Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини

Значну частину супресорних генів астроцитарних пухлин до цих пір не ідентифіковано, незважа­ючи на те, що докази їхнього існування на різних хромосомах людини були підтверджені останніми роками численними дослідженнями. Тому пошук нових генів, активація або інактивація яких асоційована з прогресією...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Біополімери і клітина
Date:2001
Main Authors: Шостак, К.О., Дмитренко, В.В., Гарифулін, О.М., Розуменко, В.Д., Хоменко, О.В., Зозуля, Ю.П., Цехетнер, Г., Кавсан, В.М.
Format: Article
Language:Ukrainian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2001
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154671
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини / К.О. Шостак, В.В. Дмитренко, О.М. Гарифулін, В.Д. Розуменко, О.В. Хоменко, Ю.П. Зозуля, Г. Цехетнер, В.М. Кавсан // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 2. — С. 152-159. — Бібліогр.: 40 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1860065883072757760
author Шостак, К.О.
Дмитренко, В.В.
Гарифулін, О.М.
Розуменко, В.Д.
Хоменко, О.В.
Зозуля, Ю.П.
Цехетнер, Г.
Кавсан, В.М.
author_facet Шостак, К.О.
Дмитренко, В.В.
Гарифулін, О.М.
Розуменко, В.Д.
Хоменко, О.В.
Зозуля, Ю.П.
Цехетнер, Г.
Кавсан, В.М.
citation_txt Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини / К.О. Шостак, В.В. Дмитренко, О.М. Гарифулін, В.Д. Розуменко, О.В. Хоменко, Ю.П. Зозуля, Г. Цехетнер, В.М. Кавсан // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 2. — С. 152-159. — Бібліогр.: 40 назв. — укр.
collection DSpace DC
container_title Біополімери і клітина
description Значну частину супресорних генів астроцитарних пухлин до цих пір не ідентифіковано, незважа­ючи на те, що докази їхнього існування на різних хромосомах людини були підтверджені останніми роками численними дослідженнями. Тому пошук нових генів, активація або інактивація яких асоційована з прогресією гліальних пухлин, є метою інтенсивних досліджень. У даній роботі диференційна гібридизація «грид» упорядкованих бібліотек кДНК ембріонального і постнатального головного мозку людини показала різницю в рівні сигналу з пробами тотальної кДНК нормального головного мозку і мультиформної гліобластоми для більш ніж сотні клонів кДНК. Повторна диференційна гібридизація відібраних первинним скринінгом клонів, а також аналіз РНК зразків нормального головного мозку і гліальних пухлин дозволили виявити 16 нуклеотидних послідов­ностей, вміст яких змінюється в пухлинах. Серед мРНК, вміст яких зменшується в астроци­тарних пухлинах, було ідентифіковано мРНК TSC-22, відповідна кДНК якої міститься в клоні ICRFp507J1041 бібліотеки кДНК ембріонального головного мозку людини. Нозерн-гібридизація тотальних РНК чотирьох зразків нормального головного мозку та 17 зразків різних пухлин головного мозку виявила значне зменшення експресії гена TSC-22 в більшості зразків мультифор­мної гліобластоми, анапластичної астроцитоми, астроцитоми II ступеня злоякісності, а також у деяких інших новоутвореннях – загалом, в 12 індивідуальних пухлинах. В декількох пухлинах головного мозку експресія гена TSC-22 була відсутня повністю. Саузерн-гібридизація геномної ДНК виявила делеції в геномному локусі гена TSC-22 в двох із трьох досліджених зразків анапластичних астроцитом. Показаний у даній роботі суттєво зменшений рівень продукції мРНК TSC-22 в пухлинах головного мозку, описаний раніше зменшений вміст мРНК TSC-22 в пухлинах слинної залози, делеції в локусі гена TSC-22 в анапластичних астроцитомах, негативна роль білка TSC-22 в процесі проліферації клітин, локалізація гена TSC-22 на ділянці 13q14 поряд з геном ретинобластоми (Rb) – все це свідчить про потенційну супресорну роль зазначеного гена. Значительная часть супрессорных генов астроцитарних опу­холей до сих пор не идентифицирована, несмотря на то, что доказательства их существования на разных хромосомах че­ловека были подтверждены в последние годы многочисленными исследованиями. Поэтому поиск новых генов, активация или инактивация которых ассоциирована с прогрессией глиальных опухолей, является целью интенсивных исследований. В данной работе дифференциальная гибридизация «грид» упорядоченных библиотек к ДНК эмбрионального и постнатального голо­вного мозга человека показала разницу в уровне гибридизационного сигнала с пробами тотальной кДНК нормального голо­вного мозга и мультиформной глиобластомы для более чем сотни клонов к ДНК. Повторная дифференциальная гибридиза­ция отобранных первичным скринингом клонов, а также анализ РНК образцов нормального головного мозга и глиальных опухолей позволили определить 16 нуклеотидных последовательностей, содержание которых изменяется в опухолях. В астроцитарных опухолях с пониженным содержанием мРНК была идентифицирована мРНК TSC-22, соответствующая к ДНК которой содержится в клоне ICRFp507J1041 библиоте­ки кДНК эмбрионального головного мозга человека. Нозерн-гибридизация тотальных РНК четырех образцов нормального головного мозга и 17 образцов различных опухолей головного мозга выявила значительное снижение экспрессии гена TSC-22 в большинстве образцов мультиформной глиобластомы, анапластической астроцитомы, астроцитоми II степени злокачественности, а также в некоторых других новообразованиях – в целом, в 12 индивидуальных опухолях. В нескольких опухолях головного мозга экспрессия гена TSC-22 отсутствовала пол­ностью. Саузерн-гибридизация геномной ДНК выявила делеции в геномном локусе гена TSC-22 в двух из трех исследованных образцов анапластических астроцитом. Показанный в данной работе значительно пониженный уровень продукции мРНК TSC-22 в опухолях головного мозга, описанный ранее понижен­ный уровень мРНК TSC-22 в опухолях слюнной железы, деле­ции в локусе гена TSC-22 в анапластических астроцитомах, негативная роль белка TSC-22 в процессе пролиферации кле­ток, локализация гена TSC-22 на участке 13q14 рядом с геном ретинобластомы (Rb) – все это свидетельствует о потенци­альной супрессорной роли этого гена. At present some biological mechanisms assumed to initiate and promote astrocytoma formation have been partly revealed. Several putative genes in regions strongly suggested to harbour tumour suppressors should be identified. For example, these are the regions on the chromosomal arms 1p, 10p, 13q, 19g and 22g. More comprehensive approach in the analysis of astrocytomas includes gene expression determination in order to focus not only on the structural alterations but on the regulatory differences as well. Such changes in gene expression are important determinants of normal cellular physiology and, if disturbed, directly contribute to abnormal cellular physiology, including cancer. The search of new genes, the activation or inactivation of which is associated with the progression of astrocytic tumours, is still a goal of intensive investigations. In this work, more than a hundred cDNA clones differed in hybridization signals between human normal brain and glioblastoma multiform have been found by screening of high density grids of arrayed human fetal brain and human postnatal brain cDNA libraries. The repeated differential hybridization of the clones selected by primary screening, as well as the analysis of RNA from human adult normal brain and glial tumour samples have revealed 16 nucleotide sequences, which content had changed in tumours. The decreased content in astrocytic tumours has been determined for TSC-22 mRNA corresponding to cDNA in ICRFp507J 1041 clone from the library of human fetal brain cDNAs. The Northern blot hybridization of RNA from different human brain tumours has shown very low amount of TSC-22 mRNA in a bulk of the investigated samples of glioblastoma multiform, anaptastic astrocytoma, WHO grade II astrocytoma and some other tumours. The expression of TSC-22 gene has not been detected at all in astrocytoma WHO grade 11 as well as in meningioma, brain sarcoma, sarcomatous meningioma and oligodendroglioma (one sample of each tumor kind). The Southern blot hybridization has revealed the deletions in genomic loci of TSC-22 gene in two of three anaplastic astrocytomas analyzed. A significantly decreased level of the production of TSC-22 mRNA in the human brain tumours and, as it was shown previously, in the salivary gland tumours, an antiproliferative role of TSC-22 protein, the localization of TSC-22 gene in 13q14 region close to the known tumour suppressor retinoblastoma (Rb) gene, and the deletions in this genomic locus strongly evidence TSC-22 to be a tumour suppressor.
