Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК
На основе атом-атомных потенциальных функций проведено численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований в модели тринуклеотида В-формы молекулы ДНК. При помощи расчетов методом молекулярной динамики и изучения топологии поверхности потенциальной энергии, соответствующей...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Дата: | 1994 |
| Автор: | |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1994
|
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155061 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК / А.И. Егоренков // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 79-85. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862712936072478720 |
|---|---|
| author | Егоренков, А.И. |
| author_facet | Егоренков, А.И. |
| citation_txt | Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК / А.И. Егоренков // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 79-85. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | На основе атом-атомных потенциальных функций проведено численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований в модели тринуклеотида В-формы молекулы ДНК. При помощи расчетов методом молекулярной динамики и изучения топологии поверхности потенциальной энергии, соответствующей анализируемому типу конформационной подвижности, исследована степень скоррелированности некоторых типов движений азотистых оснований раскрывающейся пары молекулы ДНК и показана зависимость путей раскрытия центральной пары от нуклеотидного состава фрагмента ДНК.
На основі атом-атомних потенціальних функцій здійснено чисельне моделювання динаміки локального розкриття пар азотистих основ у моделі тринуклеотида В-форми молекули ДНК. За допомогою розрахунків методом молекулярної динаміки та вивчення топологи поверхні потенидальної енергії, що відповідає досліджуваному типові конформаційної рухливості, проаналізовано ступені скорельованості деяких типів руxiв азотистих основ пари, що розкривається, молекули ДНК i показано залежність шляхів розкриття центральної пари віднуклеотидного складу фрагмента ДНК.
The method of atom-atomic potentials has permitted to realize the numerical simulation of local base pairs opening in a trinucleotide model of B-form DNA molecule. Having used molecular dynamics calculation and also data concerning potential energy surfase topology adequate to a type of conformation flexibility studied here, the author has determined correlation degree for some types of DNA bases movements in any opening DNA bases pair and has shown the dependence of opening processes in a central nucleotide pair on nucleotide content of DNA duplex being studied.
|
| first_indexed | 2025-12-07T17:40:28Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155061 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T17:40:28Z |
| publishDate | 1994 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Егоренков, А.И. 2019-06-16T08:51:21Z 2019-06-16T08:51:21Z 1994 Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК / А.И. Егоренков // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 79-85. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0003A9 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155061 547.963.3 + 577.323 На основе атом-атомных потенциальных функций проведено численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований в модели тринуклеотида В-формы молекулы ДНК. При помощи расчетов методом молекулярной динамики и изучения топологии поверхности потенциальной энергии, соответствующей анализируемому типу конформационной подвижности, исследована степень скоррелированности некоторых типов движений азотистых оснований раскрывающейся пары молекулы ДНК и показана зависимость путей раскрытия центральной пары от нуклеотидного состава фрагмента ДНК. На основі атом-атомних потенціальних функцій здійснено чисельне моделювання динаміки локального розкриття пар азотистих основ у моделі тринуклеотида В-форми молекули ДНК. За допомогою розрахунків методом молекулярної динаміки та вивчення топологи поверхні потенидальної енергії, що відповідає досліджуваному типові конформаційної рухливості, проаналізовано ступені скорельованості деяких типів руxiв азотистих основ пари, що розкривається, молекули ДНК i показано залежність шляхів розкриття центральної пари віднуклеотидного складу фрагмента ДНК. The method of atom-atomic potentials has permitted to realize the numerical simulation of local base pairs opening in a trinucleotide model of B-form DNA molecule. Having used molecular dynamics calculation and also data concerning potential energy surfase topology adequate to a type of conformation flexibility studied here, the author has determined correlation degree for some types of DNA bases movements in any opening DNA bases pair and has shown the dependence of opening processes in a central nucleotide pair on nucleotide content of DNA duplex being studied. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК Чисельне моделювання динаміки локального розкриття пар азотистих основ молекул ДНК Numerical simulation of local base pairs opening in DNA molecule Article published earlier |
| spellingShingle | Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК Егоренков, А.И. |
| title | Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК |
| title_alt | Чисельне моделювання динаміки локального розкриття пар азотистих основ молекул ДНК Numerical simulation of local base pairs opening in DNA molecule |
| title_full | Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК |
| title_fullStr | Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК |
| title_full_unstemmed | Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК |
| title_short | Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК |
| title_sort | численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы днк |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155061 |
| work_keys_str_mv | AT egorenkovai čislennoemodelirovaniedinamikilokalʹnogoraskrytiâparazotistyhosnovaniimolekulydnk AT egorenkovai čiselʹnemodelûvannâdinamíkilokalʹnogorozkrittâparazotistihosnovmolekuldnk AT egorenkovai numericalsimulationoflocalbasepairsopeningindnamolecule |