Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors
Aim. To assess relative expression (RE) levels of genes involved in lipid metabolism in prostate tumors. To define clinically significant specific alterations on the basis of the expression pattern. Methods. RE levels were analyzed in 37 samples of prostate cancer tissues by quantitative RT-PCR. The...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2018 |
| Main Authors: | , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2018
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154367 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors / G.V. Gerashchenko, O.A. Kononenko, Yu.M. Bondarenko, E.O. Stakhovsky, V.I. Kashuba // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 6. — С. 445-460. — Бібліогр.: 37 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154367 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Gerashchenko, G.V. Kononenko, O.A. Bondarenko, Yu.M. Stakhovsky, E.O. Kashuba, V.I. 2019-06-15T14:37:49Z 2019-06-15T14:37:49Z 2018 Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors / G.V. Gerashchenko, O.A. Kononenko, Yu.M. Bondarenko, E.O. Stakhovsky, V.I. Kashuba // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 6. — С. 445-460. — Бібліогр.: 37 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000990 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154367 577.218+616.65 Aim. To assess relative expression (RE) levels of genes involved in lipid metabolism in prostate tumors. To define clinically significant specific alterations on the basis of the expression pattern. Methods. RE levels were analyzed in 37 samples of prostate cancer tissues by quantitative RT-PCR. The tumors were of a different Gleason score (GS) and various stages; the paired conventionally normal prostate tissue (CNT) samples and 20 samples of prostate adenomas were also analyzed. Results. Increased RE levels of FASN and COX2 were found in an adenocarcinoma group and in adenocarcinomas with GS=7 compared to the adenoma group. Four genes, namely FASN, LDLR, HMGCR and COX2, demonstrated significant RE alterations in the adenocarcinoma groups at different stages compared to the adenoma and CNT groups. Expression of three genes (LDLR, HMGCR, COX2) showed a negative correlation with stage and GS in the adenocarcinoma group. For FASN, LDLR, HMGCR, several positive correlations of RE with levels of the epithelial cell markers were found. CPT1C and COX2 demonstrated positive correlations of RE with expression of mesenchymal, fibroblast and inflammation markers in the adenocarcinoma group. Conclusions. The studied genes controlling lipid metabolism showed differential RE in prostate cancer samples. RE levels of FASN, HMGCR and COX2 might be used as markers of sensitivity and efficacy of inhibitory drugs. Further studies are needed to confirm these data in a larger patient cohort. Мета. Встановити рівні відносної експресії (ВЕ) генів, що задіяні у ліпідному метаболізмі у пухлинах передміхурової залози. На основі цих патернів виявити клінічно-значущі специфічні порушення. Методи. ВЕ була встановлена у 37 зразках раку передміхурової залози (П) методом ПЛР у реальному часі. Пухлини були з різним ступенем Глісону (СГ) та різними стадіями. Крім того ВЕ виявлена у парних умовно-нормальних тканинах (УНТ) та аденомах (А) передміхурової залози. Результати. Підвищені рівні ВЕ FASN та COX2 знайдено у групі аденокарцином та аденокарцином зі СГ=7 порівняно з групою аденом. Чотири гени, а саме FASN, LDLR, HMGCR та COX2 продемонстрували значущі порушення ВЕ у групах аденокарцином з різними стадіями у порівнянні з групою аденом та УНТ. Три гени (LDLR, HMGCR, COX2) показали значущі негативні кореляції зі стадіями та СГ у групі аденокарцином. Для генів FASN, LDLR, HMGCR виявлена низка позитивних кореляцій ВЕ з маркерами епітеліальних клітин, тоді як для генів CPT1С та COX2 знайдено ряд позитивних кореляцій ВЕ з маркерами мезенхімальних клітин, фібробластів та запалення у групі аденокарцином. Висновки. Досліджені гени, що залучені до контролю ліпідного метаболізму показали диференційну експресію у пухлинах передміхурової залози. Рівні ВЕ генів FASN, HMGCR та COX2 можуть бути маркерами чутливості та ефективності препаратів-інгібіторів експресії генів. Для підтвердження отриманих результатів необхідні додаткові дослідження на більшій вибірці пацієнтів. Цель. Установить урони относительной экспрессии (ОЭ) генов, участвующих в липидном метаболизме в опухолях простаты. На основе этих паттернов выявить клинически-значимые специфические нарушения. Методы. ОЭ была установлена в 37 образцах рака простаты (О) методом ПЦР в реальном времени. Были использованы опухоли с разной степенью Глиссона (СГ) и различными стадиями заболевания. Кроме того ОЭ установлена в условно-нормальных тканях (УНТ) и аденомах (А) простаты. Результаты. Повышенные уровни ОЭ FASN и COX2 выявлены в группах аденокарцином и аденокарцином с СГ=7 по сравнению с группой аденом. Четыре гена, а именно FASN, LDLR, HMGCR и COX2 показали значимые изменения ОЭ в группах аденокарцином с разными стадиями по сравнению с группой аденом и УНТ. Три гена (LDLR, HMGCR, COX2) показали значимые негативные корреляции со стадией и СГ в группе аденокарцином. Для генов FASN, LDLR, HMGCR выявлен ряд позитивных корреляций ОЭ с маркерами эпителиальных клеток, тогда как для генов CPT1С и COX2 найден ряд позитивных корреляций с маркерами мезенхимальных клеток, фибробластов и воспаления в группе аденокарцином. Выводы. Исследованные гены, участвующие в контроле липидного метаболизма, показали дифференциальную экспрессию в опухолях простаты. Уровни ОЭ генов FASN, HMGCR и COX2 могут быть маркерами чувствительности и эффективности препаратов-ингибиторов экспрессии. Для подтверждения полученных результатов необходимы дополнительные исследования на большей выборке пациентов. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Biomedicine Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors Патерни експресії генів, що регулюють ліпідний метаболізм у пухлинах передміхурової залози Паттерны экспрессии генов, регулирующих липидный метаболизм в опухолях простаты Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors |
| spellingShingle |
Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors Gerashchenko, G.V. Kononenko, O.A. Bondarenko, Yu.M. Stakhovsky, E.O. Kashuba, V.I. Biomedicine |
| title_short |
Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors |
| title_full |
Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors |
| title_fullStr |
Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors |
| title_full_unstemmed |
Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors |
| title_sort |
expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors |
| author |
Gerashchenko, G.V. Kononenko, O.A. Bondarenko, Yu.M. Stakhovsky, E.O. Kashuba, V.I. |
| author_facet |
Gerashchenko, G.V. Kononenko, O.A. Bondarenko, Yu.M. Stakhovsky, E.O. Kashuba, V.I. |
| topic |
Biomedicine |
| topic_facet |
Biomedicine |
| publishDate |
2018 |
| language |
English |
| container_title |
Вiopolymers and Cell |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Патерни експресії генів, що регулюють ліпідний метаболізм у пухлинах передміхурової залози Паттерны экспрессии генов, регулирующих липидный метаболизм в опухолях простаты |
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154367 |
| citation_txt |
Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors / G.V. Gerashchenko, O.A. Kononenko, Yu.M. Bondarenko, E.O. Stakhovsky, V.I. Kashuba // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 6. — С. 445-460. — Бібліогр.: 37 назв. — англ. |
| work_keys_str_mv |
AT gerashchenkogv expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors AT kononenkooa expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors AT bondarenkoyum expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors AT stakhovskyeo expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors AT kashubavi expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors AT gerashchenkogv paterniekspresíígenívŝoregulûûtʹlípídniimetabolízmupuhlinahperedmíhurovoízalozi AT kononenkooa paterniekspresíígenívŝoregulûûtʹlípídniimetabolízmupuhlinahperedmíhurovoízalozi AT bondarenkoyum paterniekspresíígenívŝoregulûûtʹlípídniimetabolízmupuhlinahperedmíhurovoízalozi AT stakhovskyeo paterniekspresíígenívŝoregulûûtʹlípídniimetabolízmupuhlinahperedmíhurovoízalozi AT kashubavi paterniekspresíígenívŝoregulûûtʹlípídniimetabolízmupuhlinahperedmíhurovoízalozi AT gerashchenkogv patternyékspressiigenovreguliruûŝihlipidnyimetabolizmvopuholâhprostaty AT kononenkooa patternyékspressiigenovreguliruûŝihlipidnyimetabolizmvopuholâhprostaty AT bondarenkoyum patternyékspressiigenovreguliruûŝihlipidnyimetabolizmvopuholâhprostaty AT stakhovskyeo patternyékspressiigenovreguliruûŝihlipidnyimetabolizmvopuholâhprostaty AT kashubavi patternyékspressiigenovreguliruûŝihlipidnyimetabolizmvopuholâhprostaty |
| first_indexed |
2025-12-07T19:44:46Z |
| last_indexed |
2025-12-07T19:44:46Z |
| _version_ |
1850879966080663552 |
| description |
Aim. To assess relative expression (RE) levels of genes involved in lipid metabolism in prostate tumors. To define clinically significant specific alterations on the basis of the expression pattern. Methods. RE levels were analyzed in 37 samples of prostate cancer tissues by quantitative RT-PCR. The tumors were of a different Gleason score (GS) and various stages; the paired conventionally normal prostate tissue (CNT) samples and 20 samples of prostate adenomas were also analyzed. Results. Increased RE levels of FASN and COX2 were found in an adenocarcinoma group and in adenocarcinomas with GS=7 compared to the adenoma group. Four genes, namely FASN, LDLR, HMGCR and COX2, demonstrated significant RE alterations in the adenocarcinoma groups at different stages compared to the adenoma and CNT groups. Expression of three genes (LDLR, HMGCR, COX2) showed a negative correlation with stage and GS in the adenocarcinoma group. For FASN, LDLR, HMGCR, several positive correlations of RE with levels of the epithelial cell markers were found. CPT1C and COX2 demonstrated positive correlations of RE with expression of mesenchymal, fibroblast and inflammation markers in the adenocarcinoma group. Conclusions. The studied genes controlling lipid metabolism showed differential RE in prostate cancer samples. RE levels of FASN, HMGCR and COX2 might be used as markers of sensitivity and efficacy of inhibitory drugs. Further studies are needed to confirm these data in a larger patient cohort.
Мета. Встановити рівні відносної експресії (ВЕ) генів, що задіяні у ліпідному метаболізмі у пухлинах передміхурової залози. На основі цих патернів виявити клінічно-значущі специфічні порушення. Методи. ВЕ була встановлена у 37 зразках раку передміхурової залози (П) методом ПЛР у реальному часі. Пухлини були з різним ступенем Глісону (СГ) та різними стадіями. Крім того ВЕ виявлена у парних умовно-нормальних тканинах (УНТ) та аденомах (А) передміхурової залози. Результати. Підвищені рівні ВЕ FASN та COX2 знайдено у групі аденокарцином та аденокарцином зі СГ=7 порівняно з групою аденом. Чотири гени, а саме FASN, LDLR, HMGCR та COX2 продемонстрували значущі порушення ВЕ у групах аденокарцином з різними стадіями у порівнянні з групою аденом та УНТ. Три гени (LDLR, HMGCR, COX2) показали значущі негативні кореляції зі стадіями та СГ у групі аденокарцином. Для генів FASN, LDLR, HMGCR виявлена низка позитивних кореляцій ВЕ з маркерами епітеліальних клітин, тоді як для генів CPT1С та COX2 знайдено ряд позитивних кореляцій ВЕ з маркерами мезенхімальних клітин, фібробластів та запалення у групі аденокарцином. Висновки. Досліджені гени, що залучені до контролю ліпідного метаболізму показали диференційну експресію у пухлинах передміхурової залози. Рівні ВЕ генів FASN, HMGCR та COX2 можуть бути маркерами чутливості та ефективності препаратів-інгібіторів експресії генів. Для підтвердження отриманих результатів необхідні додаткові дослідження на більшій вибірці пацієнтів.
Цель. Установить урони относительной экспрессии (ОЭ) генов, участвующих в липидном метаболизме в опухолях простаты. На основе этих паттернов выявить клинически-значимые специфические нарушения. Методы. ОЭ была установлена в 37 образцах рака простаты (О) методом ПЦР в реальном времени. Были использованы опухоли с разной степенью Глиссона (СГ) и различными стадиями заболевания. Кроме того ОЭ установлена в условно-нормальных тканях (УНТ) и аденомах (А) простаты. Результаты. Повышенные уровни ОЭ FASN и COX2 выявлены в группах аденокарцином и аденокарцином с СГ=7 по сравнению с группой аденом. Четыре гена, а именно FASN, LDLR, HMGCR и COX2 показали значимые изменения ОЭ в группах аденокарцином с разными стадиями по сравнению с группой аденом и УНТ. Три гена (LDLR, HMGCR, COX2) показали значимые негативные корреляции со стадией и СГ в группе аденокарцином. Для генов FASN, LDLR, HMGCR выявлен ряд позитивных корреляций ОЭ с маркерами эпителиальных клеток, тогда как для генов CPT1С и COX2 найден ряд позитивных корреляций с маркерами мезенхимальных клеток, фибробластов и воспаления в группе аденокарцином. Выводы. Исследованные гены, участвующие в контроле липидного метаболизма, показали дифференциальную экспрессию в опухолях простаты. Уровни ОЭ генов FASN, HMGCR и COX2 могут быть маркерами чувствительности и эффективности препаратов-ингибиторов экспрессии. Для подтверждения полученных результатов необходимы дополнительные исследования на большей выборке пациентов.
|