Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації
Вивчено реакційну здатність залишків фосфорної кислоти тРНК₂Ser із Т. thermophilus, шр знаходиться у комплексі з серил-тРНК синтетазою. Серил-тРНК синтетаза захищає від модифікації нітрозоетилсечовиною фосфати акцепторного, варіабельного, Т-стеблів та Т-петлі. Изучена реакционная способность остатко...
Saved in:
| Published in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Date: | 1997 |
| Main Authors: | , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1997
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155443 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації / О.П. Коваленко, 3.М. Петрушенко, Н.Н. Мальченко, И.А. Крикливый, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 4. — С. 298-302. — Бібліогр.: 19 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1859847073144242176 |
|---|---|
| author | Коваленко, О.П. Петрушенко, З.М. Мальченко, Н.М. Крикливий, І.А. Яремчук, Г.Д. Тукало, М.А. |
| author_facet | Коваленко, О.П. Петрушенко, З.М. Мальченко, Н.М. Крикливий, І.А. Яремчук, Г.Д. Тукало, М.А. |
| citation_txt | Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації / О.П. Коваленко, 3.М. Петрушенко, Н.Н. Мальченко, И.А. Крикливый, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 4. — С. 298-302. — Бібліогр.: 19 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Вивчено реакційну здатність залишків фосфорної кислоти тРНК₂Ser із Т. thermophilus, шр знаходиться у комплексі з серил-тРНК синтетазою. Серил-тРНК синтетаза захищає від модифікації нітрозоетилсечовиною фосфати акцепторного, варіабельного, Т-стеблів та Т-петлі.
Изучена реакционная способность остатков фосфорной кислоты тРНК₂Ser из Т. thermophilus, находящейся в комплексе с серил-тРНК синтетазой. Серил-тРНК синтетаза из Т. thermophilus защищает от модификации нитрозоэтилмочевиной фосфаты акцепторного, вариабельного и Т-стеблей, а также Т-петли.
The reaction activity of phosphates of tRNA₂Ser from T. thermophilus complexed with it a cognate aminoacyi-tRNA syntlmtase has been defined. Seryl-tRNA synthelase protects phosphates of acceptor, variable, T-stems and T-loop from alkylation by ethyl-nitrosourea.
|
| first_indexed | 2025-12-07T15:39:55Z |
| format | Article |
| fulltext |
ISSN 0233-7657. Биополимеры и клетка. 1997. Т. 13. № 4
Изучение участков взаимодействия тРНК 2
из Thermus thermophilus с серил-тРНК синтетазой
методом химической модификации
О- П. Коваленко, 3 . М. Петрушенко, Н. Н. Мальченко,
И. А, Крикливый, А- Д . Яремчук, М. А. Тукало
Институт молекулярной биологии и генетики Н А Н Украины
252143 , Киев , ул. Академика Заболотного, 150
Изучена реакционная способность остатков фосфорной кислоты тРНКг™ из Т. thermophilus,
находящейся в комплексе с серил-тРНК синтетазой. Серил-тРНК синтетаза из Т. thermophilus
защищает от модификации нитрозоэтилмочевиной фосфаты акцепторного, вариабельного и
Т-стеблей, а также Т-петли.
Введение. Специфическое узнавание т Р Н К гомоло
гичными аминоацил-тРНК синтетазами (АРС) яв
ляется ключевым этапом в процессе трансляции
генетической информации. С этим связано наличие
огромного количества работ, посвященных исследо
ванию молекулярных механизмов специфического
взаимодействия т Р Н К с АРСазами. Большой инте
рес исследователей к этой проблеме объясняется
также тем, что до недавнего времени структуры
тРНК-синтетазных комплексов были единственным
источником детальной информации о структурных
основах РНК-белкового взаимодействия.
