Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226»
Приведено описание пакета программ для обработки аминокислотных последовательностей белков и пептидов. Входящие в пакет программы дают возможность: 1) ввода и редактирования аминокислотных последовательностей; 2) распечатки выравненных аминокислотных последовательностей семейств гомологичных белков;...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Datum: | 1990 |
| Hauptverfasser: | , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1990
|
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154147 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» / П.В. Костецкий, И.В. Артемьев, О.И. Пожильцова, В.В. Ульяшин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 72-79. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862665029031034880 |
|---|---|
| author | Костецкий, П.В. Артемьев, И.В. Пожильцова, О.И. Ульяшин, В.В. |
| author_facet | Костецкий, П.В. Артемьев, И.В. Пожильцова, О.И. Ульяшин, В.В. |
| citation_txt | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» / П.В. Костецкий, И.В. Артемьев, О.И. Пожильцова, В.В. Ульяшин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 72-79. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Приведено описание пакета программ для обработки аминокислотных последовательностей белков и пептидов. Входящие в пакет программы дают возможность: 1) ввода и редактирования аминокислотных последовательностей; 2) распечатки выравненных аминокислотных последовательностей семейств гомологичных белков; 3) попарного сравнения гомологичных последовательностей; 4) расчета филогенетических деревьев гомологичных белковых последовательностей; 5) идентификации местоположения вариабельных и консервативных участков в аминокислотных последовательностях гомологичных белков; 6) поиска сходства двух сравниваемых белков с распечаткой точечной матрицы сравнения; 7) предсказания локализации В- и T-клеточных антигенных детерминант; 8) перенесения аминокислотных последовательностей банка белковых последовательностей PIR, хранящихся на магнитных лентах, на гибкий магнитный диск персональной ЭВМ «Искра-226» и обратно; 9) идентификации фрагментов структурного гена с помощью набора пептидов; 10) трансляции структурных генов, содержащих интроны. Пакет программ написан на алгоритмическом языке Бейсик. С целью ускорения работы отдельных наиболее трудоемких блоков программ использован автокод микро-ЭВМ. Программы реализованы в диалоговом режиме.
Наведено опис пакету програм для обробки амінокислотних послідовностей білків і пептидів. Програми, які входять до пакету, дають можливість: 1) введення і редагування амінокислотних послідовностей; 2) роздруківки вирівняних амінокислотних послідовностей родин гомологічних білків; 3) попарного порівняння гомологічних послідовностей; 4) розрахунку філогенетичних дерев гомологічних білкових послідовностей; 5) ідентифікації місця розташування варіабельних і консервативних ділянок в амінокислотних послідовностях гомологічних білків; 6) пошуку подібності двох порівнюваних білків з роздрукуванням точкової матриці порівняння; 7) передбачення локалізації В- і T-клітинних антигенних детермінант; 8) перенесення амінокислотних послідовностей банку білкових послідовностей PIR, що зберігаються на магнітних стрічках, на гнучкий магнітний диск персональної ЕОМ «Іскра-226» і назад; 9) ідентифікації фрагментів структурного гена за допомогою набору пептидів; 10) трансляції структурних генів, що містять інтрони. Пакет програм написаний на алгоритмічній мові Бейсик. Для прискорення роботи окремих найтрудомісткіших блоків програм використано автокод мікро-ЕОМ. Програми реалізовані в діалоговому режимі.
Presented software package allows: 1) input and edition of amino acid sequences; 2) listing of aligned amino acid sequences of homologous protein; 3) pairwise comparison of homologous sequences; 4) calculation of phylogenetic trees of homologous protein sequences; 5) identification of variable and constant regions of amino acid sequences; 6) search for similarity between two amino acid sequences and list out comparison dot matrix; 7) prediction of B- and T-cell antigenic determinants; 8) trans forming Protein Identification Resource (PIR) from magnetic tape media to «Iskra-226» floppy disk media and vice versa; 9) identification of structure gene fragments using a set of peptides;. 10) translation of structure genes containing introns. Programs are written in BASIC for a personal computer «Iskra-226» (USSR). To accelerate some operations, computer code commands are used. Software package is realized in interactive mode and intended for specialists on peptide and protein chemistry.
