Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика

Предложен простой и быстрый метод получения фенилаланил-тРНК синтетазы из пе­чени кролика. Процедура состоит из трех стадий и включает в себя осаждение пост- митохондриального супернатанта полиэтиленгликолем с последующими хроматографиями на анионо-(ДЭАЭ-целлюлоза) и катионо-(фосфоцеллюлоза) обменни...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:1994
Автори: Турковская, Г.В., Шалак, В.Ф., Семенихин, К.В., Негруцкий, Б.С.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1994
Назва видання:Биополимеры и клетка
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154710
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика / Г.В. Турковская, В.Ф. Шалак, К.В. Семенихин, Б.С. Негруцкий // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 24-27. — Бібліогр.: 8 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154710
record_format dspace
spelling nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-1547102025-02-10T01:44:55Z Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика Експрес-метод виділення фенілаланіл-тРНК синтетази із печінки кроля Fast procedure for isolation of phenylalanyl-tRNA synthetase from rabbit liver Турковская, Г.В. Шалак, В.Ф. Семенихин, К.В. Негруцкий, Б.С. Предложен простой и быстрый метод получения фенилаланил-тРНК синтетазы из пе­чени кролика. Процедура состоит из трех стадий и включает в себя осаждение пост- митохондриального супернатанта полиэтиленгликолем с последующими хроматографиями на анионо-(ДЭАЭ-целлюлоза) и катионо-(фосфоцеллюлоза) обменниках. Запропоновано швидкии, простий та не потребуючий дорогого обладнання метод одержання фенілаланіл-тРНК синтетази iз печінки кроля. Він складаеться з трьох стаій i включає осаджування поліетиленгліколем постмітохондріального супернатанта з на­ступивши хроматографіями на ДЕАЕ-целюлозі i фосфоцелюлозі. Simple and fast method for isolation of phenylalanyl-tRNA synthetase from rabbit liver is proposed. Three-step procedure includes polyethylene glycol precipitation of post-rnitochondrial supernatant with subsequent DEAE-cellulose and phosphocellulose chromatographies. 1994 Article Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика / Г.В. Турковская, В.Ф. Шалак, К.В. Семенихин, Б.С. Негруцкий // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 24-27. — Бібліогр.: 8 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00039E https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154710 577.152 ru Биополимеры и клетка application/pdf Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
description Предложен простой и быстрый метод получения фенилаланил-тРНК синтетазы из пе­чени кролика. Процедура состоит из трех стадий и включает в себя осаждение пост- митохондриального супернатанта полиэтиленгликолем с последующими хроматографиями на анионо-(ДЭАЭ-целлюлоза) и катионо-(фосфоцеллюлоза) обменниках.
format Article
author Турковская, Г.В.
Шалак, В.Ф.
Семенихин, К.В.
Негруцкий, Б.С.
spellingShingle Турковская, Г.В.
Шалак, В.Ф.
Семенихин, К.В.
Негруцкий, Б.С.
Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика
Биополимеры и клетка
author_facet Турковская, Г.В.
Шалак, В.Ф.
Семенихин, К.В.
Негруцкий, Б.С.
author_sort Турковская, Г.В.
title Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика
title_short Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика
title_full Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика
title_fullStr Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика
title_full_unstemmed Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика
title_sort экспресс-метод выделения фенилаланил-трнк синтетазы из печени кролика
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 1994
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154710
citation_txt Экспресс-метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика / Г.В. Турковская, В.Ф. Шалак, К.В. Семенихин, Б.С. Негруцкий // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 24-27. — Бібліогр.: 8 назв. — рос.
series Биополимеры и клетка
work_keys_str_mv AT turkovskaâgv ékspressmetodvydeleniâfenilalaniltrnksintetazyizpečenikrolika
AT šalakvf ékspressmetodvydeleniâfenilalaniltrnksintetazyizpečenikrolika
AT semenihinkv ékspressmetodvydeleniâfenilalaniltrnksintetazyizpečenikrolika
AT negruckiibs ékspressmetodvydeleniâfenilalaniltrnksintetazyizpečenikrolika
AT turkovskaâgv ekspresmetodvidílennâfenílalaníltrnksintetaziízpečínkikrolâ
AT šalakvf ekspresmetodvidílennâfenílalaníltrnksintetaziízpečínkikrolâ
AT semenihinkv ekspresmetodvidílennâfenílalaníltrnksintetaziízpečínkikrolâ
AT negruckiibs ekspresmetodvidílennâfenílalaníltrnksintetaziízpečínkikrolâ
AT turkovskaâgv fastprocedureforisolationofphenylalanyltrnasynthetasefromrabbitliver
AT šalakvf fastprocedureforisolationofphenylalanyltrnasynthetasefromrabbitliver
AT semenihinkv fastprocedureforisolationofphenylalanyltrnasynthetasefromrabbitliver
AT negruckiibs fastprocedureforisolationofphenylalanyltrnasynthetasefromrabbitliver
first_indexed 2025-12-02T13:45:20Z
last_indexed 2025-12-02T13:45:20Z
_version_ 1850404367845294080
fulltext УДК 577.152 Г. В. Турковская, В. Ф. Шалак, К. В. Семенихин, Б. С. Негруцкий ЭКСПРЕСС-МЕТОД ВЫДЕЛЕНИЯ ФЕНИЛАЛАНИЛ-тРНК СИНТЕТАЗЫ ИЗ ПЕЧЕНИ КРОЛИКА Предложен простой и быстрый метод получения фенилаланил-тРНК синтетазы из пе­ чени кролика. Процедура состоит из трех стадий и включает в себя осаждение пост- митохондриального супернатанта полиэтиленгликолем с последующими хроматографи- ями на анионо-(ДЭАЭ-целлюлоза) и катионо-(фосфоцеллюлоза) обменниках. Введение. Фенилаланил-тРНК синтетаза отличается от других амино- ацил-тРНК синтетаз из высших эукариот целым рядом особенностей, в числе которых уникальная тетрамерная структура и большое сродст­ во к рибосомам [1, 2]. Необходимость поиска быстрого и надежного метода очистки этого фермента объясняется, среди прочего, доступно­ стью и глубокой изученностью его субстрата — фенилаланиновой тРНК. В то же время адекватного по простоте и надежности метода получе­ ния фенилаланил-тРНК синтетазы, несмотря на ряд попыток, предпри­ нятых в последнее время [3, 4], все еще не предложено. Изучение же особенностей фермент-субстратного взаимодействия, равно как и ис­ следование влияния фактора элонгации 1 на этот процесс, как предло­ жено нами ранее [5], требуют получения препаративных количеств вы- сокоочищенного фермента. Задача настоящего исследования состояла в разработке простого и быстрого метода выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика. Материалы и методы. Препарат суммарной тРНК получали, как описано ранее [6]. Активность фенилаланил-тРНК синтетазы опреде­ ляли в реакции аминоацилирования тРНК. Реакционная смесь содер­ жала в объеме 50 мкл 50 мМ HEPES, рН 7,8, 100 мМ КС1, 15 мМ MgCl2, 3 мМ АТФ, 133 мкг суммарной тРНК из печени кролика., 55,5 мкМ Ь-[14С]фенилаланин. Реакцию вели 15 мин при 37 °С и оста­ навливали добавлением 0,5 мл охлажденной 10 %-й трихлоруксусной кислоты. Осадки отмывали на фильтрах GF/C («Whatman», "Англия), фильтры высушивали и радиоактивность определяли на счетчике LKB. Электрофорез белков в 12,5 %-м полиакриламидном геле с 0,1 %-м DS-Na проводили по методу Леммли [7]. Ультрацентрифугирование фенил ал анил-тРНК синтетазы в градиенте плотности 15—25 % глице­ рина осуществляли в 20 мМ HEPES, рН 7,55, содержавшем 5 мМ MgCl2 и 3 мМ ДТТ при 4 °С в течение 16 ч при 