first_indexed 2025-12-07T17:07:33Z
format Article
fulltext ISSN 0233-7657. Біополімери і клітина. 2001. Т. 17. № 2 МОЛЕКУЛЯРНІ МЕХАНІЗМИ ДИФЕРЕНЦІЮВАННЯ Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини К. О. Шостак, В. В. Дмитренко, О. М. Тарифулін, В. Д. Розуменко1, О. В. Хоменко1, Ю. П. Зозуля 1, Г. Цехетнер2, В- М. Кавсан Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, 03143, Україна Інститут нейрохірургії ім. А. П, Ромоданова АМН України Вул. Манільського, 32, Київ, 04050, Україна 2 Інститут молекулярної генетики Макса Планка Берлін-Харлоттенбург 140059, Нойбнервег 6, Німеччина Значну частину супресорних генів астроцитарних пухлин до цих пір не ідентифіковано, незважа­ ючи на те, що докази їхнього існування на різних хромосомах людини були підтверджені останніми роками численними дослідженнями. Тому пошук нових генів, активація або інактивація яких асоційована з прогресією гліальних пухлин, є метою інтенсивних досліджень. У даній роботі диференційна гібридизація «грид» упорядкованих бібліотек кДНК ембріонального і постнатального головного мозку людини показала різницю в рівні сигналу з пробами тотальної кДНК нормального головного мозку і мультиформної гліобластоми для більш ніж сотні клонів кДНК. Повторна диференційна гібридизація відібраних первинним скринінгом клонів, а також аналіз РНК зразків нормального головного мозку і гліальних пухлин дозволили виявити 16 нуклеотидних послідов­ ностей, вміст яких змінюється в пухлинах. Серед мРНК, вміст яких зменшується в астроци­ тарних пухлинах, було ідентифіковано мРНК TSC-22, відповідна кДНК якої міститься в клоні ICRFp507JJ04J бібліотеки кДНК ембріонального головного мозку людини. Нозерн-гібридизація тотальних РНК чотирьох зразків нормального головного мозку та 17 зразків різних пухлин головного мозку виявила значне зменшення експресії гена TSC-22 в більшості зразків мультифор­ мної гліобластоми, анапластичної астроцитоми, астроцитоми II ступеня злоякісності, а також у деяких інших новоутвореннях — загалом, в 12 індивідуальних пухлинах. В декількох пухлинах головного мозку експресія гена TSC-22 була відсутня повністю. Саузерн-гібридизація геномної ДНК виявила делеції в геномному локусі гена TSC-22 в двох із трьох досліджених зразків анапластичних астроцитом. Показаний у даній роботі суттєво зменшений рівень продукції мРНК TSC-22 в пухлинах головного мозку, описаний раніше зменшений вміст мРНК TSC-22 в пухлинах слинної залози, делеції в локусі гена TSC-22 в анапластичних астроцитомах, негативна роль білка TSC-22 в процесі проліферації клітин, локалізація гена TSC-22 на ділянці 13д14 поряд з геном ретинобластоми (Rb) — все це свідчить про потенційну супресорну роль зазначеного гена. Вступ. Сучасні уявлення щодо молекулярних основ пухлин головного мозку людини відображають комплексну взаємодію між численними генетични­ ми подіями, які включають хромосомні аномалії, активацію протоонкогенів, інактивацію супресор­ них генів пухлин, аберантну експресію факторів росту і їхніх рецепторів. Різними науковими група- © К О. ШОСТАК, В. В. ДМИТРЕНКО, О. М. ГАРИФУЛІН, В. Д. РОЗУМЕНКО, О. В. ХОМЕНКО, Ю. П. ЗОЗУЛЯ, Г. ЦЕХЕТНЕР, В. М. КАВСАН, 2001 ми були отримані цитогенетичні і молекулярно-ге­ нетичні докази інактивації в пухлинах головного мозку потенційних супресорних генів пухлин, які знаходяться на хромосомах 1р, 9р, 10, l i p , 13q, 17р, 19q та 22q [1—7] . Однак значну частину цих генів ще й досі не ідентифіковано. Більш інформативний підхід до вивчення моле­ кулярних основ пухлин головного мозку включає вивчення експресії генів з метою концентрування уваги не лише на структурних змінах, а й на регуляторних відмінностях. Варіації в експресії 152 ПОТЕНЦІЙНА СУПРЕСОРНА РОЛЬ ГЕНА TSC-22 В ПУХЛИНАХ МОЗКУ генів є важливими показниками нормальної клі­ тинної фізіології, і при порушеннях роблять пря­ мий внесок у клітинні аномалії, до яких входить і пухлинний процес. У цьому контексті можна очі­ кувати, що ідентифікація, клонування і характери­ стика генів із зміненою в пухлинних клітинах експресією забезпечать важливу інформацію для кращого розуміння механізмів виникнення і про­ гресії злоякісних новоутворень. Краще розуміння цих процесів має важливе значення для удоскона­ лення діагностики і прогностичної оцінки, для виз­ начення біологічних мішеней при розробці хіміо­ терапевтичних препаратів. Таким чином, пошук нових генів, активація або репресія яких асо­ ційована з прогресією астроцитарних пухлин, є на сьогодні метою інтенсивних досліджень. Для виявлення змін в експресії генів в астро­ цитарних пухлинах головного мозку людини нами була використана д и ф е р е н ц і й н а г ібридизац ія «грид» упорядкованих бібліотек к Д Н К ембріональ­ ного та постнатального головного мозку людини з пробами тотальних к Д Н К нормального головного мозку та мультиформної гліобластоми. Клони кДНК, для яких виявлено різницю в інтенсивності гібридизації з використаними пробами, були оха­ рактеризовані за допомогою аналізу нуклеотидної послідовності вставок к Д Н К . Розміри транскриптів і рівні експресії відповідних генів в астроцитарних пухлинах різного ступеня злоякісності, а також в інших типах пухлин головного мозку визначали Нозерн-гібридизацією Р Н К , виділеної з хірургіч­ них зразків пухлин. Серед генів, рівень експресії яких зменшується в астроцитарних пухлинах, виявлено ген TSC-22. Вперше цей ген виділено з лінії мишачих остео­ бластів як ген, що стимулюється трансформуючим фактором росту /?1 (TGF-/J1 stimulated clone 22) [8] . Він кодує білок, який містить «лейцинову блискавку», і є транскрипційним репресором [9] . Раніше було показано, що рівень експресії гена TSC-22 суттєво знижений в пухлинах слинної за­ лози, а також, що даун-регуляція гена TSC-22 значно посилює ріст клітинної лінії раку слинної залози [10, 11] . Ці дані, а також отримані нами результати стосовно зменшеного рівня експресії TSC-22 в пухлинах головного мозку і виявлені делеції в локусі гена TSC-22 в анапластичних астроцитомах свідчать про потенційну супресорну роль цього гена в онкогенезі. Матеріали і методи. Диференційну гібридиза­ цію «грид» упорядкованих бібліотек к Д Н К ембріо­ нального та постнатального головного мозку люди­ ни, одержаних з Центру ресурсів і бази даних проекту «Геном людини» Німеччини (RZPD, R e ­ source Zen t rum/Pr imary Data Base) , з