Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР
Изучена самоассоциация молекул дезоксиоктануклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе методом одномерной и двухмерной ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 и 600 МГц). Двухмерная гомоядерная ПМР спектроскопия (2M-TOCSY и 2M-NOESY) использована для полного отнесения сигналов протонов дезоксиолигонуклеотида....
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Дата: | 1998 |
| Автори: | , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1998
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155225 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР / A.H. Веселков, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, Н.В. Веселкова, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 3. — С. 184-190. — Бібліогр.: 20 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862709497844203520 |
|---|---|
| author | Веселков, А.Н. Осетров, С.Г. Пахомов, В.И. Веселкова, Н.В. Дэвис, Д.Б. |
| author_facet | Веселков, А.Н. Осетров, С.Г. Пахомов, В.И. Веселкова, Н.В. Дэвис, Д.Б. |
| citation_txt | Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР / A.H. Веселков, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, Н.В. Веселкова, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 3. — С. 184-190. — Бібліогр.: 20 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Изучена самоассоциация молекул дезоксиоктануклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе методом одномерной и двухмерной ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 и 600 МГц). Двухмерная гомоядерная ПМР спектроскопия (2M-TOCSY и 2M-NOESY) использована для полного отнесения сигналов протонов дезоксиолигонуклеотида. Измерены концентрационные (при температурах T₁ – 298 К и Т₂ –308 К) и температурные зависимости химических сдвигов протонов октамера. Экспериментальные результаты проанализированы с помощью предложенной методики на основе димерной модели ассоциации молекул. Определены равновесная константа самоассоциации, температура плавления дуплекса, термодинамические параметры ΔН и ΔS реакции образования, дуплекса октамера в водном растворе. Проведен сравнительный анализ характеристик самоассоциации дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) с полученными ранее данными для дезокситетрануклеотидов различной последовательности оснований в цепи.
Вивчено самоасоціацію молекул дезоксиоктануклеотиду d( GpApCpApTpGpTpC) у водному розчині методом одно- та двомірної ¹Н-ЯМР спектроскопи (500 та 600 МГц). Двомірну гомоядерну ПМР спектроскопію (2M-TOCSY і 2M-NOESY) використано для повного віднесення сигналів протонів дезоксиолігонуклеотиду. Виміряно концентраційні (при температурах Т₁ –298 К тa Т₂ – 308 К) і температурні залежності хімічних зсувів протонів октамера. Експериментальні результати проаналізовано за допомогою запропонованої методики на основі димерної моделі асоціації молекул. Визначено рівноважну константу самоасоціації, температуру плавлення дуплексу у термодинамічні параметри ΔН і ΔS реакції утворення дуплексу октамера у водному розчині. Здійснено порівняльний аналіз характеристик самоасоціації дезоксиолігонуклеотиду d(GpApCpApTpGpTpC) з отриманими раніше даними для дезокситетрануклеотидів різної послідовності основ у ланцюгу.
Self-association of deoxyoctanucleotide 5'-d(GpApCpApTpGpTpC) in aqueous solution has been studied by one-dimensional and two-dimensional ¹H-NMR spectroscopy (500 and 600 MHz). Two-dimensional homonudear PMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) was used for complete assignments of deoxyoligonucleotide proton signals. Concentration (at temperatures T₁ – 298 K and T₂ – 308 K) and temperature dependences of proton chemical shifts of the octamer have been measured. Experimental results have been analysed using the proposed method based on a dimer model of association of the molecules. Equilibrium association constant, malting temperature of the duplex, thermodynamical parameters ΔH and ΔS of the reaction of duplex formation of the octamer in aqueous solution liave been determined. A comparative analysis has been made of the characteristics of the self-association of the deoxyoligonucleotide d(GpApCpApTpGpTpC) with previous data for deoxytetranucleotides of different
|
| first_indexed | 2025-12-07T17:17:39Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155225 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T17:17:39Z |
| publishDate | 1998 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Веселков, А.Н. Осетров, С.Г. Пахомов, В.И. Веселкова, Н.В. Дэвис, Д.Б. 2019-06-16T11:49:17Z 2019-06-16T11:49:17Z 1998 Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР / A.H. Веселков, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, Н.