Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus

Методом ЯМР-релаксации изучена внутримолекулярная подвижность трех электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины. Установлено, что фракции гемоглобина с большей внутримолекулярной подвижностью имеют больший общий объем гидрофобных полостей и характеризуются меньшим сродством к кислороду....

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:1998
Автори: Коношенко, С.В., Осляк, Т.В.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1998
Назва видання:Биополимеры и клетка
Теми:
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155593
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus / С.В. Коношенко, Т.В. Осляк // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 5. — С. 434-437. — Бібліогр.: 20 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155593
record_format dspace
spelling nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-1555932025-02-09T15:48:45Z Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus Взаємозв'язок структурно-динамічних властивостей та спорідненості з киснем електрофоретичних фракцій гемоглобіну дельфіна-афаліни Tursiops truncatus Correlation of structure-dynamic properties and oxygen affinity lo haemoglobin's electrophoretic fractions of dolphiri-afaline Tursiops truncatus Коношенко, С.В. Осляк, Т.В. Структура и функции биополимеров Методом ЯМР-релаксации изучена внутримолекулярная подвижность трех электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины. Установлено, что фракции гемоглобина с большей внутримолекулярной подвижностью имеют больший общий объем гидрофобных полостей и характеризуются меньшим сродством к кислороду. Методом ЯMP-релаксації вивчено внутрішньомолекулярну рухливість трьох електрофоретичних фракцій гемоглобіну дельфіна-афаліни. Встановлено, що фракції гемоглобіну з більшою внутрішньомолекулярною рухливістю мають більший загальний об'єм гідрофобних порожнин та характеризуються меншою спорідненістю з киснем. Intramolecular mobility of all fractions of haemoglobin in dolphin-afaline Tursiops truncatus has been studied by method of NMR-ralaxation. It has been determined that haemoglobin's fractions with more intramolecular mobility have more volume of hydrophobic cavities and smaller affinity to oxygen. 1998 Article Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus / С.В. Коношенко, Т.В. Осляк // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 5. — С. 434-437. — Бібліогр.: 20 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0004E8 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155593 ru Биополимеры и клетка application/pdf Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
topic Структура и функции биополимеров
Структура и функции биополимеров
spellingShingle Структура и функции биополимеров
Структура и функции биополимеров
Коношенко, С.В.
Осляк, Т.В.
Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus
Биополимеры и клетка
description Методом ЯМР-релаксации изучена внутримолекулярная подвижность трех электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины. Установлено, что фракции гемоглобина с большей внутримолекулярной подвижностью имеют больший общий объем гидрофобных полостей и характеризуются меньшим сродством к кислороду.
format Article
author Коношенко, С.В.
Осляк, Т.В.
author_facet Коношенко, С.В.
Осляк, Т.В.
author_sort Коношенко, С.В.
title Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus
title_short Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus
title_full Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus
title_fullStr Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus
title_full_unstemmed Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus
title_sort взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины tursiops truncatus
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 1998
topic_facet Структура и функции биополимеров
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155593
citation_txt Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus / С.В. Коношенко, Т.В. Осляк // Биополимеры и клетка. — 1998. — Т. 14, № 5. — С. 434-437. — Бібліогр.: 20 назв. — рос.
