Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа

Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа

В работе предложен метод классификации симметричных структур одноцепочечной ДНК, использующий понятие цветной симметрии. Приводится систематическое перечисление цветных точечных и пространственных групп. Для поиска структур с инверсионной симметрией предлагается использовать фурье-анализ с фильтраци...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1990
Hauptverfasser: Волков, В.В., Леонтьев, А.Ю.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1990
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154144
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа / В.В. Волков, А.Ю. Леонтьев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 68-72. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154144
record_format dspace
spelling Волков, В.В.
Леонтьев, А.Ю.
2019-06-15T08:53:39Z
2019-06-15T08:53:39Z
1990
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа / В.В. Волков, А.Ю. Леонтьев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 68-72. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002A3
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154144
576.315.42
В работе предложен метод классификации симметричных структур одноцепочечной ДНК, использующий понятие цветной симметрии. Приводится систематическое перечисление цветных точечных и пространственных групп. Для поиска структур с инверсионной симметрией предлагается использовать фурье-анализ с фильтрацией, основанной на симметричной числовой кодировке нуклеотидной последовательности. Прямые повторы обнаруживаются с помощью фурье-анализа как первого этапа поиска, существенно сокращающего число операций сравнения. Методы опробованы на модельных последовательностях и областях инициации репликации прокариотического генома.
Запропоновано метод класифікації симетричних структур одноланцюгової ДНК, що використовує поняття кольорової симетрії. Наведено систематичне перерахування кольорових точкових і просторових груп. Для пошуку структур з інверсійною симетрією пропонується використовувати фур’є-аналіз з фільтрацією, заснованою на симетричному числовому кодуванні нуклеотидної послідовності. Прямі повтори виявляються за допомогою фур’є-аналізу як першого етапу пошуку, що істотно скорочує число операцій порівняння. Методи апробовано на модельних послідовностях і областях ініціації реплікації прокаріотичного геному.
A system of the single strand DNA symmetry based on the theory of coloured symmetry is proposed. The search of the fragments with the inversion symmetry is carried out by means of the Fourier transformation, DNA being preliminary presented as a three-dimensional number series. For the search of the direct repeats the Fourier transformation is proposed as the first step to decrease the number of comparisons. The both methods have been tested on the model sequences as well as on the prokaryotic origins of replication.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
Дослідження симетрії генетичних текстів методом Фур’є-аналізу
An investigation of the single strand DNA symmetry by fourier transformation method
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
spellingShingle Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
Волков, В.В.
Леонтьев, А.Ю.
title_short Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
title_full Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
title_fullStr Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
title_full_unstemmed Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
title_sort исследование симметрии генетических текстов методом фурье-анализа
author Волков, В.В.
Леонтьев, А.Ю.
author_facet Волков, В.В.
Леонтьев, А.Ю.
publishDate 1990
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Дослідження симетрії генетичних текстів методом Фур’є-аналізу
An investigation of the single strand DNA symmetry by fourier transformation method
description В работе предложен метод классификации симметричных структур одноцепочечной ДНК, использующий понятие цветной симметрии. Приводится систематическое перечисление цветных точечных и пространственных групп. Для поиска структур с инверсионной симметрией предлагается использовать фурье-анализ с фильтрацией, основанной на симметричной числовой кодировке нуклеотидной последовательности. Прямые повторы обнаруживаются с помощью фурье-анализа как первого этапа поиска, существенно сокращающего число операций сравнения. Методы опробованы на модельных последовательностях и областях инициации репликации прокариотического генома. Запропоновано метод класифікації симетричних структур одноланцюгової ДНК, що використовує поняття кольорової симетрії. Наведено систематичне перерахування кольорових точкових і просторових груп. Для пошуку структур з інверсійною симетрією пропонується використовувати фур’є-аналіз з фільтрацією, заснованою на симетричному числовому кодуванні нуклеотидної послідовності. Прямі повтори виявляються за допомогою фур’є-аналізу як першого етапу пошуку, що істотно скорочує число операцій порівняння. Методи апробовано на модельних послідовностях і областях ініціації реплікації прокаріотичного геному. A system of the single strand DNA symmetry based on the theory of coloured symmetry is proposed. The search of the fragments with the inversion symmetry is carried out by means of the Fourier transformation, DNA being preliminary presented as a three-dimensional number series. For the search of the direct repeats the Fourier transformation is proposed as the first step to decrease the number of comparisons. The both methods have been tested on the model sequences as well as on the prokaryotic origins of replication.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154144
citation_txt Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа / В.В. Волков, А.Ю. Леонтьев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 68-72. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT volkovvv issledovaniesimmetriigenetičeskihtekstovmetodomfurʹeanaliza
AT leontʹevaû issledovaniesimmetriigenetičeskihtekstovmetodomfurʹeanaliza
AT volkovvv doslídžennâsimetríígenetičnihtekstívmetodomfurêanalízu
AT leontʹevaû doslídžennâsimetríígenetičnihtekstívmetodomfurêanalízu
AT volkovvv aninvestigationofthesinglestranddnasymmetrybyfouriertransformationmethod
AT leontʹevaû aninvestigationofthesinglestranddnasymmetrybyfouriertransformationmethod
first_indexed 2025-11-29T09:36:22Z
last_indexed 2025-11-29T09:36:22Z
_version_ 1850854806314287104

Ähnliche Einträge