Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ

Созданы две программы для выявления и визуализации пространственной асимметрии ДНК. С их помощью анализировали 2 мкм плазмиду дрожжей-сахаромицетов. Выявлен участок особой ориентации G—С-пар. Расположение этого участка совпадает с локализацией ненуклеосомного ДНК-белкового комплекса, выявленного ран...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Биополимеры и клетка
Дата:1990
Автори: Лукина, Н.И., Сойдла, Т.Р.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1990
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154118
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ / Н.И. Лукина, Т.Р. Сойдла // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 52-58. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154118
record_format dspace
spelling Лукина, Н.И.
Сойдла, Т.Р.
2019-06-15T08:07:02Z
2019-06-15T08:07:02Z
1990
Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ / Н.И. Лукина, Т.Р. Сойдла // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 52-58. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002A0
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154118
1577.323:681.3
Созданы две программы для выявления и визуализации пространственной асимметрии ДНК. С их помощью анализировали 2 мкм плазмиду дрожжей-сахаромицетов. Выявлен участок особой ориентации G—С-пар. Расположение этого участка совпадает с локализацией ненуклеосомного ДНК-белкового комплекса, выявленного ранее в экспериментальной работе. Созданные программы могут быть использованы для поиска крупных ДНК-белковых комплексов.
Створено дві програми для виявлення та візуалізації просторової асиметрії ДНК. З їхньою допомогою проаналізовано 2 мкм плазміду дріжджів-сахароміцетів. Виявлено ділянку особливої орієнтації G–С-пар. Розташування цієї ділянки збігається з локалізацією ненуклеосомного ДНК-білкового комплексу, виявленого раніше в експериментальній роботі. Створені програми можуть бути використані для пошуку великих ДНК-білкових комплексів.
Two simple programs to detect extensive spatial asymmetries of DNA were created. The programs were used to study the 2 u,m plasmid of Saccharomyces yeast. A nearly 600 bp. uninterrupted region of special spatial orientation of G-C base pairs was found covering the REP 3 locus. The anomaly was obvious when estimating the helix lead approx. 104.4 (but not at 1 ,10:0 or 10.6). It is supposed that the region corresponds to a giant non-nucleosomal DNA-protein complex supposedly of an «oozing» mechanism according to the classification by Ptashne (19*86). The complex is also indicated by some recent experimental results. The new programs can be used for searching giant DNA-protein complexes.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ
Пошук гігантських ДНК-білкових комплексів за допомогою ЕОМ
A computer-aided search for giant DNA-protein complexes
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ
spellingShingle Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ
Лукина, Н.И.
Сойдла, Т.Р.
title_short Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ
title_full Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ
title_fullStr Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ
title_full_unstemmed Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ
title_sort поиск гигантских днк-белковых комплексов при помощи эвм
author Лукина, Н.И.
Сойдла, Т.Р.
author_facet Лукина, Н.И.
Сойдла, Т.Р.
publishDate 1990
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Пошук гігантських ДНК-білкових комплексів за допомогою ЕОМ
A computer-aided search for giant DNA-protein complexes
description Созданы две программы для выявления и визуализации пространственной асимметрии ДНК. С их помощью анализировали 2 мкм плазмиду дрожжей-сахаромицетов. Выявлен участок особой ориентации G—С-пар. Расположение этого участка совпадает с локализацией ненуклеосомного ДНК-белкового комплекса, выявленного ранее в экспериментальной работе. Созданные программы могут быть использованы для поиска крупных ДНК-белковых комплексов. Створено дві програми для виявлення та візуалізації просторової асиметрії ДНК. З їхньою допомогою проаналізовано 2 мкм плазміду дріжджів-сахароміцетів. Виявлено ділянку особливої орієнтації G–С-пар. Розташування цієї ділянки збігається з локалізацією ненуклеосомного ДНК-білкового комплексу, виявленого раніше в експериментальній роботі. Створені програми можуть бути використані для пошуку великих ДНК-білкових комплексів. Two simple programs to detect extensive spatial asymmetries of DNA were created. The programs were used to study the 2 u,m plasmid of Saccharomyces yeast. A nearly 600 bp. uninterrupted region of special spatial orientation of G-C base pairs was found covering the REP 3 locus. The anomaly was obvious when estimating the helix lead approx. 104.4 (but not at 1 ,10:0 or 10.6). It is supposed that the region corresponds to a giant non-nucleosomal DNA-protein complex supposedly of an «oozing» mechanism according to the classification by Ptashne (19*86). The complex is also indicated by some recent experimental results. The new programs can be used for searching giant DNA-protein complexes.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154118
citation_txt Поиск гигантских ДНК-белковых комплексов при помощи ЭВМ / Н.И. Лукина, Т.Р. Сойдла // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 52-58. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT lukinani poiskgigantskihdnkbelkovyhkompleksovpripomoŝiévm
AT soidlatr poiskgigantskihdnkbelkovyhkompleksovpripomoŝiévm
AT lukinani pošukgígantsʹkihdnkbílkovihkompleksívzadopomogoûeom
AT soidlatr pošukgígantsʹkihdnkbílkovihkompleksívzadopomogoûeom
AT lukinani acomputeraidedsearchforgiantdnaproteincomplexes
AT soidlatr acomputeraidedsearchforgiantdnaproteincomplexes
first_indexed 2025-12-07T16:19:42Z
last_indexed 2025-12-07T16:19:42Z
_version_ 1850867064689917952