Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР

Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР

Изучена самоассоциация молекул дезоксиоктануклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе методом одномерной и двухмерной ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 и 600 МГц). Двухмерная гомоядерная ПМР спектроскопия (2M-TOCSY и 2M-NOESY) использована для полного отнесения сигналов протонов дезоксиолигонуклеотида....

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Биополимеры и клетка
Date:1998
Main Authors: Веселков, А.Н., Осетров, С.Г., Пахомов, В.И., Веселкова, Н.В., Дэвис, Д.Б.
Format: Article
Language:Russian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1998
Subjects:
Структура и функции биополимеров
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155225
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР / A.H. Веселков, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, Н.В. Веселкова, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 3. — С. 184-190. — Бібліогр.: 20 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155225
record_format dspace
spelling Веселков, А.Н.
Осетров, С.Г.
Пахомов, В.И.
Веселкова, Н.В.
Дэвис, Д.Б.
2019-06-16T11:49:17Z
2019-06-16T11:49:17Z
1998
Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР / A.H. Веселков, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, Н.В. Веселкова, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 3. — С. 184-190. — Бібліогр.: 20 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0004CC
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155225
Изучена самоассоциация молекул дезоксиоктануклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе методом одномерной и двухмерной ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 и 600 МГц). Двухмерная гомоядерная ПМР спектроскопия (2M-TOCSY и 2M-NOESY) использована для полного отнесения сигналов протонов дезоксиолигонуклеотида. Измерены концентрационные (при температурах T₁ – 298 К и Т₂ –308 К) и температурные зависимости химических сдвигов протонов октамера. Экспериментальные результаты проанализированы с помощью предложенной методики на основе димерной модели ассоциации молекул. Определены равновесная константа самоассоциации, температура плавления дуплекса, термодинамические параметры ΔН и ΔS реакции образования, дуплекса октамера в водном растворе. Проведен сравнительный анализ характеристик самоассоциации дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) с полученными ранее данными для дезокситетрануклеотидов различной последовательности оснований в цепи.
Вивчено самоасоціацію молекул дезоксиоктануклеотиду d( GpApCpApTpGpTpC) у водному розчині методом одно- та двомірної ¹Н-ЯМР спектроскопи (500 та 600 МГц). Двомірну гомоядерну ПМР спектроскопію (2M-TOCSY і 2M-NOESY) використано для повного віднесення сигналів протонів дезоксиолігонуклеотиду. Виміряно концентраційні (при температурах Т₁ –298 К тa Т₂ – 308 К) і температурні залежності хімічних зсувів протонів октамера. Експериментальні результати проаналізовано за допомогою запропонованої методики на основі димерної моделі асоціації молекул. Визначено рівноважну константу самоасоціації, температуру плавлення дуплексу у термодинамічні параметри ΔН і ΔS реакції утворення дуплексу октамера у водному розчині. Здійснено порівняльний аналіз характеристик самоасоціації дезоксиолігонуклеотиду d(GpApCpApTpGpTpC) з отриманими раніше даними для дезокситетрануклеотидів різної послідовності основ у ланцюгу.
Self-association of deoxyoctanucleotide 5'-d(GpApCpApTpGpTpC) in aqueous solution has been studied by one-dimensional and two-dimensional ¹H-NMR spectroscopy (500 and 600 MHz). Two-dimensional homonudear PMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) was used for complete assignments of deoxyoligonucleotide proton signals. Concentration (at temperatures T₁ – 298 K and T₂ – 308 K) and temperature dependences of proton chemical shifts of the octamer have been measured. Experimental results have been analysed using the proposed method based on a dimer model of association of the molecules. Equilibrium association constant, malting temperature of the duplex, thermodynamical parameters ΔH and ΔS of the reaction of duplex formation of the octamer in aqueous solution liave been determined. A comparative analysis has been made of the characteristics of the self-association of the deoxyoligonucleotide d(GpApCpApTpGpTpC) with previous data for deoxytetranucleotides of different
Выражает благодарность Королевскому обще­ству Великобритании за частичное финансирование (А. Н, В.) экспериментальных исследований; Объе­диненному исследовательскому центру Лондонско­го университета — за предоставленную возмож­ность в Беркбек колледже и Куин Мери колледже использовать для измерений ЯМР-спектрометры 500 и 600 Мщ.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Структура и функции биополимеров
Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР
Самоасоціація молекул дезоксиолігонуклеотиду d(GpApCpApTpGpTpC) у водному розчині: термодинамічний аналі з утворення дуплексу охтамера за даними ¹Н-ЯМР
Self-association of deoxyoligonucleotide d(GpApCpApTpGpTpC) in aqueous solution: ¹H-NMR thermodynamical analysis of the octamer duplex formation
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР
spellingShingle Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР
Веселков, А.Н.
Осетров, С.Г.
Пахомов, В.И.
Веселкова, Н.В.
Дэвис, Д.Б.
Структура и функции биополимеров
title_short Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР
title_full Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР
title_fullStr Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР
title_full_unstemmed Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР
title_sort самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(gpapcpaptpgptpc) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹н-ямр
author Веселков, А.Н.
Осетров, С.Г.
Пахомов, В.И.
Веселкова, Н.В.
Дэвис, Д.Б.
author_facet Веселков, А.Н.
Осетров, С.Г.
Пахомов, В.И.
Веселкова, Н.В.
Дэвис, Д.Б.
topic Структура и функции биополимеров
topic_facet Структура и функции биополимеров
publishDate 1998
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Самоасоціація молекул дезоксиолігонуклеотиду d(GpApCpApTpGpTpC) у водному розчині: термодинамічний аналі з утворення дуплексу охтамера за даними ¹Н-ЯМР
Self-association of deoxyoligonucleotide d(GpApCpApTpGpTpC) in aqueous solution: ¹H-NMR thermodynamical analysis of the octamer duplex formation
description Изучена самоассоциация молекул дезоксиоктануклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе методом одномерной и двухмерной ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 и 600 МГц). Двухмерная гомоядерная ПМР спектроскопия (2M-TOCSY и 2M-NOESY) использована для полного отнесения сигналов протонов дезоксиолигонуклеотида. Измерены концентрационные (при температурах T₁ – 298 К и Т₂ –308 К) и температурные зависимости химических сдвигов протонов октамера. Экспериментальные результаты проанализированы с помощью предложенной методики на основе димерной модели ассоциации молекул. Определены равновесная константа самоассоциации, температура плавления дуплекса, термодинамические параметры ΔН и ΔS реакции образования, дуплекса октамера в водном растворе. Проведен сравнительный анализ характеристик самоассоциации дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) с полученными ранее данными для дезокситетрануклеотидов различной последовательности оснований в цепи. Вивчено самоасоціацію молекул дезоксиоктануклеотиду d( GpApCpApTpGpTpC) у водному розчині методом одно- та двомірної ¹Н-ЯМР спектроскопи (500 та 600 МГц). Двомірну гомоядерну ПМР спектроскопію (2M-TOCSY і 2M-NOESY) використано для повного віднесення сигналів протонів дезоксиолігонуклеотиду. Виміряно концентраційні (при температурах Т₁ –298 К тa Т₂ – 308 К) і температурні залежності хімічних зсувів протонів октамера. Експериментальні результати проаналізовано за допомогою запропонованої методики на основі димерної моделі асоціації молекул. Визначено рівноважну константу самоасоціації, температуру плавлення дуплексу у термодинамічні параметри ΔН і ΔS реакції утворення дуплексу октамера у водному розчині. Здійснено порівняльний аналіз характеристик самоасоціації дезоксиолігонуклеотиду d(GpApCpApTpGpTpC) з отриманими раніше даними для дезокситетрануклеотидів різної послідовності основ у ланцюгу. Self-association of deoxyoctanucleotide 5'-d(GpApCpApTpGpTpC) in aqueous solution has been studied by one-dimensional and two-dimensional ¹H-NMR spectroscopy (500 and 600 MHz). Two-dimensional homonudear PMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) was used for complete assignments of deoxyoligonucleotide proton signals. Concentration (at temperatures T₁ – 298 K and T₂ – 308 K) and temperature dependences of proton chemical shifts of the octamer have been measured. Experimental results have been analysed using the proposed method based on a dimer model of association of the molecules. Equilibrium association constant, malting temperature of the duplex, thermodynamical parameters ΔH and ΔS of the reaction of duplex formation of the octamer in aqueous solution liave been determined. A comparative analysis has been made of the characteristics of the self-association of the deoxyoligonucleotide d(GpApCpApTpGpTpC) with previous data for deoxytetranucleotides of different
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155225
citation_txt Самоассоциация молекул дезоксиолигонуклеотида d(GpApCpApTpGpTpC) в водном растворе: термодинамический анализ образования дуплекса октамера по данным ¹Н-ЯМР / A.H. Веселков, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, Н.В. Веселкова, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 3. — С. 184-190. — Бібліогр.: 20 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT veselkovan samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr
AT osetrovsg samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr
AT pahomovvi samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr
AT veselkovanv samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr
AT dévisdb samoassociaciâmolekuldezoksioligonukleotidadgpapcpaptpgptpcvvodnomrastvoretermodinamičeskiianalizobrazovaniâdupleksaoktamerapodannym1nâmr
AT veselkovan samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr
AT osetrovsg samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr
AT pahomovvi samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr
AT veselkovanv samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr
AT dévisdb samoasocíacíâmolekuldezoksiolígonukleotidudgpapcpaptpgptpcuvodnomurozčinítermodinamíčniianalízutvorennâdupleksuohtamerazadanimi1nâmr
AT veselkovan selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation
AT osetrovsg selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation
AT pahomovvi selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation
AT veselkovanv selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation
AT dévisdb selfassociationofdeoxyoligonucleotidedgpapcpaptpgptpcinaqueoussolution1hnmrthermodynamicalanalysisoftheoctamerduplexformation
first_indexed 2025-12-07T17:17:39Z
last_indexed 2025-12-07T17:17:39Z
_version_ 1850870710838231040

Similar Items