Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)

Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)

В работе предложен новый алгоритм построения полной карты локального сходства двух биополимеров, значительно более быстрый по сравнению с известным алгоритмом Альтшуля — Эриксона. Haш алгоритм реализован в программе DotHelix из пакета GenBee. Эффективность алгоритма по сравнению с традиционным метод...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1990
Hauptverfasser: Леонтович, А.М., Бродский, Л.И., Горбаленя, А.Е.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1990
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154116
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee) / А.М. Леонтович, Л.И. Бродский, А.Е. Горбаленя // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 14-21. — Бібліогр.: 4 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154116
record_format dspace
spelling Леонтович, А.М.
Бродский, Л.И.
Горбаленя, А.Е.
2019-06-15T08:05:13Z
2019-06-15T08:05:13Z
1990
Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee) / А.М. Леонтович, Л.И. Бродский, А.Е. Горбаленя // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 14-21. — Бібліогр.: 4 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00029A
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154116
577.112
В работе предложен новый алгоритм построения полной карты локального сходства двух биополимеров, значительно более быстрый по сравнению с известным алгоритмом Альтшуля — Эриксона. Haш алгоритм реализован в программе DotHelix из пакета GenBee. Эффективность алгоритма по сравнению с традиционным методом Стадена и работа программы DotHelix проиллюстрированы на примере сопоставления полипротеинов двух штаммов вируса полиомиелита. Кратко обсуждены возможные области применения предлагаемой программы.
Запропоновано новий алгоритм побудови повної карти локальної подібності двох біополімерів, значно швидший порівняно з відомим алгоритмом Альтшуля?Еріксона. Haш алгоритм реалізований у програмі DotHelix з пакету GenBee. Ефективність алгоритму порівняно з традиційним методом Стадена і робота програми DotHelix проілюстровано на прикладі зіставлення поліпротеїнів двох штамів вірусу поліомієліту. Коротко обговорено можливі галузі застосування пропонованої програми.
A novel algorithm for generation of complete maps of local similarity for two biopolymers which is much faster than the similar Altschul-Erickson algorithm is described. This algorithm was implemented as the DotHelix program within the GenBee package. The algorithm effectiveness as compared to the Staden algorithm and the results obtained with the DotHelix program are illustrated by the comparison of the polyproteins of two strains of poliomyelitis virus type 3. The possible applications of the program are discussed in brief.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
Побудова повної карти локальної подібності двох біополімерів (програма DotHelix пакета GenBee)
Compile of a complete map of local similarity for two biopolymers (DotHelix PROGRAM of the GenBee package)
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
spellingShingle Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
Леонтович, А.М.
Бродский, Л.И.
Горбаленя, А.Е.
title_short Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_full Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_fullStr Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_full_unstemmed Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_sort построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа dothelix пакета genbee)
author Леонтович, А.М.
Бродский, Л.И.
Горбаленя, А.Е.
author_facet Леонтович, А.М.
Бродский, Л.И.
Горбаленя, А.Е.
publishDate 1990
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Побудова повної карти локальної подібності двох біополімерів (програма DotHelix пакета GenBee)
Compile of a complete map of local similarity for two biopolymers (DotHelix PROGRAM of the GenBee package)
description В работе предложен новый алгоритм построения полной карты локального сходства двух биополимеров, значительно более быстрый по сравнению с известным алгоритмом Альтшуля — Эриксона. Haш алгоритм реализован в программе DotHelix из пакета GenBee. Эффективность алгоритма по сравнению с традиционным методом Стадена и работа программы DotHelix проиллюстрированы на примере сопоставления полипротеинов двух штаммов вируса полиомиелита. Кратко обсуждены возможные области применения предлагаемой программы. Запропоновано новий алгоритм побудови повної карти локальної подібності двох біополімерів, значно швидший порівняно з відомим алгоритмом Альтшуля?Еріксона. Haш алгоритм реалізований у програмі DotHelix з пакету GenBee. Ефективність алгоритму порівняно з традиційним методом Стадена і робота програми DotHelix проілюстровано на прикладі зіставлення поліпротеїнів двох штамів вірусу поліомієліту. Коротко обговорено можливі галузі застосування пропонованої програми. A novel algorithm for generation of complete maps of local similarity for two biopolymers which is much faster than the similar Altschul-Erickson algorithm is described. This algorithm was implemented as the DotHelix program within the GenBee package. The algorithm effectiveness as compared to the Staden algorithm and the results obtained with the DotHelix program are illustrated by the comparison of the polyproteins of two strains of poliomyelitis virus type 3. The possible applications of the program are discussed in brief.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154116
citation_txt Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee) / А.М. Леонтович, Л.И. Бродский, А.Е. Горбаленя // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 14-21. — Бібліогр.: 4 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT leontovičam postroeniepolnoikartylokalʹnogoshodstvadvuhbiopolimerovprogrammadothelixpaketagenbee
AT brodskiili postroeniepolnoikartylokalʹnogoshodstvadvuhbiopolimerovprogrammadothelixpaketagenbee
AT gorbalenâae postroeniepolnoikartylokalʹnogoshodstvadvuhbiopolimerovprogrammadothelixpaketagenbee
AT leontovičam pobudovapovnoíkartilokalʹnoípodíbnostídvohbíopolímerívprogramadothelixpaketagenbee
AT brodskiili pobudovapovnoíkartilokalʹnoípodíbnostídvohbíopolímerívprogramadothelixpaketagenbee
AT gorbalenâae pobudovapovnoíkartilokalʹnoípodíbnostídvohbíopolímerívprogramadothelixpaketagenbee
AT leontovičam compileofacompletemapoflocalsimilarityfortwobiopolymersdothelixprogramofthegenbeepackage
AT brodskiili compileofacompletemapoflocalsimilarityfortwobiopolymersdothelixprogramofthegenbeepackage
AT gorbalenâae compileofacompletemapoflocalsimilarityfortwobiopolymersdothelixprogramofthegenbeepackage
first_indexed 2025-12-07T20:48:19Z
last_indexed 2025-12-07T20:48:19Z
_version_ 1850883964219162624

Ähnliche Einträge