Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
Search for new chemical structures possessing specific biological activity is a complex problem that needs the use of the latest achievements of molecular modeling technologies. It is well known that SH2 domains play a major role in ontogenesis as intermediaries of specific protein-protein interacti...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Дата: | 2014 |
| Автори: | Hurmach, V.V., Balinskyi, O.M., Platonov, M.O., Boyko, O.M., Borysko, P.O., Prylutskyy, Yu.I. |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Англійська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2014
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154423 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods / V.V. Hurmach, O.M. Balinskyi, M.O. Platonov, O.M. Boyko, P.O. Borysko, Yu.I. Prylutskyy // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 4. — С. 321-325. — Бібліогр.: 12 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of UkraineСхожі ресурси
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)
Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2014)
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2014)
New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)
Molecular docking method involving SH2-domains
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2012)
Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)
The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)
New conformational properties of SH2 domain binding pocket
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2015)
Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)
Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)
Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2016)
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2016)
Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)
Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)
Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)
Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)
Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)
Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: O. O. Sudakov, та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: O. O. Sudakov, та інші
Опубліковано: (2013)
Hydration change on complexation of aromatic ligands with DNA: molecular dynamics simulations
за авторством: Kostjukov, V.V., та інші
Опубліковано: (2010)
за авторством: Kostjukov, V.V., та інші
Опубліковано: (2010)
Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
за авторством: Negrutska, V.V., та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: Negrutska, V.V., та інші
Опубліковано: (2013)
Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
за авторством: V. V. Negrutska, та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: V. V. Negrutska, та інші
Опубліковано: (2013)
Application of the methods of molecular modeling to the search for new biologically active substances
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2015)
Proline rich regions of coenzyme A synthase α and β interact with SH3 domains of signaling proteins in vitro
за авторством: Breus, O.S., та інші
Опубліковано: (2008)
за авторством: Breus, O.S., та інші
Опубліковано: (2008)
On the issue of automating the workflow design based on algebra-algorithmic and ontological tools
за авторством: Ovdii, O.M.
Опубліковано: (2019)
за авторством: Ovdii, O.M.
Опубліковано: (2019)
Study of the complexation of the copper (II) nitrate with polynucleative ligand
за авторством: M. O. Plutenko, та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: M. O. Plutenko, та інші
Опубліковано: (2013)
New selenium-containing ligand Se 9
за авторством: O. G. Janko
Опубліковано: (2011)
за авторством: O. G. Janko
Опубліковано: (2011)
A global inventory of concentration measurements of free and dissolved in underground waters molecular hydrogen in the Earth’s crust on land
за авторством: Rusakov, O.M.
Опубліковано: (2020)
за авторством: Rusakov, O.M.
Опубліковано: (2020)
The molecular design of biologically active derivatives of N-phenylanthranilic acid
за авторством: O. M. Sviechnikova, та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: O. M. Sviechnikova, та інші
Опубліковано: (2018)
Optimization of quantum cascade laser operation by geometric design of cascade active band in open and closed models
за авторством: Tkach, M.V., та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: Tkach, M.V., та інші
Опубліковано: (2013)
Effect of Different Ligand and Different Ligand Heterometal Xylaratohermanates on the Activity of б-L-Rhamnosidases Eupenicillium erubescens, Cryptococcus albidus and Penicillium tardum
за авторством: O. V. Gudzenko, та інші
Опубліковано: (2021)
за авторством: O. V. Gudzenko, та інші
Опубліковано: (2021)
The role of the TNF receptors and apoptosis inducing ligands in tumor growth
за авторством: O. H. Minchenko, та інші
Опубліковано: (2016)
за авторством: O. H. Minchenko, та інші
Опубліковано: (2016)
Ontological design of subject domain with problems of e-Science
за авторством: Zinkovich, V.M.
Опубліковано: (2025)
за авторством: Zinkovich, V.M.
Опубліковано: (2025)
Supramolecular design of carbon structure for molecular the store of energy
за авторством: I. I. Hryhorchak, та інші
Опубліковано: (2014)
за авторством: I. I. Hryhorchak, та інші
Опубліковано: (2014)
Thione-thiol tautomerism of thiourea ligands on silica surface
за авторством: O. V. Smirnova, та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: O. V. Smirnova, та інші
Опубліковано: (2015)
Differential recognition of ITSN2/Ese2 by the SH2 domains of Fyn, Abl1, PLCg1 and PI3KR1 in mouse tissues
за авторством: O. V. Novokhatska, та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: O. V. Novokhatska, та інші
Опубліковано: (2013)
Differential recognition of ITSN2/Ese2 by the SH2 domains of Fyn, Abl1, PLCg1 and PI3KR1 in mouse tissues
за авторством: Novokhatska, O.V., та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: Novokhatska, O.V., та інші
Опубліковано: (2013)
Synthesis pathway and molecular design of macrobicyclictris-diiminates of d-metals (clathrochelates)
за авторством: O. A. Varzatskij, та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: O. A. Varzatskij, та інші
Опубліковано: (2015)
Problem-oriented computer simulators for solving theoretical and applied tasks of human physiology
за авторством: Grygoryan, R.D.
Опубліковано: (2018)
за авторством: Grygoryan, R.D.
Опубліковано: (2018)
Ligand-induced variability of the FtsZ protein interdomain cleft site pocket
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2024)
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2024)
Docking of lowmolecular ligands on the plant FtsZprotein with application of CUDAaccelerated calculations
за авторством: O. N. Demchuk, та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: O. N. Demchuk, та інші
Опубліковано: (2012)
EXCHANGE REACTIONS OF DECANOATE LIGANDS OF ZIRCONIUM AND HAFNIUM PHTHALOCYANINES
за авторством: Chernii, Viktor, та інші
Опубліковано: (2024)
за авторством: Chernii, Viktor, та інші
Опубліковано: (2024)
Схожі ресурси
-
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013) -
Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2014) -
New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010) -
Molecular docking method involving SH2-domains
за авторством: V. V. Hurmach, та інші
Опубліковано: (2012) -
Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)