Выбор пары T P H K ' S c ' — серил-тРНК синтетаза
в качестве объекта исследования продиктован не
с к о л ь к и м и п р и ч и н а м и . В о - п е р в ы х , т Р Н К * е г ,
т Р Н К Ь е и и прокариотические т Р Н К Т у г отличаются
от т Р Н К других с п е ц и ф и ч н о с т и наличием длин
ной вариабельной ветви, состоящей более чем из 1 0
нуклеотидов в отличие от обычных 4 — 5 нуклеоти-
дов. Биохимические данные указывают на то, что
длинная вариабельная ветвь является важным ф а к
тором при дискриминации т Р Н К II структурного
класса гомологичными аминоацил-тРНК синтета
зами [ 1 , 2 ] . С другой стороны, T P H K S E R и T P H K U U ,
а также т Р Н К А 1 а , относящаяся к т Р Н К I класса,
узнаются гомологичными АРСазами особым кодон-
© О П. К О В А Л Е Н К О , З М П Е Т Р У Ш Е Н К О . Н. Н. М А Л Ь Ч Е Н К О .
И А. К Р И К Л И В Ы Й , А. Д Я Р Е М Ч У К , М А Т У К А Л О , 1997
независимым способом [ 3 — 6 ] , в то время как для
всех остальных т Р Н К антикодон является одним из
основных элементов узнавания [ 7 , 8 ]. Кроме того,
недавно были получены кристаллы T P H K S E R и се-
рил-тРНК синтетазы из Т. thermophilus, диффрак-
тирующие с высоким разрешением, и расшифрова
на структура комплекса [ 9 , 1 0 ] . Полученные ре
зультаты указывают на принципиально важную
роль рибозофосфатного остова, особенно остатков
фосфорной кислоты вариабельного стебля, T P H K S 6 1
в узнавании ее серил-тРНК синтетазой. Однако
при сравнении данных рентгеноструктурного ана
лиза с результатами биохимических исследований
взаимодействия T P H K S E T Escherichia coli с гомоло
гичной аминоацил-тРНК синтетазой f l l J были об
наружены существенные различия в участии вари
абельного стебля в этом процессе. Осталось не
выясненным, отражают ли эти отличия существо
вание разных состояний комплекса в растворе и в
кристалле либо они свидетельствуют о разных
механизмах узнавания T P H K ' S E R .
Материалы и методы. В работе использовали
Т , - Р Н К а з у (КФ 3 . 1 . 2 7 . 3 , «Sankyo»\ Япония) ; ще
лочную фосфатазу из Е. coli (КФ 3 . 1 . 3 . 1 , «Sigma»,
С Ш А ) , фосфодиэстеразу змеиного яда ( 3 . 1 . 4 . 1 ,
«Worthington», С Ш А ) , полинуклеотидкиназу (КФ
2 . 7 . 1 . 7 8 ) , выделенную из клеток Е. coli, инфициро
ванных фагом Т 4 («Pharmacia», Швеция) , т Р Н К -
нуклеотидилтрансферазу (КФ 2 . 7 . 2 . 1 ) , любезно
2 9 8
предоставленную д-ром Р. Ж ь е ж е (Институт моле
кулярной и клеточной биологии, Страсбург).
( а - 3 2 Р ) А Т Ф , уд. а к т . 400 К и / м м о л ь , (у-
3 2 Р ) А Т Ф , уд. акт. 3000 К и / м м о л ь («Amersham»,
Англия).
Нитрозоэтилмочевина синтезирована А. Г. Т е -
рентьевым (Институт молекулярной биологии и
генетики НАН Украины) .
T P H K V f \ получали из суммарного препарата
тРНК Т. thermophilus в несколько ступеней, как в
работе [12].
Серил-тРНК синтетаза (КФ 6.1.1.11) из Т.
thermophilus 98 % чистоты получена по методу,
описанному в работе [13] .
тРНК./*' , 3 2 Р - м е ч е н н у ю по 3 ' - и 5 - к о н ц а м ,
получали, как описано в работах [14] и [15]
соответственно.
Алкилирование т Р Н К / С 1 (1 мкМ) в присутст
вии аминоацил-тРНК синтетазы (4 мкМ) проводи
ли в 25 мкл 50 мМ трис-HCl (рН 7,9), содержащего
5 мМ MgCl 2 , 2,5 мМ 2-меркаптоэтанол, добавляя
2,5 мкл насыщенного спиртового раствора нитрозо-
этилмочевины. Реакцию вели в течение 2 ч при
25 °С или 10 мин при 65 °С. Останавливали реак
цию добавлением 3 мкл З М ацетата натрия, рН
5,5. Аминоацил-тРНК синтетазу удаляли обработ
кой реакционной смеси водонасыщенным фенолом.
тРНК осаждали добавлением 100 мкл дважды пе
регнанного этанола . Контрольный эксперимент
проводили, добавляя вместо нитрозоэтилмочевины
этанол,
Алкилирование свободной т Р Н К осуществляли
в аналогичных условиях без фенольной экстра
кции.
Алкилирование т Р Н К в денатурирующих усло
виях проводили в 25 мкл 0,3 М натрий-какодилат-
ного буфера, рН 8,0, содержащего 0,1 мМ EDTA, в
течение 2 мин при 80 °С.
Полинуклеотидную цепь по модифицирован
ным фосфатам расщепляли (5 мин) в 10 мкл 100
мМ трис-НС1-буфера (рН 9,0) при 55 °С. Фрагмен
ты т Р Н К осаждали добавлением 3 мкл З М ацетата
натрия, рН 5,5, и 100 мкл этанола. Полученные
образцы расщепленной т Р Н К анализировали гель-
электрофорезом в полиакриламидном геле в при
сутствии 8 М мочевины в 50 мМ трис-боратном
буфере, рН 8,3, содержащем 1 мМ EDTA. Элект-
рофорстические полосы идентифицировали, срав
нивая их подвижности с таковыми фрагментов
тРНК, полученных частичным гидролизом ее рибо-
нуклеазой Т , . Радиоавтографы гелей сканировали
на микроденситометре «Joyce Loebl» (Англия).
Трудности, возникающие при осаждении ко
ротких олигонуклеотидов, не позволили получить
И З У Ч Е Н И Е У Ч А С Т К О В В З А И М О Д Е Й С Т В И Я тРНКЬ 'ег2
информации о реакционной способности фосфатов
нуклеотидов 1—3, 70—76.
Результаты и обсуждение . Участки взаимодей
ствия т Р Н К / е г с серил-тРНК синтетазой из Т .
thermophilus изучали с помощью алкилирования
комплекса нитрозоэтилмочевиной по методу Власо
ва і 15] . Параллельно исследовали и остатки фос
форной кислоты, участвующие в формировании
пространственной структуры т Р Н К / е г . Для этого
алкилирование т Р Н К осуществляли тремя способа
ми: в денатурирующих условиях; в условиях, ста
билизирующих третичную структуру молекулы
т Р Н К и в присутствии гомологичной аминоацил-
т Р Н К синтетазы. Для более точного анализа также
было проведено несколько экспериментов с разде
лением меченых олигонуклеотидов в полиакрила-
мидных гелях с концентрациями 10; 12,5 и 20 %.
Исследования выполняли как на 3 - , так и на
5 '-меченной т Р Н К . На рис. 1 приведена фотогра
фия радиоавтографа одного из таких гелей. Отно
сительные реакционные способности остатков фос
форной кислоты т Р Н К / е г ' участвующих в формиро
вании пространственной структуры молекулы, а
также находящихся в комплексе с аминоацил-
т Р Н К синтетазой, рассчитывали по денситограм-
мам соответствующих электрофоретических треков
(рис. 2 ) .
Из кривой расчета денситограмм следует, что
серил-тРНК синтетаза из Т. thermophilus защищает
от модификации нитрозоэтилмочевиной 5 - ф о с ф а
ты нуклеотидов 46—47:с, 47:о, 47:р, 50, 53 , 54,
67—69. Как видно, что т Р Н К / е ' взаимодействует с
гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой со сто
роны вариабельной ветви. Фосфаты антикодоновой
ветви не имеют контактов с серил-тРНК синтета
зой.
Наши данные по исследованию участков взаи
модействия т Р Н К 2
Ч е 1 из Т. thermophilus с гомоло
гичной АРСазой в растворе хорошо согласуются с
результатами, полученными при изучении взаимо
действия этих молекул в кристалле [9, 10]. В этих
работах показано, что с мономером 2 серил-тРНК
синтетазы взаимодействуют 5 - ф о с ф а т ы нуклеоти
дов 46, 47:с, 47:р, 47:о, 53 , 54, 57, 67, а с
мономером 1 — ф о с ф а т ы нуклеотидов 67, 68, 69,
71 . В растворе наблюдается несколько большее
количество остатков фосфорной кислоты т Р Н К / ' ,
защищенных от алкилирования нитрозоэтилмоче
виной в присутствии серил-тРНК синтетазы, чем
обнаружено контактов между фосфатами т Р Н К и
белком в кристалле. Отличия наблюдаются в вари
абельном и Т-стеблях.
Следует отметить, что в кристалле комплекса
т Р Н К / е г с серил-тРНК синтетазой 0 2 ' атом нукле-
299
/ - J 4 Э О / в
Рис. I. Авторадиограмма 12,5 %-го полиакриламидного геля, в
котором были разделены фрагменты 5 ' -меченной T P H K 2
S e i из Т.
thermophilus, полученные после алкилирования ее нитрозоэтил
мочевиной » условиях, д е н а т у р и р у ю щ и х (2) и стабилизирую
щих (3, 5) пространственную структуру макромолекулы; в
присутствии с е р и л - т Р Н К синтетазы (6) и гистидил-тРНК син
тетазы (7) . Контрольные инкубации проводили в условиях,
стабилизирующих пространственную структуру т Р Н К (4), и в
присутствии с е р и л - т Р Н К синтетазы (8) в отсутствие нитрозоэ
тилмочевины; / — т Р Н К , частично гидролизованная рибонукле-
азой Т\. Штриховой л и н и е й выделены ф о с ф а т ы т Р Н К , з а щ и
щенные серил-тРМК синтетазой от алкилирования реагентом
отида G47:a и фосфат 0 2 Р G47:b приближены к
аминокислотным остаткам Lys"41 и Arg* фермента и
находятся на расстоянии, лишь немногим превы
шающем 3,5 А , что позволяет считать их потенци
альными сайтами взаимодействия, осуществляемо
го при участии молекул воды. Обширная контакт
н а я з о н а т Р Н К с с е р и л - т Р Н К с и н т е т а з о й
(нуклеотиды 46—47с), вероятно, создает стериче-
ские препятствия для модификации 5 -фосфатов
нуклеотидов 47—47Ь нитрозоэтилмочевиной, атом
ный радиус молекул которой составляет 2,8 А [17] .
Пространственные затруднения также, возмо
жно, являются причиной низкой реакционной спо
собности 5 ' -фосфата нуклеотида 50, поскольку из
кристаллографических данных известно, что он
сближен с рибозой нуклеотида 48 [9] .
Количественной информации об активности 5 -
фосфата нуклеотида 57 получить не удалось, так
как в растворе происходит спонтанный гидролиз
фосфодиэфирной связи между нуклеотидами 56 и
57.
Остается открытым вопрос о различиях в уча
стии вариабельного стебля в процессе узнавания
т Р Н К " гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой
в клетках Е. coli и Т. thermophilus.
