Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР

Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР

На импульсном ЯМР-спектрометре (500 МГц) исследованы температурные зависимости хими­ческих сдвигов протонов молекул в водных растворах фенантридинового красителя бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5'-d(AAGC), имеющими инверсное чередован...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1997
Hauptverfasser: Веселков, А.Н., Барановский, С.Ф., Дымант, Л.Н., Петренко, Н.В., Веселков, Д.А., Такер, А., Дэвис, Д.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1997
Schlagworte:
Структура и функции биополимеров
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155106
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР / А.Н. Веселков, С.Ф. Барановский, Л.Н. Дымант, Н.В. Петренко, Д.А. Веселков, А. Такер, Д. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 2. — С. 100-107. — Бібліогр.: 15 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155106
record_format dspace
spelling Веселков, А.Н.
Барановский, С.Ф.
Дымант, Л.Н.
Петренко, Н.В.
Веселков, Д.А.
Такер, А.
Дэвис, Д.
2019-06-16T09:10:24Z
2019-06-16T09:10:24Z
1997
Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР / А.Н. Веселков, С.Ф. Барановский, Л.Н. Дымант, Н.В. Петренко, Д.А. Веселков, А. Такер, Д. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 2. — С. 100-107. — Бібліогр.: 15 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00046F
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155106
577.113
На импульсном ЯМР-спектрометре (500 МГц) исследованы температурные зависимости хими­ческих сдвигов протонов молекул в водных растворах фенантридинового красителя бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5'-d(AAGC), имеющими инверсное чередование оснований в нуклеотидной цепи. Разработаны методики расчета, позволяющие дифференцированно определить термодинамические параметры реакций образования различного типа комплексов в растворе. Получены значения свободной энергии Гиббса, энтальпии и энтропии реакций образования комплексов 1:1, 2:1 и 1:2 бромистого этидия с тетрануклеотидами. Проведен сравнительный анализ термодинамических характеристик взаи­модействия красителя с изомерными последовательностями, сделаны выводы о проявлении специфичности при связывании бромистого этидия с одноцепочечными дезокситетрануклеотида­ми.
На імпульсному ЯМР-спектрометрі (500 МГц) досліджено температурні залежності хімічних зсувів протонів молекул у водних розчинах фенантридинового барвника бромистого ети­дію з некомплементарными ізомерними дезокситетрануклео­тидами 5'-d(CGAA) та 5'-d(AAGC), які мають інверсне чергування основ у нуклеотидному ланцюгу. Розроблено мето­дики розрахунку, що дозволяють диференційовано визначити термодинамічні параметри реакції утворення різного типу комплексів у розчині. Отримано значення вільної енергії Гіббса, ентальпії реакції утворення комплексів 1:1, 2:1 і 1:2 бромистого етидію з тетрануклеотидами. Здійснено порів­няльний аналіз термодинамічних характеристик взаємодії барвника з ізомерними послідовностями, зроблено висновки стосовно прояву специфічності при зв'язуванні бромистого етидію з одноланцюговими дезокситетрануклеотидами.
The temperature dependences of the proton chemical shifts of the phenantridine dye ethidium bromide in the mixture with the non-complementary isomeric deoxytetranucleotides 5'-d(CGAA) and 5'-d(AAGC) have been studied in aqueous solutions by 500 MHz spectroscopy. The methods of calculation giving an opportunity to determine differentially the thermodynamic parameters of the formation of various types of the complexes in solution have been used. The free Gibbs energies, enthalpies and entropies of the reactions of 1:1, 2:1 and 1:2 complexes formation between ethidium bromide and tetranucleotides have been determined. Comparative analysis of the calculated thermodynamic parameters of the dye binding with the isomeric sequences has been made, it is concluded that there is sequence-selective interaction of ethidium bromide with single-stranded deoxytetranucleotides in solution.
Проведенные исследования частично финансированы Грантом N UD 7200 Международного научного фонда.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Структура и функции биополимеров
Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР
Термодинаміка взаємодії ароматичного ліганду з одноланцюговою ДНК: аналіз комплексоутворення бромистого етидію з некомплементарними ізомерними дезокситетрануклеотидами 5'- d(CGAA) та 5-d(AAGC) за даними ¹H-ЯМР
Thermodynamics of interaction of aromatic ligand with single-stranded DNA: ¹H NMR analysis of complex formation between ethidium bromide and non-complementary isomeric deoxytetranucleotides 5'-d(CGAA) and 5'-d(AAGC)
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР
spellingShingle Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР
Веселков, А.Н.
Барановский, С.Ф.
Дымант, Л.Н.
Петренко, Н.В.
Веселков, Д.А.
Такер, А.
Дэвис, Д.
Структура и функции биополимеров
title_short Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР
title_full Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР
title_fullStr Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР
title_full_unstemmed Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР
title_sort термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной днк: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(cgaa) и 5' -d(aagc) по данным ¹h-ямр
author Веселков, А.Н.
Барановский, С.Ф.
Дымант, Л.Н.
Петренко, Н.В.
Веселков, Д.А.
Такер, А.
Дэвис, Д.
author_facet Веселков, А.Н.
Барановский, С.Ф.
Дымант, Л.Н.
Петренко, Н.В.
Веселков, Д.А.
Такер, А.
Дэвис, Д.
topic Структура и функции биополимеров
topic_facet Структура и функции биополимеров
publishDate 1997
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Термодинаміка взаємодії ароматичного ліганду з одноланцюговою ДНК: аналіз комплексоутворення бромистого етидію з некомплементарними ізомерними дезокситетрануклеотидами 5'- d(CGAA) та 5-d(AAGC) за даними ¹H-ЯМР
Thermodynamics of interaction of aromatic ligand with single-stranded DNA: ¹H NMR analysis of complex formation between ethidium bromide and non-complementary isomeric deoxytetranucleotides 5'-d(CGAA) and 5'-d(AAGC)
description На импульсном ЯМР-спектрометре (500 МГц) исследованы температурные зависимости хими­ческих сдвигов протонов молекул в водных растворах фенантридинового красителя бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5'-d(AAGC), имеющими инверсное чередование оснований в нуклеотидной цепи. Разработаны методики расчета, позволяющие дифференцированно определить термодинамические параметры реакций образования различного типа комплексов в растворе. Получены значения свободной энергии Гиббса, энтальпии и энтропии реакций образования комплексов 1:1, 2:1 и 1:2 бромистого этидия с тетрануклеотидами. Проведен сравнительный анализ термодинамических характеристик взаи­модействия красителя с изомерными последовательностями, сделаны выводы о проявлении специфичности при связывании бромистого этидия с одноцепочечными дезокситетрануклеотида­ми. На імпульсному ЯМР-спектрометрі (500 МГц) досліджено температурні залежності хімічних зсувів протонів молекул у водних розчинах фенантридинового барвника бромистого ети­дію з некомплементарными ізомерними дезокситетрануклео­тидами 5'-d(CGAA) та 5'-d(AAGC), які мають інверсне чергування основ у нуклеотидному ланцюгу. Розроблено мето­дики розрахунку, що дозволяють диференційовано визначити термодинамічні параметри реакції утворення різного типу комплексів у розчині. Отримано значення вільної енергії Гіббса, ентальпії реакції утворення комплексів 1:1, 2:1 і 1:2 бромистого етидію з тетрануклеотидами. Здійснено порів­няльний аналіз термодинамічних характеристик взаємодії барвника з ізомерними послідовностями, зроблено висновки стосовно прояву специфічності при зв'язуванні бромистого етидію з одноланцюговими дезокситетрануклеотидами. The temperature dependences of the proton chemical shifts of the phenantridine dye ethidium bromide in the mixture with the non-complementary isomeric deoxytetranucleotides 5'-d(CGAA) and 5'-d(AAGC) have been studied in aqueous solutions by 500 MHz spectroscopy. The methods of calculation giving an opportunity to determine differentially the thermodynamic parameters of the formation of various types of the complexes in solution have been used. The free Gibbs energies, enthalpies and entropies of the reactions of 1:1, 2:1 and 1:2 complexes formation between ethidium bromide and tetranucleotides have been determined. Comparative analysis of the calculated thermodynamic parameters of the dye binding with the isomeric sequences has been made, it is concluded that there is sequence-selective interaction of ethidium bromide with single-stranded deoxytetranucleotides in solution.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155106
citation_txt Термодинамика взаимодействия ароматического лиганда с одноцепочечной ДНК: анализ комплексообразования бромистого этидия с некомплементарными изомерными дезокситетрануклеотидами 5'-d(CGAA) и 5' -d(AAGC) по данным ¹H-ЯМР / А.Н. Веселков, С.Ф. Барановский, Л.Н. Дымант, Н.В. Петренко, Д.А. Веселков, А. Такер, Д. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 2. — С. 100-107. — Бібліогр.: 15 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT veselkovan termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr
AT baranovskiisf termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr
AT dymantln termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr
AT petrenkonv termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr
AT veselkovda termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr
AT takera termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr
AT dévisd termodinamikavzaimodeistviâaromatičeskogoligandasodnocepočečnoidnkanalizkompleksoobrazovaniâbromistogoétidiâsnekomplementarnymiizomernymidezoksitetranukleotidami5dcgaai5daagcpodannym1hâmr
AT veselkovan termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr
AT baranovskiisf termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr
AT dymantln termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr
AT petrenkonv termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr
AT veselkovda termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr
AT takera termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr
AT dévisd termodinamíkavzaêmodííaromatičnogolíganduzodnolancûgovoûdnkanalízkompleksoutvorennâbromistogoetidíûznekomplementarnimiízomernimidezoksitetranukleotidami5dcgaata5daagczadanimi1hâmr
AT veselkovan thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc
AT baranovskiisf thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc
AT dymantln thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc
AT petrenkonv thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc
AT veselkovda thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc
AT takera thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc
AT dévisd thermodynamicsofinteractionofaromaticligandwithsinglestrandeddna1hnmranalysisofcomplexformationbetweenethidiumbromideandnoncomplementaryisomericdeoxytetranucleotides5dcgaaand5daagc
first_indexed 2025-12-07T19:43:23Z
last_indexed 2025-12-07T19:43:23Z
_version_ 1850879879226064896

Ähnliche Einträge