SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis?
In this paper we employed an extraction of the cells with high concentration of sodium chloride (a procedure commonly used for preparation of histone-depleted nuclei) to investigate the genesis of nuclear DNA degradation during apoptosis. We demonstrated that apoptosis in primary culture of murine t...
Збережено в:
| Дата: | 1997 |
|---|---|
| Автор: | |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1997
|
| Назва видання: | Биополимеры и клетка |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155586 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? / V.T. Solov'yan // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 4. — С. 314-322. — Бібліогр.: 58 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155586 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| fulltext |
|
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
English |
| topic |
Геном и его регуляция Геном и его регуляция |
| spellingShingle |
Геном и его регуляция Геном и его регуляция Solov'yan, V.T. SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? Биополимеры и клетка |
| description |
In this paper we employed an extraction of the cells with high concentration of sodium chloride (a procedure commonly used for preparation of histone-depleted nuclei) to investigate the genesis of nuclear DNA degradation during apoptosis. We demonstrated that apoptosis in primary culture of murine thymocytes and in continuously growing Swiss 3T3 fibroblasts is associated with progressive disintegration of nuclear DNA into high molecular weight (HMW) DNA fragments of about 50–150 kb followed by the development of oligonucleosomai DNA ladder. In apoptotic cells both HMW DNA cleavage and internucleosomal DNA fragmentation can be detected cither by cell treatment with ionic detergents (SDS) or by extraction with high concentration of sodium chloride. However, at the early stage of apoptosis only SOS-detected HMW-DNA cleavage can be observed which precedes the sodium-chloride-detected nuclear DNA degradation. SDS-detected but not sodium-chloride-detected formation of HMW-DNA fragments occurs in apoptotic cells as early as before detachment. It may be observed also in nonapoptotic cells after they reach t/ic confluent state and is reversible. On the basis of obtained results it is possible to suggest thai SDS-detected HMW-DNA cleavage represents a physiological reaction of alive cells that accompanies an early commitment step of apoptosis. |
| format |
Article |
| author |
Solov'yan, V.T. |
| author_facet |
Solov'yan, V.T. |
| author_sort |
Solov'yan, V.T. |
| title |
SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? |
| title_short |
SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? |
| title_full |
SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? |
| title_fullStr |
SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? |
| title_full_unstemmed |
SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? |
| title_sort |
sds-dependent cleavage of nuclear dna into high molecular weight dna fragments: a signal to the engagement of apoptosis? |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
1997 |
| topic_facet |
Геном и его регуляция |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155586 |
| citation_txt |
SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? / V.T. Solov'yan // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 4. — С. 314-322. — Бібліогр.: 58 назв. — англ. |
| series |
Биополимеры и клетка |
| work_keys_str_mv |
AT solovyanvt sdsdependentcleavageofnucleardnaintohighmolecularweightdnafragmentsasignaltotheengagementofapoptosis AT solovyanvt dsnazaležnerozŝeplennââdernoídnknavisokomolekulârnífragmentisignaldopočatkuapoptozu AT solovyanvt dsnazavisimoerasŝeplenieâdernojdnknavysokomolekulârnyefragmentysignalknačaluapoptoza |
| first_indexed |
2025-11-26T00:08:39Z |
| last_indexed |
2025-11-26T00:08:39Z |
| _version_ |
1849809404771172352 |
| spelling |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-1555862025-02-09T12:36:35Z SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? DS-Na-залежне розщеплення ядерної ДНК на високомолекулярні фрагменти: сигнал до початку апоптозу? DS-Na-зависимое расщепление ядерной ДНК на высокомолекулярные фрагменты: сигнал к началу апоптоза? Solov'yan, V.T. Геном и его регуляция In this paper we employed an extraction of the cells with high concentration of sodium chloride (a procedure commonly used for preparation of histone-depleted nuclei) to investigate the genesis of nuclear DNA degradation during apoptosis. We demonstrated that apoptosis in primary culture of murine thymocytes and in continuously growing Swiss 