Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК
Предложена схема моделирования цепочки ДНК как последовательности блоков нуклеотидов. Показано, что такая модель более адекватно описывает наблюдаемые частоты встречаемости локальных зеркальных гомопурин-гомопиримидиновых повторов, нежели марковская однородная модель второго порядка. Описывается мет...
Saved in:
| Published in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Date: | 1989 |
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Russian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1989
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154974 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК / Γ.Μ. Субоч, Ю.А. Сприжицкий // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 4. — С. 30-37. — Бібліогр.: 8 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862683664117137408 |
|---|---|
| author | Субоч, Г.М. Сприжицкий, Ю. А. |
| author_facet | Субоч, Г.М. Сприжицкий, Ю. А. |
| citation_txt | Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК / Γ.Μ. Субоч, Ю.А. Сприжицкий // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 4. — С. 30-37. — Бібліогр.: 8 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Предложена схема моделирования цепочки ДНК как последовательности блоков нуклеотидов. Показано, что такая модель более адекватно описывает наблюдаемые частоты встречаемости локальных зеркальных гомопурин-гомопиримидиновых повторов, нежели марковская однородная модель второго порядка. Описывается методика оценки статистической значимости встречаемости в ДНК некоторых сложных сочетаний нуклеотидов.
Запропоновано схему моделювання ланцюжка ДНК як послідовності блоків нуклеотидів. Показано, що така модель адекватніше описує спостережувані частоти зустрічальності локальних дзеркальних гомопурин- гомопіримідинових повторів, ніж марковська однорідна модель другого порядку. Описано методику оцінки статистичної значущості зустрічальності в ДНК деяких складних поєднань нуклеотидів.
A scheme for modeling of the DNA chain as a sequence of the nucleotide runs of different length is presented. The advantages of such a method and range of its application are discussed. A procedure is suggested to estimate statistical significance of occurrence of some complex sequence structures in DNA by the Monte-Carlo method. It uses a bootstrap algorithm and necessitates comparatively small number of calculations. Three different models, used to derive such estimations of the frequencies of homopurine-homopyrimidine mirror repeats in the DNA of phage K and rodentia noncoding regions are compared.
|
| first_indexed | 2025-12-07T15:56:38Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-154974 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T15:56:38Z |
| publishDate | 1989 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Субоч, Г.М. Сприжицкий, Ю. А. 2019-06-16T07:31:59Z 2019-06-16T07:31:59Z 1989 Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК / Γ.Μ. Субоч, Ю.А. Сприжицкий // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 4. — С. 30-37. — Бібліогр.: 8 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0000D0 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154974 576.315.42 Предложена схема моделирования цепочки ДНК как последовательности блоков нуклеотидов. Показано, что такая модель более адекватно описывает наблюдаемые частоты встречаемости локальных зеркальных гомопурин-гомопиримидиновых повторов, нежели марковская однородная модель второго порядка. Описывается методика оценки статистической значимости встречаемости в ДНК некоторых сложных сочетаний нуклеотидов. Запропоновано схему моделювання ланцюжка ДНК як послідовності блоків нуклеотидів. Показано, що така модель адекватніше описує спостережувані частоти зустрічальності локальних дзеркальних гомопурин- гомопіримідинових повторів, ніж марковська однорідна модель другого порядку. Описано методику оцінки статистичної значущості зустрічальності в ДНК деяких складних поєднань нуклеотидів. A scheme for modeling of the DNA chain as a sequence of the nucleotide runs of different length is presented. The advantages of such a method and range of its application are discussed. A procedure is suggested to estimate statistical significance of occurrence of some complex sequence structures in DNA by the Monte-Carlo method. It uses a bootstrap algorithm and necessitates comparatively small number of calculations. Three different models, used to derive such estimations of the frequencies of homopurine-homopyrimidine mirror repeats in the DNA of phage K and rodentia noncoding regions are compared. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК Статистична значущість зустрічальності деяких складних поєднань нуклеотидів: порівняння моделей ДНК Statistical significance of the occurrence of some complex nucleotide combinations: comparison of the DNA models Article published earlier |
| spellingShingle | Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК Субоч, Г.М. Сприжицкий, Ю. А. Структура и функции биополимеров |
| title | Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК |
| title_alt | Статистична значущість зустрічальності деяких складних поєднань нуклеотидів: порівняння моделей ДНК Statistical significance of the occurrence of some complex nucleotide combinations: comparison of the DNA models |
| title_full | Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК |
| title_fullStr | Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК |
| title_full_unstemmed | Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК |
| title_short | Статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей ДНК |
| title_sort | статистическая значимость встречаемости некоторых сложных сочетаний нуклеотидов: сравнение моделей днк |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/154974 |
| work_keys_str_mv | AT subočgm statističeskaâznačimostʹvstrečaemostinekotoryhsložnyhsočetaniinukleotidovsravneniemodeleidnk AT sprižickiiûa statističeskaâznačimostʹvstrečaemostinekotoryhsložnyhsočetaniinukleotidovsravneniemodeleidnk AT subočgm statističnaznačuŝístʹzustríčalʹnostídeâkihskladnihpoêdnanʹnukleotidívporívnânnâmodeleidnk AT sprižickiiûa statističnaznačuŝístʹzustríčalʹnostídeâkihskladnihpoêdnanʹnukleotidívporívnânnâmodeleidnk AT subočgm statisticalsignificanceoftheoccurrenceofsomecomplexnucleotidecombinationscomparisonofthednamodels AT sprižickiiûa statisticalsignificanceoftheoccurrenceofsomecomplexnucleotidecombinationscomparisonofthednamodels |