Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction

The objective of the research carried out is study of the pathway of alkaloid production in Papaver species and cell lines, and integration data on physical mapping of newly developed marker DNA sequences with existing difference in expression of genes for key enzymes of alkaloid biosynthesis. This...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Біополімери і клітина
Date:2005
Main Authors: Kyrylenko, T.K., Martynenko, O.I., Alkhimova, O.G.
Language:English
Published: 2005
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155232
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction / T.K. Kyrylenko, O.I. Martynenko, O.G. Alkhimova // Биополимеры и клетка. — 2005. — Т. 21, № 2. — С. 145-150. — Бібліогр.: 14 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862716362422484992
author Kyrylenko, T.K.
Martynenko, O.I.
Alkhimova, O.G.
author_facet Kyrylenko, T.K.
Martynenko, O.I.
Alkhimova, O.G.
citation_txt Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction / T.K. Kyrylenko, O.I. Martynenko, O.G. Alkhimova // Биополимеры и клетка. — 2005. — Т. 21, № 2. — С. 145-150. — Бібліогр.: 14 назв. — англ.
collection DSpace DC
container_title Біополімери і клітина
description The objective of the research carried out is study of the pathway of alkaloid production in Papaver species and cell lines, and integration data on physical mapping of newly developed marker DNA sequences with existing difference in expression of genes for key enzymes of alkaloid biosynthesis. This research requires the knowledge on genome structure and organization, and development of genomic resources for detailed characterization of opium poppy genome. The work is focused on the investigation of some features of genome organization of Papaver somniferum and related species, Papaver bracteatum and Papaver rhoeas. These characteristics are necessary for the construction of a BAC library which would be used as appropriate genomic resource for characterization of karyotype changes in poppy stocks with altered alkaloid biosynthesis pathway. Some of these stocks (cell lines) were generated and differed in the types of alkaloids they accumulated. Роботу присвячено вивченню шляхів біосинтезу алкалоїдів у видів Papaver та інтегруванню даних фізичного картування нових маркерних послідовностей ДНК з відмінностями в експресії генів ключових ферментів біосинтезу алкалоїдів. Таке дослідження потребує знання структури геному та його організації, а також передбачає наявність геномних ресурсів задля детального аналізу геному опійного маку. У даному повідомленні визначено розмір геному опійного маку та зроб­лено каріотипічний аналіз Papaver somniferum і його спорід­нених видів, P. bracteatum і P. rhoeas. Отримані характеристи­ки є необхідними для створення ВАС бібліотеки, яка слугує базисом для цитогенетичного картування та пошуку змін каріотипу в лініях маку, що відрізняються за шляхами біоси­нтезу алкалоїдів. Вже одержано декілька клітинних ліній, які накопичують різні типи алкалоїдів. The objective of the research carried out is study of the pathway of alkaloid production in Papaver species and cell lines, and integration data on physical mapping of newly developed marker DNA sequences with existing difference in expression of genes for key enzymes of alkaloid biosynthesis. This research requires the knowledge on genome structure and organization, and development of genomic resources for detailed characterization of opium poppy genome. The work is focused on the investigation of some features of genome organization of Papaver somniferum and related species, Papaver bracteatum and Papaver rhoeas. These characteristics are necessary for the construction of a BAC library which would be used as appropriate genomic resource for characterization of karyotype changes in poppy stocks with altered alkaloid biosynthesis pathway. Some of these stocks (cell lines) were generated and differed in the types of alkaloids they accumulated.
first_indexed 2025-12-07T18:05:11Z
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155232
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
language English
last_indexed 2025-12-07T18:05:11Z
publishDate 2005
record_format dspace
spelling Kyrylenko, T.K.
Martynenko, O.I.
Alkhimova, O.G.
2019-06-16T12:23:27Z
2019-06-16T12:23:27Z
2005
Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction / T.K. Kyrylenko, O.I. Martynenko, O.G. Alkhimova // Биополимеры и клетка. — 2005. — Т. 21, № 2. — С. 145-150. — Бібліогр.: 14 назв. — англ.
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0006E5
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155232
575:577.21.12
The objective of the research carried out is study of the pathway of alkaloid production in Papaver species and cell lines, and integration data on physical mapping of newly developed marker DNA sequences with existing difference in expression of genes for key enzymes of alkaloid biosynthesis. This research requires the knowledge on genome structure and organization, and development of genomic resources for detailed characterization of opium poppy genome. The work is focused on the investigation of some features of genome organization of Papaver somniferum and related species, Papaver bracteatum and Papaver rhoeas. These characteristics are necessary for the construction of a BAC library which would be used as appropriate genomic resource for characterization of karyotype changes in poppy stocks with altered alkaloid biosynthesis pathway. Some of these stocks (cell lines) were generated and differed in the types of alkaloids they accumulated.
Роботу присвячено вивченню шляхів біосинтезу алкалоїдів у видів Papaver та інтегруванню даних фізичного картування нових маркерних послідовностей ДНК з відмінностями в експресії генів ключових ферментів біосинтезу алкалоїдів. Таке дослідження потребує знання структури геному та його організації, а також передбачає наявність геномних ресурсів задля детального аналізу геному опійного маку. У даному повідомленні визначено розмір геному опійного маку та зроб­лено каріотипічний аналіз Papaver somniferum і його спорід­нених видів, P. bracteatum і P. rhoeas. Отримані характеристи­ки є необхідними для створення ВАС бібліотеки, яка слугує базисом для цитогенетичного картування та пошуку змін каріотипу в лініях маку, що відрізняються за шляхами біоси­нтезу алкалоїдів. Вже одержано декілька клітинних ліній, які накопичують різні типи алкалоїдів.
The objective of the research carried out is study of the pathway of alkaloid production in Papaver species and cell lines, and integration data on physical mapping of newly developed marker DNA sequences with existing difference in expression of genes for key enzymes of alkaloid biosynthesis. This research requires the knowledge on genome structure and organization, and development of genomic resources for detailed characterization of opium poppy genome. The work is focused on the investigation of some features of genome organization of Papaver somniferum and related species, Papaver bracteatum and Papaver rhoeas. These characteristics are necessary for the construction of a BAC library which would be used as appropriate genomic resource for characterization of karyotype changes in poppy stocks with altered alkaloid biosynthesis pathway. Some of these stocks (cell lines) were generated and differed in the types of alkaloids they accumulated.
Acknowledgements. We are grateful to Dr J. Dolezel (Institute of Experimental Botany, Olomouc, Czech Republic) for providing us with technical facilities, and P. Suchankova for technical assistance. This work was supported by the National Academy of Sciences of Ukraine and the International Atomic Energy Agency (Research Contract No.
 12235/RBF).
en
Біополімери і клітина
Геном та його регуляція
Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction
Визначення розміру ядерного геному і каріотипічний аналіз видів Papaver для створення ВАС бібліотек
Определение размера ядерного генома и кариотипический анализ видов Papaver для создания ВАС библиотеки
published earlier
spellingShingle Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction
Kyrylenko, T.K.
Martynenko, O.I.
Alkhimova, O.G.
Геном та його регуляція
title Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction
title_alt Визначення розміру ядерного геному і каріотипічний аналіз видів Papaver для створення ВАС бібліотек
Определение размера ядерного генома и кариотипический анализ видов Papaver для создания ВАС библиотеки
title_full Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction
title_fullStr Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction
title_full_unstemmed Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction
title_short Nuclear genome size and karyotype analysis in Papaver for BAC library construction
title_sort nuclear genome size and karyotype analysis in papaver for bac library construction
topic Геном та його регуляція
topic_facet Геном та його регуляція
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155232
work_keys_str_mv AT kyrylenkotk nucleargenomesizeandkaryotypeanalysisinpapaverforbaclibraryconstruction
AT martynenkooi nucleargenomesizeandkaryotypeanalysisinpapaverforbaclibraryconstruction
AT alkhimovaog nucleargenomesizeandkaryotypeanalysisinpapaverforbaclibraryconstruction
AT kyrylenkotk viznačennârozmíruâdernogogenomuíkaríotipíčniianalízvidívpapaverdlâstvorennâvasbíblíotek
AT martynenkooi viznačennârozmíruâdernogogenomuíkaríotipíčniianalízvidívpapaverdlâstvorennâvasbíblíotek
AT alkhimovaog viznačennârozmíruâdernogogenomuíkaríotipíčniianalízvidívpapaverdlâstvorennâvasbíblíotek
AT kyrylenkotk opredelenierazmeraâdernogogenomaikariotipičeskiianalizvidovpapaverdlâsozdaniâvasbiblioteki
AT martynenkooi opredelenierazmeraâdernogogenomaikariotipičeskiianalizvidovpapaverdlâsozdaniâvasbiblioteki
AT alkhimovaog opredelenierazmeraâdernogogenomaikariotipičeskiianalizvidovpapaverdlâsozdaniâvasbiblioteki