39 000 об/мин (ротор SW-65, Spinco L5). Результаты и обсуждение. Нами предложена следующая схема очистки фенилаланил-тРНК синтетазы: 1) фракционирование полиэти­ ленгликолем; 2) хроматография на ДЭАЭ-целлюлозе, 3) хроматография. на фосфоцеллюлозе. Печень шести кролей (после двух дней голодания) гомогенизиро­ вали в двух объемах 50 мМ трис-HCl, рН 7,5, содержавшего 5 мМ MgCl2, 6 мМ ДТТ, 2 мМ ПМСФ, 10 %-й глицерин. К постмитохондрн- альному супернатанту по каплям прибавляли 50 %-й раствор полиэти- ленгликоля 6000 в том же буфере, исключая глицерин и ПМСФ, до ко- © Г. В. Турковская, В. Ф. Шалак, К. В. Семенихин, Б. С. Негруцкий, 1994 24 ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ II КЛЕТКА. 1994. Т. 10. № 2 нечной концентрации 3 %. При такой концентрации полиэтиленглико- ля происходило количественное осаждение фракции полирибосом. Оса­ док формировали без перемешивания 20 мин, отделяли центрифугиро­ ванием и растворяли в 50 мМ трис-HCl, рН 7,5, содержавшем 5 мМ MgCl2, 35 мМ КС1, 10%-й глицерин, 1 мМ ДТТ, 0,1 мМ ЭДТА (бу­ фер А) при помощи гомогенизатора Поттера. Для отделения фенил- аланил-тРНК синтетазной активности от рибосом к полученному ра­ створу прибавляли 4 М КС1 до конечной концентрации 0,4 М и после перемешивания в течение 20 мин при 4 °С центрифугировали 2 ч при 1 — оптическая плотность при 280 нм; 2 — фенилаланил-тРНК синтетазная активность; 3 — градиент КС1. На колонку с сорбентом (объем 180 мл) наносили 170 мл раствора белка с концентрацией 56 мг/мл. Элюцию проводили линейным градиентом КО (объе­ мом 700 мл), собирая 3-мл фракции. Активность фермента определяли, как описано в разделе «Материалы и методы» Рис. 2. Хроматография препарата фенилаланил-тРНК синтетазы на фосфоцеллюлозе Р11: 1 — оптическая плотность при 280 нм; 2 — фенилаланил-тРНК синтетазная ак­ тивность; 3 — градиент калий-фосфатного буфера. На колонку с сорбентом (объем 15 мл) наносили 210 мл раствора белка. Элюцию проводили линейным градиентом ка­ лий-фосфатного буфера (о0ъем 40 мл), собирая фракции по 2 мл 22 000 об/мин (ротор SW-27, Spinco L5) для осаждения полирибосом. Надосадочную жидкость диализовали в течение ночи против 50 мМ трис-HCl, рН 7,5, содержавшего 5 мМ MgCl2 и 1 мМ ДТТ, осветляли центрифугированием и наносили на колонку с ДЭАЭ-целлюлозой («Re- anal», Венгрия), уравновешенной буфером А. После промывки этим же буфером до исчезновения на выходе колонки оптической плотности при 280 нм связавшиеся с сорбентом белки элюировали линейным гра­ диентом концентрации (0,035—0,5 М) КС1 в буфере А, собирая фрак­ ции по 3 мл (рис. 1). Фенилаланил-тРНК синтетазную активность оп­ ределяли по реакции аминоацилирования. Фракции, содержащие наи­ большую активность, объединяли, разбавляли в 5 раз буфером Б (25 мМ К-фосфатный буфер, рН 6,8, 1 мМ ДТТ, 0,05 мМ ПМСФ, 0,1 мМ ЭДТА, 10 %-й глицерин) и наносили на колонку с фосфоцеллюлозой Р11 («Whatman»), уравновешенной буфером Б. Затем промывали дву­ мя объемами буфера Б и связавшиеся с колонкой белки элюировали линейным градиентом К-фосфатного буфера (0,25—0,5 М), собирая фракции по 2 мл (рис. 2). После определения ферментативной актив­ ности по градиенту и электрофореза фракций, содержащих активность, фракции с максимальной степенью очистки (80—90%) объединяли, диализовали в течение ночи против 50 мМ HEPES, рН 7,5, и 20 %-го глицерина и хранили в жидком азоте. Молекулярная