пробами тотальних к Д Н К нормального головного мозку і мультиформної гліобластоми здійснювали, як опи­ сано в наших попередніх роботах з визначення генів з різною специфічністю експресії [12—14]. Нуклеотидні послідовності вставок к Д Н К визнача­ ли за методом Сенгера [15] . Нозерн-гібридизацію Р Н К , виділеної гуанідинтіоціанатним методом [16] із заморожених у рідкому азоті хірургічних зразків пухлин головного мозку та нормального головного мозку, які отримані в Інституті нейрохірургії ім. А. П. Ромоданова АМН України, проводили згідно із стандартними методиками [17] . Синтез міченої дигоксигеніном проби к Д Н К ICRFp507J1041 за до­ помогою полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) та Саузерн-гібридизацію геномної Д Н К з міченою дигоксигеніном пробою проводили згідно з інструк­ цією виробника («Boehringer Mannheim», Німеч­ чина) . Результати і обговорення. Диференційна гіб­ ридизація упорядкованих бібліотек к Д Н К ембріо­ нального і постнатального головного мозку людини показала різницю в гібридизації з пробами тоталь­ ної к Д Н К нормального головного мозку і мульти­ формної гліобластоми для більш ніж сотні клонів к Д Н К . Подібно до віднімальної гібридизації [18] , цей метод має перевагу в тому, що не потребує попередньої інформації про нуклеотидні послідов­ ності, однак є унікальним, оскільки дозволяє порі­ внювати як загальні, так і специфічні м Р Н К в декількох тканинах або зразках клітин одночасно [19] . Таким чином, в одному експерименті можна ідентифікувати гени, які експресуються лише в нормальних тканинах, іншими словами це по­ тенційні супресорні гени пухлин, а також гени, які , навпаки, мають пухлиноспецифічну експресію, то­ бто є маркерами пухлин, або ж активованими онкогенами. Повторна диференційна гібридизація відібра­ них первинним скринінгом клонів, а також аналіз Р Н К зразків нормального головного мозку і гліаль­ них пухлин дозволили виявити 16 нуклеотидних послідовностей, вміст яких змінюється в пухлинах. Серед м Р Н К , вміст яких зменшується в пухлинах головного мозку, було ідентифіковано м Р Н К TSC- 22, в ідповідна к Д Н К якої міститься в клоні ICRFp507J1041 бібліотеки к Д Н К ембріонального головного мозку людини. Нуклеотидна послідов­ ність к Д Н К ICRFp507J1041 (рис. 1) є ідентичною опублікованій раніше нуклеотидній послідовності к Д Н К TSC-22 [20, 21 ], однак З '-нетрансльований район к Д Н К ICRFp507J1041 коротший на два нук- леотиди порівняно з З ' -нетрансльованим районом к Д Н К TSC-22 в цих роботах. Аналогічна гетеро- 153 ШОСТАК К. О. ТА ІН. Рис. 1. Нуклеотидна послідовність кДНК ICRFp507J1041 і дедукована амінокислотна послідовність TSC-22 людини. Амінокислотну послідовність позначено однолітерним кодом над першими позиціями кодонів. Чотири лейцинові і один валіновий залишки, які формують «лейцинову блискавку», і сигнал поліаденілювання підкреслено. Нуклеотидні послідовності праймерів ргі і рг2, використаних для синтезу міченої дигоксигеніном проби, позначено стрілками. Реєстраційний номер нуклеотидної послідовності в базі даних EMBL AJ222700 154 ПОТЕНЦІЙНА СУПРЕСОРНА РОЛЬ ГЕНА TSC-22 В ПУХЛИНАХ МОЗКУ генність сайт ів п о л і а д е н і л ю в а н н я первинного транскрипту з використанням одного й того ж сигналу поліаденілювання була описана нами для трьох генів (альбуміну, °у-глобіну та А у~ г л °б іну) в клітинах печінки людини [22] , а також опублі­ кована іншими авторами для декількох інших генів [23—27 ]. Ген TSC-22 є еволюційно консервативним. З а допомогою Саузерн-гібридизації геномних Д Н К з різних організмів, так званого зоо-блота, було ви­ явлено нуклеотидні послідовності цього гена у хре­ бетних — людини, миші, корови, курки, жаби та риби [21 ]; його було клоновано у людини [20, 21 ], миші [8] , щура [28] , курки [29] . Крім того, комп'ютерний аналіз показав, що білок TSC-22 має 69 % гомології з коротшим за розміром пепти­ дом DSIP (delta-sleep-inducing peptide) свині [ЗО ] і 52 % гомології — з білком короткозорості дро­ зофіли shs (shortsighted) [31 ]. Білок TSC-22 і його гомологи містять мотив «лейцинової блискавки». Це вказує на їхню можливу функцію як транс­ крипційних факторів, хоча на відміну від відомих транскрипційних факторів родини bZIP та b H L H - Zip TSC-22 не має класичного ДНК-зв 'язуючого домену. TSC-22 є транскрипційним регулятором промотора гена натрійуретичного пептиду С (CNP, C-type natriuretic peptide) , взаємодіючи з GC-бага- тим районом цього промотору [21 ]. Нещодавно було знайдено, що TSC-22 є транскрипційним ре- пресором, функціонуючи як гомодимер, який утво­ рюється за рахунок «лейцинової блискавки» [9 ] . Не виключено, що TSC-22 може утворювати гете- родимери з іншими партнерами, які містять «лей­ цинову блискавку», і, таким чином, або репресува­ ти класичні транскрипційні активатори, як це роб­ лять , наприклад, домінантно-негативні білки Id l — Id4 з родини факторів, що мають мотив спіраль- петля-спіраль (helix-loop-helix) [32] , або зміню­ вати свою репресорну функцію. Ген TSC-22 спочатку був виявлений в біб­ ліотеці к Д Н К остеобластами миші як клон, що стимулюється TGF-/H [8] і належить до родини генів ранньої відповіді. Експресія цього гена також швидко зростає при обробці клітин іншими ци- токінами, фактором некрозу пухлин а , / - інтер­ фероном і деякими індукторами, такими як декса- метазон, токсин холери або 12-міристат, 13-ацетат- діефір форболу, ліпополісахариди [20] . Вивчення механізму дії пригнічення прогестероном росту клі ­ тинної лінії T47D карциноми молочної залози л ю ­ дини і індукції диференціювання цих клітин пока­ зало, що ген TSC-22 є однією з мішеней прогесте­ рону [33] . Індукція прогестереном свідчить про наявність нуклеотидних послідовностей в промоторі гена TSC-22, які відповідають за зв 'язування з рецептором прогестерону, так званих елементів PRE (progesterone response e lement) . Експресія ге­ на зростала у відповідь на дексаметазон — синте­ тичний активатор рецептора глюкокортико'щу [8] . Останній, подібно до рецептора прогестерону, ак­ тивує промотори деяких генів у результаті взає­ модії з послідовностями G R E (glucocorticoid res­ ponse element) , аналогічними P R E . Для визначення рівня експресії гена TSC-22 в пухлинах головного мозку з хірургічних зразків гліальних пухлин виділено тотальну Р Н К і прове­ дено Нозерн-гібридизацію з радіоактивно міченою пробою к Д Н К ICRFp507J104L Н а рис. 2 наведено Рис. 2. Аналіз експресії гена TSC-22 в нормальних тканинах людини і пухлинах головного мозку людини: а — Нозерн-гібридизація з міченою радіоізотопом 3 2 Р кДНК ICRFp507J1041; б — гібридизація з контрольною пробою кДНК бета-актину. Кожна доріжка містить 20 мкг тотальної РНК (/ — серце; 2 — нирка; 3—6 — зразки нормального головного мозку; 7—10 — зразки мультиформної гліобластоми; 11—/J, 21 — зразки анапластичної астроцитоми; 16 — ембріональний мозок (вік 6 тижнів); 77, 19 — зразки менінготеліальніої менінгіоми; 18, 20 — зразки астроцитоми 2-го ступеня злоякісності; 22 — саркоматозна менінгіома; 23 — саркома мозку; 24 — олігодендрогліома 2—3-го ступеня злоякісності 155 ШОСТАК К. О. ТА ІН. результати Нозерн-гібридизації Р Н К , одержаної з хірургічних зразків гліальних пухлин різного сту­ пеня злоякісності, В усіх зразках виявляється транскрипт розміром 1,8 тис. нуклеотидів. Як по­ казано [20, 21 ], ген TSC-22 експресується у виг­ ляді одного транскрипту розміром 1,8 тис. нуклео­ тидів у широкому асортименті клітин, за винятком периферійних лейкоцитів, причому найвищий рі­ вень експресії — в клітинах серця, мозку і легень, а також товстої кишки. В наших експериментах найінтенсивніший гібридизаційний сигнал був з Р Н К головного мозку дорослої людини, зразки 58А, 55А, 54А, 52А (доріжки 3—6 відповідно), трохи слабший — з Р Н К серця і нирок дорослої людини (доріжки 1 і 2 відповідно). Більшість зраз­ ків Р Н К пухлин головного мозку виявила гібри­ дизаційні сигнали меншої інтенсивності, ніж Р Н К нормального головного мозку. Порівняння інтенсивності гібридизації Р Н К з пробою к Д Н К TSC-22 відносно гібридизації з кон­ трольною пробою к Д Н К ^-актину однозначно де­ монструє значне зменшення вмісту м Р Н К TSC-22 в трьох зразках мультиформної гліобластоми (зраз­ ки 56, 93 , 106; доріжки 8—10 відповідно). Зниже­ ний рівень цієї Р Н К спостерігається і в четвертому зразку мультиформної гліобластоми (зразок 59, доріжка 7) . Значно зменшений рівень м Р Н К TSC- 22 відмічено в трьох з п 'яти анапластичних астро­ цитом (зразки 99, 92, 55; доріжки 77—72, 14 відповідно), причому в двох з них м Р Н К TSC-22 майже відсутня. Дуже низьким є вміст м Р Н К TSC-22 в одній з двох астроцитом II ступеня злоякісності (зразок 52, доріжка 18) і в одній з двох доброякісних менінгіом (зразок 36, доріжка 77). Практично відсутня м Р Н К TSC-22 і в інших типах злоякісних пухлин головного мозку — в сар­ коматозній менінгіомі, саркомі, а також оліго- дендрогліомі II—НІ ступеня (зразки 18, 4, 62; доріжки 22, 23 і 24 відповідно). Таким чином, проведена нами Нозерн-гібри- дизація Р Н К показала, що ген TSC-22 інактиву- ється більш ніж в половині астроцитарних пухлин, а також в інших типах пухлин головного мозку, навіть на ранніх стадіях їхнього формування. Аналіз експресії гена TSC-22 в доброякісних і злоякісних пухлинах слинної залози [10] виявив зменшений вміст м Р Н К TSC-22 порівняно з нор­ мальними клітинами, а в деяких пухлинах — її повну відсутність. Ці результати свідчать про те, що зменшений рівень TSC-22 може відігравати мажорну роль у пухлинному процесі клітин слин­ ної залози. TSC-22 є негативним регулятором про­ ліферації, виконуючи роль посередника в цьому процесі, передаючи сигнал від TGF-/21 [34] . Транс- фекція клітин HSC-39 конструкцією, яка експресує TSC-22, призводила до суттєвого зниження жит­ тєдайності клітин і спричиняла їхній апоптоз, дуже вірогідно, за участю протеазної активності типу СРР32. Специфічний синтетичний пептидний ін­ гібітор протеази СРР32 пригнічував апоптоз клітин як TGF-/H-опосередкований, так і той, що був результатом дії TSC-22. Отже, TSC-22 напевне викликав апоптоз клітин карциноми шлунка люди­ ни шляхом активації СРР32-подібної протеазної активності, а також, можливо, брав участь в апоп- тозі клітин, який індукувався під дією TGF-/?1. Введення до клітин TYS раку слинної залози, оброблених веснаріноном (новий протипухлинний лікарський засіб), антисенс-олігонуклеотиду проти м Р Н К TSC-22 стимулює ріст клітин TYS за пасив­ них умов [10] . Однак в умовах росту клітин антисенс-олігонуклеотид не впливає на ріст клітин. Більше того, антисенс-олігонуклеотид супресує ан- типроліферативний ефект веснарінону. Ці резуль­ тати показують, що TSC-22 є негативним регуля­ тором росту і може відігравати важливу роль в антипроліферативному ефекті веснарінону [10] . Для з 'ясування ролі зростання або зниження експресії TSC-22 на ріст клітин TYS in vitro та in vivo було проведено трансфекцію клітин вектора­ ми, які експресують смислову і антисмислову Р Н К TSC-22, і проаналізовано ріст клітин in vitro та їхній пухлинний потенціал в експериментах з «го­ лими мишами» [11] . Експресія білка TSC-22 була підвищеною в смислових трансфектантах і зниже­ ною — в антисмислових. Всупереч очікуваному, підвищений рівень білка TSC-22 не впливає на ріст клітин in vitro та in vivo, однак знижений рівень білка TSC-22 помітно посилює ріст клітин TYS як in vitro, так і in vivo. Ген TSC-22 людини був картований на довгому плечі 13-ї хромосоми в районі q l 4 [20] . Приблизно в 50 % астроцитом відбувається втрата довгого плеча хромосоми 13, що свідчить про присутність супресорного гена на цій хромосомі [35—38 ]. Гете­ розиготність в локусі гена ретинобластоми (Rb) на ділянці 13ql4 відсутня в ЗО % астроцитом високого ступеня злоякісності і її не знайдено ні в одній з астроцитом низького ступеня [35] . Ці результати свідчать про те, що локус гена R b є однією з мішеней делецій на ділянці 13ql4, однак вказують і на можливість існування іншого супресорного гена астроцитом на цій ділянці. Для виявлення потенційних делецій в локусі гена TSC-22 нами був здійснений аналіз геномної Д Н К , одержаної з трьох зразків анапластичних астроцитом, одного зразка нормального головного мозку і одного зразка нормальної нирки. Саузерн- 156 ПОТЕНЦІЙНА СУПРЕСОРНА РОЛЬ ГЕНА TSC-22 В ПУХЛИНАХ МОЗКУ EcoRI Hindlll Рис. 3. Саузерн-гібридизація геномних ДНК з міченим дигокси­ геніном фрагментом ICRFp507J1041. Кожна доріжка містить 10 мкг геномної ДНК, розщепленої рестрикційною ендонуклеазою EcoRl (а), або Hindlll (б): І — нирка; 2, і , 5 -— зразки анапла- стичної астроцитоми; 4 — нормальний головний мозок. Право­ руч вказано приблизні розміри фрагментів у тис. п. н. гібридизація геномних Д Н К з міченим дигокси­ геніном фрагментом к Д Н К ICRFp507J 1041, отри­ маним за допомогою П Л Р з праймерами ргі та рг2 (позиції праймерів позначено на рис. 1), показала відсутність # ш ^ / / / - ф р а г м е н т а розміром 7,0 тис. п. н. у ДНК двох анапластичних астроцитом (рис. З, доріжки 2 і 3). Це свідчить про втрату генетичного матеріалу в локусі гена TSC-22 в цих двох пухли­ нах. Отримані нами результати щодо суттєвого зме­ ншення вмісту м Р Н К TSC-22 в пухлинах головного мозку, показана раніше іншими авторами відсут­ ність експресії гена в пухлинах слинної залози, негативна роль білка TSC-22 в процесі пролі­ ферації клітин, делеції в геномному локусі гена TSC-22, що знаходиться на довгому плечі хромосо­ ми 13 — відомій мішені делецій в астроцитарних пухлинах, все це разом свідчить про потенційну супресорну роль згаданого гена в пухлинному про­ цесі. Геноінженерні конструкції з геном TSC-22 мо­ жуть мати практичне використання при хіміо­ терапії пухлин. В експериментах з трансфекції клітинної лінії TYS раку слинної залозі людини та в експериментах з «голими мишами» було показа­ но, що надекспресія TSC-22 посилює індукований 5-бромурацилом апоптоз клітин TYS [39 ], а також чутливість пухлин in vivo до 5-бромурацилу [40 ]. Робота частково фінансувалася за рахунок гра­ нта Фонду фундаментальних досліджень 5.4.46 «Транскрипційне картування окремих районів 21-ї хромосоми людини». К. О. Shostak, V. V. Dmitrenko, О. М. Garifulin, V. D. Rozumenko, О. V. Khomenko, Yu. A. Zozulya, G. Zehetner, V. M. Kavsan Potential tumour suppressor role of TSC-22 gene in human brain tumours Summary At present some biological mechanisms assumed to initiate and promote astrocytoma formation have been partly revealed. Several putative genes in regions strongly suggested to harbour tumour suppressors should be identified. For example, these are the regions on the chromosomal arms lp, JOp, 13q, 19q and 22q. More comprehensive approach in the analysis of astrocytomas includes gene expression determination in order to focus not only on the structural alterations but on the regulatory differences as well. Such changes in gene expression are important determinants of normal cellular physiology and, if disturbed, directly contribute to abnormal cellular physiology, including cancer. The search of new genes, the activation or inactivation of which is associated with the progression of astrocytic tumours, is still a goal of intensive investigations. In this work, more than a hundred cDNA clones differed in hybridization signals between human normal brain and glioblastoma multiform have been found by screening of high density grids of arrayed human fetal brain and human postnatal brain cDNA libraries. The repeated differential hybridization of the clones selected by primary screening, as well as the analysis of RNA from human adult normal brain and glial tumour samples have revealed 16 nucleotide sequences, which content had changed in tumours. The decreased content in astrocytic tumours has been determined for TSC-22 mRNA corresponding to cDNA in ICRFp507J 1041 clone from the library of human fetal brain cDNAs. The Northern blot hybridization of RNA from different human brain tumours has shown very low amount of TSC-22 mRNA in a bulk of the investigated samples of glioblastoma multiform, anaplastic astro­ cytoma, WHO grade II astrocytoma and some other tumours. The expression of TSC-22 gene has not been detected at all in astrocytoma WHO grade II as well as in meningioma, brain sarcoma, sarcomatous meningioma and oligodendroglioma (one sample of each tumor kind). The Southern blot hybridization has revealed the deletions in genomic loci of TSC-22 gene in two of three anaplastic astrocytomas analyzed. A significantly decreased level of the production of TSC-22 mRNA in the human brain tumours and, as it was shown previously, in the salivary gland tumours, an antiproliferative role of TSC-22 protein, the lo­ calization of TSC-22 gene in 13ql4 region close to the known tumour suppressor retinoblastoma (Rb) gene, and the deletions in this genomic locus strongly evidence TSC-22 to be a tumour suppressor. E. А. Шостак, В. В. Дмитренко, О. М. Гарифулин, В. Д. Розуменко, О. В. Хоменко, Ю. П. Зозуля, Г. Цехетнер, В. М. Кавсан Потенциальная супрессорная роль гена TSC-22 в опухолях головного мозга человека Резюме Значительная часть супрессорных генов астроцитарних опу­ холей до сих пор не идентифицирована, несмотря на то, что доказательства их существования на разных хромосомах че­ ловека были подтверждены в последние годы многочисленными исследованиями. Поэтому поиск новых генов, активация или инактивация которых ассоциирована с прогрессией глиальных опухолей, является целью интенсивных исследований. В дан­ ной работе дифференциальная гибридизация «грид» упорядочен- 157 ШОСТАК К. О. ТА ІН. ных библиотек к ДНК эмбрионального и постнатального голо­ вного мозга человека показала разницу в уровне гибридизацион- ного сигнала с пробами тотальной кДНК нормального голо­ вного мозга и мультиформной глиобластомы для более чем сотни клонов к ДНК. Повторная дифференциальная гибридиза­ ция отобранных первичным скринингом клонов, а также анализ РНК образцов нормального головного мозга и глиаль- ных опухолей позволили определить 16 нуклеотидных последо­ вательностей, содержание которых изменяется в опухолях. В астроцитарных опухолях с пониженным содержанием мРНК была идентифицирована мРНК TSC-22, соответствующая к ДНК которой содержится в клоне ICRFp507J1041 библиоте­ ки кДНК эмбрионального головного мозга человека. Нозерн- гибридизация тотальных РНК четырех образцов нормального головного мозга и 17 образцов различных опухолей головного мозга выявила значительное снижение экспрессии гена TSC-22 в большинстве образцов мультиформной глиобластомы, анап- ластической астроцитомы, астроцитоми II степени злокаче­ ственности, а также в некоторых других новообразованиях — в целом, в 12 индивидуальных опухолях. В нескольких опухолях головного мозга экспрессия гена TSC-22 отсутствовала пол­ ностью. Саузерн-гибридизация геномной ДНК выявила делеции в геномном локусе гена TSC-22 в двух из трех исследованных образцов анапластических астроцитом. Показанный в данной работе значительно пониженный уровень продукции мРНК TSC-22 в опухолях головного мозга, описанный ранее понижен­ ный уровень мРНК TSC-22 в опухолях слюнной железы, деле­ ции в локусе гена TSC-22 в анапластических астроцитомах, негативная роль белка TSC-22 в процессе пролиферации кле­ ток, локализация гена TSC-22 на участке 13ql4 рядом с геном ретинобластомы (Rb) — все это свидетельствует о потенци­ альной супрессорной роли этого гена. ПЕРЕЛІК ЛІТЕРАТУРИ 1. Maier D., Zhang Z., Taylor E., Hamou M.