми ДНК залежно від іонної сили. Порівняння теорії з експериментом Changes in stability of Z form depending on ionic strength, comparison between the theory and experiment Article published earlier |
| spellingShingle | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом Иванов, В.И. Минят, Э.Е. Структура и функции биополимеров |
| title | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_alt | Зміна стабільності Z-форми ДНК залежно від іонної сили. Порівняння теорії з експериментом Changes in stability of Z form depending on ionic strength, comparison between the theory and experiment |
| title_full | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_fullStr | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_full_unstemmed | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_short | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_sort | изменение стабильности z-формы днк в зависимости от ионной силы. сравнение теории с экспериментом |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153937 |
| work_keys_str_mv | AT ivanovvi izmeneniestabilʹnostizformydnkvzavisimostiotionnoisilysravnenieteoriiséksperimentom AT minâtée izmeneniestabilʹnostizformydnkvzavisimostiotionnoisilysravnenieteoriiséksperimentom AT ivanovvi zmínastabílʹnostízformidnkzaležnovídíonnoísiliporívnânnâteoríízeksperimentom AT minâtée zmínastabílʹnostízformidnkzaležnovídíonnoísiliporívnânnâteoríízeksperimentom AT ivanovvi changesinstabilityofzformdependingonionicstrengthcomparisonbetweenthetheoryandexperiment AT minâtée changesinstabilityofzformdependingonionicstrengthcomparisonbetweenthetheoryandexperiment |