series Биополимеры и клетка
work_keys_str_mv AT konošenkosv vzaimosvâzʹstrukturnodinamičeskihsvojstvisrodstvakkisloroduélektroforetičeskihfrakcijgemoglobinadelʹfinaafalinytursiopstruncatus
AT oslâktv vzaimosvâzʹstrukturnodinamičeskihsvojstvisrodstvakkisloroduélektroforetičeskihfrakcijgemoglobinadelʹfinaafalinytursiopstruncatus
AT konošenkosv vzaêmozvâzokstrukturnodinamíčnihvlastivostejtasporídnenostízkisnemelektroforetičnihfrakcíjgemoglobínudelʹfínaafalínitursiopstruncatus
AT oslâktv vzaêmozvâzokstrukturnodinamíčnihvlastivostejtasporídnenostízkisnemelektroforetičnihfrakcíjgemoglobínudelʹfínaafalínitursiopstruncatus
AT konošenkosv correlationofstructuredynamicpropertiesandoxygenaffinitylohaemoglobinselectrophoreticfractionsofdolphiriafalinetursiopstruncatus
AT oslâktv correlationofstructuredynamicpropertiesandoxygenaffinitylohaemoglobinselectrophoreticfractionsofdolphiriafalinetursiopstruncatus
first_indexed 2025-11-27T15:51:14Z
last_indexed 2025-11-27T15:51:14Z
_version_ 1849959342491566080
fulltext I S S N 0233-7657. Биополимеры и клетка. 1998. Т. 14. № 5 Взаимосвязь структурно-динамических свойств и сродства к кислороду электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины Tursiops truncatus С В. Коношенко, Т. В. Осляк Симферопольский государственный университет 333036, Симферополь, ул. Ялтинская, 4 Методом ЯМР-релаксации изучена внутримолекулярная подвижность трех электрофоретических фракций гемоглобина дельфина-афалины. Установлено, что фракции гемоглобина с большей внутримолекулярной подвижностью имеют больший общий объем гидрофобных полостей и характеризуются меньшим сродством к кислороду. Введение. Гемоглобин является одним из компо­ нентов общей системы молекулярных механизмов адаптации, действие которых направлено на под­ держание оптимального уровня жизнедеятельности организма в различных условиях существования. Имеющиеся в литературе данные [1—3] свидетель­ ствуют о важном приспособительном значении структурно-функциональной гетерогенности гемо- глобинов в регуляции кислородного режима у жи­ вотных. Несмотря на всю широту проводимых исследо­ ваний, работы по изучению структурных и функ­ циональных свойств гемоглобинов в сравнительном аспекте не дают возможности получить полной оценки изменений различных параметров внутри­ молекулярной структуры гемоглобина и его функ­ циональной активности в процессе филогенеза. Ма­ лоизученным остается вопрос об особенностях внутримолекулярной динамики различных типов гемоглобина и ее связи со структурными и функци­ ональными параметрами гемоглобинов, принадле­ жащих животным разного уровня организации. Целью настоящей работы было изучение внут­ римолекулярной подвижности, общего объема гид­ рофобных полостей и сродства к кислороду элект- © С В. КОНОШЕНКО, Т. В. ОСЛЯК, 1998 рофоретических фракций гемоглобина дельфина- афалины и определение возможной связи структур­ но-динамических свойств фракций гемоглобина с их функциональной активностью. Материалы и методы. Материалом для иссле­ дования служил гемоглобин черноморского дельфи­ на-афалины Tursiops truncatus. Кровь брали у 11 половозрелых особей, адаптированных к условиям содержания в Государственном Океанариуме Укра­ ины (Севастополь). Гемоглобин выделяли по [4], гемолизируя эритроциты в присутствии дистилли­ рованной воды. Фракционный состав гемоглобина изучали с помощью диск-электрофореза в 7 %-м ПААГ [5]. Фракции гемоглобина выделяли препаративным электрофорезом в блоках 7 %-го ПААГ [6]. Элек­ трофорез проводили в трис-глициновом буфере (рН 8,3) при напряжении 50 В и силе тока 10—20 мА на блок геля. Внутримолекулярную динамику фракций ге­ моглобинов изучали методом ЯМР-релаксации [7—10]. Релаксационные показатели снимали на ЯМР-релаксометре «Minispec-120» («Вгикег», ФРГ) при температуре 25 °С В качестве исследуемых образцов использовали 10 %-е растворы гемоглоби­ нов в тяжелой воде (D 2 0) . Напряженность магнитного поля составляла 1,7 Т, частота резонанса — 20 мГц. Процессы 434 К.