Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе
Методом Ли и Ричардса рассчитана стерическая доступность атомов ДНК в В- и D-формах для молекул воды. Показано, что уменьшение доступности нуклеотидов в D-форме, отражающее более экономную гидратацию D-конформации по сравнению с В-конфррмацией ДНК, происходит главным образом за счет сужения гликозид...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Дата: | 1989 |
| Автори: | , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1989
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155015 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе / Д.Б. Беглов, А.А. Липанов, В.П. Чуприна // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 4. — С. 66-70. — Бібліогр.: 16 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862558235073970176 |
|---|---|
| author | Беглов, Д.Б. Липанов, А.А. Чуприна, В.П. |
| author_facet | Беглов, Д.Б. Липанов, А.А. Чуприна, В.П. |
| citation_txt | Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе / Д.Б. Беглов, А.А. Липанов, В.П. Чуприна // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 4. — С. 66-70. — Бібліогр.: 16 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Методом Ли и Ричардса рассчитана стерическая доступность атомов ДНК в В- и D-формах для молекул воды. Показано, что уменьшение доступности нуклеотидов в D-форме, отражающее более экономную гидратацию D-конформации по сравнению с В-конфррмацией ДНК, происходит главным образом за счет сужения гликозидного желобка двойной спирали. Оценена также доступность D-формы для ионов натрия. По результатам расчетов обсужден механизм В — D-перехода в AT-богатых ДНК.
Методом Лі і Річардса розраховано стеричну доступність атомів ДНК у В- і D-формах для молекул води. Показано, що зменшення доступності нуклеотидів у D-формі, що відображає економнішу гідратацію D-конформації порівняно з В-конфрмацією ДНК, відбувається головним чином за рахунок звуження глікозидного жолобка подвійної спіралі. Оцінено також доступність D-форми для іонів натрію. За результатами розрахунків обговорено механізм В?D-переходу в AT-багатих ДНК.
Steric accessibility of DNA atoms in the B and D forms for water molecules has been calculated by the Lee and Richards method. It is shown that a decrease in the D-form nucleotide accessibility, reflecting more economic hydration of the D conformation as against the DNA B conformation is mainly induced by the narrowing of the double helix minor groove. D-form accessibility for sodium ions has been estimated as well. B-D transition mechanism in the AT-rich DNAs is discussed with allowance for the results of calculations.
|
| first_indexed | 2025-11-25T22:47:30Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155015 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-25T22:47:30Z |
| publishDate | 1989 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Беглов, Д.Б. Липанов, А.А. Чуприна, В.П. 2019-06-16T08:35:44Z 2019-06-16T08:35:44Z 1989 Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе / Д.Б. Беглов, А.А. Липанов, В.П. Чуприна // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 4. — С. 66-70. — Бібліогр.: 16 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0000D6 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155015 547.963.3 Методом Ли и Ричардса рассчитана стерическая доступность атомов ДНК в В- и D-формах для молекул воды. Показано, что уменьшение доступности нуклеотидов в D-форме, отражающее более экономную гидратацию D-конформации по сравнению с В-конфррмацией ДНК, происходит главным образом за счет сужения гликозидного желобка двойной спирали. Оценена также доступность D-формы для ионов натрия. По результатам расчетов обсужден механизм В — D-перехода в AT-богатых ДНК. Методом Лі і Річардса розраховано стеричну доступність атомів ДНК у В- і D-формах для молекул води. Показано, що зменшення доступності нуклеотидів у D-формі, що відображає економнішу гідратацію D-конформації порівняно з В-конфрмацією ДНК, відбувається головним чином за рахунок звуження глікозидного жолобка подвійної спіралі. Оцінено також доступність D-форми для іонів натрію. За результатами розрахунків обговорено механізм В?D-переходу в AT-багатих ДНК. Steric accessibility of DNA atoms in the B and D forms for water molecules has been calculated by the Lee and Richards method. It is shown that a decrease in the D-form nucleotide accessibility, reflecting more economic hydration of the D conformation as against the DNA B conformation is mainly induced by the narrowing of the double helix minor groove. D-form accessibility for sodium ions has been estimated as well. B-D transition mechanism in the AT-rich DNAs is discussed with allowance for the results of calculations. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе Стерична доступність ДНК для молекул води та іонів при В–D-переході DNA steric accessibility for water molecules and ions in the case of B–D transition Article published earlier |
| spellingShingle | Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе Беглов, Д.Б. Липанов, А.А. Чуприна, В.П. Структура и функции биополимеров |
| title | Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе |
| title_alt | Стерична доступність ДНК для молекул води та іонів при В–D-переході DNA steric accessibility for water molecules and ions in the case of B–D transition |
| title_full | Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе |
| title_fullStr | Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе |
| title_full_unstemmed | Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе |
| title_short | Стерическая доступность ДНК для молекул воды и ионов при В – D-переходе |
| title_sort | стерическая доступность днк для молекул воды и ионов при в – d-переходе |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155015 |
| work_keys_str_mv | AT beglovdb steričeskaâdostupnostʹdnkdlâmolekulvodyiionovprivdperehode AT lipanovaa steričeskaâdostupnostʹdnkdlâmolekulvodyiionovprivdperehode AT čuprinavp steričeskaâdostupnostʹdnkdlâmolekulvodyiionovprivdperehode AT beglovdb steričnadostupnístʹdnkdlâmolekulvoditaíonívprivdperehodí AT lipanovaa steričnadostupnístʹdnkdlâmolekulvoditaíonívprivdperehodí AT čuprinavp steričnadostupnístʹdnkdlâmolekulvoditaíonívprivdperehodí AT beglovdb dnastericaccessibilityforwatermoleculesandionsinthecaseofbdtransition AT lipanovaa dnastericaccessibilityforwatermoleculesandionsinthecaseofbdtransition AT čuprinavp dnastericaccessibilityforwatermoleculesandionsinthecaseofbdtransition |