Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli

Количественно изучали поли(U) – зависимое связывание 15 – нуклеотидного фрагмента аналога антикодоновой ветви дрожжевой тРНКPhe c 30S субчастицами и 70S рибосомами E.coli. Показано, что связывание с субчастицами обратимо, подавляется эдеином и частично тетрациклином и происходит на двух сайтах субча...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1989
Hauptverfasser: Нехай, С.А., Саминский, Е.М.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1989
Schlagworte:
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154626
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli / С.А. Нехай, Ε.Μ. Саминский // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 2. — С. 62-69. — Бібліогр.: 17 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154626
record_format dspace
spelling Нехай, С.А.
Саминский, Е.М.
2019-06-15T17:00:15Z
2019-06-15T17:00:15Z
1989
Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli / С.А. Нехай, Ε.Μ. Саминский // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 2. — С. 62-69. — Бібліогр.: 17 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0000A8
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154626
577.217
Количественно изучали поли(U) – зависимое связывание 15 – нуклеотидного фрагмента аналога антикодоновой ветви дрожжевой тРНКPhe c 30S субчастицами и 70S рибосомами E.coli. Показано, что связывание с субчастицами обратимо, подавляется эдеином и частично тетрациклином и происходит на двух сайтах субчастицы. Сайт с большим сродством к фрагменту охарактеризован константами скорости ассоциации и диссоциации (2,3*10⁴ М⁻¹ с⁻¹ соответсвенно при 20°С) и константой равновесия ( 0,8*10⁷ М⁻¹при 37°С, 4*10⁷ М⁻¹ при 20°С и примерно 3*10⁸ М⁻¹ при 0°С). Второй сайт связываетфрагмент значительно слабее ( константа равновесия 0,4*10⁷ М⁻¹ при 20°С). 70S рибосомы взаимодействуют с фрагментом качественно и количественно почти так же, как 30S субчастицы. Описанная поли(U) – зависимая ассоциация фрагмента с 30S субчастицей очень сходна во всех отношениях с таковой для Phe – тРНКPhe. По аналогии с последней можно предположить, что более сильно связывающий сайт является частью Р – сайта, а более слабо – частью А – сайта рибосомы.
Кількісно вивчали полі (U)-залежне зв’язування 15-нуклеотидного фрагмента аналога антикодонової гілки дріжджової тРНКPhe з 30S субчастинками і 70S рибосомами E. coli. Показано, що зв’язування з субчастинками оборотне, пригнічується едеїном і частково тетрацикліном і відбувається на двох сайтах субчастинки. Сайт з великою спорідненістю до фрагмента охарактеризовано константами швидкості асоціації і дисоціації (2,3·10⁴ М⁻¹ с⁻¹ відповідно за температури 20 °С) і константою рівноваги (0,8·10⁷ М⁻¹ при 37°С, 4 ·10⁷ М⁻¹ при 20 °С і приблизно 3·10⁸ М⁻¹ при 0 °С). Другий сайт зв’язує фрагмент значно слабкіше (константа рівноваги 0,4 ·10⁷ М⁻¹ при 20 ° С). 70S рибосоми взаємодіють з фрагментом якісно і кількісно майже так само, як 30S субчастинки. Описана полі (U)-залежна асоціація фрагмента з 30S субчастинками загалом дуже подібна з такою для Phe-тРНКPhe. За аналогією з останньою можна припустити, що сайт, який зв’язує сильніше є частиною Р-сайта, а слабше – частиною А-сайта рибосоми.
The 15-nucleotide analog of the yeast tRNAPhe anticodon arm binds reversibly two sites of E. coli poly (U)-programmed 305 ribosomal subunits. There is a competition between the tRNAphe fragment and tRNAPhe for this binding. It is blocked totally by edeine and partially by tetracycline. The site with higher affinity for fragment has been characterized by association and dissociation rate constants and by equilibrium affinity constant. The second site reveals the affinity constant at 20 °C one order of magnitude lower. 70S ribosomes bind the fragment quantitatively and qualitatively in almost the same way as SOS subunits. The association of the fragment with 80S subunits is quite similar to analogous association of Phe-tRNAphe (Kirillov S. V. et al., 1980, Nucl. Acids Res., 8, 186-193). It permits supposing by analogy with the latter that the site with high affinity for the fragment can be presumably identified as a part of the P-site, and the site with lower affinity — as a part of the A-site of ribosomc.
Автор выражаю благодарность В.И. Махно, Ю.П. Семенкову, В.И. Катупин и Д.В. Парфенов з предоставленные препараты, а также А.А. Востров и А.Б. Мериину — за участие в работе на первом ее этапе.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Структура и функции биополимеров
Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli
Зв’язування фрагмента фенілаланінової тРНК дріжджів, що містить антикодонову петлю, з 30S субчастинками і 70S рибосомами Escherichia coli
Binding of yeast tRNAPhe with anticodon arm to Escherichia coli 305 Subunits and 70S ribosomes
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli
spellingShingle Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli
Нехай, С.А.
Саминский, Е.М.
Структура и функции биополимеров
title_short Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli
title_full Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli
title_fullStr Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli
title_full_unstemmed Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli
title_sort связывание фрагмента фенилаланиновой трнк дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30s субчастицами и 70s рибосомами escherichia coli
author Нехай, С.А.
Саминский, Е.М.
author_facet Нехай, С.А.
