On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
Calculating decay-associated spectra (DAS) is a common mode of analyzing complex fluorescence decay in proteins. Unfortunately, these spectra are attributed almost exclusively to certain species in the population of macromolecules (retainers), often without sufficient evidence. An alternative explan...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Datum: | 2001 |
| 1. Verfasser: | |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Englisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2001
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155228 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins / A.S. Ladokhin // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 3. — С. 221-224. — Бібліогр.: 14 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862546456818221056 |
|---|---|
| author | Ladokhin, A.S. |
| author_facet | Ladokhin, A.S. |
| citation_txt | On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins / A.S. Ladokhin // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 3. — С. 221-224. — Бібліогр.: 14 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Біополімери і клітина |
| description | Calculating decay-associated spectra (DAS) is a common mode of analyzing complex fluorescence decay in proteins. Unfortunately, these spectra are attributed almost exclusively to certain species in the population of macromolecules (retainers), often without sufficient evidence. An alternative explanation of decay heterogeneity, based on structural relaxation., was believed to require a negative DAS component. Here we demonstrate that dipolar relaxation of the indole molecule, lacking any rotameric forms, doesn't always result in negative pre-exponential amplitude. We conclude that the shape of DAS alone is not sufficient to differentiate among various causes of heterogeneity of tryptophan fluorescence decay in proteins.
Расчет спектров, ассоциированных с затуханием (САЗ), является обычным путем анализа сложного затухания флюоресценции в белках. К сожалению, эти спектры почти исключительно относят к определенным видам в популяции молекул (ротамеров), часто без достаточных оснований Считалось, что альтернативное объяснение гетерогенности затухания, связанное со структурной релаксацией, требует отрицательной компоненты САЗ. В данной работе мы демонстрируем, что дипольная релаксация молекулы индола, лишенной каких-либо ротамерных форм, не всегда приводит к отрицательным при-экспоненциальным амплитудам. Мы делаем вывод о том, что форма САЗ сама по себе недостаточна, чтобы определить среди других причину гетерогенности затухания триптофановой флюоресценции в белках.
Обрахунок спектрів, асоційованих із затуханням (САЗ), є звичайним шляхом аналізу складного затухання флюоресценції в білках. На жаль, ці спектри майже виключно відносять до певних видів у популяції молекул (ротамерів), часто без достатніх на те підстав. Вважалося, що альтернативне пояснення гетерогенності затухання, пов'язане зі структурною релаксацією, потребує негативної компоненти САЗ. У цій роботі ми демонструємо, що дипольна релаксація молекули індолу, позбавленої будь-яких ротамерних форм, не завжди призводить до негативних при-експоненціальних амплітуд. Ми робимо висновок стосовно того, що форма САЗ сама по собі не є достатньою, щоб вирізнити серед інших причину гетерогенності затухання триптофанової флюоресценції в білках.
|
| first_indexed | 2025-11-25T10:29:01Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155228 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-11-25T10:29:01Z |
| publishDate | 2001 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Ladokhin, A.S. 2019-06-16T11:54:14Z 2019-06-16T11:54:14Z 2001 On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins / A.S. Ladokhin // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 3. — С. 221-224. — Бібліогр.: 14 назв. — англ. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005AE https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155228 577.32 + 577.322 Calculating decay-associated spectra (DAS) is a common mode of analyzing complex fluorescence decay in proteins. Unfortunately, these spectra are attributed almost exclusively to certain species in the population of macromolecules (retainers), often without sufficient evidence. An alternative explanation of decay heterogeneity, based on structural relaxation., was believed to require a negative DAS component. Here we demonstrate that dipolar relaxation of the indole molecule, lacking any rotameric forms, doesn't always result in negative pre-exponential amplitude. We conclude that the shape of DAS alone is not sufficient to differentiate among various causes of heterogeneity of tryptophan fluorescence decay in proteins. Расчет спектров, ассоциированных с затуханием (САЗ), является обычным путем анализа сложного затухания флюоресценции в белках. К сожалению, эти спектры почти исключительно относят к определенным видам в популяции молекул (ротамеров), часто без достаточных оснований Считалось, что альтернативное объяснение гетерогенности затухания, связанное со структурной релаксацией, требует отрицательной компоненты САЗ. В данной работе мы демонстрируем, что дипольная релаксация молекулы индола, лишенной каких-либо ротамерных форм, не всегда приводит к отрицательным при-экспоненциальным амплитудам. Мы делаем вывод о том, что форма САЗ сама по себе недостаточна, чтобы определить среди других причину гетерогенности затухания триптофановой флюоресценции в белках. Обрахунок спектрів, асоційованих із затуханням (САЗ), є звичайним шляхом аналізу складного затухання флюоресценції в білках. На жаль, ці спектри майже виключно відносять до певних видів у популяції молекул (ротамерів), часто без достатніх на те підстав. Вважалося, що альтернативне пояснення гетерогенності затухання, пов'язане зі структурною релаксацією, потребує негативної компоненти САЗ. У цій роботі ми демонструємо, що дипольна релаксація молекули індолу, позбавленої будь-яких ротамерних форм, не завжди призводить до негативних при-експоненціальних амплітуд. Ми робимо висновок стосовно того, що форма САЗ сама по собі не є достатньою, щоб вирізнити серед інших причину гетерогенності затухання триптофанової флюоресценції в білках. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Структура та функції біополімерів On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins До тлумачення спектрів, асоційованих із затуханням флюоресценції в білках К интерпретации спектров, ассоциированных с затуханием флюоресценции в белках Article published earlier |
| spellingShingle | On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins Ladokhin, A.S. Структура та функції біополімерів |
| title | On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins |
| title_alt | До тлумачення спектрів, асоційованих із затуханням флюоресценції в білках К интерпретации спектров, ассоциированных с затуханием флюоресценции в белках |
| title_full | On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins |
| title_fullStr | On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins |
| title_full_unstemmed | On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins |
| title_short | On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins |
| title_sort | on the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins |
| topic | Структура та функції біополімерів |
| topic_facet | Структура та функції біополімерів |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155228 |
| work_keys_str_mv | AT ladokhinas ontheinterpretationofdecayassociatedfluorescencespectrainproteins AT ladokhinas dotlumačennâspektrívasocíiovanihízzatuhannâmflûorescencíívbílkah AT ladokhinas kinterpretaciispektrovassociirovannyhszatuhaniemflûorescenciivbelkah |