Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей

Методом графического представления нуклеотидных последовательностей в виде кривых линий, отражающих распределение AT- и GC-оснований по длине последовательности, выявлены характерные (S-образные) профили кривых, соответствующие местам крепления ДНК к ядерному скелету эукариот. Впервые показана приме...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Биополимеры и клетка
Date:1990
Main Authors: Шматченко, В.В., Бережнев, А.Б.
Format: Article
Language:Russian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1990
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154145
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей / В.В. Шматченко, А.Б. Бережнев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 63-68. — Бібліогр.: 19 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862551745079541760
author Шматченко, В.В.
Бережнев, А.Б.
author_facet Шматченко, В.В.
Бережнев, А.Б.
citation_txt Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей / В.В. Шматченко, А.Б. Бережнев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 63-68. — Бібліогр.: 19 назв. — рос.
collection DSpace DC
container_title Биополимеры и клетка
description Методом графического представления нуклеотидных последовательностей в виде кривых линий, отражающих распределение AT- и GC-оснований по длине последовательности, выявлены характерные (S-образные) профили кривых, соответствующие местам крепления ДНК к ядерному скелету эукариот. Впервые показана применимость использованного метода для картирования участков связывания ДНК со скелетными структурами ядра. Тем самым продемонстрирована возможность обнаружения функционально однотипных негомологичных участков ДНК, что не представляется возможным с помощью других известных компьютерных методов анализа протяженных нуклеотидных последовательностей. Методом графічного представлення нуклеотидних послідовностей у вигляді кривих ліній, що відображають розподіл AT- і GC-основ по довжині послідовності, виявлено характерні (S-подібні) профілі кривих, відповідні місцям кріплення ДНК до ядерного скелету еукаріотів. Вперше показано застосовність даного методу для картування ділянок зв’язування ДНК зі скелетними структурами ядра. Тим самим продемонстровано можливість виявлення функціонально однотипових негомологічних ділянок ДНК, що не є можливим за використання інших відомих комп’ютерних методів аналізу протяжних нуклеотидних послідовностей. Characteristic (S-form) curves corresponding to nuclear matrix association regions have been revealed by graphically represented DNA sequences. The curves reflect AT and GC distribution along the sequence length. The method is applicable for mapping DNA attachment sites on nuclear frame. Functionally identical nonhomologous DNA regions in long sequences can be detected which is impossible using other computer-assisted methods of nucleotide sequence analysis.
first_indexed 2025-11-25T20:56:20Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154145
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0233-7657
language Russian
last_indexed 2025-11-25T20:56:20Z
publishDate 1990
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
record_format dspace
spelling Шматченко, В.В.
Бережнев, А.Б.
2019-06-15T08:54:08Z
2019-06-15T08:54:08Z
1990
Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей / В.В. Шматченко, А.Б. Бережнев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 63-68. — Бібліогр.: 19 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002A2
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154145
576.315.42
Методом графического представления нуклеотидных последовательностей в виде кривых линий, отражающих распределение AT- и GC-оснований по длине последовательности, выявлены характерные (S-образные) профили кривых, соответствующие местам крепления ДНК к ядерному скелету эукариот. Впервые показана применимость использованного метода для картирования участков связывания ДНК со скелетными структурами ядра. Тем самым продемонстрирована возможность обнаружения функционально однотипных негомологичных участков ДНК, что не представляется возможным с помощью других известных компьютерных методов анализа протяженных нуклеотидных последовательностей.
Методом графічного представлення нуклеотидних послідовностей у вигляді кривих ліній, що відображають розподіл AT- і GC-основ по довжині послідовності, виявлено характерні (S-подібні) профілі кривих, відповідні місцям кріплення ДНК до ядерного скелету еукаріотів. Вперше показано застосовність даного методу для картування ділянок зв’язування ДНК зі скелетними структурами ядра. Тим самим продемонстровано можливість виявлення функціонально однотипових негомологічних ділянок ДНК, що не є можливим за використання інших відомих комп’ютерних методів аналізу протяжних нуклеотидних послідовностей.
Characteristic (S-form) curves corresponding to nuclear matrix association regions have been revealed by graphically represented DNA sequences. The curves reflect AT and GC distribution along the sequence length. The method is applicable for mapping DNA attachment sites on nuclear frame. Functionally identical nonhomologous DNA regions in long sequences can be detected which is impossible using other computer-assisted methods of nucleotide sequence analysis.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей
Картування місць прикріплення ДНК до ядерного скелету методом графічного представлення протяжних нуклеотидних послідовностей
Mapping DNA attachment sites on nuclear frame by graphic representation of long DNA sequences
Article
published earlier
spellingShingle Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей
Шматченко, В.В.
Бережнев, А.Б.
title Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей
title_alt Картування місць прикріплення ДНК до ядерного скелету методом графічного представлення протяжних нуклеотидних послідовностей
Mapping DNA attachment sites on nuclear frame by graphic representation of long DNA sequences
title_full Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей
title_fullStr Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей
title_full_unstemmed Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей
title_short Картирование мест прикрепления ДНК к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей
title_sort картирование мест прикрепления днк к ядерному скелету методом графического представления протяженных нуклеотидных последовательностей
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154145
work_keys_str_mv AT šmatčenkovv kartirovaniemestprikrepleniâdnkkâdernomuskeletumetodomgrafičeskogopredstavleniâprotâžennyhnukleotidnyhposledovatelʹnostei
AT berežnevab kartirovaniemestprikrepleniâdnkkâdernomuskeletumetodomgrafičeskogopredstavleniâprotâžennyhnukleotidnyhposledovatelʹnostei
AT šmatčenkovv kartuvannâmíscʹprikríplennâdnkdoâdernogoskeletumetodomgrafíčnogopredstavlennâprotâžnihnukleotidnihposlídovnostei
AT berežnevab kartuvannâmíscʹprikríplennâdnkdoâdernogoskeletumetodomgrafíčnogopredstavlennâprotâžnihnukleotidnihposlídovnostei
AT šmatčenkovv mappingdnaattachmentsitesonnuclearframebygraphicrepresentationoflongdnasequences
AT berežnevab mappingdnaattachmentsitesonnuclearframebygraphicrepresentationoflongdnasequences