The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype

Aim. To estimate WaaL ligase contribution in the lipopolysaccharide (LPS) phenotype profile formation of Y. enterocolitica O:3 (YeO3) bacteria. Methods. The waaL-knock-out mutants were created by an allelic exchange strategy. The LPS phenotypes of created mutants were visualized by silver-stained DO...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Вiopolymers and Cell
Date:2014
Main Authors: Shevchenko, J.I., Pozur, V.K., Skurnik, M.
Format: Article
Language:English
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2014
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154571
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype / J.I. Shevchenko, V.K. Pozur, M. Skurnik // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 6. — С. 443-447. — Бібліогр.: 8 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154571
record_format dspace
spelling Shevchenko, J.I.
Pozur, V.K.
Skurnik, M.
2019-06-15T16:34:17Z
2019-06-15T16:34:17Z
2014
The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype / J.I. Shevchenko, V.K. Pozur, M. Skurnik // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 6. — С. 443-447. — Бібліогр.: 8 назв. — англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0008BE
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154571
579.234
Aim. To estimate WaaL ligase contribution in the lipopolysaccharide (LPS) phenotype profile formation of Y. enterocolitica O:3 (YeO3) bacteria. Methods. The waaL-knock-out mutants were created by an allelic exchange strategy. The LPS phenotypes of created mutants were visualized by silver-stained DOC-PAGE and immunoblotting with specific outer core (core oligosaccharide, hexasaccharide, OC) and O-polysaccharide (OPS or O-Ag) monoclonal antibodies. Results. Deletion of waaLOS gene from YeO3 genome has a marked effect on OC ligation in either single or double mutants. The waaLPS deletion has an opposite effect on the OPS ligation – barely detected increasing of OPS bands. Conclusions. The LPS ligases of YeO3 exhibit relaxed donor substrate specificity. Under given conditions the effect of WaaLOS ligase is more significant for OC and OPS ligation onto lipid A than that of WaaLPS.
Мета. Дослідити участь лігаз WaaL у формуванні фенотипу ліпополісахариду (LPS) серед бактерій Y. enterocolitica O:3 (YeO3). Методи. Нокаутні мутанти по генах лігаз waaL створено внаслідок обміну алелями. Фенотипи LPS отриманих мутантів візуалізували, забарвлюючи сріблом гель DOC-PAGE, а також використовували імуноблот зі специфічними моноклональними антитілами до кору (корового олігосахариду, гексасахариду, ОC) та О-полісахариду (OPS, O-Ag). Результати. Делеція гена лігази waaLOS з геному бактерій YeO3 чинить помітний вплив на лігування ОC як в одиночних, так і в подвійних мутантах. Проте маніпуляції з геном лігази waaLPS призводять до ледь помітної стимуляції утворення OPS. Висновки. Лігази LPS бактерій YeO3 демонструють низьку субстратну специфічність. Участь лігази WaaLOS у формуванні повноцінної структури LPS є суттєвішою, аніж WaaLPS, за даних умов.
Цель. Исследовать участие лигаз WaaL в формировании фенотипа липополисахарида (LPS) среди бактерий Y. enterocolitica O:3 (YeO3). Методы. Нокаутные мутанты по генам лигаз waaL созданы вследствие обмена аллелями. Фенотипы LPS полученных мутантов визуализировали, окрашивая серебром гель DOC-PAGE, а также с использованием иммуноблота со специфическими моноклональными антителами к кору (коровому олигосахариду, гексасахариду, OC) и О-полисахариду (OPS, O-Ag). Результаты. Делеция гена лигазы waaLOS из генома бактерий YeO3 оказывает заметное влияние на лигирование OC как в одиночных, так и двойных мутантах. Однако манипуляции с геном лигаз waaLPS приводят к едва заметной стимуляции образования OPS. Выводы. Лигазы LPS бактерий YeO3 демонстрируют низкую субстратную специфичность. Участие лигазы WaaLOS в образовании полноценной структуры LPS является более существенным, чем WaaLPS, при данных условиях.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Structure and Function of Biopolymers
The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
Вплив делецій генів лігаз waaL на фенотип ліпополісахаридів у бактерій Yersinia enterocolitica O:3
Влияние делеций генов лигаз waaL на фенотип липополисахаридов у бактерий Yersinia enterocolitica O:3
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
spellingShingle The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
Shevchenko, J.I.
Pozur, V.K.
Skurnik, M.
Structure and Function of Biopolymers
title_short The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_full The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_fullStr The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_full_unstemmed The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_sort effect of waal genes deletion from yersinia enterocolitica o:3 genome on bacteria lps’ phenotype
author Shevchenko, J.I.
Pozur, V.K.
Skurnik, M.
author_facet Shevchenko, J.I.
