Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam

• Опубліковано в: : Биополимеры и клетка
• Дата: 1989
• Автори: Речкунова, Н.И., Лохов, С.Г., Горбунов, Ю.А., Зиновьев, В.В., Бурьянов, Я.И., Малыгин, Э.Г.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1989
• Теми: Структура и функции биополимеров
• Онлайн доступ: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155017
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Стабильность вторичной структуры олигонуклеотидных субстратов. Эффект ДНК-метилазы Ecodam / Η.И. Речкунова, С.Г. Лохов, Ю.А. Горбунов, В.В. Зиновьев, Я.И. Бурьянов, Э.Г. Малыгин // Биополимеры и клетка. — 1989. — Т. 5, № 3. — С. 43-48. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.

Исследована стабильность олигонуклеотидных комплексов, содержащих различные дефекты в участке узнавания метилазы Ecodam. Одноцепочечный 20-членный олигонуклеотид, содержащий в центре самокомплементарную гексануклеотидную последовательность, образует частично дуплексную структуру только при температуре ниже 5 <С. Остальные комплексы плавятся в узком интервале температур 22–31 °С в 30 мМ калий-фосфатном буфере, рН 7,8. В присутствии метилазы Ecodam наблюдается увеличение температуры плавления комплекса по крайней мере на 5 °С. Досліджено стабільність олігонуклеотидних комплексів, що містять різні дефекти в ділянці упізнавання метилази Ecodam. Одноланцюговий 20-членний олігонуклеотид, який містить у центрі самокомплементарну гексануклеотидну послідовність, утворює частково дуплексну структуру лише за температури нижче 5 °С. Решта комплексів плавляться у вузькому інтервалі температур 22–31 °С у 30 мМ калій-фосфатному буфері, рН 7,8. За присутності метилази Ecodam спостерігається збільшення температури плавлення комплексу принаймні на 5 °С. Oligonucleotide complexes containing various defects in Ecodam methylase recognition site have been investigated for their stability. Partial duplex structure of the single-stranded 20-base long oligonucleotide containing a self-complementary hexanucleotide sequence is observed only below 5 °C. Other complexes are melting within the narrow temperature range of 22–31 °C in 30 mM of potassium-phosphate buffer, pH 7.8. Presence of Ecodam methylase results in an increase of complex melting point at least by 5 °C.