|
| first_indexed | 2025-12-07T15:15:15Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154147 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T15:15:15Z |
| publishDate | 1990 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Костецкий, П.В. Артемьев, И.В. Пожильцова, О.И. Ульяшин, В.В. 2019-06-15T08:54:37Z 2019-06-15T08:54:37Z 1990 Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» / П.В. Костецкий, И.В. Артемьев, О.И. Пожильцова, В.В. Ульяшин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 72-79. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002A4 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154147 577.112.5.0.87 Приведено описание пакета программ для обработки аминокислотных последовательностей белков и пептидов. Входящие в пакет программы дают возможность: 1) ввода и редактирования аминокислотных последовательностей; 2) распечатки выравненных аминокислотных последовательностей семейств гомологичных белков; 3) попарного сравнения гомологичных последовательностей; 4) расчета филогенетических деревьев гомологичных белковых последовательностей; 5) идентификации местоположения вариабельных и консервативных участков в аминокислотных последовательностях гомологичных белков; 6) поиска сходства двух сравниваемых белков с распечаткой точечной матрицы сравнения; 7) предсказания локализации В- и T-клеточных антигенных детерминант; 8) перенесения аминокислотных последовательностей банка белковых последовательностей PIR, хранящихся на магнитных лентах, на гибкий магнитный диск персональной ЭВМ «Искра-226» и обратно; 9) идентификации фрагментов структурного гена с помощью набора пептидов; 10) трансляции структурных генов, содержащих интроны. Пакет программ написан на алгоритмическом языке Бейсик. С целью ускорения работы отдельных наиболее трудоемких блоков программ использован автокод микро-ЭВМ. Программы реализованы в диалоговом режиме. Наведено опис пакету програм для обробки амінокислотних послідовностей білків і пептидів. Програми, які входять до пакету, дають можливість: 1) введення і редагування амінокислотних послідовностей; 2) роздруківки вирівняних амінокислотних послідовностей родин гомологічних білків; 3) попарного порівняння гомологічних послідовностей; 4) розрахунку філогенетичних дерев гомологічних білкових послідовностей; 5) ідентифікації місця розташування варіабельних і консервативних ділянок в амінокислотних послідовностях гомологічних білків; 6) пошуку подібності двох порівнюваних білків з роздрукуванням точкової матриці порівняння; 7) передбачення локалізації В- і T-клітинних антигенних детермінант; 8) перенесення амінокислотних послідовностей банку білкових послідовностей PIR, що зберігаються на магнітних стрічках, на гнучкий магнітний диск персональної ЕОМ «Іскра-226» і назад; 9) ідентифікації фрагментів структурного гена за допомогою набору пептидів; 10) трансляції структурних генів, що містять інтрони. Пакет програм написаний на алгоритмічній мові Бейсик. Для прискорення роботи окремих найтрудомісткіших блоків програм використано автокод мікро-ЕОМ. Програми реалізовані в діалоговому режимі. Presented software package allows: 1) input and edition of amino acid sequences; 2) listing of aligned amino acid sequences of homologous protein; 3) pairwise comparison of homologous sequences; 4) calculation of phylogenetic trees of homologous protein sequences; 5) identification of variable and constant regions of amino acid sequences; 6) search for similarity between two amino acid sequences and list out comparison dot matrix; 7) prediction of B- and T-cell antigenic determinants; 8) trans forming Protein Identification Resource (PIR) from magnetic tape media to «Iskra-226» floppy disk media and vice versa; 9) identification of structure gene fragments using a set of peptides;. 10) translation of structure genes containing introns. Programs are written in BASIC for a personal computer «Iskra-226» (USSR). To accelerate some operations, computer code commands are used. Software package is realized in interactive mode and intended for specialists on peptide and protein chemistry. Авторы признательны сотрудникам института Г. С. Монастырской,
 И. Е. Дулубовой за участие в постановке задач и ценные рекомендации, высказанные в процессе реализации отдельных программ пакета.
 Авторы благодаря т также Н. А. Фонину, Р. Р. Владимирову за помощь
 в составлении отдельных программ, В. Е. Костюшко — за изготовление
 накладной клавиатуры для ввода белковых последовательностей в
 трехбуквенном коде. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» Пакет прикладних програм для аналізу амінокислотних послідовностей на персональній мікро-ЕОМ «ИСКРА-226» A software package for analysing amino acid sequences by personal microcomputer «ISKRA-226» Article published earlier |
| spellingShingle | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» Костецкий, П.В. Артемьев, И.В. Пожильцова, О.И. Ульяшин, В.В. |
| title | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_alt | Пакет прикладних програм для аналізу амінокислотних послідовностей на персональній мікро-ЕОМ «ИСКРА-226» A software package for analysing amino acid sequences by personal microcomputer «ISKRA-226» |
| title_full | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_fullStr | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_full_unstemmed | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_short | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_sort | пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-эвм «искра-226» |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154147 |
| work_keys_str_mv | AT kosteckiipv paketprikladnyhprogrammdlâanalizaaminokislotnyhposledovatelʹnosteinapersonalʹnoimikroévmiskra226 AT artemʹeviv paketprikladnyhprogrammdlâanalizaaminokislotnyhposledovatelʹnosteinapersonalʹnoimikroévmiskra226 AT požilʹcovaoi paketprikladnyhprogrammdlâanalizaaminokislotnyhposledovatelʹnosteinapersonalʹnoimikroévmiskra226 AT ulʹâšinvv paketprikladnyhprogrammdlâanalizaaminokislotnyhposledovatelʹnosteinapersonalʹnoimikroévmiskra226 AT kosteckiipv paketprikladnihprogramdlâanalízuamínokislotnihposlídovnosteinapersonalʹníimíkroeomiskra226 AT artemʹeviv paketprikladnihprogramdlâanalízuamínokislotnihposlídovnosteinapersonalʹníimíkroeomiskra226 AT požilʹcovaoi paketprikladnihprogramdlâanalízuamínokislotnihposlídovnosteinapersonalʹníimíkroeomiskra226 AT ulʹâšinvv paketprikladnihprogramdlâanalízuamínokislotnihposlídovnosteinapersonalʹníimíkroeomiskra226 AT kosteckiipv asoftwarepackageforanalysingaminoacidsequencesbypersonalmicrocomputeriskra226 AT artemʹeviv asoftwarepackageforanalysingaminoacidsequencesbypersonalmicrocomputeriskra226 AT požilʹcovaoi asoftwarepackageforanalysingaminoacidsequencesbypersonalmicrocomputeriskra226 AT ulʹâšinvv asoftwarepackageforanalysingaminoacidsequencesbypersonalmicrocomputeriskra226 |