Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности

Предлагается эмпирический метод предсказания функционально важных областей белков и пептидов. Рассматриваются только такие функционально важные участки, остатки которых располагаются близко в последовательности (линейные или непрерывные функционально важные участки). В основе метода лежит ранее обна...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1990
Hauptverfasser: Жилкин, П.А., Ерошкин, А.М.
Format: Artikel
Sprache:Russisch
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1990
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154120
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности / П.А. Жилкин, А.М. Ерошкин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 36-42. — Бібліогр.: 33 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862575230741905408
author Жилкин, П.А.
Ерошкин, А.М.
author_facet Жилкин, П.А.
Ерошкин, А.М.
citation_txt Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности / П.А. Жилкин, А.М. Ерошкин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 36-42. — Бібліогр.: 33 назв. — рос.
collection DSpace DC
container_title Биополимеры и клетка
description Предлагается эмпирический метод предсказания функционально важных областей белков и пептидов. Рассматриваются только такие функционально важные участки, остатки которых располагаются близко в последовательности (линейные или непрерывные функционально важные участки). В основе метода лежит ранее обнаруженная корреляция между локализацией известных непрерывных функционально важных областей в последовательностях белков и низкими значениями профилей сходства этих последовательностей с последовательностями белков человека [7]. Применение предлагаемого метода к большому набору белков позволяет правильно предсказать более половины из известных непрерывных функциональных центров. Пропонується емпіричний метод передбачення функціонально важливих областей білків і пептидів. Розглядаються лише такі функціонально важливі ділянки, залишки яких розташовані близько в послідовності (лінійні або безперервні функціонально важливі ділянки). В основі методу лежить раніше виявлена кореляція між локалізацією відомих безперервних функціонально важливих областей в послідовностях білків і низькими значеннями профілів подібності цих послідовностей з послідовностями білків людини [7]. Застосування запропонованого методу до великого набору білків дозволяє правильно передбачити більше половини з відомих безперервних функціональних центрів. An empirical method for predicting functionally important regions in protein and peptide sequences is suggested. It concerns only linear or continues regions (those consisting of residues closely placed in the sequence). The method is based on an already obtained correlation between continuous protein regions known to be functionally important and corresponding resemblance profile low values. The method allows predicting correctly more than a half of the known continuous functional centers for the large protein set.
first_indexed 2025-11-26T11:51:42Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154120
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0233-7657
language Russian
last_indexed 2025-11-26T11:51:42Z
publishDate 1990
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
record_format dspace
spelling Жилкин, П.А.
Ерошкин, А.М.
2019-06-15T08:07:46Z
2019-06-15T08:07:46Z
1990
Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности / П.А. Жилкин, А.М. Ерошкин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 36-42. — Бібліогр.: 33 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00029D
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154120
577.112
Предлагается эмпирический метод предсказания функционально важных областей белков и пептидов. Рассматриваются только такие функционально важные участки, остатки которых располагаются близко в последовательности (линейные или непрерывные функционально важные участки). В основе метода лежит ранее обнаруженная корреляция между локализацией известных непрерывных функционально важных областей в последовательностях белков и низкими значениями профилей сходства этих последовательностей с последовательностями белков человека [7]. Применение предлагаемого метода к большому набору белков позволяет правильно предсказать более половины из известных непрерывных функциональных центров.
Пропонується емпіричний метод передбачення функціонально важливих областей білків і пептидів. Розглядаються лише такі функціонально важливі ділянки, залишки яких розташовані близько в послідовності (лінійні або безперервні функціонально важливі ділянки). В основі методу лежить раніше виявлена кореляція між локалізацією відомих безперервних функціонально важливих областей в послідовностях білків і низькими значеннями профілів подібності цих послідовностей з послідовностями білків людини [7]. Застосування запропонованого методу до великого набору білків дозволяє правильно передбачити більше половини з відомих безперервних функціональних центрів.
An empirical method for predicting functionally important regions in protein and peptide sequences is suggested. It concerns only linear or continues regions (those consisting of residues closely placed in the sequence). The method is based on an already obtained correlation between continuous protein regions known to be functionally important and corresponding resemblance profile low values. The method allows predicting correctly more than a half of the known continuous functional centers for the large protein set.
Авторы выражают свою искреннюю признательность В. А. Куличкову за помощь в работе и А. Е. Никулину — за предоставление программы быстрого сравнения последовательностей.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности
Метод пошуку функціонально важливих областей білків і пептидів за амінокислотною послідовністю
Protein and peptide functionaly important regions search method by aminoacid sequence
Article
published earlier
spellingShingle Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности
Жилкин, П.А.
Ерошкин, А.М.
title Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности
title_alt Метод пошуку функціонально важливих областей білків і пептидів за амінокислотною послідовністю
Protein and peptide functionaly important regions search method by aminoacid sequence
title_full Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности
title_fullStr Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности
title_full_unstemmed Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности
title_short Метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности
title_sort метод поиска функционально важных областей белков и пептидов по аминокислотной последовательности
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154120
work_keys_str_mv AT žilkinpa metodpoiskafunkcionalʹnovažnyhoblasteibelkovipeptidovpoaminokislotnoiposledovatelʹnosti
AT eroškinam metodpoiskafunkcionalʹnovažnyhoblasteibelkovipeptidovpoaminokislotnoiposledovatelʹnosti
AT žilkinpa metodpošukufunkcíonalʹnovažlivihoblasteibílkívípeptidívzaamínokislotnoûposlídovnístû
AT eroškinam metodpošukufunkcíonalʹnovažlivihoblasteibílkívípeptidívzaamínokislotnoûposlídovnístû
AT žilkinpa proteinandpeptidefunctionalyimportantregionssearchmethodbyaminoacidsequence
AT eroškinam proteinandpeptidefunctionalyimportantregionssearchmethodbyaminoacidsequence