-F., Gratzl O., Van Meir E. G., Scott R. G., Merlo A. Somatic deletion mapping on chromosome 10 and sequence analysis of PTEN/MMAC1 point to the 10q25-26 region as the primary target in low-grade and high-grade gliomas / / Oncogene.—1998.—16.— P. 3331—3335. 2. Rosenberg E. J., Lisle D. K, Burwick J. A., Ueki K, von Deimling A., Mohrenweiser H. W., Louis D. N. Refined deletion mapping of the chromosome 19q glioma tumor sup­ pressor gene to the D19S412-STD interval / / Oncogene.— 1996.—13.—P. 2483—2485. 3 . 1 no Y., Silver J. S., Blazejewski L., Nishikawa R., Matsutani M., von Deimling A., Louis D. N. Common regions of deletions on chromosome 22ql2.3ql3.1 and 22ql3.2 in human astro­ cytomas appear related to malignancy grade / / J. Neuropathol. Exp. Neurol.—1999.—58.—P. 881—885. 4. Simons A., Jeuken J. W., Eleweld M. J., Boerman R. H., Geurts Van Kessel A. Isolation and characterization of glioblas- toma-associated homozygously deleted DNA fragments from chromosomal region 9p21 suggests involvement of multiple tumour suppressor genes / / J. Pathol.—1999.—189.— P. 402—409. 5. Smith J. S., Tachibana I., Allen C, Chiappa S. A., Lee H. К, M elver В., Jenkins R. В., Raff el C. Cloning of a human ortholog (RPH3AL) of (RNO)Rph3al from a candidate 17pl3.3 medulloblastoma tumor suppressor locus / / Geno­ mics.—1999.—59.—P. 97—101. 6. Farrell W. E., Clayton R. N. Tumor suppressor genes in pituitary tumour formation / / Ballieres Best Pract. Res. Clin. Endocrinol. Metab.—1999.—13.—P. 81—93. 7. Bello M. J., de Campos J. M., Vaquero J., Kusak M. E., Sarasa J. L., Rey J. A. High-resolution analysis of chromosome arm lp alterations in meningioma / / Cancer Genet. Cyto- genet—2000.—20.—P. 30—36. 8. Shibanuma M., Kuroki Т., Nose K. Isolation of a gene encoding a putative leucine zipper structure that is induced by transforming growth factor betal and other growth factors / / J. Biol. Chem.—1992.—267.—P. 10219—10224. 9. Kestler H. A., Blanchetot C, den Hertog J., van der Saag P. Т., van der Burg B. Transforming growth factor beta stimulated clone TSC-22 is a member of a family of leucine zipper proteins that can homo- and heterodimerize and has transcrip­ tional repressor activity / / J. Biol. Chem.—1999.—274.— P. 27439—27447. 10. Kawamata H, Nakashiro K, Uchida D., Hino S., Omotehara F., Yoshida H, Sato M. Induction of TSC-22 by treatment with a new anti-cancer drug, vesnarinone, in a human salivary gland cancer cell / / Brit. J. Cancer.—1998.—77.—P. 71—78. 11. Nakashiro K, Kawamata H, Hino S., Uchida D., Miwa Y., Hamano H., Omotehara F., Yoshida H., Sato M. Down- regulation of TSC-22 (transforming growth factor beta-stimu­ lated clone 22) markedly enhances the growth of a human salivary gland cancer cell line in vitro and in vivo II Cancer Res.—1998.—58.—P. 549—555. 12. Дмитренко В. В., Гарифулин О. М., Смикодуб А. И., Кавсан В. М. Анализ экспрессии генома человека при помощи библиотек кДНК различных органов / / Цитология и генетика.—1995.—29.—С. 64—71. 13. Дмитренко В. В., Гарифулин О. М., Шостак Е. А., Смикодуб А. И., Кавсан В. М. Характеристика различных типов мРНК, экспрессирующихся в головном мозге че­ ловека / / Цитология и генетика.—1996.—30.—С. 41—47. 14. Дмитренко В. В., Шостак К О., Гарифулін О. М,, Зозуля Ю. П., Кавсан В. М. Зміни експресії генів у клітинах астроцитом головного мозку людини / / Эксперим. онко­ логия.—1998.—20.—С. 191—197. 15. Sanger F. S., Nicklen S., Coulson A. R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors / / Proc. Nat. Acad. Sci. USA.— 1977.—74.—P. 6463—6467. 16. Chomchinsky P., Sacchi N. Single step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction / / Anal. Biochem.—1987.—162.—P. 156—159. 17. Sambrook J., Fritch E. F., Maniatis T. Molecular cloning. A laboratory manual.—New York: Cold Spring Harbor Lab. press, 1989. 18. Diachenko L, Lau Y.-F. C, Campbell A. P., Chenchik A., Mogadam F., Huang В., Lukyanov S., Gurskaya N., Sverdlov E. D., Siebert P. D. Suppression subtractive hybridization. A method for generating differentially regulated or tissue-specific cDNA probes and libraries / / Proc. Nat. Acad. Sci. USA.— 1996.—93.—P. 6025—6030. 19. Nguyen C, Rocha D., Granjeaud S., Baldit M., Bernard K, Naquet P., Jordan B. R. Differential gene expression in the murine thymus assayed by quantitative hybridization of ar­ rayed cDNA clones / / Genomics.—1995.—29.—P. 207—216. 20. Jay P., J і J. W., Marsollier C, Taviaux S., Berge-Lefranc J.-L., Berta P. Cloning of the human homologue of the TGFbeta-stimulated clone 22 gene / / Biochem. and Biophys. Res. Communs.—1996.—222.—P. 821—826. 21. Ohta S., Shimekake Y., Nagata K. Molecular cloning and characterization of a transcription factor for the C-type natri­ uretic peptide gene promoter / / Eur. J. Biochem.—1996.— 242.—P. 460—466. 22. Dmitrenko V. V., Kavsan V. M. Variability of polyadenylation sites in mRNAs from human fetal liver / / FEBS Lett.—1991.— 280.—P. 284—286. 23. Simonsen С. C, Levinson A. D. Analysis of processing and polyadenylation signals of the hepatitis B virus surface antigen 158 ПОТЕНЦІЙНА СУПРЕСОРНА РОЛЬ ГЕНА TSC-22 В ПУХЛИНАХ МОЗКУ gene by using simian virus 40 — hepatitis В vims chimeric plasmids / / Мої. and Cell. Biol.—1983.—3.—P. 2250—2258. 24. Sasavage N L, Smith M., Gillam S., Woychick R. P., Rotmann F. M. Variation in polyadenylation site of bovine prolactin mRNA / / Proc. Nat. Acad. Sci. USA.—1982,—79.— P. 223—227. 25. Wiedemann L. M., Perry R. P. Characterization of the expressed gene and several processed pseudogenes for the mouse ribosomal protein L30 gene family / / Мої. and Cell. Biol.—1984.—4.—P. 2518—2528. 26. Aho S., Tate V., Boedtker H. Multiple 3' ends of the chicken pro al(I) collagen gene / / Nucl. Acids Res.—1983.—11.— P. 5443—5450. 27. Hernandez-Lucas C, Roy о J., Paz-Ares J., Ponz F., Garcia- Olmedo F, Carbonero P. Polyadenylation site heterogeneity in mRNA encoding the precursor of the barley toxin /?-hor- dothionin / / FEBS Lett.—1986.—200.—P. 103—106. 28. Hamil JC G, Hall S. H. Cloning of rat Sertoli cell follicle- stimulating hormone primary response complementary deoxy­ ribonucleic acid: regulation of TSC-22 gene expression / / Endocrinology.—1994.—134.—P. 1205—1212. 29. Sawada JC, Agata JC, Eguchi G. Characterization of terminally differentiated cell state by categorizing cDNA clones derived from chicken lens fibers / / Int. J. Dev. Biol.—1996.—40.— P. 531—535. 30. Sillard R., Schulz-Knappe P., Vogel P., Raida M., Bensch K. W., Forssman W. G., Mutt V. A novel 77-residue peptide from porcine brain contains a leucine-zipper motif and is recognized by an antiserum to delta-sleep-inducing peptide / / Eur. J. Biochem.—1993.—216.—P. 429—436. 31. Treisman J. E., Lai Z. C, Rubin G. M. Shortsighted acts in the decapentaplegic pathway in Drosophila eye development and has homology to a mouse TGF-beta-responsive gene / / Development.—1995.—121.—P. 2835—2845. 32. Riechmann V., van Cruchten L, Sablitzky F. The expression pattern of Id4, a novel dominant negative helix-loop-helix protein, is distinct from Idl, Id2 and Id3 / / Nucl. Acids Res.—1994.—22.—P. 749—55. 33. Kestler H. A., van der Leebe B.-J. M., van der Saag P. Т., van der Burg B. Novel progesterone target genes identified by an improved differential display technique suggest that progest- ing-induced growth inhibition of breast cancer cells coincides with enchancement of differentiation / / J. Biol. Chem.— 1997.—272.—P. 16637—16643. 34. Ohta S., Yanagihara JC, N agata К Mechanism of apoptotic cell death of human gastric carcinoma cells mediated by transforming growth factor beta / / Biochem. J.—1997.— 324.—P. 777—782. 35. Henson J. W., Schnitker B. L., Correa 1С M., von Deimling A., Fassender F, Xu H. J., Benedict W. F, Yandell D. W., Louis D. N. The retinoblastoma gene is involved in malignant progression of astrocytomas / / Ann. Neurol.—1994.—36.— P. 714—721. 36. Huhn S. L, Mohapatra G., Bollen A., Lamborn JC, Prados M. D., Feuerstein B. G. Chromosomal abnormalities in glioblas­ toma multiforme by comparative genomic hybridization: cor­ relation with radiation treatment outcome / / Clin. Cancer Res.—1999.—5.—P. 1435—1443. 37. Venkatraj V. S., Begemann M., Sobrino A., Bruce J. N, Weinstein I. В., Warburton D. Genomic changes in glioblas­ toma cell lines detected by comparative genomic hybridization / / J. Neurooncol.—1998.—36.—P. 141—148. 38. Harada K., Nishizaki Т., Ozaki S., Kubota H., Ho H, Sasaki JC Intratumoral cytogenetic heterogeneity detected by com­ parative genomic hybridization and laser scanning cytometry in human gliomas / / Cancer Res.—1998.—58.—P. 4694—4700. 39. Uchida D., Kawamata H, Omotehara F., Miwa Y., Hino S., Begum N. M., Yoshido H, Sato M. Over-expression of TSC-22 (TGF-beta stimulated clone-22) markedly enhances 5- fluorouracil-induced apoptosis in a human salivary gland cancer cell line / / Lab. Invest.—2000.—80.—P. 955—963. 40. Omotehara F, Uchida D., Hino S., Begum N., Yoshida H, Sato M., Kawamata H. In vivo enhancement of chemosensivity of human salivary gland cancer cells by overexpression of TGF-beta stimulated clone-22 / / Oncol. Rep.—2000.—7.— P. 737—740. УДК 577.21:577.214.622 Надійшла до редакції 21.12.99 159
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154671
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0233-7657
language Ukrainian
last_indexed 2025-12-07T17:07:33Z
publishDate 2001
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
record_format dspace
spelling Шостак, К.О.
Дмитренко, В.В.
Гарифулін, О.М.
Розуменко, В.Д.
Хоменко, О.В.
Зозуля, Ю.П.
Цехетнер, Г.
Кавсан, В.М.
2019-06-15T17:38:02Z
2019-06-15T17:38:02Z
2001
Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини / К.О. Шостак, В.В. Дмитренко, О.М. Гарифулін, В.Д. Розуменко, О.В. Хоменко, Ю.П. Зозуля, Г. Цехетнер, В.М. Кавсан // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 2. — С. 152-159. — Бібліогр.: 40 назв. — укр.
0233-7657
DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005A6
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154671
577.21:577.214.622
Значну частину супресорних генів астроцитарних пухлин до цих пір не ідентифіковано, незважа­ючи на те, що докази їхнього існування на різних хромосомах людини були підтверджені останніми роками численними дослідженнями. Тому пошук нових генів, активація або інактивація яких асоційована з прогресією гліальних пухлин, є метою інтенсивних досліджень. У даній роботі диференційна гібридизація «грид» упорядкованих бібліотек кДНК ембріонального і постнатального головного мозку людини показала різницю в рівні сигналу з пробами тотальної кДНК нормального головного мозку і мультиформної гліобластоми для більш ніж сотні клонів кДНК. Повторна диференційна гібридизація відібраних первинним скринінгом клонів, а також аналіз РНК зразків нормального головного мозку і гліальних пухлин дозволили виявити 16 нуклеотидних послідов­ностей, вміст яких змінюється в пухлинах. Серед мРНК, вміст яких зменшується в астроци­тарних пухлинах, було ідентифіковано мРНК TSC-22, відповідна кДНК якої міститься в клоні ICRFp507J1041 бібліотеки кДНК ембріонального головного мозку людини. Нозерн-гібридизація тотальних РНК чотирьох зразків нормального головного мозку та 17 зразків різних пухлин головного мозку виявила значне зменшення експресії гена TSC-22 в більшості зразків мультифор­мної гліобластоми, анапластичної астроцитоми, астроцитоми II ступеня злоякісності, а також у деяких інших новоутвореннях – загалом, в 12 індивідуальних пухлинах. В декількох пухлинах головного мозку експресія гена TSC-22 була відсутня повністю. Саузерн-гібридизація геномної ДНК виявила делеції в геномному локусі гена TSC-22 в двох із трьох досліджених зразків анапластичних астроцитом. Показаний у даній роботі суттєво зменшений рівень продукції мРНК TSC-22 в пухлинах головного мозку, описаний раніше зменшений вміст мРНК TSC-22 в пухлинах слинної залози, делеції в локусі гена TSC-22 в анапластичних астроцитомах, негативна роль білка TSC-22 в процесі проліферації клітин, локалізація гена TSC-22 на ділянці 13q14 поряд з геном ретинобластоми (Rb) – все це свідчить про потенційну супресорну роль зазначеного гена.
Значительная часть супрессорных генов астроцитарних опу­холей до сих пор не идентифицирована, несмотря на то, что доказательства их существования на разных хромосомах че­ловека были подтверждены в последние годы многочисленными исследованиями. Поэтому поиск новых генов, активация или инактивация которых ассоциирована с прогрессией глиальных опухолей, является целью интенсивных исследований. В данной работе дифференциальная гибридизация «грид» упорядоченных библиотек к ДНК эмбрионального и постнатального голо­вного мозга человека показала разницу в уровне гибридизационного сигнала с пробами тотальной кДНК нормального голо­вного мозга и мультиформной глиобластомы для более чем сотни клонов к ДНК. Повторная дифференциальная гибридиза­ция отобранных первичным скринингом клонов, а также анализ РНК образцов нормального головного мозга и глиальных опухолей позволили определить 16 нуклеотидных последовательностей, содержание которых изменяется в опухолях. В астроцитарных опухолях с пониженным содержанием мРНК была идентифицирована мРНК TSC-22, соответствующая к ДНК которой содержится в клоне ICRFp507J1041 библиоте­ки кДНК эмбрионального головного мозга человека. Нозерн-гибридизация тотальных РНК четырех образцов нормального головного мозга и 17 образцов различных опухолей головного мозга выявила значительное снижение экспрессии гена TSC-22 в большинстве образцов мультиформной глиобластомы, анапластической астроцитомы, астроцитоми II степени злокачественности, а также в некоторых других новообразованиях – в целом, в 12 индивидуальных опухолях. В нескольких опухолях головного мозга экспрессия гена TSC-22 отсутствовала пол­ностью. Саузерн-гибридизация геномной ДНК выявила делеции в геномном локусе гена TSC-22 в двух из трех исследованных образцов анапластических астроцитом. Показанный в данной работе значительно пониженный уровень продукции мРНК TSC-22 в опухолях головного мозга, описанный ранее понижен­ный уровень мРНК TSC-22 в опухолях слюнной железы, деле­ции в локусе гена TSC-22 в анапластических астроцитомах, негативная роль белка TSC-22 в процессе пролиферации кле­ток, локализация гена TSC-22 на участке 13q14 рядом с геном ретинобластомы (Rb) – все это свидетельствует о потенци­альной супрессорной роли этого гена.
At present some biological mechanisms assumed to initiate and promote astrocytoma formation have been partly revealed. Several putative genes in regions strongly suggested to harbour tumour suppressors should be identified. For example, these are the regions on the chromosomal arms 1p, 10p, 13q, 19g and 22g. More comprehensive approach in the analysis of astrocytomas includes gene expression determination in order to focus not only on the structural alterations but on the regulatory differences as well. Such changes in gene expression are important determinants of normal cellular physiology and, if disturbed, directly contribute to abnormal cellular physiology, including cancer. The search of new genes, the activation or inactivation of which is associated with the progression of astrocytic tumours, is still a goal of intensive investigations. In this work, more than a hundred cDNA clones differed in hybridization signals between human normal brain and glioblastoma multiform have been found by screening of high density grids of arrayed human fetal brain and human postnatal brain cDNA libraries. The repeated differential hybridization of the clones selected by primary screening, as well as the analysis of RNA from human adult normal brain and glial tumour samples have revealed 16 nucleotide sequences, which content had changed in tumours. The decreased content in astrocytic tumours has been determined for TSC-22 mRNA corresponding to cDNA in ICRFp507J 1041 clone from the library of human fetal brain cDNAs. The Northern blot hybridization of RNA from different human brain tumours has shown very low amount of TSC-22 mRNA in a bulk of the investigated samples of glioblastoma multiform, anaptastic astrocytoma, WHO grade II astrocytoma and some other tumours. The expression of TSC-22 gene has not been detected at all in astrocytoma WHO grade 11 as well as in meningioma, brain sarcoma, sarcomatous meningioma and oligodendroglioma (one sample of each tumor kind). The Southern blot hybridization has revealed the deletions in genomic loci of TSC-22 gene in two of three anaplastic astrocytomas analyzed. A significantly decreased level of the production of TSC-22 mRNA in the human brain tumours and, as it was shown previously, in the salivary gland tumours, an antiproliferative role of TSC-22 protein, the localization of TSC-22 gene in 13q14 region close to the known tumour suppressor retinoblastoma (Rb) gene, and the deletions in this genomic locus strongly evidence TSC-22 to be a tumour suppressor.
uk
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Молекулярні механізми диференціювання
Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини
Потенциальная супрессорная роль гена TSC-22 в опухолях головного мозга человека
Potential tumour suppressor role of TSC-22 gene in human brain tumours
Article
published earlier
spellingShingle Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини
Шостак, К.О.
Дмитренко, В.В.
Гарифулін, О.М.
Розуменко, В.Д.
Хоменко, О.В.
Зозуля, Ю.П.
Цехетнер, Г.
Кавсан, В.М.
Молекулярні механізми диференціювання
title Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини
title_alt Потенциальная супрессорная роль гена TSC-22 в опухолях головного мозга человека
Potential tumour suppressor role of TSC-22 gene in human brain tumours
title_full Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини
title_fullStr Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини
title_full_unstemmed Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини
title_short Потенційна супресорна роль гена TSC-22 в пухлинах головного мозку людини
title_sort потенційна супресорна роль гена tsc-22 в пухлинах головного мозку людини
topic Молекулярні механізми диференціювання
topic_facet Молекулярні механізми диференціювання
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154671
work_keys_str_mv AT šostakko potencíinasupresornarolʹgenatsc22vpuhlinahgolovnogomozkulûdini
AT dmitrenkovv potencíinasupresornarolʹgenatsc22vpuhlinahgolovnogomozkulûdini
AT garifulínom potencíinasupresornarolʹgenatsc22vpuhlinahgolovnogomozkulûdini
AT rozumenkovd potencíinasupresornarolʹgenatsc22vpuhlinahgolovnogomozkulûdini
AT homenkoov potencíinasupresornarolʹgenatsc22vpuhlinahgolovnogomozkulûdini
AT zozulâûp potencíinasupresornarolʹgenatsc22vpuhlinahgolovnogomozkulûdini
AT cehetnerg potencíinasupresornarolʹgenatsc22vpuhlinahgolovnogomozkulûdini
AT kavsanvm potencíinasupresornarolʹgenatsc22vpuhlinahgolovnogomozkulûdini
AT šostakko potencialʹnaâsupressornaârolʹgenatsc22vopuholâhgolovnogomozgačeloveka
AT dmitrenkovv potencialʹnaâsupressornaârolʹgenatsc22vopuholâhgolovnogomozgačeloveka
AT garifulínom potencialʹnaâsupressornaârolʹgenatsc22vopuholâhgolovnogomozgačeloveka
AT rozumenkovd potencialʹnaâsupressornaârolʹgenatsc22vopuholâhgolovnogomozgačeloveka
AT homenkoov potencialʹnaâsupressornaârolʹgenatsc22vopuholâhgolovnogomozgačeloveka
AT zozulâûp potencialʹnaâsupressornaârolʹgenatsc22vopuholâhgolovnogomozgačeloveka
AT cehetnerg potencialʹnaâsupressornaârolʹgenatsc22vopuholâhgolovnogomozgačeloveka
AT kavsanvm potencialʹnaâsupressornaârolʹgenatsc22vopuholâhgolovnogomozgačeloveka
AT šostakko potentialtumoursuppressorroleoftsc22geneinhumanbraintumours
AT dmitrenkovv potentialtumoursuppressorroleoftsc22geneinhumanbraintumours
AT garifulínom potentialtumoursuppressorroleoftsc22geneinhumanbraintumours
AT rozumenkovd potentialtumoursuppressorroleoftsc22geneinhumanbraintumours
AT homenkoov potentialtumoursuppressorroleoftsc22geneinhumanbraintumours
AT zozulâûp potentialtumoursuppressorroleoftsc22geneinhumanbraintumours
AT cehetnerg potentialtumoursuppressorroleoftsc22geneinhumanbraintumours
AT kavsanvm potentialtumoursuppressorroleoftsc22geneinhumanbraintumours