Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques
Aim. There are several techniques for the identification of hierarchy of dynamic domains in proteins. The goal of this work is to compare systematically two recently developed techniques, HCCP and HDWA,on a set of proteins from diverse structural classes. Methods. HDWA and HCCP techniques are used....
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Datum: | 2010 |
| 1. Verfasser: | Yesylevskyy, S.O. |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Englisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2010
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154135 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques / S.O. Yesylevskyy // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 4. — С. 311-316. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of UkraineÄhnliche Einträge
New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
von: Yesylevskyy, S.O.
Veröffentlicht: (2010)
von: Yesylevskyy, S.O.
Veröffentlicht: (2010)
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
von: Sudakov, O.O., et al.
Veröffentlicht: (2013)
von: Sudakov, O.O., et al.
Veröffentlicht: (2013)
Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
von: Hurmach, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014)
von: Hurmach, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014)
The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
von: Mykuliak, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014)
von: Mykuliak, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014)
Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
von: Rayevsky, A.V., et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: Rayevsky, A.V., et al.
Veröffentlicht: (2016)
A link between β-catenin and hypertrophy: evaluation and meta-analysis
von: Palchevska, O.L., et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: Palchevska, O.L., et al.
Veröffentlicht: (2016)
Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
von: Lykhenko, O., et al.
Veröffentlicht: (2017)
von: Lykhenko, O., et al.
Veröffentlicht: (2017)
Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
von: Rayevsky, O.V., et al.
Veröffentlicht: (2018)
von: Rayevsky, O.V., et al.
Veröffentlicht: (2018)
Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
von: Lisitsyna, O.M., et al.
Veröffentlicht: (2017)
von: Lisitsyna, O.M., et al.
Veröffentlicht: (2017)
PTI-1: novel way to oncogenicity
von: Vislovukh, A.A., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Vislovukh, A.A., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
von: Bondarenko, V.S., et al.
Veröffentlicht: (2015)
von: Bondarenko, V.S., et al.
Veröffentlicht: (2015)
Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
von: Babichev, S.A., et al.
Veröffentlicht: (2017)
von: Babichev, S.A., et al.
Veröffentlicht: (2017)
Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
von: Babichev, S.A., et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: Babichev, S.A., et al.
Veröffentlicht: (2016)
Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
von: Chellapandi P., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Chellapandi P., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
von: Polishchuk, L.V.
Veröffentlicht: (2017)
von: Polishchuk, L.V.
Veröffentlicht: (2017)
Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
von: Pydiura, N.A., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Pydiura, N.A., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Mathematical modeling of folate-related processes in human placenta
von: Dotsenko, V.A., et al.
Veröffentlicht: (2014)
von: Dotsenko, V.A., et al.
Veröffentlicht: (2014)
Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
von: Куклін, А.В., et al.
Veröffentlicht: (2013)
von: Куклін, А.В., et al.
Veröffentlicht: (2013)
Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи
von: Сліщук, Г.І., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Сліщук, Г.І., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Clustering Monte Carlo simulations of the hierarchical protein folding on a simple lattice model
von: Yesylevskyy, S.O., et al.
Veröffentlicht: (2004)
von: Yesylevskyy, S.O., et al.
Veröffentlicht: (2004)
BBGKY Hierarchy and Dynamics of Correlations
von: Polishchuk, D.O.
Veröffentlicht: (2010)
von: Polishchuk, D.O.
Veröffentlicht: (2010)
Comparison of empirical force fields for bacteriochlorophyll: an influence on hydration and long-time dynamics of bacterial photoreaction centers
von: S. Yesylevskyy, et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: S. Yesylevskyy, et al.
Veröffentlicht: (2016)
Comparison of empirical force fields for bacteriochlorophyll: an influence on hydration and long-time dynamics of bacterial photoreaction centers
von: S. Yesylevskyy, et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: S. Yesylevskyy, et al.
Veröffentlicht: (2016)
Stochastic dynamics and Boltzmann hierarchy. I
von: Petrina, D. Ya., et al.
Veröffentlicht: (1998)
von: Petrina, D. Ya., et al.
Veröffentlicht: (1998)
Stochastic dynamics and Boltzmann hierarchy. II
von: Petrina, D. Ya., et al.
Veröffentlicht: (1998)
von: Petrina, D. Ya., et al.
Veröffentlicht: (1998)
Stochastic dynamics and Boltzmann hierarchy. III
von: Petrina, D. Ya., et al.
Veröffentlicht: (1998)
von: Petrina, D. Ya., et al.
Veröffentlicht: (1998)
Conformational relaxations of human serum albumin studied by molecular dynamics simulations with pressure jumps
von: Yesylevskyy, S.O., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Yesylevskyy, S.O., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Improved analytic hierarchy process on the basis of clarification of formation procedures for matrix of paired comparisons
von: M. M. Potomkin, et al.
Veröffentlicht: (2020)
von: M. M. Potomkin, et al.
Veröffentlicht: (2020)
Identification of Tudor domain containing 7 protein as a novel partner and a substrate for ribosomal protein S6 kinases – S6K1 and S6K2
von: O. Skorokhod, et al.
Veröffentlicht: (2013)
von: O. Skorokhod, et al.
Veröffentlicht: (2013)
The toolkit for nonparametric identification nonlinear dynamical systems based on Volterra models in frequency domain
von: V. D. Pavlenko, et al.
Veröffentlicht: (2014)
von: V. D. Pavlenko, et al.
Veröffentlicht: (2014)
The toolkit for nonparametric identification nonlinear dynamical systems based on Volterra models in frequency domain
von: Pavlenko, V.D., et al.
Veröffentlicht: (2014)
von: Pavlenko, V.D., et al.
Veröffentlicht: (2014)
Comparison of microarray and sage techniques in gene expression analysis of human glioblastoma
von: Kavsan, V.M., et al.
Veröffentlicht: (2007)
von: Kavsan, V.M., et al.
Veröffentlicht: (2007)
New Approach for Identification of Bacteriophage Virion Structural Proteins
von: N. A. Korol, et al.
Veröffentlicht: (2013)
von: N. A. Korol, et al.
Veröffentlicht: (2013)
Identification of protein fractions of milk cows casein complex
von: A. V. Iukalo
Veröffentlicht: (2015)
von: A. V. Iukalo
Veröffentlicht: (2015)
From Toda Hierarchy to KP Hierarchy
von: Yang, Di, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Yang, Di, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Development of the analytic hierarchy process under collective decision-making based on aggregated matrices of pairwise comparisons
von: Yu. Ya. Samokhvalov
Veröffentlicht: (2022)
von: Yu. Ya. Samokhvalov
Veröffentlicht: (2022)
Identification by electrophoretic spectra of storage proteins varieties and hybrids of plants
von: L. V. Sirant, et al.
Veröffentlicht: (2015)
von: L. V. Sirant, et al.
Veröffentlicht: (2015)
Comparison of different systems for purification of recombinant proteins produced by transient expression in plants
von: Lypova, N.M., et al.
Veröffentlicht: (2008)
von: Lypova, N.M., et al.
Veröffentlicht: (2008)
Radar techniques for identification of desert regions – the sources of dust in the atmosphere
von: V. K. Ivanov, et al.
Veröffentlicht: (2015)
von: V. K. Ivanov, et al.
Veröffentlicht: (2015)
Identification of the Scale of Changes in Personnel Motivation Techniques at Mechanical-Engineering Enterprises
von: O. H. Melnyk, et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: O. H. Melnyk, et al.
Veröffentlicht: (2016)
Ähnliche Einträge
-
New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
von: Yesylevskyy, S.O.
Veröffentlicht: (2010) -
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
von: Sudakov, O.O., et al.
Veröffentlicht: (2013) -
Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
von: Hurmach, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014) -
The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
von: Mykuliak, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014) -
Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
von: Rayevsky, A.V., et al.
Veröffentlicht: (2016)