Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження

Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження

Мета. Використовуючи найпростіші молекулярні моделі – пари основ ДНК, одна з яких є іонізованою, та електронейтральні й іонізовані ДНК-подібні конформери канонічних нуклеозидів, теоретично дослідити адекватність іонізаційного механізму виникнення спонтанних транзицій. Методи. Неемпірична квантова хі...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Вiopolymers and Cell
Datum:2010
Hauptverfasser: Броварець, О.О., Жураківський, Р.О., Говорун, Д.М.
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2010
Schlagworte:
Molecular Biophysics
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154188
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження / О.О. Броварець, Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 5. — С. 398-405. — Бібліогр.: 31 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154188
record_format dspace
spelling Броварець, О.О.
Жураківський, Р.О.
Говорун, Д.М.
2019-06-15T09:49:29Z
2019-06-15T09:49:29Z
2010
Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження / О.О. Броварець, Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 5. — С. 398-405. — Бібліогр.: 31 назв. — укр.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00016F
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154188
577.3
Мета. Використовуючи найпростіші молекулярні моделі – пари основ ДНК, одна з яких є іонізованою, та електронейтральні й іонізовані ДНК-подібні конформери канонічних нуклеозидів, теоретично дослідити адекватність іонізаційного механізму виникнення спонтанних транзицій. Методи. Неемпірична квантова хімія, фізико-хімічна кінетика, аналіз топології електронної густини за Бейдером. Результати. Показано, що на рівні пар основ іонізаційний механізм виникнення транзицій не гарантує жодних переваг у порівнянні з іншими механізмами, представленими в літературі. Проте протонування/депротонування основ у складі будь-якого канонічного нуклеозиду суттєво збурює ДНК-подібні конформації останнього. Висновки. Іонізаційний механізм не може претендувати на вичерпне пояснення природи спонтанних транзицій.
Aim. To investigate theoretically the adequacy of the ionization mechanism of the spontaneous transitions appearance, using simple molecular models – DNA base pairs, one of which is ionized, and electroneutral and ionized DNA-like conformers of canonical nucleosides. Methods. Non-empirical quantum chemistry, physicochemical kinetics and analysis of the electron density by means of Bader’s atoms in molecules (AIM) theory were used. Results. It is established at base pairs that the ionization mechanism of transitions origin doesn’t imply any advantages in comparison with other mechanisms described in literature. However, the protonation/deprotonation of base in any canonical nucleoside significantly perturbs DNA-like conformations of the latter. Conclusions. The ionization mechanism can’t explain entirely the nature of the spontaneous transitions.
Цель. Используя простые молекулярные модели – пары оснований ДНК, однo из которых является ионизированным, а также электронейтральные и ионизированные ДНК-подобные конформеры канонических нуклеозидов, теоретически исследовать адекватность ионизационного механизма возникновения спонтанных транзиций. Методы. Неэмпирическая квантовая химия, физико-химическая кинетика, анализ топологии электронной плотности по Бейдеру. Результаты. Показано, что на уровне пар оснований ионизационный механизм возникновения транзиций не гарантирует никаких преимуществ по сравнению с другими механизмами, представленными в литературе. Однако протонирование/депротонирование оснований в составе любого канонического нуклеозида существенно изменяет ДНК-подобные конформации последнего. Выводы. Ионизационный механизм не может претендовать на исчерпывающее объяснение природы спонтанных транзиций.
uk
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Molecular Biophysics
Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження
Is there adequate ionization mechanism of the spontaneous transitions? Quantum-chemical investigation
Адекватен ли ионизационный механизм спонтанных транзиций? Квантово-химическое исследование
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження
spellingShingle Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження
Броварець, О.О.
Жураківський, Р.О.
Говорун, Д.М.
Molecular Biophysics
title_short Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження
title_full Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження
title_fullStr Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження
title_full_unstemmed Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження
title_sort чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? квантово-хімічне дослідження
author Броварець, О.О.
Жураківський, Р.О.
Говорун, Д.М.
author_facet Броварець, О.О.
Жураківський, Р.О.
Говорун, Д.М.
topic Molecular Biophysics
topic_facet Molecular Biophysics
publishDate 2010
language Ukrainian
container_title Вiopolymers and Cell
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Is there adequate ionization mechanism of the spontaneous transitions? Quantum-chemical investigation
Адекватен ли ионизационный механизм спонтанных транзиций? Квантово-химическое исследование
description Мета. Використовуючи найпростіші молекулярні моделі – пари основ ДНК, одна з яких є іонізованою, та електронейтральні й іонізовані ДНК-подібні конформери канонічних нуклеозидів, теоретично дослідити адекватність іонізаційного механізму виникнення спонтанних транзицій. Методи. Неемпірична квантова хімія, фізико-хімічна кінетика, аналіз топології електронної густини за Бейдером. Результати. Показано, що на рівні пар основ іонізаційний механізм виникнення транзицій не гарантує жодних переваг у порівнянні з іншими механізмами, представленими в літературі. Проте протонування/депротонування основ у складі будь-якого канонічного нуклеозиду суттєво збурює ДНК-подібні конформації останнього. Висновки. Іонізаційний механізм не може претендувати на вичерпне пояснення природи спонтанних транзицій. Aim. To investigate theoretically the adequacy of the ionization mechanism of the spontaneous transitions appearance, using simple molecular models – DNA base pairs, one of which is ionized, and electroneutral and ionized DNA-like conformers of canonical nucleosides. Methods. Non-empirical quantum chemistry, physicochemical kinetics and analysis of the electron density by means of Bader’s atoms in molecules (AIM) theory were used. Results. It is established at base pairs that the ionization mechanism of transitions origin doesn’t imply any advantages in comparison with other mechanisms described in literature. However, the protonation/deprotonation of base in any canonical nucleoside significantly perturbs DNA-like conformations of the latter. Conclusions. The ionization mechanism can’t explain entirely the nature of the spontaneous transitions. Цель. Используя простые молекулярные модели – пары оснований ДНК, однo из которых является ионизированным, а также электронейтральные и ионизированные ДНК-подобные конформеры канонических нуклеозидов, теоретически исследовать адекватность ионизационного механизма возникновения спонтанных транзиций. Методы. Неэмпирическая квантовая химия, физико-химическая кинетика, анализ топологии электронной плотности по Бейдеру. Результаты. Показано, что на уровне пар оснований ионизационный механизм возникновения транзиций не гарантирует никаких преимуществ по сравнению с другими механизмами, представленными в литературе. Однако протонирование/депротонирование оснований в составе любого канонического нуклеозида существенно изменяет ДНК-подобные конформации последнего. Выводы. Ионизационный механизм не может претендовать на исчерпывающее объяснение природы спонтанных транзиций.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154188
citation_txt Чи є адекватним іонізаційний механізм спонтанних транзицій? Квантово-хімічне дослідження / О.О. Броварець, Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 5. — С. 398-405. — Бібліогр.: 31 назв. — укр.
work_keys_str_mv AT brovarecʹoo čiêadekvatnimíonízacíiniimehanízmspontannihtranzicíikvantovohímíčnedoslídžennâ
AT žurakívsʹkiiro čiêadekvatnimíonízacíiniimehanízmspontannihtranzicíikvantovohímíčnedoslídžennâ
AT govorundm čiêadekvatnimíonízacíiniimehanízmspontannihtranzicíikvantovohímíčnedoslídžennâ
AT brovarecʹoo isthereadequateionizationmechanismofthespontaneoustransitionsquantumchemicalinvestigation
AT žurakívsʹkiiro isthereadequateionizationmechanismofthespontaneoustransitionsquantumchemicalinvestigation
AT govorundm isthereadequateionizationmechanismofthespontaneoustransitionsquantumchemicalinvestigation
AT brovarecʹoo adekvatenliionizacionnyimehanizmspontannyhtranziciikvantovohimičeskoeissledovanie
AT žurakívsʹkiiro adekvatenliionizacionnyimehanizmspontannyhtranziciikvantovohimičeskoeissledovanie
AT govorundm adekvatenliionizacionnyimehanizmspontannyhtranziciikvantovohimičeskoeissledovanie
first_indexed 2025-11-30T09:51:05Z
last_indexed 2025-11-30T09:51:05Z
_version_ 1850857111003594752

Ähnliche Einträge