Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations

Aim. To extract information on the nature of protein structural relaxation from the kinetics of electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre (RC). Methods. The kinetic curves obtained by absorption spectroscopy are processed by a maximum entropy method to get the spectrum of rela...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Вiopolymers and Cell
Date:2010
Main Authors: Kharkyanen, V.N., Barabash, Yu.M., Berezetskaya, N.M., Olenchuk, M.V., Knox, P.P., Christophorov, L.N.
Format: Article
Language:English
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2010
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154128
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations / V.N. Kharkyanen, Yu.M. Barabash, N.M. Berezetskaya, M.V. Olenchuk, P.P. Knox, L.N. Christophorov // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 4. — С. 286-294. — Бібліогр.: 26 назв. — англ, рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154128
record_format dspace
spelling Kharkyanen, V.N.
Barabash, Yu.M.
Berezetskaya, N.M.
Olenchuk, M.V.
Knox, P.P.
Christophorov, L.N.
2019-06-15T08:22:34Z
2019-06-15T08:22:34Z
2010
Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations / V.N. Kharkyanen, Yu.M. Barabash, N.M. Berezetskaya, M.V. Olenchuk, P.P. Knox, L.N. Christophorov // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 4. — С. 286-294. — Бібліогр.: 26 назв. — англ, рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000161
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154128
577.355
Aim. To extract information on the nature of protein structural relaxation from the kinetics of electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre (RC). Methods. The kinetic curves obtained by absorption spectroscopy are processed by a maximum entropy method to get the spectrum of relaxation times. Results. A series of distinctive peaks of this spectrum in the interval from 0.1 s to hundreds of seconds is revealed. With the time of exposure of the sample to actinic light increasing, the positions of the peak maxima grow linearly. Conclusions. Theoretical analysis of these results reveals the formation of several structural states of the RC protein. Remarkably, in each of these states the slow reaction kinetics follow the same fractional power law that reflects the glass-like properties of the protein.
Цель. Определить характер структурной релаксации белка из анализа кинетики реакции электрон- ного транспорта в фотосинтетическом реакционном центре (РЦ). Методы. Кинетические кривые, полученные методами абсорбционной спектроскопии, обрабатывали с использованием метода максимальной энтропии для получения спектра времен релаксации. Результаты. Обнаружен ряд характерных пиков этого спектра в интервале от 0,1 до сотен секунд. С увеличением длительности экспозиции образца в актиничном свете положения максимумов пиков линейно возрастают. Выводы. Из теоретического анализа результатов следует, что появляется несколько структурных состояний белкового компонента РЦ, в которых, однако, медленная кинетика реакции подчиняется одному и тому же дробно-степенному закону, отражающему стеклоподобные свойства белка.
Мета. Визначити характер структурної релаксації білка з аналізу кінетики реакції електронного транспорту у фотосинтетичному реакційному центрі (РЦ). Методи. Кінетичні криві, одержані з використанням абсорбційної спектроскопії, обробляли методом максимальної ентропії для отримання спектра часів релаксації. Результати. Знайдено низку характерних піків цього спектра в интервалі від 0,1 до сотень секунд. Зі збільшенням тривалості експозиції зразка в актинічному світлі положення максимумів піків лінійно зростають. Висновки. З теоретичного аналізу результатів випливає, що виникає декілька структурних станів білкового компонента РЦ, у яких, однак, повільна кінетика реакції підпорядкована одному й тому ж дрiбно-ступеневому закону, що відбиває склоподібні властивості білка.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Molecular Biophysics
Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
Уповільнення реакції перенесення электрона у фотосинтетичному реакційному центрі як прояв флуктуацій його структури
Замедление реакции переноса электрона в фотосинтетическом реакционном центре как проявление флуктуаций его структуры
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
spellingShingle Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
Kharkyanen, V.N.
Barabash, Yu.M.
Berezetskaya, N.M.
Olenchuk, M.V.
Knox, P.P.
Christophorov, L.N.
Molecular Biophysics
title_short Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_full Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_fullStr Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_full_unstemmed Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_sort deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
author Kharkyanen, V.N.
Barabash, Yu.M.
Berezetskaya, N.M.
Olenchuk, M.V.
Knox, P.P.
Christophorov, L.N.
author_facet Kharkyanen, V.N.
Barabash, Yu.M.
Berezetskaya, N.M.
Olenchuk, M.V.
Knox, P.P.
Christophorov, L.N.
topic Molecular Biophysics
topic_facet Molecular Biophysics
publishDate 2010
language English
container_title Вiopolymers and Cell
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Уповільнення реакції перенесення электрона у фотосинтетичному реакційному центрі як прояв флуктуацій його структури
Замедление реакции переноса электрона в фотосинтетическом реакционном центре как проявление флуктуаций его структуры
description Aim. To extract information on the nature of protein structural relaxation from the kinetics of electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre (RC). Methods. The kinetic curves obtained by absorption spectroscopy are processed by a maximum entropy method to get the spectrum of relaxation times. Results. A series of distinctive peaks of this spectrum in the interval from 0.1 s to hundreds of seconds is revealed. With the time of exposure of the sample to actinic light increasing, the positions of the peak maxima grow linearly. Conclusions. Theoretical analysis of these results reveals the formation of several structural states of the RC protein. Remarkably, in each of these states the slow reaction kinetics follow the same fractional power law that reflects the glass-like properties of the protein. Цель. Определить характер структурной релаксации белка из анализа кинетики реакции электрон- ного транспорта в фотосинтетическом реакционном центре (РЦ). Методы. Кинетические кривые, полученные методами абсорбционной спектроскопии, обрабатывали с использованием метода максимальной энтропии для получения спектра времен релаксации. Результаты. Обнаружен ряд характерных пиков этого спектра в интервале от 0,1 до сотен секунд. С увеличением длительности экспозиции образца в актиничном свете положения максимумов пиков линейно возрастают. Выводы. Из теоретического анализа результатов следует, что появляется несколько структурных состояний белкового компонента РЦ, в которых, однако, медленная кинетика реакции подчиняется одному и тому же дробно-степенному закону, отражающему стеклоподобные свойства белка. Мета. Визначити характер структурної релаксації білка з аналізу кінетики реакції електронного транспорту у фотосинтетичному реакційному центрі (РЦ). Методи. Кінетичні криві, одержані з використанням абсорбційної спектроскопії, обробляли методом максимальної ентропії для отримання спектра часів релаксації. Результати. Знайдено низку характерних піків цього спектра в интервалі від 0,1 до сотень секунд. Зі збільшенням тривалості експозиції зразка в актинічному світлі положення максимумів піків лінійно зростають. Висновки. З теоретичного аналізу результатів випливає, що виникає декілька структурних станів білкового компонента РЦ, у яких, однак, повільна кінетика реакції підпорядкована одному й тому ж дрiбно-ступеневому закону, що відбиває склоподібні властивості білка.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154128
citation_txt Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations / V.N. Kharkyanen, Yu.M. Barabash, N.M. Berezetskaya, M.V. Olenchuk, P.P. Knox, L.N. Christophorov // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 4. — С. 286-294. — Бібліогр.: 26 назв. — англ, рос.
work_keys_str_mv AT kharkyanenvn decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT barabashyum decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT berezetskayanm decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT olenchukmv decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT knoxpp decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT christophorovln decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT kharkyanenvn upovílʹnennâreakcííperenesennâélektronaufotosintetičnomureakcíinomucentríâkproâvfluktuacíiiogostrukturi
AT barabashyum upovílʹnennâreakcííperenesennâélektronaufotosintetičnomureakcíinomucentríâkproâvfluktuacíiiogostrukturi
AT berezetskayanm upovílʹnennâreakcííperenesennâélektronaufotosintetičnomureakcíinomucentríâkproâvfluktuacíiiogostrukturi
AT olenchukmv upovílʹnennâreakcííperenesennâélektronaufotosintetičnomureakcíinomucentríâkproâvfluktuacíiiogostrukturi
AT knoxpp upovílʹnennâreakcííperenesennâélektronaufotosintetičnomureakcíinomucentríâkproâvfluktuacíiiogostrukturi
AT christophorovln upovílʹnennâreakcííperenesennâélektronaufotosintetičnomureakcíinomucentríâkproâvfluktuacíiiogostrukturi
AT kharkyanenvn zamedleniereakciiperenosaélektronavfotosintetičeskomreakcionnomcentrekakproâvleniefluktuaciiegostruktury
AT barabashyum zamedleniereakciiperenosaélektronavfotosintetičeskomreakcionnomcentrekakproâvleniefluktuaciiegostruktury
AT berezetskayanm zamedleniereakciiperenosaélektronavfotosintetičeskomreakcionnomcentrekakproâvleniefluktuaciiegostruktury
AT olenchukmv zamedleniereakciiperenosaélektronavfotosintetičeskomreakcionnomcentrekakproâvleniefluktuaciiegostruktury
AT knoxpp zamedleniereakciiperenosaélektronavfotosintetičeskomreakcionnomcentrekakproâvleniefluktuaciiegostruktury
AT christophorovln zamedleniereakciiperenosaélektronavfotosintetičeskomreakcionnomcentrekakproâvleniefluktuaciiegostruktury
first_indexed 2025-11-27T10:35:26Z
last_indexed 2025-11-27T10:35:26Z
_version_ 1850852102461456384