Результаты наших исследований указывают на
то, что взаимодействие T P H K S " С серил-тРНК син
тетазой в растворе и в кристалле поисходит анало
гичным образом при определяющей роли сахаро-
фосфатного остова вариабельного стебля. Мы пола
г а е м , ч т о п о д о б н ы й м е х а н и з м д о л ж е н
реализоваться и в клетках Е. coli. В пользу этого
предположения свидетельствуют следующие фак
ты:
1. Серил-тРНК синтетазы из Е. coli и Т.
thermophilus имеют очень похожие структуры, осо
бенно в активном центре |18 ].
2. В перекрестных реакциях осуществляется
эффективное аминоацилирование гетерологичной
T P H K V i как серил-тРНК синтетазой из Е. coli, так
и из Т . thermophilus [9 J.
3. Вследствие изменений структуры тРНК' ' , п Е.
coli, вызванных введением мутаций, было показа
но, что при уменьшении длины вариабельного
стебля до трех пар нуклеотидов аминоацилирова-
ния не происходит, что свидетельствует о важной
роли данного структурного элемента для процесса
узнавания серил-тРНК синтетазой |3J .
4. Реакция аминоацилирования полностью уг
нетена при делеции суперспирального стебля се-
рил-тРНК синтетазы Е. coli [19] . В серил-тРНК
синтетазе из Т. thermophilus именно этот домен
взаимодействует с вариабельным стеблем т Р Н К Л ( '
[9, 10].
300
И З У Ч Е Н И Е У Ч А С Т К О В В З А И М О Д Е Й С Т В И Я т Р Н К 5 е г 2
R
Рис. 2. Относительные реакционные способности остатков фосфорной кислоты т Р Н К 2 * е г из Т. thermophilus. R — отношения
интенсивностей соответствующих электрофоретических полос электрофореграмм экспериментов по алкилированию тРНК в
условиях, стабилизирующих пространственную структуру тРНК, и в присутствии серил-тРНК синтетазы. Нуклеотид в положении
18 метилирован по рибозе и потому не вступает в реакцию с нитрозоэтилмочевиной
Рис. 3. Структура т Р Н К 2
Х е ' из Т. thermophilus в виде клеверного
листа. Указаны фосфаты, взаимодействующие с серил-тРНК
синтетазой в кристалле комплекса (выделены треугольником) и
защищенные серил-тРНК синтетазой от модификации нитрозо
этилмочевиной в растворе (указаны стрелкой)
5. Обнаруженное в комплексе т Р Н К / 6 ' — се-
рил-тРНК синтетаза из Т. thermophilics нуклеотид-
специфическое взаимодейсвие (пара G 4 7 a - C 4 7 / J ) не
является критичным для узнавания. При замене
этой пары на A 4 7 a - U 4 7 / r или U 4 7 a * U 4 7 / / происходит
эффективное и специфичное аминоацилирование
т Р Н К 8 е г (Тукало М. А., неопубликованные резуль
таты) .
6. В экспериментах по изменению специфич
ности т Р Н К Т у г Е. coli на T P H K S e r были получены
мутантные т Р Н К Т у г , которые эффективно и с высо
кой степенью специфичности аминоацилировались
серином при участии серил-тРНК синтетазы. При
этом нуклеотидная последовательность вариабель
ной ветви этих мутантных т Р Н К Т у г полностью от
личалась от таковой для T P H K S e r [1 ]. Следователь
но, узнавание вариабельной ветви T P H K S e r Е. coli
серил-тРНК синтетазой не зависит от ее нуклео-
тидной последовательности.
Поэтому тот факт , что при исследовании уча
стков взаимодействия TPHK S e r Е. coli с серил-тРНК
синтетазой фосфоротиоатным методом не обнару
жено контактов с сахарофосфатным остовом вари
абельного стебля, остается непонятным.
Работа частично финансировалась мединститу
том Говарда Хьюза (США) , грант № 75195—
548201.
0 . П. Коваленко, 3. М. Петруигенко, Н. М. Мальченко,
1. А Крикливий, Г. Д. Я реліну к, М. А. Тукало
Вивчення ділянок взаємодії т Р Н К 2 із Tliermus thermophiiua
з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації
Резюме
Вивчено^^реащійну здатність залишків фосфорної кислоти
тРНК^ із Т. thermophilus, шр знаходиться у комплексі з
серил-тРНК синтетазою. Серил-тРНК синтетаза захищає
від модифікації нітрозоетилсечовиною фосфати акцепторно-
ео, варіабельного, Т-стсблів та Т-петлі.
301
К О В А Л Е Н К О О. П. И Д Р .
0. P. Kovalenko, Z. М. Pelruslienko, N. N. Mal'chenko,
1. A. Krikliviy, A. D. Yaremchuk, M. A. Tukalo
Set'
Studies of interaction sites between t £ N A 2 from Thermus
thermophilus and seryl-tRNA synthetase by chemical modification
method
Summary
The reaction activity of phosphates of tRNA2 ' from T. thermo
philus complexed with its cognate aminoacyl-tRNA synthetase has
been defined. Seryl-tRNA synthetase protects phosphates of ac
ceptor, variable, T-sterns and T-loop from alkylation by ethyl-
nitrosourea.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Himeno И., Hasegava Т., Veda Т. et at. Conversion of
aminoacylation specificity from t R N A T y r to t R N A S e r in vitro II
Nucl. Acids R e s . — 1 9 9 0 — 1 8 , N 2 3 . — P . 6815—6818 .
2. Asahara //., Himeno H.f Tamura K. et al. Recognition
nucleotides of Escherichia coli tRNA 1' 6 1 1 and its elements
facilitating discrimination from t R N A S e r and t R N A T y r / / J. Mo).
B i o l . — 1 9 9 3 . — 2 3 1 . — P . 2 1 9 — 2 2 9 .
3. Asahara H., Himeno H., Tamura K. et al. Escherichia coli
seryl-tRNA synthetase recognizes tRNA' S e r by its characteristic
tertiary structure / / I b i d . — 1 9 9 4 , — 2 3 6 . — P . 738—748 .
4. Петрушенко 3. M., Тукало M. А., ГуОзера О. И. и др.
Определение участков взаимодействия T P H K U u молочной
железы коров с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой
методом химических модификаций / / Биоорг. химия.—
1990 .—16.—С. 1647—1652 .
5. Dietrich A., Romby P., Marechal-Drouard L. et al. Solution
conformation of several free tRNA b e i 1 species from bean, yeast
and Escherichia coli and interaction of these tRNAs with bean
cytoplasmic leucyl-tRNA synthetase. A phosphate alkylation
study with ethylnitrosourea / / Nucl. Acids Res. — 1 9 9 0 . — 1 8 . —
P . 2589—2597.
6. Tamura K., Asahara H., Himeno H. et al Identity elements of
E. coli tRNA A l f l / / J. Мої. Recogn. — 1 9 9 1 . — 4 . — P . 129—132.
7. Normanly Abelson J. tRNA identity / / Annu. Rev. Bio-
c h e m . — 1 9 8 9 . — 5 8 . — P . 1029—1049.
8. Saks M. E., Sampson J. R., Abelson J. N. The transfer RNA
identity problem: a search for rules / / Science.—1994.—
263 — P . 191—197.
9. Biou V., Yaremchuk A., Tukalo M., Cusack S. The 2.9 A
crystal structure of T. thermophilus seryl-tRNA synthetase
complexed with t R N A S e r / / Ibid.—P. 1404—1410.
10. Cusack S., Yaremchuk A., Tukalo M. The crystal structure of
the ternary complex of Thermus thermophilus seryl-tRNA
synthetase with t R N A S e i and a seryl-adenylate analogue reveals
a conformational switch in the active site / / The EMBO
J — 1 9 9 6 . — 1 5 , N 11.—P. 2834—2842 .
11. Schatz D., Leberman R., Eckstein F. Interaction of Escherichia
coli l R N A S e r with its cognate aminoacyl-tRNA synthetase as
determined by footprinting with phosphorotioate-containing
tRNA transcripts / / Proc. Nat. Acad. Sci. USA. — 1 991 .—88 .—
P. 6132—6136 .
12. Петруиіенко 3. M., Коваленко О. П., Мальченко Н. Н. и
др. Первичная структура TPHK S e i из Thermus thermophilus
II Биополимеры и клетка. —1997 . — 1 3 , N9 3 .—С. 202—
208.
13. Яремчук А. Д , Тукало М. А., Коноваленко А. В. и др.
Выделение серил-тРНК синтетазы из Thermus thermophilus
HB-27 / / Там же. — 1 9 8 9 . — 5 , № 5 .—С. 83—86.
14. Silberclang М., Gillum A., RajBhandary U. II Nucl. Acids
Res. — 1 9 7 7 . — 4 , N 12.—P. 4091—4108 .
15. Венкстерн Т. В. Первичная структура транспортных рибо
нуклеиновых кислот.—М.: Наука, 1970 .—С. 258.
16. Vlassov V., Giege Я, Ebei Т.-P. Tertiary structure of tRNAs
in solution monitored by phosphodiester modification with
ethylnitrosourea / / Eur. J. B iochem.—1981 .—119.—P. 51 —
59.
17. Dock-Bregeon A. C , Westhof E., Giege R., Moras D. Solution
structure of a tRNA with large variable region: Yeast tRNA S e i
/ / J. Мої. Biol.— 1989s—206.—P. 7 0 7 — 7 2 2 .
18. Fujinaga M., Berthet-Colominas C , Yaremchuk AD. et al
Refined crystal structure of the seryl-tRNA synthetase from
Thermus thermophilus at "2.5 A resolution / / Ibid.—1993.—
234 .—P. 2 2 2 — 2 3 3 .
19. Borel F., Vincent C , Leberman R., Hartlein M. Seryl-tRNA
synthetase from E. coli: implication of its N-terminal domain in
aminoacylation activity and specificity / / Nucl. Acids Res.—
1994 .—22.—P. 2963—2969 .
УДК 577.217.337.2
Поступила в редакцию 12.06.97
3 0 2
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155443 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T15:39:55Z |
| publishDate | 1997 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Коваленко, О.П. Петрушенко, З.М. Мальченко, Н.М. Крикливий, І.А. Яремчук, Г.Д. Тукало, М.А. 2019-06-16T20:18:05Z 2019-06-16T20:18:05Z 1997 Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації / О.П. Коваленко, 3.М. Петрушенко, Н.Н. Мальченко, И.А. Крикливый, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 4. — С. 298-302. — Бібліогр.: 19 назв. — укр. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00048E https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155443 577.217.337.2 Вивчено реакційну здатність залишків фосфорної кислоти тРНК₂Ser із Т. thermophilus, шр знаходиться у комплексі з серил-тРНК синтетазою. Серил-тРНК синтетаза захищає від модифікації нітрозоетилсечовиною фосфати акцепторного, варіабельного, Т-стеблів та Т-петлі. Изучена реакционная способность остатков фосфорной кислоты тРНК₂Ser из Т. thermophilus, находящейся в комплексе с серил-тРНК синтетазой. Серил-тРНК синтетаза из Т. thermophilus защищает от модификации нитрозоэтилмочевиной фосфаты акцепторного, вариабельного и Т-стеблей, а также Т-петли. The reaction activity of phosphates of tRNA₂Ser from T. thermophilus complexed with it a cognate aminoacyi-tRNA syntlmtase has been defined. Seryl-tRNA synthelase protects phosphates of acceptor, variable, T-stems and T-loop from alkylation by ethyl-nitrosourea. Работа частично финансировалась мединститутом Говарда Хьюза (США), грант № 75195— 548201. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації Изучение участков взаимодействия тРНК₂Ser из Thermus thermophilus с серил-тРНК синтетазой методом химической модификации Studies of interaction sites between tRNA₂Ser from Thermus thermophilus and seryl-tRNA synthetase by chemical modification Article published earlier |
| spellingShingle | Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації Коваленко, О.П. Петрушенко, З.М. Мальченко, Н.М. Крикливий, І.А. Яремчук, Г.Д. Тукало, М.А. Структура и функции биополимеров |
| title | Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації |
| title_alt | Изучение участков взаимодействия тРНК₂Ser из Thermus thermophilus с серил-тРНК синтетазой методом химической модификации Studies of interaction sites between tRNA₂Ser from Thermus thermophilus and seryl-tRNA synthetase by chemical modification |
| title_full | Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації |
| title_fullStr | Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації |
| title_full_unstemmed | Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації |
| title_short | Вивчення ділянок взаємодії тРНК₂Ser із Thermus thermophilus з серил-тРНК синтетазою методом хімічної модифікації |
| title_sort | вивчення ділянок взаємодії трнк₂ser із thermus thermophilus з серил-трнк синтетазою методом хімічної модифікації |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155443 |
| work_keys_str_mv | AT kovalenkoop vivčennâdílânokvzaêmodíítrnk2serízthermusthermophiluszseriltrnksintetazoûmetodomhímíčnoímodifíkacíí AT petrušenkozm vivčennâdílânokvzaêmodíítrnk2serízthermusthermophiluszseriltrnksintetazoûmetodomhímíčnoímodifíkacíí AT malʹčenkonm vivčennâdílânokvzaêmodíítrnk2serízthermusthermophiluszseriltrnksintetazoûmetodomhímíčnoímodifíkacíí AT krikliviiía vivčennâdílânokvzaêmodíítrnk2serízthermusthermophiluszseriltrnksintetazoûmetodomhímíčnoímodifíkacíí AT âremčukgd vivčennâdílânokvzaêmodíítrnk2serízthermusthermophiluszseriltrnksintetazoûmetodomhímíčnoímodifíkacíí AT tukaloma vivčennâdílânokvzaêmodíítrnk2serízthermusthermophiluszseriltrnksintetazoûmetodomhímíčnoímodifíkacíí AT kovalenkoop izučenieučastkovvzaimodeistviâtrnk2serizthermusthermophilussseriltrnksintetazoimetodomhimičeskoimodifikacii AT petrušenkozm izučenieučastkovvzaimodeistviâtrnk2serizthermusthermophilussseriltrnksintetazoimetodomhimičeskoimodifikacii AT malʹčenkonm izučenieučastkovvzaimodeistviâtrnk2serizthermusthermophilussseriltrnksintetazoimetodomhimičeskoimodifikacii AT krikliviiía izučenieučastkovvzaimodeistviâtrnk2serizthermusthermophilussseriltrnksintetazoimetodomhimičeskoimodifikacii AT âremčukgd izučenieučastkovvzaimodeistviâtrnk2serizthermusthermophilussseriltrnksintetazoimetodomhimičeskoimodifikacii AT tukaloma izučenieučastkovvzaimodeistviâtrnk2serizthermusthermophilussseriltrnksintetazoimetodomhimičeskoimodifikacii AT kovalenkoop studiesofinteractionsitesbetweentrna2serfromthermusthermophilusandseryltrnasynthetasebychemicalmodification AT petrušenkozm studiesofinteractionsitesbetweentrna2serfromthermusthermophilusandseryltrnasynthetasebychemicalmodification AT malʹčenkonm studiesofinteractionsitesbetweentrna2serfromthermusthermophilusandseryltrnasynthetasebychemicalmodification AT krikliviiía studiesofinteractionsitesbetweentrna2serfromthermusthermophilusandseryltrnasynthetasebychemicalmodification AT âremčukgd studiesofinteractionsitesbetweentrna2serfromthermusthermophilusandseryltrnasynthetasebychemicalmodification AT tukaloma studiesofinteractionsitesbetweentrna2serfromthermusthermophilusandseryltrnasynthetasebychemicalmodification |