Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism
Low molecular weight natural mediators, 2'-5'-linked oligoadenylates, play an important role in interferon-based antiviral mechanism; participate in growth, apoptosis and other important cellular processes. The aim of current study was to find the evidence for the cell interaction with hum...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Datum: | 2014 |
| Hauptverfasser: | , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Englisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2014
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154434 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism / O.Yu. Skorobogatov, D.N. Lozhko, I.Yu. Zhukov, O.V. Kozlov, Z.Yu. Tkachuk // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 4. — С. 279-285. — Бібліогр.: 35 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862647461316657152 |
|---|---|
| author | Skorobogatov, O.Yu. Lozhko, D.N. Zhukov, I.Yu. Kozlov, O.V. Tkachuk, Z.Yu. |
| author_facet | Skorobogatov, O.Yu. Lozhko, D.N. Zhukov, I.Yu. Kozlov, O.V. Tkachuk, Z.Yu. |
| citation_txt | Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism / O.Yu. Skorobogatov, D.N. Lozhko, I.Yu. Zhukov, O.V. Kozlov, Z.Yu. Tkachuk // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 4. — С. 279-285. — Бібліогр.: 35 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вiopolymers and Cell |
| description | Low molecular weight natural mediators, 2'-5'-linked oligoadenylates, play an important role in interferon-based antiviral mechanism; participate in growth, apoptosis and other important cellular processes. The aim of current study was to find the evidence for the cell interaction with human apo-S100A1 using the methods of circular dichroism (CD) and heteronuclear NMR spectroscopy. Taking into account their concentration within living cells, the 2'-5'A3 oligoadenylates may act as additional biologically active substrates, capable of regulating the S100A1 protein functioning in vivo. The obtained results demonstrated the occurrence of the secondary structure changes in human S100A1 protein upon the interaction with 2'-5'-linked oligoadenylates as well as indicated specific residues involved in this process. Our study points to the 2'-5'-linked oligoadenylates as possible additional elements of the complex system of fine regulation of the Ca2+-signal transduction pathway in human cells.
Низькомолекулярні медіатори природного походження – 2'-5' олігоаденілати – відіграють важливу роль в антивірусному механізмі, пов’язаному з інтерфероном, вони причетні до росту клітин, апоптозу та інших важливих процесів, що протікають у клітині. Мета даного дослідження полягала в пошуку доказів мож- ливості взаємодії 2'-5' олігоаденілатів з апо-формою білка S100A1 людини. Методи. Використано методи ЯМР і КД. Результати. Зважаючи на значну концентрацію 2'-5' олігоаденілатів всередині живої клітини, можна припустити, що вони слугують додатковими біологічно активними субстратами і здатні регулювати функціонування білка S100A1 in vivo. Отримані дані вказують на те, що внаслідок взаємодії між 2'-5' олігоаденілатами та S100A1 відбуваються перебудови у вторинній структурі останнього. Крім того, вдалося визначити, які саме амінокислотні залишки беруть учать у цій взаємодії. Висновки. Ймовірно, 2'-5' олігоаденілати є додатковими елементами складної системи регуляції процесів, опосередкованих іонами Са2+.
Низкомолекулярные медиаторы природного происхождения – 2'-5' олигоаденилаты – играют важную роль в антивирусном механизме, связанном с интерфероном, они причастны к росту клеток, апоптозу и другим важным процессам, происходящим в клетке. Цель данного исследования состояла в поиске доказательств возможности взаимодействия 2'-5' олигоаденилатов с апо-формой белка S100A1 человека. Методы. Использованы методы ЯМР и КД. Результаты. Учитывая концентрацию 2'-5' олигоаденилатов внутри живой клетки, можно предположить, что они служат дополнительными биологически активными соединениями, способными регулировать функционирование белка S100A1 in vivo. Полученные данные указывают на то, что в итоге взаимодействия между 2'-5' олигоаденилатами и белком S100A1 происходят изменения вторичной структуры последнего. Кроме того, удалось определить аминокислотные остатки, непосредственно участвующие в этом взаимодействии. Выводы. Вероятно, что 2'-5' олигоаденилаты являются дополнительными элементами сложной системы, регулирующей процессы, опосредованные ионами Са2+.
|
| first_indexed | 2025-12-01T13:29:59Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154434 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-12-01T13:29:59Z |
| publishDate | 2014 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Skorobogatov, O.Yu. Lozhko, D.N. Zhukov, I.Yu. Kozlov, O.V. Tkachuk, Z.Yu. 2019-06-15T15:31:05Z 2019-06-15T15:31:05Z 2014 Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism / O.Yu. Skorobogatov, D.N. Lozhko, I.Yu. Zhukov, O.V. Kozlov, Z.Yu. Tkachuk // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 4. — С. 279-285. — Бібліогр.: 35 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0008A1 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154434 577.32 : 577.112 Low molecular weight natural mediators, 2'-5'-linked oligoadenylates, play an important role in interferon-based antiviral mechanism; participate in growth, apoptosis and other important cellular processes. The aim of current study was to find the evidence for the cell interaction with human apo-S100A1 using the methods of circular dichroism (CD) and heteronuclear NMR spectroscopy. Taking into account their concentration within living cells, the 2'-5'A3 oligoadenylates may act as additional biologically active substrates, capable of regulating the S100A1 protein functioning in vivo. The obtained results demonstrated the occurrence of the secondary structure changes in human S100A1 protein upon the interaction with 2'-5'-linked oligoadenylates as well as indicated specific residues involved in this process. Our study points to the 2'-5'-linked oligoadenylates as possible additional elements of the complex system of fine regulation of the Ca2+-signal transduction pathway in human cells. Низькомолекулярні медіатори природного походження – 2'-5' олігоаденілати – відіграють важливу роль в антивірусному механізмі, пов’язаному з інтерфероном, вони причетні до росту клітин, апоптозу та інших важливих процесів, що протікають у клітині. Мета даного дослідження полягала в пошуку доказів мож- ливості взаємодії 2'-5' олігоаденілатів з апо-формою білка S100A1 людини. Методи. Використано методи ЯМР і КД. Результати. Зважаючи на значну концентрацію 2'-5' олігоаденілатів всередині живої клітини, можна припустити, що вони слугують додатковими біологічно активними субстратами і здатні регулювати функціонування білка S100A1 in vivo. Отримані дані вказують на те, що внаслідок взаємодії між 2'-5' олігоаденілатами та S100A1 відбуваються перебудови у вторинній структурі останнього. Крім того, вдалося визначити, які саме амінокислотні залишки беруть учать у цій взаємодії. Висновки. Ймовірно, 2'-5' олігоаденілати є додатковими елементами складної системи регуляції процесів, опосередкованих іонами Са2+. Низкомолекулярные медиаторы природного происхождения – 2'-5' олигоаденилаты – играют важную роль в антивирусном механизме, связанном с интерфероном, они причастны к росту клеток, апоптозу и другим важным процессам, происходящим в клетке. Цель данного исследования состояла в поиске доказательств возможности взаимодействия 2'-5' олигоаденилатов с апо-формой белка S100A1 человека. Методы. Использованы методы ЯМР и КД. Результаты. Учитывая концентрацию 2'-5' олигоаденилатов внутри живой клетки, можно предположить, что они служат дополнительными биологически активными соединениями, способными регулировать функционирование белка S100A1 in vivo. Полученные данные указывают на то, что в итоге взаимодействия между 2'-5' олигоаденилатами и белком S100A1 происходят изменения вторичной структуры последнего. Кроме того, удалось определить аминокислотные остатки, непосредственно участвующие в этом взаимодействии. Выводы. Вероятно, что 2'-5' олигоаденилаты являются дополнительными элементами сложной системы, регулирующей процессы, опосредованные ионами Са2+. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Structure and Function of Biopolymers Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism Вивчення впливу дефосфорильованих 2'-5' олігоаденілатів на конформацію білка apo-S100A1 методами гетероядерного ЯМР та кругового дихроїзму Изучение влияния дефосфорилированных 2'-5' олигоаденилатов на конформацию белка apo-S100A1 методами гетероядерного ЯМР и кругового дихроизма Article published earlier |
| spellingShingle | Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism Skorobogatov, O.Yu. Lozhko, D.N. Zhukov, I.Yu. Kozlov, O.V. Tkachuk, Z.Yu. Structure and Function of Biopolymers |
| title | Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism |
| title_alt | Вивчення впливу дефосфорильованих 2'-5' олігоаденілатів на конформацію білка apo-S100A1 методами гетероядерного ЯМР та кругового дихроїзму Изучение влияния дефосфорилированных 2'-5' олигоаденилатов на конформацию белка apo-S100A1 методами гетероядерного ЯМР и кругового дихроизма |
| title_full | Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism |
| title_fullStr | Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism |
| title_full_unstemmed | Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism |
| title_short | Study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-S100A1 protein conformation by heteronuclear NMR and circular dichroism |
| title_sort | study of dephosphorylated 2'-5'-linked oligoadenylates impact on apo-s100a1 protein conformation by heteronuclear nmr and circular dichroism |
| topic | Structure and Function of Biopolymers |
| topic_facet | Structure and Function of Biopolymers |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154434 |
| work_keys_str_mv | AT skorobogatovoyu studyofdephosphorylated25linkedoligoadenylatesimpactonapos100a1proteinconformationbyheteronuclearnmrandcirculardichroism AT lozhkodn studyofdephosphorylated25linkedoligoadenylatesimpactonapos100a1proteinconformationbyheteronuclearnmrandcirculardichroism AT zhukoviyu studyofdephosphorylated25linkedoligoadenylatesimpactonapos100a1proteinconformationbyheteronuclearnmrandcirculardichroism AT kozlovov studyofdephosphorylated25linkedoligoadenylatesimpactonapos100a1proteinconformationbyheteronuclearnmrandcirculardichroism AT tkachukzyu studyofdephosphorylated25linkedoligoadenylatesimpactonapos100a1proteinconformationbyheteronuclearnmrandcirculardichroism AT skorobogatovoyu vivčennâvplivudefosforilʹovanih25olígoadenílatívnakonformacíûbílkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrtakrugovogodihroízmu AT lozhkodn vivčennâvplivudefosforilʹovanih25olígoadenílatívnakonformacíûbílkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrtakrugovogodihroízmu AT zhukoviyu vivčennâvplivudefosforilʹovanih25olígoadenílatívnakonformacíûbílkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrtakrugovogodihroízmu AT kozlovov vivčennâvplivudefosforilʹovanih25olígoadenílatívnakonformacíûbílkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrtakrugovogodihroízmu AT tkachukzyu vivčennâvplivudefosforilʹovanih25olígoadenílatívnakonformacíûbílkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrtakrugovogodihroízmu AT skorobogatovoyu izučenievliâniâdefosforilirovannyh25oligoadenilatovnakonformaciûbelkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrikrugovogodihroizma AT lozhkodn izučenievliâniâdefosforilirovannyh25oligoadenilatovnakonformaciûbelkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrikrugovogodihroizma AT zhukoviyu izučenievliâniâdefosforilirovannyh25oligoadenilatovnakonformaciûbelkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrikrugovogodihroizma AT kozlovov izučenievliâniâdefosforilirovannyh25oligoadenilatovnakonformaciûbelkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrikrugovogodihroizma AT tkachukzyu izučenievliâniâdefosforilirovannyh25oligoadenilatovnakonformaciûbelkaapos100a1metodamigeteroâdernogoâmrikrugovogodihroizma |