Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР
На импульсном ЯМР-спектрометре (500 МГц) исследованы температурные зависимости химических сдвигов протонов молекул в водных растворах фенантридинового красителя бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5'-d(AAGC), имеющими инверсное чередован...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Дата: | 1997 |
| Автори: | , , , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1997
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155106 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР / А.Н. Веселков, С.Ф. Барановский, Л.Н. Дымант, Н.В. Петренко, Д.А. Веселков, А. Такер, Д. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 2. — С. 100-107. — Бібліогр.: 15 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862734525293920256 |
|---|---|
| author | Веселков, А.Н. Барановский, С.Ф. Дымант, Л.Н. Петренко, Н.В. Веселков, Д.А. Такер, А. Дэвис, Д. |
| author_facet | Веселков, А.Н. Барановский, С.Ф. Дымант, Л.Н. Петренко, Н.В. Веселков, Д.А. Такер, А. Дэвис, Д. |
| citation_txt | Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР / А.Н. Веселков, С.Ф. Барановский, Л.Н. Дымант, Н.В. Петренко, Д.А. Веселков, А. Такер, Д. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 2. — С. 100-107. — Бібліогр.: 15 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | На импульсном ЯМР-спектрометре (500 МГц) исследованы температурные зависимости химических сдвигов протонов молекул в водных растворах фенантридинового красителя бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5'-d(AAGC), имеющими инверсное чередование оснований в нуклеотидной цепи. Разработаны методики расчета, позволяющие дифференцированно определить термодинамические параметры реакций образования различного типа комплексов в растворе. Получены значения свободной энергии Гиббса, энтальпии и энтропии реакций образования комплексов 1:1, 2:1 и 1:2 бромистого этидия с тетрануклеотидами. Проведен сравнительный анализ термодинамических характеристик взаимодействия красителя с изомерными последовательностями, сделаны выводы о проявлении специфичности при связывании бромистого этидия с одноцепочечными дезокситетрануклеотидами.
На імпульсному ЯМР-спектрометрі (500 МГц) досліджено температурні залежності хімічних зсувів протонів молекул у водних розчинах фенантридинового барвника бромистого етидію з некомплементарными ізомерними дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) та 5'-d(AAGC), які мають інверсне чергування основ у нуклеотидному ланцюгу. Розроблено методики розрахунку, що дозволяють диференційовано визначити термодинамічні параметри реакції утворення різного типу комплексів у розчині. Отримано значення вільної енергії Гіббса, ентальпії реакції утворення комплексів 1:1, 2:1 і 1:2 бромистого етидію з тетрануклеотидами. Здійснено порівняльний аналіз термодинамічних характеристик взаємодії барвника з ізомерними послідовностями, зроблено висновки стосовно прояву специфічності при зв'язуванні бромистого етидію з одноланцюговими дезокситетрануклеотидами.
The temperature dependences of the proton chemical shifts of the phenantridine dye ethidium bromide in the mixture with the non-complementary isomeric deoxytetranucleotides 5'-d(CGAA) and 5'-d(AAGC) have been studied in aqueous solutions by 500 MHz spectroscopy. The methods of calculation giving an opportunity to determine differentially the thermodynamic parameters of the formation of various types of the complexes in solution have been used. The free Gibbs energies, enthalpies and entropies of the reactions of 1:1, 2:1 and 1:2 complexes formation between ethidium bromide and tetranucleotides have been determined. Comparative analysis of the calculated thermodynamic parameters of the dye binding with the isomeric sequences has been made, it is concluded that there is sequence-selective interaction of ethidium bromide with single-stranded deoxytetranucleotides in solution.
