Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека

Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека

Проанализировано распределение интегрированных провирусов HTLV-I (вирус Т-клеточной лейке­мии человека типа 1) и HIV-I (вирус иммунодефицита человека типа 1) в геноме пациентов с различными проявлениями и стадиями инфекции, используя новую методику фракционирования ДНК в пологом градиенте CsCl в при...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Биополимеры и клетка
Date:2000
Main Authors: Цыба, Л.А., Зубак, С.В., Тряпицина-Гулей, Н., Бернарди, Дж., Рындич, А.В.
Format: Article
Language:Russian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2000
Subjects:
Вирусы и клетка
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154219
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека / Л.А. Цыба, С.В. Зубак, Н. Тряпицина-Гулей, Дж. Бернарди, А.В. Рындич // Биополимеры и клетка. — 2000. — Т. 16, № 6. — С. 547-558. — Бібліогр.: 47 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154219
record_format dspace
spelling Цыба, Л.А.
Зубак, С.В.
Тряпицина-Гулей, Н.
Бернарди, Дж.
Рындич, А.В.
2019-06-15T10:53:49Z
2019-06-15T10:53:49Z
2000
Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека / Л.А. Цыба, С.В. Зубак, Н. Тряпицина-Гулей, Дж. Бернарди, А.В. Рындич // Биополимеры и клетка. — 2000. — Т. 16, № 6. — С. 547-558. — Бібліогр.: 47 назв. — рос.
0233-7657
DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.000596
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154219
578.264.3
Проанализировано распределение интегрированных провирусов HTLV-I (вирус Т-клеточной лейке­мии человека типа 1) и HIV-I (вирус иммунодефицита человека типа 1) в геноме пациентов с различными проявлениями и стадиями инфекции, используя новую методику фракционирования ДНК в пологом градиенте CsCl в присутствии двух маркеров плавучей плотности. Основные пики распределения GC-богатых последовательностей HTLV-I в 18 исследуемых случаях были локали­зованы в GC-богатых (> 44 % GC) участках генома человека, составляющих 30 % генома и содержащих транскрипционно активные провирусы HTLV-I. У пациентов с Т-клеточной лейкемией (ATL) вирусные последовательности не были обнаружены в участках генома, GC-состав которых ниже 44 %. Более широкое и мультимодальное распределение HTLV-I (в районе 38–54,8 % GC) установлено для пациентов с тропическим спастическим парапарезом (TSP/HAM) и асимптоматических вирусоносителей. GC-бедные провирусы HJV-1 обнаружены как в GC-бедных, так и в GC-богатых компартментах геномов 27 пациентов с разным уровнем виремии. Для пациентов с высоким уровнем вирусной продукции показано более высокое содержание последовательностей HIV-1 в GC-бедных участках генома. Полученные результаты свидетельствуют о неравномерном распределении in vivo интегрированных провирусов в компартментах генома клетки и в более широком диапазоне, чем in vitro.
Проаналізовано розподіл інтегрованих провірусів HTLV-I (ві­рус Т-клітинної лейкемії людини типу І) і HIV-1 (вірус имунодефіщіту людини типу 1) в геномі пацієнтів з різними проявами та стадіями інфекції, використовуючи нову мето­дику фракціонування ДНК у пологому градієнті CsCl у присут­ності двох маркерів плавучої густини. Основні піки розподілу GC-багатих послідовностей HTLV-I у 18 досліджуваних випад­ках були локалізовані в GC-багатих (>44 % GC) ділянках геному людини, які складають ЗО % геному і містять транс­крипційно активні провіруси HTLV-I. У пацієнтів з Т-клітинною лейкемією (ATL) вірусних послідовностей не було виявлено в ділянках геному, GC-склад яких нижче від 44 %. Більш, широкий і мультимодальний розподіл HTLV-I (у межах 38–54,8 % GC) встановлено в лімфоцитах пацієнтів з тропічним спастичним парапарезом (TSP/HAM) та в асимптоматичних вірусоносіїв. GC-бідні провіруси HIV-1 виявлено як у GC-бідних, так і в GC-багатих компартментах геномів 27 пацієнтів з різним рівнем віремії. Для пацієнтів з високим рівнем вірусної продукції показано вищий вміст послідов­ностей H1V-1 в GC-бідних ділянках геному. Отримані резуль­тати свідчать про нерівномірний розподіл in vivo інтегро­ваних провірусів в компартментах геному клітини та в більш широкому діапазоні % GC, ніж in vitro.
Localization of HTLV-1 (human T-cell leukemia virus type I) and H1V-1 (human immunodeficiency virus type 1) proviral sequences in compositional compartments of genomes of patients with different manifestation of infection have been studied by a new technique of centrifugation in shallow CsCl gradients with two buoyant density markers. The major peaks of distribution of GC-rich HTLV-I sequences in genomes of 18 patients were centered at GC-rich (> 44 % GC) regions of the human genome which usually account 30 % of the genome and contain transcriptionally active HTLV-I sequences (Zoubak et al. (1994) Gene 143, 155–163). In the case of patients with T-cell leukemia (ATL) viral sequences were not found below 44 % GC. Patients with TSP/HAM and asymptomatic carriers had a broader and multimodal distribution of HTLV-I (at 38–54,8 % GC) with minor peaks in GC-poorer regions. GC-poor HIV-1 proviruses were found in both GC-poor and GC-rich compartments of genomes of 27 patients with different levels of virus production. More intense peaks were centered at GC-rich regions for the patients with lower virus load. These results have revealed that the distribution of integrated proviruses in vivo is nonuniform in the compositional compartments of cell genome and broader than in vitro.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Вирусы и клетка
Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека
Композиційна специфічність інтеграції вірусів Т-клітинної лейкемії людини типу І і імунодефіциту людини типу 1 у геном людини
Compositional specificity of human T-cell leukemia virus type I and human immunodeficiency virus type 1 integration into the human genome
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека
spellingShingle Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека
Цыба, Л.А.
Зубак, С.В.
Тряпицина-Гулей, Н.
Бернарди, Дж.
Рындич, А.В.
Вирусы и клетка
title_short Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека
title_full Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека
title_fullStr Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека
title_full_unstemmed Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека
title_sort композиционная специфичность интеграции вирусов т-клеточной лейкемии человека типа i и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека
author Цыба, Л.А.
Зубак, С.В.
Тряпицина-Гулей, Н.
Бернарди, Дж.
Рындич, А.В.
author_facet Цыба, Л.А.
Зубак, С.В.
Тряпицина-Гулей, Н.
Бернарди, Дж.
Рындич, А.В.
topic Вирусы и клетка
topic_facet Вирусы и клетка
publishDate 2000
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Композиційна специфічність інтеграції вірусів Т-клітинної лейкемії людини типу І і імунодефіциту людини типу 1 у геном людини
Compositional specificity of human T-cell leukemia virus type I and human immunodeficiency virus type 1 integration into the human genome
description Проанализировано распределение интегрированных провирусов HTLV-I (вирус Т-клеточной лейке­мии человека типа 1) и HIV-I (вирус иммунодефицита человека типа 1) в геноме пациентов с различными проявлениями и стадиями инфекции, используя новую методику фракционирования ДНК в пологом градиенте CsCl в присутствии двух маркеров плавучей плотности. Основные пики распределения GC-богатых последовательностей HTLV-I в 18 исследуемых случаях были локали­зованы в GC-богатых (> 44 % GC) участках генома человека, составляющих 30 % генома и содержащих транскрипционно активные провирусы HTLV-I. У пациентов с Т-клеточной лейкемией (ATL) вирусные последовательности не были обнаружены в участках генома, GC-состав которых ниже 44 %. Более широкое и мультимодальное распределение HTLV-I (в районе 38–54,8 % GC) установлено для пациентов с тропическим спастическим парапарезом (TSP/HAM) и асимптоматических вирусоносителей. GC-бедные провирусы HJV-1 обнаружены как в GC-бедных, так и в GC-богатых компартментах геномов 27 пациентов с разным уровнем виремии. Для пациентов с высоким уровнем вирусной продукции показано более высокое содержание последовательностей HIV-1 в GC-бедных участках генома. Полученные результаты свидетельствуют о неравномерном распределении in vivo интегрированных провирусов в компартментах генома клетки и в более широком диапазоне, чем in vitro. Проаналізовано розподіл інтегрованих провірусів HTLV-I (ві­рус Т-клітинної лейкемії людини типу І) і HIV-1 (вірус имунодефіщіту людини типу 1) в геномі пацієнтів з різними проявами та стадіями інфекції, використовуючи нову мето­дику фракціонування ДНК у пологому градієнті CsCl у присут­ності двох маркерів плавучої густини. Основні піки розподілу GC-багатих послідовностей HTLV-I у 18 досліджуваних випад­ках були локалізовані в GC-багатих (>44 % GC) ділянках геному людини, які складають ЗО % геному і містять транс­крипційно активні провіруси HTLV-I. У пацієнтів з Т-клітинною лейкемією (ATL) вірусних послідовностей не було виявлено в ділянках геному, GC-склад яких нижче від 44 %. Більш, широкий і мультимодальний розподіл HTLV-I (у межах 38–54,8 % GC) встановлено в лімфоцитах пацієнтів з тропічним спастичним парапарезом (TSP/HAM) та в асимптоматичних вірусоносіїв. GC-бідні провіруси HIV-1 виявлено як у GC-бідних, так і в GC-багатих компартментах геномів 27 пацієнтів з різним рівнем віремії. Для пацієнтів з високим рівнем вірусної продукції показано вищий вміст послідов­ностей H1V-1 в GC-бідних ділянках геному. Отримані резуль­тати свідчать про нерівномірний розподіл in vivo інтегро­ваних провірусів в компартментах геному клітини та в більш широкому діапазоні % GC, ніж in vitro. Localization of HTLV-1 (human T-cell leukemia virus type I) and H1V-1 (human immunodeficiency virus type 1) proviral sequences in compositional compartments of genomes of patients with different manifestation of infection have been studied by a new technique of centrifugation in shallow CsCl gradients with two buoyant density markers. The major peaks of distribution of GC-rich HTLV-I sequences in genomes of 18 patients were centered at GC-rich (> 44 % GC) regions of the human genome which usually account 30 % of the genome and contain transcriptionally active HTLV-I sequences (Zoubak et al. (1994) Gene 143, 155–163). In the case of patients with T-cell leukemia (ATL) viral sequences were not found below 44 % GC. Patients with TSP/HAM and asymptomatic carriers had a broader and multimodal distribution of HTLV-I (at 38–54,8 % GC) with minor peaks in GC-poorer regions. GC-poor HIV-1 proviruses were found in both GC-poor and GC-rich compartments of genomes of 27 patients with different levels of virus production. More intense peaks were centered at GC-rich regions for the patients with lower virus load. These results have revealed that the distribution of integrated proviruses in vivo is nonuniform in the compositional compartments of cell genome and broader than in vitro.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154219
citation_txt Композиционная специфичность интеграции вирусов Т-клеточной лейкемии человека типа I и иммунодефицита человека типа 1 в геном человека / Л.А. Цыба, С.В. Зубак, Н. Тряпицина-Гулей, Дж. Бернарди, А.В. Рындич // Биополимеры и клетка. — 2000. — Т. 16, № 6. — С. 547-558. — Бібліогр.: 47 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT cybala kompozicionnaâspecifičnostʹintegraciivirusovtkletočnoileikemiičelovekatipaiiimmunodeficitačelovekatipa1vgenomčeloveka
AT zubaksv kompozicionnaâspecifičnostʹintegraciivirusovtkletočnoileikemiičelovekatipaiiimmunodeficitačelovekatipa1vgenomčeloveka
AT trâpicinagulein kompozicionnaâspecifičnostʹintegraciivirusovtkletočnoileikemiičelovekatipaiiimmunodeficitačelovekatipa1vgenomčeloveka
AT bernardidž kompozicionnaâspecifičnostʹintegraciivirusovtkletočnoileikemiičelovekatipaiiimmunodeficitačelovekatipa1vgenomčeloveka
AT ryndičav kompozicionnaâspecifičnostʹintegraciivirusovtkletočnoileikemiičelovekatipaiiimmunodeficitačelovekatipa1vgenomčeloveka
AT cybala kompozicíinaspecifíčnístʹíntegracíívírusívtklítinnoíleikemíílûdinitipuííímunodefícitulûdinitipu1ugenomlûdini
AT zubaksv kompozicíinaspecifíčnístʹíntegracíívírusívtklítinnoíleikemíílûdinitipuííímunodefícitulûdinitipu1ugenomlûdini
AT trâpicinagulein kompozicíinaspecifíčnístʹíntegracíívírusívtklítinnoíleikemíílûdinitipuííímunodefícitulûdinitipu1ugenomlûdini
AT bernardidž kompozicíinaspecifíčnístʹíntegracíívírusívtklítinnoíleikemíílûdinitipuííímunodefícitulûdinitipu1ugenomlûdini
AT ryndičav kompozicíinaspecifíčnístʹíntegracíívírusívtklítinnoíleikemíílûdinitipuííímunodefícitulûdinitipu1ugenomlûdini
AT cybala compositionalspecificityofhumantcellleukemiavirustypeiandhumanimmunodeficiencyvirustype1integrationintothehumangenome
AT zubaksv compositionalspecificityofhumantcellleukemiavirustypeiandhumanimmunodeficiencyvirustype1integrationintothehumangenome
AT trâpicinagulein compositionalspecificityofhumantcellleukemiavirustypeiandhumanimmunodeficiencyvirustype1integrationintothehumangenome
AT bernardidž compositionalspecificityofhumantcellleukemiavirustypeiandhumanimmunodeficiencyvirustype1integrationintothehumangenome
AT ryndičav compositionalspecificityofhumantcellleukemiavirustypeiandhumanimmunodeficiencyvirustype1integrationintothehumangenome
first_indexed 2025-12-07T18:47:47Z
last_indexed 2025-12-07T18:47:47Z
_version_ 1850876381118857216

Similar Items