Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function
Doxorubicin in the concentration of 1 mg/ml and streptonigrin in the concentration 1000 mg/ml each agent separately should by useful to determination of replicative (5'→3') or reparatlve (3'→5') function DNA-polymerase. This enzymes with 5'→3' fully inhibited by doxorub...
Saved in:
| Published in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Date: | 1994 |
| Main Authors: | , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1994
|
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155405 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function / I. G. Skripal', S.V. Bezugly, V.V. Babitschev // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 3-4. — С. 103-104. — Бібліогр.: 7 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1860057073123852288 |
|---|---|
| author | Skripal', I.G. Bezugly, S.V. Babitschev, V.V. |
| author_facet | Skripal', I.G. Bezugly, S.V. Babitschev, V.V. |
| citation_txt | Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function / I. G. Skripal', S.V. Bezugly, V.V. Babitschev // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 3-4. — С. 103-104. — Бібліогр.: 7 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Doxorubicin in the concentration of 1 mg/ml and streptonigrin in the concentration 1000 mg/ml each agent separately should by useful to determination of replicative (5'→3') or reparatlve (3'→5') function DNA-polymerase. This enzymes with 5'→3' fully inhibited by doxorubicine but net sensitive to action of streptonigrin in concentration substances mentioned above. And contraverse, DNA-polymerase with 3'→5' function don't sensitive to doxorubicin and it's activity depressed by streptonigrin.
Доксорубіцин в концентраци 1 мкг/мл i стрептонігрин в концентраццї 1000 мкг/мл кожний окремо можуть застосовуватися для визначення реплікативної (5'→3') або репаративної (3'→5') функцій ДНК-полімерази. Активність ферменту з реплікативною (5'→3') функцією повністю пригнічується доксорубіцином, але не чутлива до дії стрептонігрину в концентращях, зазначених вище. І, навпаки, активність ДНК-полімерази з репаративною (3'→5') функцією не чутлива до впливу доксорубіцину, але інкубується стрептонігрином.
Доксорубицин в концентраци 1 мкг / мл i стрептонигрин в концентрацци 1000 мкг / мл каждый отдельно могут применяться для определения репликативной (5 '? 3') или репаративной (3 '? 5') функций ДНК-полимеразы. Активность фермента с репликативной (5 '? 3') функцией полностью подавляется доксорубицином, но не чувствительна к действию стрептонигрину в концентращях, указанных выше. И, наоборот, активность ДНК-полимеразы с репаративной (3 '? 5') функцией не чувствительна к влиянию доксорубицина, но инкубируется стрептонигрином.
|
| first_indexed | 2025-12-07T17:01:40Z |
| format | Article |
| fulltext |
УДК 579.88:577.15
I. G. SkripaF, S. V. Bezugly, V. V. Babitschev
INDIRECT DETERMINATION OF THE 5-^3' AND 3-^5 '
OF THE DNA-DEPENDENT DNA-POLYMERASE FUNCTION
Doxorubicin in the concentration of l\ig/ml and streptonigrin in the concentration
1000 \ig/ml each agent separately should by useful to determination of replicative
(S'-¥-3') or reparative (3'-*5f) function DNA-polymerase. This enzymes with 5'-+3' fully
inhibited by doxorubicine but net sensitive to action of streptonigrin in concentration
substances mentioned above. And contraverse, DNA-polymerase with 3'-+5f function don't
sensitive to doxorubicin and it's activity depressed by streptonigrin.
Doxorubicin (Adriamycin; C27H29NOii-HCl, mm 580.0) and streptonigrin
(Nigrin; Bruneomycin; С25Н22^08, mm 506.5) (both produced by SIGMA
Company, U. S. A) that are inhibitors of nucleic acid synthesis, despite
the long history of the studies on them, up to know are considered to be
the agents with yet undefined action mechanism and undetermined tar
get for them in prokaryotic cells [1, 2].
During studies on these antibiotics in standard synthesis system of
DNA in vitro [3], using different prokaryotic DNA-dependent DNA-po-
lymerases with known function (5'->3' or 3'->5') and denaturated (sing
le-stranded) DNA as template obtained by either from microorganisms
or eukaryotes we have determined that both these agents would had pre-
The dynamic of influence (inhibition percentage) depending on concentration (ug/ml)
of doxorubicin (a) and streptonigrin (b) on the synthesis of DNA in vitro processed by
DNA-polymerases with 5'-*3' (/) or with 3'-v5' (//) function
cisely defined targets in a cell of microorganisms and strongly deter
mined and different mechanism action on DNA-polymerases with 5 ->3'
or 3'-*5' function.
Doxorubicin practically completely inhibited the activity of the DNA-
polymerase with 5'-ьЗ' function (replicase) in the concentration substan
ces in assay about 1 jig/ml and has no effect in the concentration up to
100 jig/ml on the activity of the DNA-polymerase possessing 3'-й>'
function (reparase) (figure, a) .
Streptonigrin also proved to be suitable for differentiation of the
forms of DNA-polymerases and determination of their functions: the
© I. G. SKRIPAL', S. V. BEZUGLY, V. V. BABITSCHEV, 1994
ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1994. Т. 10. № 3—4 103
forms of DNA-polymerase with 5'->~3' functions were not sensitive to
this antibiotic in the concentration of 1000 jug/ml, while the activity of
the forms of DNA-polymerases with 3'—^5' exonuclease function was fully
inhibited by this concentration of the antibiotics in the assay (figure, b).
Streptonigrin is known to cause the formation of single raptures in
native DNA in the prokaryotic and animal cells [2]. From our experi
ment, using single-stranded DNA as template is followed, that this agent
doesn't inhibit 3'->5 exonuclease function of DNA-polymerases with re
parative function, but it does block reparative centre of this enzyme,
what results in fragmentation of template DNA.
Thus, DNA-dependent DNA-polymerases, while realizing replication
of genome DNA (replicase) in prokaryoting cells, are the target for do
xorubicin, and DNA-dependent DNA-polymerases with 3'-^5' exonucle
ase and reparative function while realizing reparation of DNA (repa-
rase), are the target for streptonigrin. These antibiotics may be useful
in molecular biology (each antibiotic separately in the concentrations
mentioned above) as reactive for chemical indication of the form DNA-
dependent DNA-polymerases and its function, as an example of appli
cation of a-amanitine for determination of DNA-dependent RNA-poly-
merase II (B) and its differentiation from I (A) and III (C) forms of
these enzyme [4, 5].
Determination of 3'->5' DNA-dependent DNA-polymerase function
by a direct method is know to be quite a complicated and difficult pro
cedure [6, 7]. Otherwise, the combination of doxorubicin and streptonig
rin can be used for selectivity inhibition of the function of one or ano
ther DNA-polymerase in the assay where both enzymes are in the mix.
/. Г. Скрипаль, С. В. Безуглий, В. В. Бабичев
НЕПРЯМЕ ВИЗНАЧЕННЯ 5'~>3' I 3'-*5' ФУНКЦШ
ДНК-ЗАЛЕЖНИХ ДНК-ПОЛ1МЕРАЗ
Р е з ю м е
Доксорубшин в концентраци 1 мкг/мл i стрептонггрин в концентраци 1000 мкг/мл
кожний окремо можуть застосовуватися для визначення реплшативно1 (5'~^3') або
репаративно! (З'-э-'б') функщй ДНК-тшмерази. Актившсть ферменту з реплжативною
(б'-кЗ') функщею повшстю пригшчуеться доксорубщином, але не чутлива до дп стреп-
тон1грину в концентращях, зазначених вище. I, навпаки, актившсть ДНК-псшмерази з
репаративною (3'--*-5') функщею не чутлива до влливу доксорубщину, але шпбуеться
стрептошгрином.
REFERENCES
1. Chuang R. Y., Chuang L. F. Inhibition of chicken myeloblastosis RNA-polymerase II
activity by adriamycin//Biochemistry.—1979.—18, N 10.—P. 2069—2073.
2. Galf E. F., Cundliff E., Reynolds P. E. et at. The molecular basis of antibiotic action /
Ed. A Wiley London; New York: John Wiley and Song, 1972.-500 p.
3. Bauer G. A., Heller H. M., Burgers M. J. DNA-polymerase III from Saccharomyces ce-
revisiae 1. Purification and characterization // J. Biol. Chem.— 1988.— 63, N 2.—
P. 917—924.
4. Kedinger C, Gniazdowski M„ Mandel J. L. et at. a-Amanitin: A specific inhibitor of
one or two DNA-dependent RNA-polymerase activities from calf thymus // Biochem.
and Biophys. Res. Communs.—1970.—38, N 1.—P. 165—171.
5. Roeder R. G. Multiple forms of DNA-dependent RNA-polymerase in Xenopus laevis:
isolation and partial characterization//J. Biol. Chem.—1974.—249, N 1.— P. 241 —
248.
6. Byrnes J. J., Downey K. M., Black V. L. et at. A new mammalian DNA-polymerase
with 3' to 5' exonuclease activity : DNA-polymerase 6 / / Biochemistry.— 1976.— 15,
N 12.—P. 2817—2823.
7. Rutimann C, Cotoras M., Zaldivar J. et at. DNA-polymerases from the extremely ther
mophilic bacterium Thermus thermophilis HB-8 / / Eur. J. Biochem.—1985.—149, N 1.—
P. 41—46.
Zabolotny Inst, of Microbiol, and Virol. 07.02.94
of the Nat. Acad, of Sci. of the Ukraine, Kiev
104 ISSN 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1994. Т. 10. № 3—4
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155405 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-12-07T17:01:40Z |
| publishDate | 1994 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Skripal', I.G. Bezugly, S.V. Babitschev, V.V. 2019-06-16T19:16:42Z 2019-06-16T19:16:42Z 1994 Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function / I. G. Skripal', S.V. Bezugly, V.V. Babitschev // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 3-4. — С. 103-104. — Бібліогр.: 7 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0003B7 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155405 579.88:577.15 Doxorubicin in the concentration of 1 mg/ml and streptonigrin in the concentration 1000 mg/ml each agent separately should by useful to determination of replicative (5'→3') or reparatlve (3'→5') function DNA-polymerase. This enzymes with 5'→3' fully inhibited by doxorubicine but net sensitive to action of streptonigrin in concentration substances mentioned above. And contraverse, DNA-polymerase with 3'→5' function don't sensitive to doxorubicin and it's activity depressed by streptonigrin. Доксорубіцин в концентраци 1 мкг/мл i стрептонігрин в концентраццї 1000 мкг/мл кожний окремо можуть застосовуватися для визначення реплікативної (5'→3') або репаративної (3'→5') функцій ДНК-полімерази. Активність ферменту з реплікативною (5'→3') функцією повністю пригнічується доксорубіцином, але не чутлива до дії стрептонігрину в концентращях, зазначених вище. І, навпаки, активність ДНК-полімерази з репаративною (3'→5') функцією не чутлива до впливу доксорубіцину, але інкубується стрептонігрином. Доксорубицин в концентраци 1 мкг / мл i стрептонигрин в концентрацци 1000 мкг / мл каждый отдельно могут применяться для определения репликативной (5 '? 3') или репаративной (3 '? 5') функций ДНК-полимеразы. Активность фермента с репликативной (5 '? 3') функцией полностью подавляется доксорубицином, но не чувствительна к действию стрептонигрину в концентращях, указанных выше. И, наоборот, активность ДНК-полимеразы с репаративной (3 '? 5') функцией не чувствительна к влиянию доксорубицина, но инкубируется стрептонигрином. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function Непряме визначення 5'→3' i 3'→5' функції ДНК-залежних ДНК-полімераз Косвенное определение 5 '? 3' i 3 '? 5' функций ДНК-зависимых ДНК-полимераз Article published earlier |
| spellingShingle | Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function Skripal', I.G. Bezugly, S.V. Babitschev, V.V. |
| title | Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function |
| title_alt | Непряме визначення 5'→3' i 3'→5' функції ДНК-залежних ДНК-полімераз Косвенное определение 5 '? 3' i 3 '? 5' функций ДНК-зависимых ДНК-полимераз |
| title_full | Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function |
| title_fullStr | Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function |
| title_full_unstemmed | Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function |
| title_short | Indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the DNA-dependent DNA-polymerase function |
| title_sort | indirect determination of the 5'→3' and 3'→5' of the dna-dependent dna-polymerase function |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155405 |
| work_keys_str_mv | AT skripalig indirectdeterminationofthe53and35ofthednadependentdnapolymerasefunction AT bezuglysv indirectdeterminationofthe53and35ofthednadependentdnapolymerasefunction AT babitschevvv indirectdeterminationofthe53and35ofthednadependentdnapolymerasefunction AT skripalig neprâmeviznačennâ53i35funkcíídnkzaležnihdnkpolímeraz AT bezuglysv neprâmeviznačennâ53i35funkcíídnkzaležnihdnkpolímeraz AT babitschevvv neprâmeviznačennâ53i35funkcíídnkzaležnihdnkpolímeraz AT skripalig kosvennoeopredelenie53i35funkciidnkzavisimyhdnkpolimeraz AT bezuglysv kosvennoeopredelenie53i35funkciidnkzavisimyhdnkpolimeraz AT babitschevvv kosvennoeopredelenie53i35funkciidnkzavisimyhdnkpolimeraz |