ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих
Проведены ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование кДНК-фрагмента, кодирующего N-концевой нуклеотидсвязывающий домен ( свертку Россмана) тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих. Впервые обнаружен уникальный вариант консервативного HIGH-подобного мотива, HVAY, в котором остаток глицина, считавший...
Gespeichert in:
| Datum: | 1996 |
|---|---|
| Hauptverfasser: | , , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russian |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1996
|
| Schriftenreihe: | Биополимеры и клетка |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154180 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих / О.В. Леванец, В.Г. Найденов, М.И. Вудмаска, К.А. Одынец, Г.X. Мацука, А.И. Корнелюк // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 5. — С. 66-71. — Бібліогр.: 19 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154180 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-1541802025-02-09T09:37:28Z ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих ПЛР-ампліфікація, клонування та секвенування фрагмента кДНК, що кодує нуклеотидзв'язуючий домен тирозил-тРНК синтетази ссавців PCR amplification, cloning and sequencing of cDNA fragment encoding a nucleotide binding domain of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase Леванец, О.В. Найденов, В.Г. Вудмаска, М.И. Одынец, К.А. Мацука, Г.Х. Корнелюк, А.И. Проведены ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование кДНК-фрагмента, кодирующего N-концевой нуклеотидсвязывающий домен ( свертку Россмана) тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих. Впервые обнаружен уникальный вариант консервативного HIGH-подобного мотива, HVAY, в котором остаток глицина, считавшийся ранее абсолютно консервативным для всех аминоацил-тРНК синтетаз I структурного класса, заменен на остаток аланина. Проведено ПЛР-ампліфікацію, клонування та секвенування кДНК-фрагмента, шо кодує N-кінцевий нуклеотидзв'язуючий домен (згортку Россмана) тирозил-тРНК синтетази ссавців. Вперше виявлено унікальний варіант консервативного HIGH-подібного мотиву, HVAY, у якому залишок гліцину, що раніше вважався абсолютно консервативним для всіх АРСаз І структурного класу, замінений на залишок аланіну. cDNA fragment encoding the N-terminal nucleotide binding domain (Rossmann fold) of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase has been PCR-amplified, cloned and sequenced. The unique variant of conservative HIGH-like motif, HVA Y, where glycine residue was substituted by alanine, has been observed for the first time. 1996 Article ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих / О.В. Леванец, В.Г. Найденов, М.И. Вудмаска, К.А. Одынец, Г.X. Мацука, А.И. Корнелюк // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 5. — С. 66-71. — Бібліогр.: 19 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00044B https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154180 577.217.32 ru Биополимеры и клетка application/pdf Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| description |
Проведены ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование кДНК-фрагмента, кодирующего N-концевой нуклеотидсвязывающий домен ( свертку Россмана) тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих. Впервые обнаружен уникальный вариант консервативного HIGH-подобного мотива, HVAY, в котором остаток глицина, считавшийся ранее абсолютно консервативным для всех аминоацил-тРНК синтетаз I структурного класса, заменен на остаток аланина. |
| format |
Article |
| author |
Леванец, О.В. Найденов, В.Г. Вудмаска, М.И. Одынец, К.А. Мацука, Г.Х. Корнелюк, А.И. |
| spellingShingle |
Леванец, О.В. Найденов, В.Г. Вудмаска, М.И. Одынец, К.А. Мацука, Г.Х. Корнелюк, А.И. ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих Биополимеры и клетка |
| author_facet |
Леванец, О.В. Найденов, В.Г. Вудмаска, М.И. Одынец, К.А. Мацука, Г.Х. Корнелюк, А.И. |
| author_sort |
Леванец, О.В. |
| title |
ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих |
| title_short |
ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих |
| title_full |
ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих |
| title_fullStr |
ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих |
| title_full_unstemmed |
ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих |
| title_sort |
пцр-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кднк, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-трнк синтетазы млекопитающих |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
1996 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154180 |
| citation_txt |
ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих / О.В. Леванец, В.Г. Найденов, М.И. Вудмаска, К.А. Одынец, Г.X. Мацука, А.И. Корнелюк // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 5. — С. 66-71. — Бібліогр.: 19 назв. — рос. |
| series |
Биополимеры и клетка |
| work_keys_str_mv |
AT levanecov pcramplifikaciâklonirovanieisekvenirovaniefragmentakdnkkodiruûŝegonukleotidsvâzyvaûŝijdomentiroziltrnksintetazymlekopitaûŝih AT najdenovvg pcramplifikaciâklonirovanieisekvenirovaniefragmentakdnkkodiruûŝegonukleotidsvâzyvaûŝijdomentiroziltrnksintetazymlekopitaûŝih AT vudmaskami pcramplifikaciâklonirovanieisekvenirovaniefragmentakdnkkodiruûŝegonukleotidsvâzyvaûŝijdomentiroziltrnksintetazymlekopitaûŝih AT odynecka pcramplifikaciâklonirovanieisekvenirovaniefragmentakdnkkodiruûŝegonukleotidsvâzyvaûŝijdomentiroziltrnksintetazymlekopitaûŝih AT macukagh pcramplifikaciâklonirovanieisekvenirovaniefragmentakdnkkodiruûŝegonukleotidsvâzyvaûŝijdomentiroziltrnksintetazymlekopitaûŝih AT kornelûkai pcramplifikaciâklonirovanieisekvenirovaniefragmentakdnkkodiruûŝegonukleotidsvâzyvaûŝijdomentiroziltrnksintetazymlekopitaûŝih AT levanecov plramplífíkacíâklonuvannâtasekvenuvannâfragmentakdnkŝokoduênukleotidzvâzuûčijdomentiroziltrnksintetazissavcív AT najdenovvg plramplífíkacíâklonuvannâtasekvenuvannâfragmentakdnkŝokoduênukleotidzvâzuûčijdomentiroziltrnksintetazissavcív AT vudmaskami plramplífíkacíâklonuvannâtasekvenuvannâfragmentakdnkŝokoduênukleotidzvâzuûčijdomentiroziltrnksintetazissavcív AT odynecka plramplífíkacíâklonuvannâtasekvenuvannâfragmentakdnkŝokoduênukleotidzvâzuûčijdomentiroziltrnksintetazissavcív AT macukagh plramplífíkacíâklonuvannâtasekvenuvannâfragmentakdnkŝokoduênukleotidzvâzuûčijdomentiroziltrnksintetazissavcív AT kornelûkai plramplífíkacíâklonuvannâtasekvenuvannâfragmentakdnkŝokoduênukleotidzvâzuûčijdomentiroziltrnksintetazissavcív AT levanecov pcramplificationcloningandsequencingofcdnafragmentencodinganucleotidebindingdomainofmammaliantyrosyltrnasynthetase AT najdenovvg pcramplificationcloningandsequencingofcdnafragmentencodinganucleotidebindingdomainofmammaliantyrosyltrnasynthetase AT vudmaskami pcramplificationcloningandsequencingofcdnafragmentencodinganucleotidebindingdomainofmammaliantyrosyltrnasynthetase AT odynecka pcramplificationcloningandsequencingofcdnafragmentencodinganucleotidebindingdomainofmammaliantyrosyltrnasynthetase AT macukagh pcramplificationcloningandsequencingofcdnafragmentencodinganucleotidebindingdomainofmammaliantyrosyltrnasynthetase AT kornelûkai pcramplificationcloningandsequencingofcdnafragmentencodinganucleotidebindingdomainofmammaliantyrosyltrnasynthetase |
| first_indexed |
2025-11-25T10:26:46Z |
| last_indexed |
2025-11-25T10:26:46Z |
| _version_ |
1849757699300917248 |
| fulltext |
ISSN 0233-7657. Биополимеры и клетка. 1996. Т. 12. № 5
ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование
фрагмента кДНК, кодирующего нуклеотидсвязывающий
домен тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих
О. В. Леванец, В. Г. Найденов, М. И. Вудмаска, К. А. Одынец,
Г. X. Мацука, А. И. Корнелюк*
Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины
252143, Киев, ул. Академика Заболотного, 150
Проведены ПЦР-амплификация, клонирование и секвенирование кДНК-фрагмен-
та, кодирующего N-концевой нуклеотидсвязывающий домен ( свертку Россмана)
тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих. Впервые обнаружен уникальный ва-
риант консервативного HIGH-подобного мотива, HVAY, в котором остаток
глицина, считавшийся ранее абсолютно консервативным для всех аминоацил-
тРНК синтетаз I структурного класса, заменен на остаток аланина.
