Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations
Proteasomes mediate functional realization of signaling proteins implicated in asthma pathogenesis. Aim. To evaluate main and sex-specific association between the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 proteasomal genes variations and childhood asthma in Latvians and Taiwanese. Methods. SNPs rs2277460, rs1048990, r...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2014 |
| Main Authors: | , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2014
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154540 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations / N. Paramonova, L.ShiShin Wu, I. RumbaRozenfelde, J.Y. Wang, N. Sjakste, T. Sjakste // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 5. — С. 377-387. — Бібліогр.: 58 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154540 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Paramonova, N. Wu, L.ShiShin Rumba-Rozenfelde, I. Wang, J.Y. Sjakste, N. Sjakste, T. 2019-06-15T16:28:23Z 2019-06-15T16:28:23Z 2014 Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations / N. Paramonova, L.ShiShin Wu, I. RumbaRozenfelde, J.Y. Wang, N. Sjakste, T. Sjakste // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 5. — С. 377-387. — Бібліогр.: 58 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0008B5 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154540 577.21 + 616.248 Proteasomes mediate functional realization of signaling proteins implicated in asthma pathogenesis. Aim. To evaluate main and sex-specific association between the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 proteasomal genes variations and childhood asthma in Latvians and Taiwanese. Methods. SNPs rs2277460, rs1048990, rs2295826, rs2295827 and rs2348071 were genotyped in 102 Latvian and 159 Taiwanese cases for comparison with genetic diversity in populations (191 and 1097 subjects respectively). Results. Haplotype CGACG showed strong (P < 0.0001) association with asthma risk in both populations. All loci heterozygous genotypes and haplotype CCGTA were identified as asthma risk factors in Latvians; rs1048990 and rs2348071 GG homozygotes and rs2295826 and rs2295827 heterozygotes showed asthma risk and protective effect in Taiwanese females respectively. The multi locus genotypes homozygous for alleles being common in Latvian population were identified as protective in Latvians and disease susceptible in Taiwanese. Conclusions. Our results suggest an association of the 14q13-23 proteasomal genes polymorphisms with the childhood asthma in Latvians and Taiwanese and high-light risk and/or protective factors being the same or different between the populations. Протеасоми опосередковують реалізацію функцій сигнальних білків, залучених до патогенезу бронхіальної астми. Мета. Оцінити загальну і залежну від статі асоціацію варіацій протеасомних генів PSMA6, PSMC6 і PSMA3 з бронхіальною астмою у дітей із Латвії і Тайваня. Mетоди. Однонуклеотидні поліморфізми rs2277460, rs1048990, rs2295826, rs2295827 і rs2348071 генотиповано у 102 хворих з Латвії і 159 – з Тайваня. Для порівняння взято контрольні групи, які представляють генетичне різноманіття в популяціях: 191 латвійських і 1097 тайваньських зразків. Результати. Гаплотип CGACG виявився тісно (P < 0.0001) асоційованим з ризиком розвитку астми в обох популяціях. Гетерозиготні генотипи за всіма локусами і гаплотип CCGTA ідентифіковано як фактор ризику для розвитку астми у жителів Латвії. Гомозиготи GG по rs1048990 і rs2348071 пов’язані з ризиком, а гетерозиготи по rs2295826 і rs2295827 проявляють захисний ефект з-поміж тайваньських жінок. Багатолокусні генотипи, гомозиготні за розповсюдженими в Латвії алелями, виявилися захисними для жителів Латвії, але пов’язаними з ризиком захворювання серед тайваньців. Висновки. Наші результати вказують на асоціацію поліморфізмів протеасомних генів локусу 14q13-23 з бронхіальною астмою серед дітей у латвійській і тайваньській популяціях, асоціація може бути пов’язана як з ризиком захворювання, так і з захисним ефектом. За даною ознакою популяції можуть різнитися або не різнитися. Протеасомы опосредуют реализацию функций сигнальных белков, вовлеченных в патогенез бронхиальной астмы. Цель. Оценить общую и зависимую от пола ассоциацию вариаций протеасомных генов PSMA6, PSMC6 и PSMA3 с бронхиальной астмой у детей из Латвии и Тайваня. Mетоды. Однонуклеотидные полиморфизмы rs2277460, rs1048990, rs2295826, rs2295827 и rs2348071 генотипированы у 102 больных из Латвии и 159 – из Тайваня. Для сравнения взяты контрольные группы, представляющие генетическое разнообразие в популяциях: 191 латвийских и 1097 тайваньских образцов. Результаты. Гаплотип CGACG оказался тесно (P < 0.0001) ассоциированным с риском развития астмы в обеих популяциях. Гетерозиготные генотипы по всем локусам и гаплотип CCGTA идентифицированы как фактор риска для развития астмы у жителей Латвии. Гомозиготы GG по rs1048990 и rs2348071 связаны с риском, а гетерозиготы по rs2295826 и rs2295827 проявляют защитный эффект среди тайваньских женщин. Многолокусные генотипы, гомозиготные по распространенным в Латвии аллелям, оказались защитными для жителей Латвии, но связанными с риском заболевания среди тайваньцев. Выводы. Наши результаты указывают на ассоциацию полиморфизмов протеасомных генов локуса 14q13-23 с бронхиальной астмой среди детей в латвийской и тайваньской популяциях, ассоциация может быть связана как с риском заболевания, так и с защитным эффектом. По данному признаку популяции могут отличаться или не отличаться. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Biomedicine Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations Генетичні варіанти генів PSMA6, PSMC6 і PSMA3, асоційовані з бронхіальною астмою у дітей латвійської і тайваньської популяцій Генетические варианты генов PSMA6, PSMC6 и PSMA3, ассоциированные с бронхиальной астмой у детей в латвийской и тайваньской популяциях Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations |
| spellingShingle |
Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations Paramonova, N. Wu, L.ShiShin Rumba-Rozenfelde, I. Wang, J.Y. Sjakste, N. Sjakste, T. Biomedicine |
| title_short |
Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations |
| title_full |
Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations |
| title_fullStr |
Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations |
| title_full_unstemmed |
Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations |
| title_sort |
genetic variants in the psma6, psmc6 and psma3 genes associated with childhood asthma in latvian and taiwanese populations |
| author |
Paramonova, N. Wu, L.ShiShin Rumba-Rozenfelde, I. Wang, J.Y. Sjakste, N. Sjakste, T. |
| author_facet |
Paramonova, N. Wu, L.ShiShin Rumba-Rozenfelde, I. Wang, J.Y. Sjakste, N. Sjakste, T. |
| topic |
Biomedicine |
| topic_facet |
Biomedicine |
| publishDate |
2014 |
| language |
English |
| container_title |
Вiopolymers and Cell |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Генетичні варіанти генів PSMA6, PSMC6 і PSMA3, асоційовані з бронхіальною астмою у дітей латвійської і тайваньської популяцій Генетические варианты генов PSMA6, PSMC6 и PSMA3, ассоциированные с бронхиальной астмой у детей в латвийской и тайваньской популяциях |
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154540 |
| citation_txt |
Genetic variants in the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes associated with childhood asthma in Latvian and Taiwanese populations / N. Paramonova, L.ShiShin Wu, I. RumbaRozenfelde, J.Y. Wang, N. Sjakste, T. Sjakste // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 5. — С. 377-387. — Бібліогр.: 58 назв. — англ. |
| work_keys_str_mv |
AT paramonovan geneticvariantsinthepsma6psmc6andpsma3genesassociatedwithchildhoodasthmainlatvianandtaiwanesepopulations AT wulshishin geneticvariantsinthepsma6psmc6andpsma3genesassociatedwithchildhoodasthmainlatvianandtaiwanesepopulations AT rumbarozenfeldei geneticvariantsinthepsma6psmc6andpsma3genesassociatedwithchildhoodasthmainlatvianandtaiwanesepopulations AT wangjy geneticvariantsinthepsma6psmc6andpsma3genesassociatedwithchildhoodasthmainlatvianandtaiwanesepopulations AT sjaksten geneticvariantsinthepsma6psmc6andpsma3genesassociatedwithchildhoodasthmainlatvianandtaiwanesepopulations AT sjakstet geneticvariantsinthepsma6psmc6andpsma3genesassociatedwithchildhoodasthmainlatvianandtaiwanesepopulations AT paramonovan genetičnívaríantigenívpsma6psmc6ípsma3asocíiovanízbronhíalʹnoûastmoûudíteilatvíisʹkoíítaivanʹsʹkoípopulâcíi AT wulshishin genetičnívaríantigenívpsma6psmc6ípsma3asocíiovanízbronhíalʹnoûastmoûudíteilatvíisʹkoíítaivanʹsʹkoípopulâcíi AT rumbarozenfeldei genetičnívaríantigenívpsma6psmc6ípsma3asocíiovanízbronhíalʹnoûastmoûudíteilatvíisʹkoíítaivanʹsʹkoípopulâcíi AT wangjy genetičnívaríantigenívpsma6psmc6ípsma3asocíiovanízbronhíalʹnoûastmoûudíteilatvíisʹkoíítaivanʹsʹkoípopulâcíi AT sjaksten genetičnívaríantigenívpsma6psmc6ípsma3asocíiovanízbronhíalʹnoûastmoûudíteilatvíisʹkoíítaivanʹsʹkoípopulâcíi AT sjakstet genetičnívaríantigenívpsma6psmc6ípsma3asocíiovanízbronhíalʹnoûastmoûudíteilatvíisʹkoíítaivanʹsʹkoípopulâcíi AT paramonovan genetičeskievariantygenovpsma6psmc6ipsma3associirovannyesbronhialʹnoiastmoiudeteivlatviiskoiitaivanʹskoipopulâciâh AT wulshishin genetičeskievariantygenovpsma6psmc6ipsma3associirovannyesbronhialʹnoiastmoiudeteivlatviiskoiitaivanʹskoipopulâciâh AT rumbarozenfeldei genetičeskievariantygenovpsma6psmc6ipsma3associirovannyesbronhialʹnoiastmoiudeteivlatviiskoiitaivanʹskoipopulâciâh AT wangjy genetičeskievariantygenovpsma6psmc6ipsma3associirovannyesbronhialʹnoiastmoiudeteivlatviiskoiitaivanʹskoipopulâciâh AT sjaksten genetičeskievariantygenovpsma6psmc6ipsma3associirovannyesbronhialʹnoiastmoiudeteivlatviiskoiitaivanʹskoipopulâciâh AT sjakstet genetičeskievariantygenovpsma6psmc6ipsma3associirovannyesbronhialʹnoiastmoiudeteivlatviiskoiitaivanʹskoipopulâciâh |
| first_indexed |
2025-12-07T20:21:02Z |
| last_indexed |
2025-12-07T20:21:02Z |
| _version_ |
1850882248152186880 |
| description |
Proteasomes mediate functional realization of signaling proteins implicated in asthma pathogenesis. Aim. To evaluate main and sex-specific association between the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 proteasomal genes variations and childhood asthma in Latvians and Taiwanese. Methods. SNPs rs2277460, rs1048990, rs2295826, rs2295827 and rs2348071 were genotyped in 102 Latvian and 159 Taiwanese cases for comparison with genetic diversity in populations (191 and 1097 subjects respectively). Results. Haplotype CGACG showed strong (P < 0.0001) association with asthma risk in both populations. All loci heterozygous genotypes and haplotype CCGTA were identified as asthma risk factors in Latvians; rs1048990 and rs2348071 GG homozygotes and rs2295826 and rs2295827 heterozygotes showed asthma risk and protective effect in Taiwanese females respectively. The multi locus genotypes homozygous for alleles being common in Latvian population were identified as protective in Latvians and disease susceptible in Taiwanese. Conclusions. Our results suggest an association of the 14q13-23 proteasomal genes polymorphisms with the childhood asthma in Latvians and Taiwanese and high-light risk and/or protective factors being the same or different between the populations.
Протеасоми опосередковують реалізацію функцій сигнальних білків, залучених до патогенезу бронхіальної астми. Мета. Оцінити загальну і залежну від статі асоціацію варіацій протеасомних генів PSMA6, PSMC6 і PSMA3 з бронхіальною астмою у дітей із Латвії і Тайваня. Mетоди. Однонуклеотидні поліморфізми rs2277460, rs1048990, rs2295826, rs2295827 і rs2348071 генотиповано у 102 хворих з Латвії і 159 – з Тайваня. Для порівняння взято контрольні групи, які представляють генетичне різноманіття в популяціях: 191 латвійських і 1097 тайваньських зразків. Результати. Гаплотип CGACG виявився тісно (P < 0.0001) асоційованим з ризиком розвитку астми в обох популяціях. Гетерозиготні генотипи за всіма локусами і гаплотип CCGTA ідентифіковано як фактор ризику для розвитку астми у жителів Латвії. Гомозиготи GG по rs1048990 і rs2348071 пов’язані з ризиком, а гетерозиготи по rs2295826 і rs2295827 проявляють захисний ефект з-поміж тайваньських жінок. Багатолокусні генотипи, гомозиготні за розповсюдженими в Латвії алелями, виявилися захисними для жителів Латвії, але пов’язаними з ризиком захворювання серед тайваньців. Висновки. Наші результати вказують на асоціацію поліморфізмів протеасомних генів локусу 14q13-23 з бронхіальною астмою серед дітей у латвійській і тайваньській популяціях, асоціація може бути пов’язана як з ризиком захворювання, так і з захисним ефектом. За даною ознакою популяції можуть різнитися або не різнитися.
Протеасомы опосредуют реализацию функций сигнальных белков, вовлеченных в патогенез бронхиальной астмы. Цель. Оценить общую и зависимую от пола ассоциацию вариаций протеасомных генов PSMA6, PSMC6 и PSMA3 с бронхиальной астмой у детей из Латвии и Тайваня. Mетоды. Однонуклеотидные полиморфизмы rs2277460, rs1048990, rs2295826, rs2295827 и rs2348071 генотипированы у 102 больных из Латвии и 159 – из Тайваня. Для сравнения взяты контрольные группы, представляющие генетическое разнообразие в популяциях: 191 латвийских и 1097 тайваньских образцов. Результаты. Гаплотип CGACG оказался тесно (P < 0.0001) ассоциированным с риском развития астмы в обеих популяциях. Гетерозиготные генотипы по всем локусам и гаплотип CCGTA идентифицированы как фактор риска для развития астмы у жителей Латвии. Гомозиготы GG по rs1048990 и rs2348071 связаны с риском, а гетерозиготы по rs2295826 и rs2295827 проявляют защитный эффект среди тайваньских женщин. Многолокусные генотипы, гомозиготные по распространенным в Латвии аллелям, оказались защитными для жителей Латвии, но связанными с риском заболевания среди тайваньцев. Выводы. Наши результаты указывают на ассоциацию полиморфизмов протеасомных генов локуса 14q13-23 с бронхиальной астмой среди детей в латвийской и тайваньской популяциях, ассоциация может быть связана как с риском заболевания, так и с защитным эффектом. По данному признаку популяции могут отличаться или не отличаться.
|