Саминский, Е.М.
topic Структура и функции биополимеров
topic_facet Структура и функции биополимеров
publishDate 1989
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Зв’язування фрагмента фенілаланінової тРНК дріжджів, що містить антикодонову петлю, з 30S субчастинками і 70S рибосомами Escherichia coli
Binding of yeast tRNAPhe with anticodon arm to Escherichia coli 305 Subunits and 70S ribosomes
description Количественно изучали поли(U) – зависимое связывание 15 – нуклеотидного фрагмента аналога антикодоновой ветви дрожжевой тРНКPhe c 30S субчастицами и 70S рибосомами E.coli. Показано, что связывание с субчастицами обратимо, подавляется эдеином и частично тетрациклином и происходит на двух сайтах субчастицы. Сайт с большим сродством к фрагменту охарактеризован константами скорости ассоциации и диссоциации (2,3*10⁴ М⁻¹ с⁻¹ соответсвенно при 20°С) и константой равновесия ( 0,8*10⁷ М⁻¹при 37°С, 4*10⁷ М⁻¹ при 20°С и примерно 3*10⁸ М⁻¹ при 0°С). Второй сайт связываетфрагмент значительно слабее ( константа равновесия 0,4*10⁷ М⁻¹ при 20°С). 70S рибосомы взаимодействуют с фрагментом качественно и количественно почти так же, как 30S субчастицы. Описанная поли(U) – зависимая ассоциация фрагмента с 30S субчастицей очень сходна во всех отношениях с таковой для Phe – тРНКPhe. По аналогии с последней можно предположить, что более сильно связывающий сайт является частью Р – сайта, а более слабо – частью А – сайта рибосомы. Кількісно вивчали полі (U)-залежне зв’язування 15-нуклеотидного фрагмента аналога антикодонової гілки дріжджової тРНКPhe з 30S субчастинками і 70S рибосомами E. coli. Показано, що зв’язування з субчастинками оборотне, пригнічується едеїном і частково тетрацикліном і відбувається на двох сайтах субчастинки. Сайт з великою спорідненістю до фрагмента охарактеризовано константами швидкості асоціації і дисоціації (2,3·10⁴ М⁻¹ с⁻¹ відповідно за температури 20 °С) і константою рівноваги (0,8·10⁷ М⁻¹ при 37°С, 4 ·10⁷ М⁻¹ при 20 °С і приблизно 3·10⁸ М⁻¹ при 0 °С). Другий сайт зв’язує фрагмент значно слабкіше (константа рівноваги 0,4 ·10⁷ М⁻¹ при 20 ° С). 70S рибосоми взаємодіють з фрагментом якісно і кількісно майже так само, як 30S субчастинки. Описана полі (U)-залежна асоціація фрагмента з 30S субчастинками загалом дуже подібна з такою для Phe-тРНКPhe. За аналогією з останньою можна припустити, що сайт, який зв’язує сильніше є частиною Р-сайта, а слабше – частиною А-сайта рибосоми. The 15-nucleotide analog of the yeast tRNAPhe anticodon arm binds reversibly two sites of E. coli poly (U)-programmed 305 ribosomal subunits. There is a competition between the tRNAphe fragment and tRNAPhe for this binding. It is blocked totally by edeine and partially by tetracycline. The site with higher affinity for fragment has been characterized by association and dissociation rate constants and by equilibrium affinity constant. The second site reveals the affinity constant at 20 °C one order of magnitude lower. 70S ribosomes bind the fragment quantitatively and qualitatively in almost the same way as SOS subunits. The association of the fragment with 80S subunits is quite similar to analogous association of Phe-tRNAphe (Kirillov S. V. et al., 1980, Nucl. Acids Res., 8, 186-193). It permits supposing by analogy with the latter that the site with high affinity for the fragment can be presumably identified as a part of the P-site, and the site with lower affinity — as a part of the A-site of ribosomc.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154626
citation_txt Связывание фрагмента фенилаланиновой тРНК дрожжей, содержащего антикодоновую петлю, с 30S субчастицами и 70S рибосомами Escherichia coli / С.А. Нехай, Ε.Μ. Саминский // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 2. — С. 62-69. — Бібліогр.: 17 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT nehaisa svâzyvaniefragmentafenilalaninovoitrnkdrožžeisoderžaŝegoantikodonovuûpetlûs30ssubčasticamii70sribosomamiescherichiacoli
AT saminskiiem svâzyvaniefragmentafenilalaninovoitrnkdrožžeisoderžaŝegoantikodonovuûpetlûs30ssubčasticamii70sribosomamiescherichiacoli
AT nehaisa zvâzuvannâfragmentafenílalanínovoítrnkdríždžívŝomístitʹantikodonovupetlûz30ssubčastinkamií70sribosomamiescherichiacoli
AT saminskiiem zvâzuvannâfragmentafenílalanínovoítrnkdríždžívŝomístitʹantikodonovupetlûz30ssubčastinkamií70sribosomamiescherichiacoli
AT nehaisa bindingofyeasttrnaphewithanticodonarmtoescherichiacoli305subunitsand70sribosomes
AT saminskiiem bindingofyeasttrnaphewithanticodonarmtoescherichiacoli305subunitsand70sribosomes
first_indexed 2025-12-07T21:11:24Z
last_indexed 2025-12-07T21:11:24Z
_version_ 1850885416415133696