Введение. Аминоацил-тРНК синтетазы (АРСазы, КФ 6. 1. 1.) — ключевые
ферменты аппарата биосинтеза бедка клетки [1]. В последние годы были
достигнуты значительные успехи в исследовании первичной и пространст-
венной структуры синтетаз из прокариот и низших эукариот, что позволило
выделить два структурных класса АРСаз [2, 3 ]. АРСазы I класса содержат
нуклеотидсвязывающий домен — свертку Россмана, — обнаруженную ранее
в дегидрогеназах [4], и характеризуются наличием консервативных струк-
турных мотивов HIGH и KMSKS в N-концевом домене [3, 5]. Для АРСаз
класса II характерно наличие трех других относительно консервативных
последовательностей в различных частях полипептидной цепи, а в их
пространственной структуре вместо свертки Россмана имеется альтернатив-
ный АТР-связывающий домен [6, 7 ]. Следует отметить, что АРСазы
высших эукариот отличаются более сложной структурой по сравнению с их
прокариотическими аналогами и обычно имеют N- или С-концевые удлине-
ния полипептидной цепи, обусловленные необходимостью выполнения ими
некоторых дополнительных функций [8 ].
Тирозил-тРНК синтетаза (КФ 6. 1. 1. 1) из печени быка, выделенная
и изученная нами ранее [9—13], представляет собой димер а2-типа с
молекулярной массой 2 * 59 кДа. Иммунохимическое исследование тиро-
зил-тРНК синтетазы с использованием моноклональных антител [10] пока-
зало наличие антигенной детерминанты, которая эволюционно приобретена
только тирозил-тРНК синтетазами высших эукариот и отсутствует у ни-
зших эукариот (дрожжи) и бактерий [11]. С использованием методов
селективных химических модификаций изучена структура активного цент-
* Correspondence address.
© о . в. ЛЕВАНЕЦ, В. Г- НАЙДЕНОВ, М. И- ВУДМАСКА, К. А. ОДЫНЕЦ. Г- X. МАЦУКА.
А. И. КОРНЕЛЮК, 1996
66
ПЦР—АМПЛИФИКАЦИЯ, КЛОНИРОВАНИЕ И СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ра бычьей тирозил-тРНК синтетазы и установлена функциональная роль
остатков гистидина и лизина в реакции аминоацилирования тРНКТуг [12,
13].
Для дальнейшего структурно-функционального анализа эукариотиче-
ской тирозил-тРНК синтетазы необходимо знание ее первичной структуры.
В данной работе нами определена первичная структура N-концевого поли-
пептидного фрагмента бычьей тирозил-тРНК синтетазы путем ПЦР-ампли-
фикации, клонирования и секвенирования соответствующего кДНК-фраг-
мента.
Материалы и методы. Получение и секвенирование пептидных фраг-
ментов. Тирозил-тРНК синтетазу печени быка, выделенную, как описано
ранее [9], дополнительно очищали ВЭЖХ в обращенной фазе на колонке
RP-304 («BioRad», США) или Nucleosil С-18 («Macherey-Nagel»). Белок
расщепляли BrCN по стандартной методике в 70 %-м растворе муравьиной
кислоты при соотношении BrCN /Met = 60 (или больших), используя
1—10 М раствор BrCN в ацетонитриле. Полученные BrCN-фрагменты
разделяли обращеннофазовой ВЭЖХ, длину пептидных фрагментов опреде-
ляли гель-электрофорезом. N-концевые аминокислотные последовательно-
сти фрагментов BrCN-расщепления белка определяли на газофазном секве-
наторе фирмы «Applied Biosystems» (модель 477А), снабженном автомати-
ческим анализатором РТН-аминокислот (модель 120А).
Выбор праймеров для полимеразной цепной реакции. Для проведения
ПЦР синтезированы две пары олигонуклеотидных праймеров:
1) Z2 (+)-праймер 5'-AAGAGAAACTGCАССТТАТСACCCG-3'
РМ (-)-праймер 5 -GCCTGTTAATCCTGGAACCATAGG-3';
2) 23(+)-праймер 5'-GAGAATTCAAGAGAAACTGCACCTTATCACCCG-3'
РМ2 (-)-праймер 5'-GAGGATCCGCCTGTTAATCCTGGAACCATAGG-3'.
Вторая пара праймеров содержит сайты рестрикции EcoRI и ВатНІ
соответственно для последующего клонирования продукта ПЦР. Синтез
олигонуклеотидных праймеров проведен фирмой «Biomaster» (Москва).