В. Веселкова, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 3. — С. 184-190. — Бібліогр.: 20 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0004CC https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155225 Изучена самоассоциация молекул дезоксиоктануклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе методом одномерной и двухмерной ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 и 600 МГц). Двухмерная гомоядерная ПМР спектроскопия (2M-TOCSY и 2M-NOESY) использована для полного отнесения сигналов протонов дезоксиолигонуклеотида. Измерены концентрационные (при температурах T₁ – 298 К и Т₂ –308 К) и температурные зависимости химических сдвигов протонов октамера. Экспериментальные результаты проанализированы с помощью предложенной методики на основе димерной модели ассоциации молекул. Определены равновесная константа самоассоциации, температура плавления дуплекса, термодинамические параметры ΔН и ΔS реакции образования, дуплекса октамера в водном растворе. Проведен сравнительный анализ характеристик самоассоциации дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) с полученными ранее данными для дезокситетрануклеотидов различной последовательности оснований в цепи. Вивчено самоасоціацію молекул дезоксиоктануклеотиду d( GpApCpApTpGpTpC) у водному розчині методом одно- та двомірної ¹Н-ЯМР спектроскопи (500 та 600 МГц). Двомірну гомоядерну ПМР спектроскопію (2M-TOCSY і 2M-NOESY) використано для повного віднесення сигналів протонів дезоксиолігонуклеотиду. Виміряно концентраційні (при температурах Т₁ –298 К тa Т₂ – 308 К) і температурні залежності хімічних зсувів протонів октамера. Експериментальні результати проаналізовано за допомогою запропонованої методики на основі димерної моделі асоціації молекул. Визначено рівноважну константу самоасоціації, температуру плавлення дуплексу у термодинамічні параметри ΔН і ΔS реакції утворення дуплексу октамера у водному розчині. Здійснено порівняльний аналіз характеристик самоасоціації дезоксиолігонуклеотиду d(GpApCpApTpGpTpC) з отриманими раніше даними для дезокситетрануклеотидів різної послідовності основ у ланцюгу. Self-association of deoxyoctanucleotide 5'-d(GpApCpApTpGpTpC) in aqueous solution has been studied by one-dimensional and two-dimensional ¹H-NMR spectroscopy (500 and 600 MHz). Two-dimensional homonudear PMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) was used for complete assignments of deoxyoligonucleotide proton signals. Concentration (at temperatures T₁ – 298 K and T₂ – 308 K) and temperature dependences of proton chemical shifts of the octamer have been measured. Experimental results have been analysed using the proposed method based on a dimer model of association of the molecules. Equilibrium association constant, malting temperature of the duplex, thermodynamical parameters ΔH and ΔS of the reaction of duplex formation of the octamer in aqueous solution liave been determined. A comparative analysis has been made of the characteristics of the self-association of the deoxyoligonucleotide d(GpApCpApTpGpTpC) with previous data for deoxytetranucleotides of different Выражает благодарность Королевскому обществу Великобритании за частичное финансирование (А. Н, В.) экспериментальных исследований; Объединенному исследовательскому центру Лондонского университета — за предоставленную возможность в Беркбек колледже и Куин Мери колледже использовать для измерений ЯМР-спектрометры 500 и 600 Мщ. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР Самоасоціація молекул дезоксиолігонуклеотиду d(GpApCpApTpGpTpC) у водному розчині: термодинамічний аналі з утворення дуплексу охтамера за даними ¹Н-ЯМР Self-association of deoxyoligonucleotide d(GpApCpApTpGpTpC) in aqueous solution: ¹H-NMR thermodynamical analysis of the octamer duplex formation Article published earlier |
| spellingShingle | Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР Веселков, А.Н. Осетров, С.Г. Пахомов, В.И. Веселкова, Н.В. Дэвис, Д.Б. Структура и функции биополимеров |
| title | Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР |
| title_alt | Самоасоціація молекул дезоксиолігонуклеотиду d(GpApCpApTpGpTpC) у водному розчині: термодинамічний аналі з утворення дуплексу охтамера за даними ¹Н-ЯМР Self-association of deoxyoligonucleotide d(GpApCpApTpGpTpC) in aqueous solution: ¹H-NMR thermodynamical analysis of the octamer duplex formation |
| title_full | Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР |
| title_fullStr | Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР |
| title_full_unstemmed | Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР |
| title_short | Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР |
| title_sort | самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(gpapcpaptpgptpc) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹н-ямр |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155225 |
| work_keys_str_mv | AT veselkovan samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr AT osetrovsg samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr AT pahomovvi samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr AT veselkovanv samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr AT dévisdb samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr AT veselkovan samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr AT osetrovsg samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr AT pahomovvi samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr AT veselkovanv samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr AT dévisdb samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr AT veselkovan selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation AT osetrovsg selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation AT pahomovvi selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation AT veselkovanv selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation AT dévisdb selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation |