Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»

Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»

Рибозимы модели «головка молотка», как и другие типы рибозимов, являются метаяло энзимами, каталитическая активность которых зависит от наличия ионов двухвалентных металлов в среде. Но если влияние двухвалентных ионов металлов на реакцию расщепления субстрата рибозимом хорошо изучено, то влияние мон...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1997
1. Verfasser: Бурьяновский, Л.Н.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1997
Schlagworte:
Структура и функции биополимеров
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154653
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка» / Л.Н. Бурьяновский // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 1. — С. 30-35. — Бібліогр.: 20 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154653
record_format dspace
spelling Бурьяновский, Л.Н.
2019-06-15T17:25:32Z
2019-06-15T17:25:32Z
1997
Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка» / Л.Н. Бурьяновский // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 1. — С. 30-35. — Бібліогр.: 20 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000463
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154653
577.214.3-577.113.4
Рибозимы модели «головка молотка», как и другие типы рибозимов, являются метаяло энзимами, каталитическая активность которых зависит от наличия ионов двухвалентных металлов в среде. Но если влияние двухвалентных ионов металлов на реакцию расщепления субстрата рибозимом хорошо изучено, то влияние моновалентных катионов не исследовалось хоть сколько-нибудь систематически. В данной работе изучалось влияние моновалентных катионов (Н⁺, K⁺, Li⁺, NH₄⁺), а также ионов буферной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом типа «головка молотка». рН-зависимость эффективности реакции имела колоколообразную форму с оптимумом рН 7,0. Ионы K⁺ и Li⁺ в концентрации 0,1 М стимулировали, а в концентрациях выше 0,2 М – снижали эффективность расщепления. При 0,8 М реакция подавля¬лась практически полностью. Ионы NH₄⁺ оказывали ингибирующее действие при всех исследованных концентрациях. Представленные данные, на взгляд автора, свидетельствуют о специфичности взаимодействий моновалентных катионов с рибозимной РНК, способствующих, или, напротив, препятствующих предпочтительному бразованию активной конформации «головки молот¬ка».
Рибозами типу «головка молотка», як і інші типи рибозимів, є металоензимами і їх активність залежить від присутності іонів двовалентних металів. Однак, якщо вплив іонів двовалентних металів на розщеплення субстрату рибозимом досліджено добре, то дія моновалентних катіонів досі не вивчалась систематично. В наведеній роботі проаналізовано вплив моновалентних катіонів (Н⁺ , k⁺ , Li⁺ , NH₄⁺ ) та іонів буферного середовища на ефективність розщеплення in vitro tat-PHK рибозимом типу «головка молотка». рН-залежність ефектив¬ності реакції мала дзвоноподібну форму з оптимумом при рН 7,0. Іони К і Li в концентрації 0,1 М стимулювали, а в концентраціях вище 0,2 М – зменшували ефективність роз¬щеплення. При концентрації солей близько 0,8 М реакція пригнічувалася практично повністю. Іони NH₄⁺ виявляли інгібуючу дію при всіх концентраціях, що вивчалися. Ці дані, на погляд автора, можуть свідчити про специфічність взаємодії моновалентних катіонів з рибозимною РНК, що може сприяти або, навпаки, перешкоджати утворенню активної конформації «головки молотка».
The hammerhead ribozymes like other types of ribozymes are metalloenzymes, and their activity strongly depend on divalent metal ion presence. While influence of divalent metal ions on the cleavage of substrate by the hammerhead ribozymes was well characterised, effect of monovalent kations was not analyse systematically. In the present work influence of monovalent cations (H⁺, K⁺, Li⁺, NH₄⁺) and buffer ions on efficiency of the tat-RNA cleavage in vitro by hammerhead ribozyme was characterized. pH-dependence was shown to be bell-shaped with an optimum at pH 7.0. Both K⁺ and Li⁺ ions at concentration 0.1 M increased, and at concentrations higher 0.2 M decreased efficiency of cleavage. At concentration 0.8 M reaction seemed to be completely blocked. NH₄⁺ ions had inhibitory effect at all concentrations tested. The data presented here suggest specificity of interactions of monovalent cations with ribozyme RNA, that might promote, or vice versa, prevent forming active hammerhead conformation.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Структура и функции биополимеров
Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»
Вплив рН, іонної сили та іонного складу реакційного середови­ща на ефективність розщеплення in vitro tat-PHK ВІЛ-1 рибози­мом моделі «головка молотка»
Effect of pH, ionic strength, and ionic composition on efficiency of hammerhead ribozyme-mediated cleavage of the tat-RNA HIV-I in vitro
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»
spellingShingle Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»
Бурьяновский, Л.Н.
Структура и функции биополимеров
title_short Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»
title_full Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»
title_fullStr Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»
title_full_unstemmed Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка»
title_sort влияние рн, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-phk вич-1 рибозимом модели «головка молотка»
author Бурьяновский, Л.Н.
author_facet Бурьяновский, Л.Н.
topic Структура и функции биополимеров
topic_facet Структура и функции биополимеров
publishDate 1997
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Вплив рН, іонної сили та іонного складу реакційного середови­ща на ефективність розщеплення in vitro tat-PHK ВІЛ-1 рибози­мом моделі «головка молотка»
Effect of pH, ionic strength, and ionic composition on efficiency of hammerhead ribozyme-mediated cleavage of the tat-RNA HIV-I in vitro
description Рибозимы модели «головка молотка», как и другие типы рибозимов, являются метаяло энзимами, каталитическая активность которых зависит от наличия ионов двухвалентных металлов в среде. Но если влияние двухвалентных ионов металлов на реакцию расщепления субстрата рибозимом хорошо изучено, то влияние моновалентных катионов не исследовалось хоть сколько-нибудь систематически. В данной работе изучалось влияние моновалентных катионов (Н⁺, K⁺, Li⁺, NH₄⁺), а также ионов буферной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом типа «головка молотка». рН-зависимость эффективности реакции имела колоколообразную форму с оптимумом рН 7,0. Ионы K⁺ и Li⁺ в концентрации 0,1 М стимулировали, а в концентрациях выше 0,2 М – снижали эффективность расщепления. При 0,8 М реакция подавля¬лась практически полностью. Ионы NH₄⁺ оказывали ингибирующее действие при всех исследованных концентрациях. Представленные данные, на взгляд автора, свидетельствуют о специфичности взаимодействий моновалентных катионов с рибозимной РНК, способствующих, или, напротив, препятствующих предпочтительному бразованию активной конформации «головки молот¬ка». Рибозами типу «головка молотка», як і інші типи рибозимів, є металоензимами і їх активність залежить від присутності іонів двовалентних металів. Однак, якщо вплив іонів двовалентних металів на розщеплення субстрату рибозимом досліджено добре, то дія моновалентних катіонів досі не вивчалась систематично. В наведеній роботі проаналізовано вплив моновалентних катіонів (Н⁺ , k⁺ , Li⁺ , NH₄⁺ ) та іонів буферного середовища на ефективність розщеплення in vitro tat-PHK рибозимом типу «головка молотка». рН-залежність ефектив¬ності реакції мала дзвоноподібну форму з оптимумом при рН 7,0. Іони К і Li в концентрації 0,1 М стимулювали, а в концентраціях вище 0,2 М – зменшували ефективність роз¬щеплення. При концентрації солей близько 0,8 М реакція пригнічувалася практично повністю. Іони NH₄⁺ виявляли інгібуючу дію при всіх концентраціях, що вивчалися. Ці дані, на погляд автора, можуть свідчити про специфічність взаємодії моновалентних катіонів з рибозимною РНК, що може сприяти або, навпаки, перешкоджати утворенню активної конформації «головки молотка». The hammerhead ribozymes like other types of ribozymes are metalloenzymes, and their activity strongly depend on divalent metal ion presence. While influence of divalent metal ions on the cleavage of substrate by the hammerhead ribozymes was well characterised, effect of monovalent kations was not analyse systematically. In the present work influence of monovalent cations (H⁺, K⁺, Li⁺, NH₄⁺) and buffer ions on efficiency of the tat-RNA cleavage in vitro by hammerhead ribozyme was characterized. pH-dependence was shown to be bell-shaped with an optimum at pH 7.0. Both K⁺ and Li⁺ ions at concentration 0.1 M increased, and at concentrations higher 0.2 M decreased efficiency of cleavage. At concentration 0.8 M reaction seemed to be completely blocked. NH₄⁺ ions had inhibitory effect at all concentrations tested. The data presented here suggest specificity of interactions of monovalent cations with ribozyme RNA, that might promote, or vice versa, prevent forming active hammerhead conformation.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154653
citation_txt Влияние рН, ионной силы и ионного состава реакционной среды на эффективность расщепления in vitro tat-PHK ВИЧ-1 рибозимом модели «головка молотка» / Л.Н. Бурьяновский // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 1. — С. 30-35. — Бібліогр.: 20 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT burʹânovskiiln vliâniernionnoisilyiionnogosostavareakcionnoisredynaéffektivnostʹrasŝepleniâinvitrotatphkvič1ribozimommodeligolovkamolotka
AT burʹânovskiiln vplivrníonnoísilitaíonnogoskladureakcíinogoseredoviŝanaefektivnístʹrozŝeplennâinvitrotatphkvíl1ribozimommodelígolovkamolotka
AT burʹânovskiiln effectofphionicstrengthandioniccompositiononefficiencyofhammerheadribozymemediatedcleavageofthetatrnahiviinvitro
first_indexed 2025-12-07T15:42:43Z
last_indexed 2025-12-07T15:42:43Z
_version_ 1850864738007777280

Ähnliche Einträge