3T3 fibroblasts is associated with progressive disintegration of nuclear DNA into high molecular weight (HMW) DNA fragments of about 50–150 kb followed by the development of oligonucleosomai DNA ladder. In apoptotic cells both HMW DNA cleavage and internucleosomal DNA fragmentation can be detected cither by cell treatment with ionic detergents (SDS) or by extraction with high concentration of sodium chloride. However, at the early stage of apoptosis only SOS-detected HMW-DNA cleavage can be observed which precedes the sodium-chloride-detected nuclear DNA degradation. SDS-detected but not sodium-chloride-detected formation of HMW-DNA fragments occurs in apoptotic cells as early as before detachment. It may be observed also in nonapoptotic cells after they reach t/ic confluent state and is reversible. On the basis of obtained results it is possible to suggest thai SDS-detected HMW-DNA cleavage represents a physiological reaction of alive cells that accompanies an early commitment step of apoptosis. У роботі застосовано метод високосолевої екстракції інтактних клітин для вивчення динаміки розщеплення ядерної ДНК при апоптозі. Показано, що апоптоз в первинній культурі тимоцитів і культивованих прикріплених клітинах фібробластів мииіі супроводжується прогресивною деградацією ядерної ДНК на високомолекулярні фрагменти розміром 50–150 тис. п. н. з подальшим формуванням олігонуклеосомних фрагментів. В апоптозних клітинах розщеплення ядерної ДНК на високо молекулярні та олігонуклеосомні фрагменти відбувається як при обробці клітин DS-Na, так і при високо-солевій, екстракції. Однак на ранніх етапах апоптозу має місце лише DS-Na-залежна високомолекулярна фрагментація ядерної ДНК, яка передує формуванню високо молекулярних фрагментів, що виявляються при високосолевій екстракції клітин. На відміну від розривів, які виявляються високосолевою екстракцією, DS-Na-залежне розщеплення ядерної ДНК на високомолекулярні фрагменти спостерігається в апоптозних клітинах перед вспливанням, а також має місце в неапоптозних клітинах, що досягли моношару. Показано, що DS-Na-залежне розщеплення ядерної ДНК на високомолекулярні фрагменти на початкових стадіях апоптозу є зворотним в умовах, що сприяють залежному від топоізомерази II лігуванню розривів ДНК. Отримані результати свідчать, що DS-Na-залежне розщеплення ядерної ДНК на високомолекулярні фрагменти є фізіологічною реакцією живих клітин, яка передує апоптозній деградації ядерної ДНК. В работе применен метод высокосолевой экстракции интактных клеток для изучения динамики расщепления ядерной ДНК при апоптозе. Показано, что апоптоз в первичной культуре тимоцитов и культивированных прикрепляющихся клетках фибробластов мыши сопровождается прогрессивной деградацией ядерной ДНК на высокомолекулярные фрагменты размером 50–150 тыс. п. н. с последующим формированием олигонуклеосомных фрагментов. В апоптозных клетках расщепление ядерной ДНК на высокомолекулярные и олигонуклеосомные фрагменты происходит как при обработке клеток DS-Na, так и при высокосолевой экстракции. Однако на ранних этапах апоптоза имеет место лишь DS-Na-зависимая высокомолекулярная фрагментация ядерной ДНК, предшествующая формированию высокомолекулярных фрагментов, выявляемых высокосолевой экстракцией клеток. В отличие от разрывов, обнаруживаемых высокосолевой экстракцией, DSNa-зависимое расиитление ядерной ДНК на высокомолекулярные фрагменты наблюдается в апоптозных клетках перед всплытием, а также имеет место в неапоптозных клетках, достигших монослоя. Показано, что DS-Na-зависимое расщепление ядерной ДНК на. высокомолекулярные фрагменты на начальных стадиях апоптоза является обратимым в условиях, способствующих опосредованному топоизомеразой II лигированию разрывов ДНК. Полученные результаты свидетельствуют, что DS-Na-зависимое расщепление ядерной ДНК на высокомолекулярные фрагменты представляет собой физиологическую реакцию живых клеток, которая, предшествует апоптозной деградации ядерной ДНК. I thank Dr. P. Pogrebnoy, for kindly provided cell cultures, Dr. S. Mikholap for help in fluorescent analysis, and Igor Andreev for excellent assistance in conducting of experiments and preparation of manuscript. This work was supported by the Committee for Fundamental Research at the National Academy of Sciences, Ukraine. 1997 Article SDS-dependent cleavage of nuclear DNA into high molecular weight DNA fragments: a signal to the engagement of apoptosis? / V.T. Solov'yan // Биополимеры и клетка. — 1997. — Т. 13, № 4. — С. 314-322. — Бібліогр.: 58 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000491 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155586 en Биополимеры и клетка application/pdf Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |