Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине

Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине

В статье представлены первые результаты анализа нуклеотидных последовательностей генов ВИЧ-1, полученных с помощью полимеразной цепной реакции на ДНК из крови украинских пациентов. Два из девяти исследованных образцов отнесены к подтипу А, остальные – к подтипу В. Обнаружен редковстречающийся вариан...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Биополимеры и клетка
Date:1998
Main Authors: Гребенюк, В.А., Аноприенко, О.В., Скороход, А.С., Маричев, И.Л., Кавсан, В.М.
Format: Article
Language:Russian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1998
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155406
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине / В.А. Гребенюк, О.В. Аноприенко, А.С. Скороход, И.Л. Маричев, В.М. Кавсан // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 4. — С. 277-285. — Бібліогр.: 35 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155406
record_format dspace
spelling Гребенюк, В.А.
Аноприенко, О.В.
Скороход, А.С.
Маричев, И.Л.
Кавсан, В.М.
2019-06-16T19:18:35Z
2019-06-16T19:18:35Z
1998
Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине / В.А. Гребенюк, О.В. Аноприенко, А.С. Скороход, И.Л. Маричев, В.М. Кавсан // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 4. — С. 277-285. — Бібліогр.: 35 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0004D9
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155406
В статье представлены первые результаты анализа нуклеотидных последовательностей генов ВИЧ-1, полученных с помощью полимеразной цепной реакции на ДНК из крови украинских пациентов. Два из девяти исследованных образцов отнесены к подтипу А, остальные – к подтипу В. Обнаружен редковстречающийся вариант района V3 гена env ВИЧ-І Из двух показаний на путь передачи инфекции подтверждено одно
Представлено перші результати аналізу нуклеотидних послідовностей генів вірусу імунодефіциту людини типу І (ВІЛ-І), отриманих за допомогою полімеразної ланцюгової реакції на ДНК з крові українських пацієнтів. Два з дев'яти досліджених зразків віднесено до підтипу А, інші — до підтипу В, Знайдено варіант ділянки V3 гена env ВІЛ-І; цей варіант зустрічається рідко. З двох показань щодо шляху передачі інфекції підтверджено одне.
Here we report first results on genetic characterization of HIV-I samples from Ukraine using polymerase chain reaction (PCR) and viral genes sequencing. PCR was done on DNA from uncultured peripheral blood mononuclear cells of 7 male (all homosexual) and 2 female (one heterosexual and one injection drug user, IDV) HIV-1 seropositive individuals. After the PCR products cloning partial sequencing of HIV-1 gag gene (0.56 kb, p17-p24), HIV-I env gene (1.1 kb, CS-C5), and HIV-1 nef gene were performed. Nucleotide and deduced amino acid sequences were aligned to reference strains of different HIV-1 subtypes by CLUSTAL method and phylogenetic neighbor-joining trees were generated. By the results of phylogenetic analysis two HIV-1 samples (one from IDV and one from male homosexual) belonged to subtype A while others were clustered to subtype B by nucieotide as welt as by amino acid sequences. Most closely related env sequences wen; found in samples from a couple of homosexual partners. One rare V3 tip tetramer (RPGR) was found in subtype B env sequence. All three sequenced samples of HIV-I nef genes belonged to the subtype R. One nef sequence contains unusually long insert in Hie N-terminal region
Работа частично финансировалась грантом 93/8 Национального комитета по борьбе с заболе­ванием СПИД при президенте Украины.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине
Генетичний аналіз варіантів ВІЛ-І в Україні
Genetic characterization of HIV-1 variants in Ukraine
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине
spellingShingle Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине
Гребенюк, В.А.
Аноприенко, О.В.
Скороход, А.С.
Маричев, И.Л.
Кавсан, В.М.
title_short Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине
title_full Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине
title_fullStr Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине
title_full_unstemmed Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине
title_sort генетический анализ вариантов вич-1 в украине
author Гребенюк, В.А.
Аноприенко, О.В.
Скороход, А.С.
Маричев, И.Л.
Кавсан, В.М.
author_facet Гребенюк, В.А.
Аноприенко, О.В.
Скороход, А.С.
Маричев, И.Л.
Кавсан, В.М.
publishDate 1998
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Генетичний аналіз варіантів ВІЛ-І в Україні
Genetic characterization of HIV-1 variants in Ukraine
description В статье представлены первые результаты анализа нуклеотидных последовательностей генов ВИЧ-1, полученных с помощью полимеразной цепной реакции на ДНК из крови украинских пациентов. Два из девяти исследованных образцов отнесены к подтипу А, остальные – к подтипу В. Обнаружен редковстречающийся вариант района V3 гена env ВИЧ-І Из двух показаний на путь передачи инфекции подтверждено одно Представлено перші результати аналізу нуклеотидних послідовностей генів вірусу імунодефіциту людини типу І (ВІЛ-І), отриманих за допомогою полімеразної ланцюгової реакції на ДНК з крові українських пацієнтів. Два з дев'яти досліджених зразків віднесено до підтипу А, інші — до підтипу В, Знайдено варіант ділянки V3 гена env ВІЛ-І; цей варіант зустрічається рідко. З двох показань щодо шляху передачі інфекції підтверджено одне. Here we report first results on genetic characterization of HIV-I samples from Ukraine using polymerase chain reaction (PCR) and viral genes sequencing. PCR was done on DNA from uncultured peripheral blood mononuclear cells of 7 male (all homosexual) and 2 female (one heterosexual and one injection drug user, IDV) HIV-1 seropositive individuals. After the PCR products cloning partial sequencing of HIV-1 gag gene (0.56 kb, p17-p24), HIV-I env gene (1.1 kb, CS-C5), and HIV-1 nef gene were performed. Nucleotide and deduced amino acid sequences were aligned to reference strains of different HIV-1 subtypes by CLUSTAL method and phylogenetic neighbor-joining trees were generated. By the results of phylogenetic analysis two HIV-1 samples (one from IDV and one from male homosexual) belonged to subtype A while others were clustered to subtype B by nucieotide as welt as by amino acid sequences. Most closely related env sequences wen; found in samples from a couple of homosexual partners. One rare V3 tip tetramer (RPGR) was found in subtype B env sequence. All three sequenced samples of HIV-I nef genes belonged to the subtype R. One nef sequence contains unusually long insert in Hie N-terminal region
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155406
citation_txt Генетический анализ вариантов ВИЧ-1 в Украине / В.А. Гребенюк, О.В. Аноприенко, А.С. Скороход, И.Л. Маричев, В.М. Кавсан // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 4. — С. 277-285. — Бібліогр.: 35 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT grebenûkva genetičeskiianalizvariantovvič1vukraine
AT anoprienkoov genetičeskiianalizvariantovvič1vukraine
AT skorohodas genetičeskiianalizvariantovvič1vukraine
AT maričevil genetičeskiianalizvariantovvič1vukraine
AT kavsanvm genetičeskiianalizvariantovvič1vukraine
AT grebenûkva genetičniianalízvaríantívvílívukraíní
AT anoprienkoov genetičniianalízvaríantívvílívukraíní
AT skorohodas genetičniianalízvaríantívvílívukraíní
AT maričevil genetičniianalízvaríantívvílívukraíní
AT kavsanvm genetičniianalízvaríantívvílívukraíní
AT grebenûkva geneticcharacterizationofhiv1variantsinukraine
AT anoprienkoov geneticcharacterizationofhiv1variantsinukraine
AT skorohodas geneticcharacterizationofhiv1variantsinukraine
AT maričevil geneticcharacterizationofhiv1variantsinukraine
AT kavsanvm geneticcharacterizationofhiv1variantsinukraine
first_indexed 2025-12-07T13:16:32Z
last_indexed 2025-12-07T13:16:32Z
_version_ 1850855540955021312

Similar Items