Pozur, V.K.
Skurnik, M.
topic Structure and Function of Biopolymers
topic_facet Structure and Function of Biopolymers
publishDate 2014
language English
container_title Вiopolymers and Cell
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Вплив делецій генів лігаз waaL на фенотип ліпополісахаридів у бактерій Yersinia enterocolitica O:3
Влияние делеций генов лигаз waaL на фенотип липополисахаридов у бактерий Yersinia enterocolitica O:3
description Aim. To estimate WaaL ligase contribution in the lipopolysaccharide (LPS) phenotype profile formation of Y. enterocolitica O:3 (YeO3) bacteria. Methods. The waaL-knock-out mutants were created by an allelic exchange strategy. The LPS phenotypes of created mutants were visualized by silver-stained DOC-PAGE and immunoblotting with specific outer core (core oligosaccharide, hexasaccharide, OC) and O-polysaccharide (OPS or O-Ag) monoclonal antibodies. Results. Deletion of waaLOS gene from YeO3 genome has a marked effect on OC ligation in either single or double mutants. The waaLPS deletion has an opposite effect on the OPS ligation – barely detected increasing of OPS bands. Conclusions. The LPS ligases of YeO3 exhibit relaxed donor substrate specificity. Under given conditions the effect of WaaLOS ligase is more significant for OC and OPS ligation onto lipid A than that of WaaLPS. Мета. Дослідити участь лігаз WaaL у формуванні фенотипу ліпополісахариду (LPS) серед бактерій Y. enterocolitica O:3 (YeO3). Методи. Нокаутні мутанти по генах лігаз waaL створено внаслідок обміну алелями. Фенотипи LPS отриманих мутантів візуалізували, забарвлюючи сріблом гель DOC-PAGE, а також використовували імуноблот зі специфічними моноклональними антитілами до кору (корового олігосахариду, гексасахариду, ОC) та О-полісахариду (OPS, O-Ag). Результати. Делеція гена лігази waaLOS з геному бактерій YeO3 чинить помітний вплив на лігування ОC як в одиночних, так і в подвійних мутантах. Проте маніпуляції з геном лігази waaLPS призводять до ледь помітної стимуляції утворення OPS. Висновки. Лігази LPS бактерій YeO3 демонструють низьку субстратну специфічність. Участь лігази WaaLOS у формуванні повноцінної структури LPS є суттєвішою, аніж WaaLPS, за даних умов. Цель. Исследовать участие лигаз WaaL в формировании фенотипа липополисахарида (LPS) среди бактерий Y. enterocolitica O:3 (YeO3). Методы. Нокаутные мутанты по генам лигаз waaL созданы вследствие обмена аллелями. Фенотипы LPS полученных мутантов визуализировали, окрашивая серебром гель DOC-PAGE, а также с использованием иммуноблота со специфическими моноклональными антителами к кору (коровому олигосахариду, гексасахариду, OC) и О-полисахариду (OPS, O-Ag). Результаты. Делеция гена лигазы waaLOS из генома бактерий YeO3 оказывает заметное влияние на лигирование OC как в одиночных, так и двойных мутантах. Однако манипуляции с геном лигаз waaLPS приводят к едва заметной стимуляции образования OPS. Выводы. Лигазы LPS бактерий YeO3 демонстрируют низкую субстратную специфичность. Участие лигазы WaaLOS в образовании полноценной структуры LPS является более существенным, чем WaaLPS, при данных условиях.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154571
citation_txt The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype / J.I. Shevchenko, V.K. Pozur, M. Skurnik // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 6. — С. 443-447. — Бібліогр.: 8 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT shevchenkoji theeffectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT pozurvk theeffectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT skurnikm theeffectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT shevchenkoji vplivdelecíigenívlígazwaalnafenotiplípopolísaharidívubakteríiyersiniaenterocoliticao3
AT pozurvk vplivdelecíigenívlígazwaalnafenotiplípopolísaharidívubakteríiyersiniaenterocoliticao3
AT skurnikm vplivdelecíigenívlígazwaalnafenotiplípopolísaharidívubakteríiyersiniaenterocoliticao3
AT shevchenkoji vliâniedeleciigenovligazwaalnafenotiplipopolisaharidovubakteriiyersiniaenterocoliticao3
AT pozurvk vliâniedeleciigenovligazwaalnafenotiplipopolisaharidovubakteriiyersiniaenterocoliticao3
AT skurnikm vliâniedeleciigenovligazwaalnafenotiplipopolisaharidovubakteriiyersiniaenterocoliticao3
AT shevchenkoji effectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT pozurvk effectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT skurnikm effectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
first_indexed 2025-12-01T05:18:24Z
last_indexed 2025-12-01T05:18:24Z
_version_ 1850859364286464000