Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening
Aim. To identify novel FGFR1 inhibitors using the virtual screening approach. Methods. Virtual screening of a small organic compounds library was performed by molecular docking using the Autodock 4.2.6 program package. The compounds activity was determined by in vitro biochemical tests using γ-32P A...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2019 |
| Main Authors: | , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2019
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154388 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening / S.S. Tarnavskiy, M.V. Protopopov, O.V. Borovykov, A.O. Pryhodko, V.G. Bdzhola, S.M. Yarmoluk // Вiopolymers and Cell. — 2019. — Т. 35, № 2. — С. 143-151. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862715089094705152 |
|---|---|
| author | Tarnavskiy, S.S. Protopopov, M.V. Borovykov, O.V. Pryhodko, A.O. Bdzhola, V.G. Yarmoluk, S.M. |
| author_facet | Tarnavskiy, S.S. Protopopov, M.V. Borovykov, O.V. Pryhodko, A.O. Bdzhola, V.G. Yarmoluk, S.M. |
| citation_txt | Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening / S.S. Tarnavskiy, M.V. Protopopov, O.V. Borovykov, A.O. Pryhodko, V.G. Bdzhola, S.M. Yarmoluk // Вiopolymers and Cell. — 2019. — Т. 35, № 2. — С. 143-151. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вiopolymers and Cell |
| description | Aim. To identify novel FGFR1 inhibitors using the virtual screening approach. Methods. Virtual screening of a small organic compounds library was performed by molecular docking using the Autodock 4.2.6 program package. The compounds activity was determined by in vitro biochemical tests using γ-32P ATP. Results. In vitro experiments demonstrated that 18 compounds belonging to three chemical classes had an inhibitory activity against FGFR1 with IC50 values in the range from 1.8 to 71 μM. Conclusions. Several FGFR1 inhibitors were found using molecular modeling and biochemical testing. These compounds are excellent candidates for further chemical optimization.
Мета. Пошук нових інгібіторів протеїнкінази FGFR1. Методи. Віртуальний скринінг бібліотеки низькомолекулярних сполук проводили методом молекулярного докінгу з використанням програмного пакету Autodock 4.2.6. Активність інгібіторів визначали у біохімічних тестах in vitro із використанням γ-32P ATФ. Результати. Експерименти in vitro показали, що 18 сполук проявляють інгібувальну активність щодо FGFR1 зі значенням IC50 в межах від 1,8 до 71 μМ. Активні сполуки належать до 3 хімічних класів. Висновки. За допомогою методів молекулярного моделювання та біохімічного тестування було знайдено низку інгібіторів FGFR1, що є перспективними для подальшої оптимізації для розробки більш активних інгібіторів цієї протеїнкінази.
Цель. Поиск новых химических соединений со способностью ингибировать протеинкиназу FGFR1. Методы. Виртуальный скрининг библиотеки низкомолекулярных органических соединений осуществляли при помощи метода молекулярного докинга программным пакетом Autodock 4.2.6. Активность ингибиторов изучали при помощи биохимических тестов in vitro, используя γ-32P ATФ. Результаты. Биохимическое тестирование показало, что 18 соединений ингибируют протеинкиназу FGFR1 в диапазоне значений IC50 от 1.8 до 71 μМ. Активные соединения являются производными от 3 химических классов. Выводы. Используя методы молекулярного моделирования и биохимического тестирования было обнаружено ряд ингибиторов FGFR1, которые являются перспективными для последующей оптимизации для разработки более активных ингибиторов исследуемой протеинкиназы.
|
| first_indexed | 2025-12-07T17:56:07Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154388 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-12-07T17:56:07Z |
| publishDate | 2019 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Tarnavskiy, S.S. Protopopov, M.V. Borovykov, O.V. Pryhodko, A.O. Bdzhola, V.G. Yarmoluk, S.M. 2019-06-15T14:59:17Z 2019-06-15T14:59:17Z 2019 Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening / S.S. Tarnavskiy, M.V. Protopopov, O.V. Borovykov, A.O. Pryhodko, V.G. Bdzhola, S.M. Yarmoluk // Вiopolymers and Cell. — 2019. — Т. 35, № 2. — С. 143-151. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00099F https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154388 577.322 Aim. To identify novel FGFR1 inhibitors using the virtual screening approach. Methods. Virtual screening of a small organic compounds library was performed by molecular docking using the Autodock 4.2.6 program package. The compounds activity was determined by in vitro biochemical tests using γ-32P ATP. Results. In vitro experiments demonstrated that 18 compounds belonging to three chemical classes had an inhibitory activity against FGFR1 with IC50 values in the range from 1.8 to 71 μM. Conclusions. Several FGFR1 inhibitors were found using molecular modeling and biochemical testing. These compounds are excellent candidates for further chemical optimization. Мета. Пошук нових інгібіторів протеїнкінази FGFR1. Методи. Віртуальний скринінг бібліотеки низькомолекулярних сполук проводили методом молекулярного докінгу з використанням програмного пакету Autodock 4.2.6. Активність інгібіторів визначали у біохімічних тестах in vitro із використанням γ-32P ATФ. Результати. Експерименти in vitro показали, що 18 сполук проявляють інгібувальну активність щодо FGFR1 зі значенням IC50 в межах від 1,8 до 71 μМ. Активні сполуки належать до 3 хімічних класів. Висновки. За допомогою методів молекулярного моделювання та біохімічного тестування було знайдено низку інгібіторів FGFR1, що є перспективними для подальшої оптимізації для розробки більш активних інгібіторів цієї протеїнкінази. Цель. Поиск новых химических соединений со способностью ингибировать протеинкиназу FGFR1. Методы. Виртуальный скрининг библиотеки низкомолекулярных органических соединений осуществляли при помощи метода молекулярного докинга программным пакетом Autodock 4.2.6. Активность ингибиторов изучали при помощи биохимических тестов in vitro, используя γ-32P ATФ. Результаты. Биохимическое тестирование показало, что 18 соединений ингибируют протеинкиназу FGFR1 в диапазоне значений IC50 от 1.8 до 71 μМ. Активные соединения являются производными от 3 химических классов. Выводы. Используя методы молекулярного моделирования и биохимического тестирования было обнаружено ряд ингибиторов FGFR1, которые являются перспективными для последующей оптимизации для разработки более активных ингибиторов исследуемой протеинкиназы. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Bioorganic Chemistry Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening Ідентифікація сполук-хітів – інгібіторів FGFR1 методом рецепторно-орієнтовного віртуального скринінгу. Идентификация хит-соединений – ингибиторов FGFR1 методом рецепторно-ориентированного виртуального скрининга Article published earlier |
| spellingShingle | Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening Tarnavskiy, S.S. Protopopov, M.V. Borovykov, O.V. Pryhodko, A.O. Bdzhola, V.G. Yarmoluk, S.M. Bioorganic Chemistry |
| title | Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening |
| title_alt | Ідентифікація сполук-хітів – інгібіторів FGFR1 методом рецепторно-орієнтовного віртуального скринінгу. Идентификация хит-соединений – ингибиторов FGFR1 методом рецепторно-ориентированного виртуального скрининга |
| title_full | Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening |
| title_fullStr | Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening |
| title_full_unstemmed | Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening |
| title_short | Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening |
| title_sort | hit identification of fgfr1 inhibitors using receptor-based virtual screening |
| topic | Bioorganic Chemistry |
| topic_facet | Bioorganic Chemistry |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154388 |
| work_keys_str_mv | AT tarnavskiyss hitidentificationoffgfr1inhibitorsusingreceptorbasedvirtualscreening AT protopopovmv hitidentificationoffgfr1inhibitorsusingreceptorbasedvirtualscreening AT borovykovov hitidentificationoffgfr1inhibitorsusingreceptorbasedvirtualscreening AT pryhodkoao hitidentificationoffgfr1inhibitorsusingreceptorbasedvirtualscreening AT bdzholavg hitidentificationoffgfr1inhibitorsusingreceptorbasedvirtualscreening AT yarmoluksm hitidentificationoffgfr1inhibitorsusingreceptorbasedvirtualscreening AT tarnavskiyss ídentifíkacíâspolukhítívíngíbítorívfgfr1metodomreceptornooríêntovnogovírtualʹnogoskriníngu AT protopopovmv ídentifíkacíâspolukhítívíngíbítorívfgfr1metodomreceptornooríêntovnogovírtualʹnogoskriníngu AT borovykovov ídentifíkacíâspolukhítívíngíbítorívfgfr1metodomreceptornooríêntovnogovírtualʹnogoskriníngu AT pryhodkoao ídentifíkacíâspolukhítívíngíbítorívfgfr1metodomreceptornooríêntovnogovírtualʹnogoskriníngu AT bdzholavg ídentifíkacíâspolukhítívíngíbítorívfgfr1metodomreceptornooríêntovnogovírtualʹnogoskriníngu AT yarmoluksm ídentifíkacíâspolukhítívíngíbítorívfgfr1metodomreceptornooríêntovnogovírtualʹnogoskriníngu AT tarnavskiyss identifikaciâhitsoedineniiingibitorovfgfr1metodomreceptornoorientirovannogovirtualʹnogoskrininga AT protopopovmv identifikaciâhitsoedineniiingibitorovfgfr1metodomreceptornoorientirovannogovirtualʹnogoskrininga AT borovykovov identifikaciâhitsoedineniiingibitorovfgfr1metodomreceptornoorientirovannogovirtualʹnogoskrininga AT pryhodkoao identifikaciâhitsoedineniiingibitorovfgfr1metodomreceptornoorientirovannogovirtualʹnogoskrininga AT bdzholavg identifikaciâhitsoedineniiingibitorovfgfr1metodomreceptornoorientirovannogovirtualʹnogoskrininga AT yarmoluksm identifikaciâhitsoedineniiingibitorovfgfr1metodomreceptornoorientirovannogovirtualʹnogoskrininga |