масса субъеди­ ниц фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика составила, по данным электрофореза, 68 000 и 74 000, что полностью коррелирует с аналогичными показателями для фенилаланил-тРНК синтетазы из дру­ гих эукариотических источников [1, 3, 4]. При разработке данного метода мы стремились максимально ис­ пользовать уже имеющиеся в литературе данные об особенностях фе- ISSiN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1994. Т. 10. № 2 2 5 нилаланил-тРНК синтетазы из высших эукариот. Поскольку значитель­ ная часть молекул этого фермента в клетке связана с рибосомами [2], логично исключить на первом этапе очистки огромную массу клеточ­ ных белков, не имеющих сродства к рибосомам. Для этого рибосомную фракцию осаждали полиэтиленгликолем непосредственно из постмито- хондриального супернатанта. Непрочно связанные с рибосомами белки, включая фенилаланил-тРНК синтетазу, были затем смыты с рибосом 0,4 М КС1. Еще одной особенностью белка, отразившейся на выборе дальней­ шего пути очистки, был его слабощелочной заряд. По литературным данным, изоэлектрическая точка фенилаланил-тРНК синтетазы из выс­ ших эукариот находится в области 8,0 [3]. Такой белок должен обла­ дать небольшим, но вполне определенным сродством к слабому анионо- обменнику, например, к ДЭАЭ-целлюлозе. Как выяснилось, фенилала- нил-тРНК синтетаза связывалась с данным сорбентом, однако элюция этого фермента происходила при весьма низкой ионной силе (рис. 1), что и обеспечивало значительную степень очистки (таблица). С другой стороны, такому белку должно быть присуще существенное сродство к сильному катионообменнику (фосфоцеллюлозе). Действительно, при хроматографии на данном носителе фенилаланил-тРНК синтетаза элюировалась с колонки уже при высоких концентрациях элюэнта (рис. 2), причем кратность очистки на этом этапе достигала 2138 раз (таблица). Следует отметить, что длительное хранение либо повторное размо­ раживание— замораживание фермента не приводило к заметному сни­ жению его активности, но характеризовалось появлением в геле двух минорных полос в более низкомолекулярной области. Интересно, что похожая картина наблюдалась при ограниченном протеолизе фенил- аланил-тРНК синтетазы из печени овцы [3]. Наличие двух пиков фе- нилаланил-тРНК синтетазной активности при ультрацентрифугирова­ нии такого препарата в градиенте плотности глицерина (данные не при­ ведены) позволяет предположить, что данные пептиды являются про­ дуктами расщепления исходного белка, не потерявшими ферментатив­ ной активности. В последнее время описано несколько методик выделения фенил- аланил-тРНК синтетазы из различных источников [3, 4, 6]. Преиму­ щества предложенного нами метода заключаются, во-первых, в суще­ ственном сокращении (с пяти до трех) количества стадий очистки и, во-вторых, в исключении являвшихся прежде обязательными процедур хроматографии на гидроксиапатите, приводивших к значительному сни­ жению активности фермента [3]. Поскольку эукариотические амино- ацил-тРНК синтетазы характеризуются повышенной структурной ла­ бильностью [1], сокращение количества стадий очистки должно бла­ готворно влиять на нативность полученного препарата, а исключение хроматографии на гидроксиапатите, в свою очередь, приводить к сохра­ нению активности фермента. Немаловажное значение имеет также и применение в данной методике общедоступных носителей и обычного хроматографического оборудования. Очистка фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика Стадия очистки Общее количество белка, мг Специфиче­ ская актив­ ность, ед/мг* Выход, % Степень очистки Постмитохондриальный суперна- тант 45 000' 0,08 100 1 ПЭГ,, 3 % 9 520 0,3 92 3,7 ДЭАЭ-целлюлоза 90 32,2 80,5 402,5 Фосфоцеллюлоза 3,5 171 16,6 2138 * Специфическую активность определяли как количество фермента, необходимое для синтеза 1 нмоль фенил ал анил-тРНК за 1 мин при 37 ° С. 26 ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1994. Т. 10. № 2 Таким образом, нами разработан простой и быстрый метод полу­ чения фенилаланил-тРНК синтетазы из печени кролика, что будет ис­ пользовано для изучения роли этого фермента в структурно-функцио­ нальных взаимоотношениях компонентов эукариотического аппарата трансляции. Работа частично финансировалась Государственным Комитетом по вопросам науки и технологий (грант 5.2/130) Г. В. Турковська, В. Ф. Шалак, К. I. Семенихш, Б. С. Негруцький ЕКСПРЕС-МЕТОД ВИД1ЛЕННЯ ФЕШЛАЛАШЛ-тРНК СИНТЕТАЗИ 13 ПЕЧ1НКИ КРОЛЯ Р е з ю м е Запропоновано швидкии, простий та не потребуючий дорогого обладнання метод одер- жання фешлалашл-тРНК синтетази i3 печшки кроля. Вш складаеться з трьох стадш i включае осаджува.ння ,пол!етиленгл1колем постм1тохондр1ального суперяата.нта з на­ ступивши хроматограф1ями на ДЕАЕ-целюлоз1 i фосфоцелюлозк И. V. Turkovskaya, V. F. Shalak, К. V. Semenikhin, В. S. Negrutskii FAST PROCEDURE FOR ISOLATION OF PHENYLALANYL-tRNA SYNTHETASE FROM RABBIT LIVER S и m in а г у Simple and fast method for isolation of phenylalanyl-tRNA synthetase from rabbit li­ ver is proposed. Three-step procedure includes polyethylene glycol precipitation of post- mitochondrial supernatant with subsequent DEAE-cellulose and phosphocellulose chroma­ tographies. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 1. Киселев Л. Л., Фаворова О. О., Лаврик О. И. Биосинтез белков от аминокислот до аминоацил-тРНК.— М. : Наука, 1984.—С. 10—215. 2. Тscheme J. S., Weinstein I. В., banks К. W. et al. Phenylalanyl-transfer ribonucleic acid synthetase activity associated with rat liver ribosomes and microsomes // Bio­ chemistry.— 1973.— 12, N 20.—P. 3859—3865. 3. Pailiez J.-P., Waller J.-P. Phenylalanyl-tRNA synthetase from sheep liver and yeast// J. Biol. Chem.—1984.—259, N 24.—P. 15491—15496. 4. Вартанян О. А., Машанов-Голиков А. В., Вольфсон А. Д. и др. Быстрый метод выделения фенилаланил-тРНК синтетазы из млекопитающих и получение монокло- нальных антител к этому ферменту // Молекуляр. биология.— 1990.— 24, № 3.— С. 788—793. 5. Negrutskii В. S., Deutscher M. P. Channeling of aminoacyl-tRNA for protein synthe­ sis in vivo /I Proc. Nat. Acad. Sci. USA.—1991.—88.—P. 4991—4995. 6. Brungraber E. F. A simplified procedure for the preparation of «soluble» RNA from rat liver//Biochem. and Biophys. Res. Communs.— 1962.— 8, N 1.— P. 1—3. 7. Laemmll V. K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4//Nature.—1970.—227, N 5259.—P. 680—685. 8. Ducruix A., Hounwanou N., Reinbolt J. et al. Purification and reversible subunit dis­ sociation of overproduced Escherichia coli phenylalanyl-tRNA synthetase//Biochim. et biophys. acta.—1983.—741.—P. 244—250. И.Н-Т молекуляр. биологии и генетики АН Украины, 'Киев Получено 18.10.93 ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1994. Т. 10. № 2 27