|
| first_indexed | 2025-12-07T19:43:23Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155106 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T19:43:23Z |
| publishDate | 1997 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Веселков, А.Н. Барановский, С.Ф. Дымант, Л.Н. Петренко, Н.В. Веселков, Д.А. Такер, А. Дэвис, Д. 2019-06-16T09:10:24Z 2019-06-16T09:10:24Z 1997 Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР / А.Н. Веселков, С.Ф. Барановский, Л.Н. Дымант, Н.В. Петренко, Д.А. Веселков, А. Такер, Д. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 2. — С. 100-107. — Бібліогр.: 15 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00046F https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155106 577.113 На импульсном ЯМР-спектрометре (500 МГц) исследованы температурные зависимости химических сдвигов протонов молекул в водных растворах фенантридинового красителя бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5'-d(AAGC), имеющими инверсное чередование оснований в нуклеотидной цепи. Разработаны методики расчета, позволяющие дифференцированно определить термодинамические параметры реакций образования различного типа комплексов в растворе. Получены значения свободной энергии Гиббса, энтальпии и энтропии реакций образования комплексов 1:1, 2:1 и 1:2 бромистого этидия с тетрануклеотидами. Проведен сравнительный анализ термодинамических характеристик взаимодействия красителя с изомерными последовательностями, сделаны выводы о проявлении специфичности при связывании бромистого этидия с одноцепочечными дезокситетрануклеотидами. На імпульсному ЯМР-спектрометрі (500 МГц) досліджено температурні залежності хімічних зсувів протонів молекул у водних розчинах фенантридинового барвника бромистого етидію з некомплементарными ізомерними дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) та 5'-d(AAGC), які мають інверсне чергування основ у нуклеотидному ланцюгу. Розроблено методики розрахунку, що дозволяють диференційовано визначити термодинамічні параметри реакції утворення різного типу комплексів у розчині. Отримано значення вільної енергії Гіббса, ентальпії реакції утворення комплексів 1:1, 2:1 і 1:2 бромистого етидію з тетрануклеотидами. Здійснено порівняльний аналіз термодинамічних характеристик взаємодії барвника з ізомерними послідовностями, зроблено висновки стосовно прояву специфічності при зв'язуванні бромистого етидію з одноланцюговими дезокситетрануклеотидами. The temperature dependences of the proton chemical shifts of the phenantridine dye ethidium bromide in the mixture with the non-complementary isomeric deoxytetranucleotides 5'-d(CGAA) and 5'-d(AAGC) have been studied in aqueous solutions by 500 MHz spectroscopy. The methods of calculation giving an opportunity to determine differentially the thermodynamic parameters of the formation of various types of the complexes in solution have been used. The free Gibbs energies, enthalpies and entropies of the reactions of 1:1, 2:1 and 1:2 complexes formation between ethidium bromide and tetranucleotides have been determined. Comparative analysis of the calculated thermodynamic parameters of the dye binding with the isomeric sequences has been made, it is concluded that there is sequence-selective interaction of ethidium bromide with single-stranded deoxytetranucleotides in solution. Проведенные исследования частично финансированы Грантом N UD 7200 Международного научного фонда. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР Термодинаміка взаємодії ароматичного ліганду з одноланцюговою ДНК: аналіз комплексоутворення бромистого етидію з некомплементарними ізомерними дезокситетрануклеотидами 5'- d(CGAA) та 5-d(AAGC) за даними ¹H-ЯМР Thermodynamics of interaction of aromatic ligand with single-stranded DNA: ¹H NMR analysis of complex formation between ethidium bromide and non-complementary isomeric deoxytetranucleotides 5'-d(CGAA) and 5'-d(AAGC) Article published earlier |
| spellingShingle | Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР Веселков, А.Н. Барановский, С.Ф. Дымант, Л.Н. Петренко, Н.В. Веселков, Д.А. Такер, А. Дэвис, Д. Структура и функции биополимеров |
| title | Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР |
| title_alt | Термодинаміка взаємодії ароматичного ліганду з одноланцюговою ДНК: аналіз комплексоутворення бромистого етидію з некомплементарними ізомерними дезокситетрануклеотидами 5'- d(CGAA) та 5-d(AAGC) за даними ¹H-ЯМР Thermodynamics of interaction of aromatic ligand with single-stranded DNA: ¹H NMR analysis of complex formation between ethidium bromide and non-complementary isomeric deoxytetranucleotides 5'-d(CGAA) and 5'-d(AAGC) |
| title_full | Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР |
| title_fullStr | Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР |
| title_full_unstemmed | Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР |
| title_short | Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР |
| title_sort | термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной днк: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(cgaa) и 5' -d(aagc) по данным ¹h-ямр |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155106 |
| work_keys_str_mv | AT veselkovan termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr AT baranovskiisf termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr AT dymantln termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr AT petrenkonv termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr AT veselkovda termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr AT takera termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr AT dévisd termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr AT veselkovan termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr AT baranovskiisf termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr AT dymantln termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr AT petrenkonv termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr AT veselkovda termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr AT takera termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr AT dévisd termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr AT veselkovan thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc AT baranovskiisf thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc AT dymantln thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc AT petrenkonv thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc AT veselkovda thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc AT takera thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc AT dévisd thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc |