Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids

Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids

A series of experiments was performed utilizing Methylene Blue (MeB) in place of the intercalating dyes ethidium bromide (EtBr) and acridine orange (AO) to stain, visualize, and isolate DNA and RNA. MeB proved to be superior to the other dyes for several purposes: 1) visualization of glyoxalated (ch...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Биополимеры и клетка
Дата:1997
Автори: Johnson, K.M., Hanekamp, T., Stayton, M.M.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1997
Теми:
Методы
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155205
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids / К.M. Johnson, T. Hanekamp, M.M. Stayton // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 3. — С. 250-253. — Бібліогр.: 8 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155205
record_format dspace
spelling Johnson, K.M.
Hanekamp, T.
Stayton, M.M.
2019-06-16T10:57:30Z
2019-06-16T10:57:30Z
1997
Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids / К.M. Johnson, T. Hanekamp, M.M. Stayton // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 3. — С. 250-253. — Бібліогр.: 8 назв. — англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000487
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155205
A series of experiments was performed utilizing Methylene Blue (MeB) in place of the intercalating dyes ethidium bromide (EtBr) and acridine orange (AO) to stain, visualize, and isolate DNA and RNA. MeB proved to be superior to the other dyes for several purposes: 1) visualization of glyoxalated (chemically denatured) RNA in agarose gels, 2) staining of nucleic acids that are to be used in subsequent hybridization experiments, and 3) isolation and purification of plasmid DNA by CsCl ultracentrifugation. MeB was found to perform at least as well as EtBr or AO for visualization of DNA in agarose of acrylamide gels, and DNA stained with MeB can be purified from agarose gel slices by the Gene Clean protocol. These results indicate that MeB is a very effective nucleic acid stain. Its safety versus conventional intercalating dyes will be discussed.
Здійснено серію експериментів з використання метиленового синього (МС) замість інтеркалюючих барвників бромистого етидію (ЕВ) та. акридинового оранжевого (АО) для забарвлен­ня, візуалізації та виділення ДНК і РНК. Показано, що МС переважає інші барвники у використанні для декількох цілей: 1) візуалізації гліоксильовано'і (хімічно денатурованої) РНК в агарозних гелях; 2) забарвлювання нуклеїнових кислот, які в подальшому будуть використані в експериментах з гібри­дизації; 3) виділення та очистки плазмідної ДНК ультрацентрифугуванням в CsCl. Знайдено, що за допомогою МС ДНК так само добре виявляється в гелях агарози або акриламіду, як і з використанням ЕВ і АО, а ДНК, забарвлена МС, може бути очищена із зрізів гелей агарози по протоколу «Gene Clean». Ці результати вказують на те, що МС є дуже ефективним барвником нуклеїнових кислот. Обговорюється його безпека іюрівняно з загальноприйнятними інтеркалюючими барвниками.
Проведена серия экспериментов по использованию метилено­вого синего (МС) вместо интеркалирующих красителей бромистого этидия (ЭВ) и акридинового оранжевого (АО) для окрашивания, визуализации и выделения ДНК и РНК. Показано, что МС превосходит другие красители в использовании для нескольких целей: 1) визуализации глиоксилированной (хи­мически денатурированной) РНК в агарозных гелях; 2) окрашивания нуклеиновых кислот, которые впоследствии будут использоваться в экспериментах по гибридизации; 3) выделе­ния и очистки плазмидной ДНК ультрацентрифугированием в CsCl. Обнаружено, что МС так же пригоден для визуализации ДНК в гелях агарозы или акриламида, как ЭВ или АО, а ДНК, окрашенная МС, может быть очищена из срезов гелей агарозы по протоколу «Gene Clean». Эти результаты указывают на то, что МС – очень эффективный краситель нуклеиновых кислот. Обсуждается его безопасность по сравнению с общепринятыми интеркалирующими красителями.
We thank L. Todd Buckman for his invaluable help with the photography and dark room work.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Методы
Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids
Метиленовий синій: альтернативний багатоцільовий барвник для виявлення, аналізу та виділення нуклеїнових кислот
Метиленовьгй синий: альтернативный многоцелевой краситель для обнаружения, анализа и выделения нуклеиновых кислот
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids
spellingShingle Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids
Johnson, K.M.
Hanekamp, T.
Stayton, M.M.
Методы
title_short Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids
title_full Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids
title_fullStr Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids
title_full_unstemmed Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids
title_sort methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids
author Johnson, K.M.
Hanekamp, T.
Stayton, M.M.
author_facet Johnson, K.M.
Hanekamp, T.
Stayton, M.M.
topic Методы
topic_facet Методы
publishDate 1997
language English
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Метиленовий синій: альтернативний багатоцільовий барвник для виявлення, аналізу та виділення нуклеїнових кислот
Метиленовьгй синий: альтернативный многоцелевой краситель для обнаружения, анализа и выделения нуклеиновых кислот
description A series of experiments was performed utilizing Methylene Blue (MeB) in place of the intercalating dyes ethidium bromide (EtBr) and acridine orange (AO) to stain, visualize, and isolate DNA and RNA. MeB proved to be superior to the other dyes for several purposes: 1) visualization of glyoxalated (chemically denatured) RNA in agarose gels, 2) staining of nucleic acids that are to be used in subsequent hybridization experiments, and 3) isolation and purification of plasmid DNA by CsCl ultracentrifugation. MeB was found to perform at least as well as EtBr or AO for visualization of DNA in agarose of acrylamide gels, and DNA stained with MeB can be purified from agarose gel slices by the Gene Clean protocol. These results indicate that MeB is a very effective nucleic acid stain. Its safety versus conventional intercalating dyes will be discussed. Здійснено серію експериментів з використання метиленового синього (МС) замість інтеркалюючих барвників бромистого етидію (ЕВ) та. акридинового оранжевого (АО) для забарвлен­ня, візуалізації та виділення ДНК і РНК. Показано, що МС переважає інші барвники у використанні для декількох цілей: 1) візуалізації гліоксильовано'і (хімічно денатурованої) РНК в агарозних гелях; 2) забарвлювання нуклеїнових кислот, які в подальшому будуть використані в експериментах з гібри­дизації; 3) виділення та очистки плазмідної ДНК ультрацентрифугуванням в CsCl. Знайдено, що за допомогою МС ДНК так само добре виявляється в гелях агарози або акриламіду, як і з використанням ЕВ і АО, а ДНК, забарвлена МС, може бути очищена із зрізів гелей агарози по протоколу «Gene Clean». Ці результати вказують на те, що МС є дуже ефективним барвником нуклеїнових кислот. Обговорюється його безпека іюрівняно з загальноприйнятними інтеркалюючими барвниками. Проведена серия экспериментов по использованию метилено­вого синего (МС) вместо интеркалирующих красителей бромистого этидия (ЭВ) и акридинового оранжевого (АО) для окрашивания, визуализации и выделения ДНК и РНК. Показано, что МС превосходит другие красители в использовании для нескольких целей: 1) визуализации глиоксилированной (хи­мически денатурированной) РНК в агарозных гелях; 2) окрашивания нуклеиновых кислот, которые впоследствии будут использоваться в экспериментах по гибридизации; 3) выделе­ния и очистки плазмидной ДНК ультрацентрифугированием в CsCl. Обнаружено, что МС так же пригоден для визуализации ДНК в гелях агарозы или акриламида, как ЭВ или АО, а ДНК, окрашенная МС, может быть очищена из срезов гелей агарозы по протоколу «Gene Clean». Эти результаты указывают на то, что МС – очень эффективный краситель нуклеиновых кислот. Обсуждается его безопасность по сравнению с общепринятыми интеркалирующими красителями.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155205
citation_txt Methylene blue: an alternative, multi-purpose stain for detection, analysis and isolation of nucleic acids / К.M. Johnson, T. Hanekamp, M.M. Stayton // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 3. — С. 250-253. — Бібліогр.: 8 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT johnsonkm methyleneblueanalternativemultipurposestainfordetectionanalysisandisolationofnucleicacids
AT hanekampt methyleneblueanalternativemultipurposestainfordetectionanalysisandisolationofnucleicacids
AT staytonmm methyleneblueanalternativemultipurposestainfordetectionanalysisandisolationofnucleicacids
AT johnsonkm metilenoviisiníialʹternativniibagatocílʹoviibarvnikdlâviâvlennâanalízutavidílennânukleínovihkislot
AT hanekampt metilenoviisiníialʹternativniibagatocílʹoviibarvnikdlâviâvlennâanalízutavidílennânukleínovihkislot
AT staytonmm metilenoviisiníialʹternativniibagatocílʹoviibarvnikdlâviâvlennâanalízutavidílennânukleínovihkislot
AT johnsonkm metilenovʹgisiniialʹternativnyimnogocelevoikrasitelʹdlâobnaruženiâanalizaivydeleniânukleinovyhkislot
AT hanekampt metilenovʹgisiniialʹternativnyimnogocelevoikrasitelʹdlâobnaruženiâanalizaivydeleniânukleinovyhkislot
AT staytonmm metilenovʹgisiniialʹternativnyimnogocelevoikrasitelʹdlâobnaruženiâanalizaivydeleniânukleinovyhkislot
first_indexed 2025-11-30T12:18:09Z
last_indexed 2025-11-30T12:18:09Z
_version_ 1850857624687345664

Схожі ресурси