Проведение полимеразной цепной реакции Реакционная смесь в объеме
20 мкл содержала 150 нг матричной ДНК (в качестве матрицы использован
суммарный препарат кДНК печени быка), 20 пмоль каждого праймера,
200 мкмоль каждого dNTP, Іхреакциошшй буфер и 3 ед. ДНК-полимеразы
TetZ («Biomaster», Москва). Проводили 30 циклов амплификации по
следующей программе: денатурация матрицы в течение 40 с при 94 °С,
отжиг праймеров в течение 60 с при 60 °С, достройка праймеров в течение
90 с при 72 °С. В первом цикле денатурацию матрицы осуществляли в
течение 90 с, после завершения реакции образец дополнительно инкубиро-
вали при 72 °С в течение 10 мин. Для последующего клонирования продукт
реакции с использованием праймеров Z2 и РМ затем реамплифицировали в
присутствии праймеров Z3 и РМ2, содержащих «липкие» концы.
Клонирование продуктов ПЦР. Продукт ПЦР, полученный с использо-
ванием праймеров Z3 и РМ2, обрабатывали эндонуклеазами рестрикции
EcoRI и ВатНІ и лидировали с обработанной указанными рестриктазами
ДНК плазмиды pUC119. Лигазную смесь использовали для трансформации
компетентных клеток Escherichia coli XL-1 Blue, полученных согласно [14].
Рекомбинантные клоны анализировали методом рестрикционного анализа
по сайтам EcoRI и ВатНІ и амплификацией плазмидной ДНК рекомбинан-
тных клонов с использованием специфических праймеров Z3 и РМ2. При
клонировании продуктов ПЦР использовали эндонуклеазы рестрикции
EcoRI и ВатНІ производства «Biomaster», набор для лигирования «Ready-
To-Go Т4 DNA Ligase» («Pharmacia Biotech»).
Секвенирование ДНК. Из полученных рекомбинантных клонов выделя-
ли плазмидную ДНК методом щелочного лизиса [15]. ДНК секвенировали
67
ЛБВАНБІІ О. В. И ДР.
68
по методу Сэнгера с помощью стандартных М13 прямого и обратного
праймеров. Использовали набор реактивов «Sequenase Version 2.0 DNA
Sequencing Kit» <<<USB»,), радиоактивные изотопы [a-32P]dATP («Радиопре-
парат», Ташкент) и [a-35S]dATP («Amersham», Англия). Полученные нук-
леотидные последовательности анализировали с помощью пакета программ
PCGENE.
Результаты и обсуждение. Аминокислотные последовательности BrCN-
фрагментов бычьей тирозил-тРНК синтетазы были определены как для
основной формы тирозил-тРНК синтетазы (Мг 2 х 59 кДа), так и для ее
протеолитически модифицированной формы (2 х 39 кДа). Сравнение
полученных аминокислотных последовательностей с первичной структурой
дрожжевой цитоплазматической тирозил-тРНК синтетазы (Р36421) [16]
показало, что три BrCN-пептида гомологичны участкам 61—86, 109—140 и
218—254 дрожжевой синтетазы.
Для амплификации специфической последовательности кДНК, кодиру-
ющей фрагмент тирозил-тРНК синтетазы печени быка, были выбраны
праймеры Z2 и РМ. Последовательность праймера РМ выведена на основе
анализа гомологии возможной нуклеотидной последовательности, кодирую-
щей BrCN-пептид тирозил-тРНК синтетазы печени быка, и последователь-
ности F11457 (GenBank), отнесенной к изологам тирозил-тРНК синтетазы
человека. Праймер Z2 выбран как часть экспрессируемой последовательно-
сти человека Z13627 (GenBank), гомологичной дрожжевой цитоплазматиче-
ской тирозил-тРНК синтетазе [16]. Выбранные праймеры анализировали с
помощью программы PCRPLAN из пакета PCGENE.
В результате проведения ПЦР с использованием праймеров Z2 и РМ
синтезирован продукт длиной около 600 п. н., который затем реамплифи-
цировали с Z3 и РМ2, содержащими сайты рестрикции EcoRI и ВатНІ
ПЦР—АМПЛИФИКАЦИЯ, КЛОНИРОВАНИЕ И СЕКВЕНИРОВАНИЕ
соответственно, для его последующего клонирования в заданной ориента-
ции, Секвенированием по Сэнгеру определена полная нуклеотидная после-
довательность ПЦР-амплифицированного фрагмента ДНК, длина которого
составила 638 п. н. На схеме 1 приведена нуклеотидная последовательность
расшифрованного кДНК-фрагмента (без последовательности праймеров), а
также выведенная соответствующая аминокислотная последовательность.
Анализ аминокислотной последовательности показал, что внутренние
фрагменты MSKI...LDN и MLKS...YRL соответствуют последовательностям
пептидов BrCN-расщепления В11 88 и В1491 соответственно. Это позволяет
считать, что амплифицированный кДНК-фрагмент действительно кодирует
часть полипептидной цепи бычьей тирозил-тРНК синтетазы.
На схеме 2 представлено сравнение аминокислотной последовательно-
сти, кодируемой полученным ДНК-фрагментом (YBta — бык, Bos taurus), і
тирозил-тРНК синтетазами низших эукариот (YSce — дрожжи,
Saccharomyces cerevisiae, Swiss-Prot Р36421, [16]) и прокариот (YEco — Е.
coli, Swiss-Prot Р00951, [17] и YBst — Bacillus s tear other mophilus, Swiss-
Prot P00952, [18]). Отмечены консервативные аминокислотные остатки и
положение мотива HIGH.
В расшифрованной нами аминокислотной последовательности тирозил-
тРНК синтетазы высших эукариот впервые обнаружен уникальный вариант
консервативного HIGH-подобного мотива, а именно: 49-HVAY-52, в кото-
ром остаток глицина, считавшийся ранее абсолютно консервативным у всех
АРСаз I класса [3 ], заменен на остаток аланина. Можно предположить, что
эта необычная аминокислотная замена не меняет существенно характера
участия этого мотива в функции синтетазы, т. е. в образовании участка
связывания аденинового кольца АТР, как это описано для тирозил-тРНК
синтетазы В. stearothermophilus [19].
69
ЛЕВАНЕЦ О. В. И ДР.
Из сравнения аминокислотных последовательностей тирозил-тРНК син-
тетаз быка и дрожжей видно, что участок 72-LFADLHAYL-80 очень
консервативен. Его положение при выравнивании аминокислотных последо-
вательностей примерно соответствует таковому характерного мотива IGDP,
имеющегося у большинства тирозил-тРНК синтетаз прокариот и митохонд-
рий и вовлеченного через остаток Asp во взаимодействие с субстратным
L-тирозином (D78 у тирозил-тРНК синтетазы В. stearothermophilus [19]).
Можно предположить по аналогии ту же функцию и для остатка D75 у
эукариотических тирозил-тРНК синтетаз.
В аминокислотной последовательности фрагмента бычьей тирозил-
тРНК синтетазы можно выделить элементы нуклеотидсвязывающего фраг-
мента (свертки Россмана): части I и II, которые разделены соединительным
полипептидом I (см. схему 2). Следует отметить, что в обеих частях свертки
Россмана наблюдается более высокая гомология аминокислотных последова-
тельностей эукариотических и бактериальных тирозил-тРНК синтетаз, чем
в области соединительного полипептида.
Данная последовательность нуклеотидсвязывающего фрагмента тиро-
зил-тРНК синтетазы быка депонирована в GenBank под номером Х96373.
О. В. Леванець, В. Г. Найденов, М. I. Вудмаска, К. О. Одинець, Г. X. Мацука, О. I. Корнелюк
ПЛР-ампліфікація, клонування та секвенування фрагмента кДНК, що кодує
нуклеотидзв'язуючий домен тирозил-тРНК синтетази ссавців
Резюме
Проведено ПЛР-ампліфікацію, клонування та секвенування кДНК-фрагмента, шо кодує N-кін-
цевий нуклеотидзв'язуючий домен (згортку Россмана) тирозил-тРНК синтетази ссавців. Впер-
ше виявлено унікальний варіант консервативного HIGH-подібного мотиву, HVAY, у якому зали-
шок гліцину, що раніше вважався абсолютно консервативним для всіх АРСаз І структурного
класу, замінений на залишок аланіну.
О. V. Levanets, V. G. Naidenov, М. I. Woodmaska, К A. Odynets, G. Н. Matsuka, А. I. Kornelyuk
PCR amplification, cloning and sequencing of cDNA fragment encoding a nucleotide binding domain
of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase
Summary
cDNA fragment encoding the N-terminal nucleotide binding domain (Rossmann fold) of mammalian
tyrosyl-tRNA synthetase has been PCR-amplified, cloned and sequenced. The unique variant of conserva-
tive HIGH-like motif HVAY, where glycine residue was substituted by alanine, has been observed for the
first time.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Киселев JI. JI., Фаворова О. О., Лаврик О. И. Биосинтез белков от аминокислот до
аминоацил-тРНК.—М.: Наука, 1984.—405 с.
2. Schimmel P. Classes of APSases and the establishment of the genetic code / / TIBS.—1991.—
16, N 1.—P. 1—3.
3. Moras D. Aminoacyl-tRNA synthetases / / Curr. Biol.—1992.—2.—P. 138—142.
4. Rossmann M. G., Moras D., Olsen К W. Chemical and biological evoluion of a nucleotide
binding domain / / Nature.—1974.—250.—P. 194—199.
5. Bhat T. N., Blow D. M., Brick P. Tyrosyl-tRNA synthetase forms a mononucleotide binding
fold 11 J. Мої. Biol.—1982.—158.—P. 699—709.
6. Eriani G., Delaure M., Poch O. et al Partitition of tRNA synthetases into two classes based on
mutually exclusive sets of sequence motifs / / Nature.—1990.—347.—P. 203—206.
7. Cusack S., Berlhet-Colominas C.t Hartlein M. et al. A second class of synthetases structure
revealed by X-rays analysis of Escherichia coli seryl-tRNA synthetase at 2.5 A / / Ibid.—
P. 249—255.
8. Mirande M. Aminoacyl-tRNA synthetase family from prokaryotes and eukaryotes. Structural
domains and their implications / / Progr. Nucl. Acid Res. Мої. Biol.—1991.—40.—P. 95—142.
70
ПЦР—АМПЛИФИКАЦИЯ, КЛОНИРОВАНИЕ И СЕКВЕНИРОВАНИЕ
9. Корнелюк А. Я., Курочкин Я. В., Мацука Г. X. Тирозил-тРНК-синтетаза из печени быка.
Выделение и физико-химические свойства / / Молекуляр. биология.—1988.—-22, № 1.—
С. 176—186.
10. Рибкинска Т. А., Вартанян О. А , Филоненко В. В. и др. Метод селекции гибридом,
секретирующих моноклональные антитела, основанный на энзиматической активности
фермента П Биополимеры и клетка.—1990.—6, № 4.—С. 97—101.
11. Рибкинска Т. А , Корнелюк А Я., Берестень С. Ф., Мацука Г. X. Иммунохимический
подход к изучению структуры тирозил-тРНК-синтетазы из печени быка / / Там же.—
1991.—7, № 6.—С. 33—36.
12. Гнатенко Д. В., Корнелюк А. Я., Мацука Г. X. Тирозил-тРНК синтетаза из печени быка.
Изучение функциональной роли остатков гистидина / / Биоорг. химия.—1991.—17,
№ 8.—С. 1033—1037.
13. Гнатенко Д. В., Корнелюк А. Я., Лаврик О. И. Химическая модификация остатков
лизина тирозил-тРНК синтетазы из печени быка с помощью пиридоксаль-5'-фосфата / /
Биохимия.—1991.—56, № 11.—С. 56—60.
14. Nishimura A , Morita М., Nishimura J., Sugino J. A rapid and highly efficient method for
preparation of competent E. coli cells / / Nucl. Acids Res.—1990.—18.—P. 6169.
15. Birnboim H. C., Doly J. A rapid alkaline extraction method for screening recombinant plasmid
DNA / / Ibid.—1979.—7.—P. 1513—1522.
16. Chow С. M., RajBhandary U. L. Saccharomyces. cerevisiae cytoplasmic tyrosyl-tRNA synthetase
gene / / J. Biol. Chem.—1993.—268, N 17.—P. 12885—12863.
17. Barker D. G., Bruton C. /., Winter G. The tyrosyl-tRNA synthetase from Escherichia coli.
Complete nucleotide sequence of the structural gene 11 FEBS Lett.—1982.—150.—P. 419—
423.
18. Winter G., Koch G. L. E.t Hartley В. 5., Barker D. G. The amino acid sequence of
tyrosyl-tRNA synthetase from Bacillus stearothermophilus II Eur. J. Biochem.—1983.—132.—
P. 383—387.
19. Brick P., Bhat T. N., Blow D. M. Structure of tyrosyl-tRNA synthetase refined at 2.3 A
resolution. Interaction of the enzyme with tyrosyl adenylate intermediate / / J . Мої. Biol.—
1988.—208.—P. 83—98.
УДК 577.217.32 Поступила в редакцию 28.10.96
71
|