ОНОШЕНКО с. в., о с л я к т. в. спин-спиновой релаксации в гемоглобинах изучали одноимпульсной методикой по спаду свободной ин­ дукции. Спад свободной индукции регистрировали в режиме диодного детектирования. Время между 90°-ми импульсами составляло 1 с. Общий объем гидрофобных полостей молекул гемоглобина исследовали методом солюбилизации углеводорода (бензола) с помощью рефрактометра ИРФ-23 при длине волны 589 нм [11]. Объем гидрофобных полостей рассчитывали на основании величины связывания бензола молеку­ лами белка (N; моль/моль) и выражали в А 3 [11]. Сродство фракций гемоглобина к кислороду изуча­ ли путем построения кривых кислородной диссоци­ ации [12], определяя показатели полунасыщения гемоглобина кислородом (Р 5 0 ) . Содержание метге- моглобина в растворах определяли по [13]; во всех исследуемых пробах уровень его не превышал 3 %. Результаты и обсуждение. Методом диск-элек­ трофореза в 7 %-м ПААГ гемоглобин дельфина- афалины разделяется на три электрофоретические фракции: две главные (Hb-З и НЬ-2) и одну минорную (НЬ-1), соотношение которых составля­ ет 4:5:1 соответственно, а электрофоретическая подвижность к аноду снижается в направлении НЬ-1 НЬ-2 -» НЬ-3. Изучение процессов спин- спиновой релаксации в протонных системах фрак­ ций гемоглобина позволило оценить уровень их внутримолекулярной подвижности. Значения вре­ мени релаксации (Т 2) быстрорелаксирующего ком­ понента (БРК) спада свободной индукции (ССИ), полученные методом ЯМР-релаксации для фрак­ ций гемоглобина дельфина, следующие: Т 2 БРК (ССИ) 10 мс"3 для НЬ-1 (минорный компонент) равно 4,9 ± 0,008; для НЬ-2 (компонент с наиболее высоким со­ держанием белка) — 4,4 ± 0,01; для НЬ-3 — 4,7 ± 0,009. По данным литературы [9, 14], полученные значения времени релаксации свидетельствуют о том., что быстрорелаксирующий компонент спада свободной индукции соответствует релаксации про­ тонов наиболее плотно упакованных и малопод­ вижных участков белковой глобулы. В связи с этим время релаксации БРК спада свободной индукции может быть использовано как параметр внутримо­ лекулярной подвижности в белке, несущий инфор­ мацию о динамической структуре наименее ла­ бильных участков макромолекулы. Полученные значения времени релаксации свидетельствуют о том, что электрофоретические фракции гемоглоби­ на дельфина отличаются по уровню внутримолеку­ лярной подвижности. Наиболее высокой внутримо­ лекулярной подвижностью характеризуется минор­ ная фракция НЬ-1, а наименьшей — главная фрак­ ция НЬ-2, составляющая 50 % от общего содержа­ ния гемоглобина. Изучение общего объема гидрофобных поло­ стей молекул исследуемых фракций методом солю­ билизации бензола (таблица) позволило устано­ вить взаимосвязь в показателях их внутримолеку­ лярной динамики и в н у т р и м о л е к у л я р н о й структуры. Увеличение общего объема гидрофоб­ ных полостей молекул гемоглобина корелирует с возрастанием их внутримолекулярной подвижно­ сти, что видно на графике (рисунок), при построе- Солюбилизация бензола фракциями гемоглобина дельфина-афалины /«.V 2.6-1 I г 2,2 Взаимозависимость времени релаксации (Т 2 ) и показателя свя­ зывания бензола, N (7) , и с величиной Р$0 (2) для фракций гемоглобина дельфина 435 нии которого аппроксимацию прямой линией вы­ полняли по методу наименьших квадратов. Осно­ вываясь на представлениях о взаимосвязи общего объема гидрофобных полостей белковых молекул с «жесткостью» их структуры [11, 15], можно пред­ положить, что молекулы гемоглобинов с большим объемом гидрофобных полостей менее плотно упа­ кованы. Возможно, это является одной из причин их большей внутримолекулярной подвижности. Из трех электрофоретических фракций гемог­ лобина дельфина главная фракция НЬ-2 характе­ ризуется наибольшим сродством к кислороду. Уста­ новленная величина полу насыщения кислородом данной фракции Р 5 0 составляет 22 ± 1,1 мм рт. ст., что более характерно для гемоглобинов позвоноч­ ных, обитающих только в воде или в воде и на суше [16]. Фракция НЬ-3 (также с высоким содержанием белка) проявляет меньшее сродство к кислороду. Величина Р 5 0 фракции Hb-З составляет 26 ± 0,8 мм рт. ст. и находится в пределах значений, характер­ ных для главных фракций гемоглобинов млекопи­ тающих [16]. Минорная фракция НЬ-1 проявляет самое низкое сродство к кислороду (Р 5 0 = 28 ± ± 0,9 мм рт. ст.). Видимо, сочетание фракций гемоглобина с вы­ соким и низким сродством к кислороду способству­ ет более длительному пребыванию дельфинов под водой, что имеет важное адаптационное значение. Наблюдается хорошо выраженная взаимосвязь показателя внутримолекулярной динамики фрак­ ций гемоглобина с их сродством к кислороду: фрак­ ции с меньшим сродством к кислороду характери­ зуются большей внутримолекулярной подвижно­ стью (см. рисунок). Эти данные подтверждают результаты предыдущих исследований, полученные при изучении гемоглобинов отдельных представи­ телей позвоночных [17—19 ], а также позволяют прийти к выводу о возможности коррелирующего влияния общего объема гидрофобных полостей и внутримолекулярной подвижности белковых моле­ кул на R -> Т-конформационный переход при де- зоксигенации гемоглобина [20]. С. В Копошенко, Т. В. Осляк В з а є м о з в ' я з о к с т р у к т у р н о - д и н а м і ч н и х в л а с т и в о с т е й та спорідненості з киснем електрофоретичних фракцій гемоглобіну дельфіна-афаліни Tursiops truncatus Резюме Методом Я MP-релаксації вивчено внутріиіньомолекулярну рухливість трьох електрофоретичних фракцій гемоглобіну дельфіна-афаліни. Встановлено, що фракції гемоглобіну з біль- СВЯЗЬ СТРУКТУРЫ И СРОДСТВА К КИСЛОРОДУ ГЕМОГЛОБИНА июю внутрішньомолекулярною рухливістю мають більший загальний об'єм гідрофобних порожнин та характеризуються меншою спорідненістю з киснем. S. V. Konoshenko, Т. V. Osliak Correlation of structure-dynamic properties and oxygen affinity lo haemoglobin's electrophoretic fractions of dolphin-afaline Tursiops truncatus Summary Intramolecular mobility of all fractions of haemoglobin in dolphin- afaline Tursiops truncatus has been studied by method of NMR- ralaxation. It has been determined that haemoglobin's fractions with more intramolecular mobility have more volume of hydrophobic cavities and smaller affinity to oxygen. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 1. Дударев В. П. Роль гемоглобина в механизмах адаптации к гипоксии и гипероксии.—Киев: Наук, думка, 1979.— 150 с. 2. Стародуб И. Ф. Гетерогенная система гемоглобина. Струк­ турные особенности, физико-химические и функциональ­ ные свойства отдельных форм гемоглобина и их роль в биохимической адаптации организма к условиям жизни / / Успехи современ. биологии.—1985.—99, № 3 .—С. 385 400. 3. Лукьяненко В. И., Васильев А. С , Лукьяненко В. В. Гетерогенность и полиморфизм гемоглобина рыб.—С. Пе­ тербург: Наука, 1991 .—392 с. 4. Drabkin D. A simplifide technique for large scole crystallization of haemoglobin in the cristalline / / Arch, biochem.—1949.—- 2 1 , N 5 .—P. 242—249 . 5. Davis D. Disk electrophoresis. II. Method and application to human serum proteins / / A n n . N. Y. Acad. Sci. —1964. — 1 2 1 , N 11.—P. 404—406. 6. Ажицский Г. Ю., Багдасарьян С. II. Возможность выделе­ ния мономерного иммунохимически чистого сывороточного альбумина / / Лаб. дело. — 1 9 8 5 . — № 12.—С. 712—714. 7. Ватман А. А., Пронин И. С. Ядерная магнитная релак­ сация и ее применение в химической физике.—М.: Наука, 1979.—235 с. 8. Ватман А. А., Пронин И. С. Ядерная магнитная релак сационная спектроскопия.—М.: Энергоатомиздат, 1986. 9. Аксенов С. И. Исследования динамической структуры глобулярных белков импульсными методами ядерного маг­ нитного резонанса / / Молекуляр. биология. —1983 . —17, № 3 .—С. 4 7 5 — 4 8 3 . 10. Федотов В. Д Ядерный магнитный резонанс и внутри молекулярная подвижность белков / / Там же .—С. 493— 504 . 11. Измайлова В. Я . , Ребиндер П. А. Структурообразование в белковых системах.—М.: Наука, 1974 .—329 с. 12. Шорохов Ю. А. Спектрофотометрический метод опреде­ ления кривой диссоциации оксигемоглобина в кювете де сатуратора / / Физиол. ж у р н . — 1 9 7 4 . — 6 0 , № 4.—С. 654— 657. 13. Куиіаковский М. С. Метгемоглобинемии / / Справочник по функциональной диагностике.—М.: Медицина, 1970.— С. 423—427. 14. Иванников А. И., Абрамов В. М., Волков В. Я., Завьялов В. 77. Сравнительные исследования динамических конфор- 436 КОНОШЕНКО с. в., осляк т. в. мационных свойств миеломных иммуноглобулинов G чело­ века разных подклассов импульсным методом ЯМР / / Молекуляр. биология.—1983.—17, № 4 .—С. 73 4 — 740 . 15. Остоловский Е. М.> Боцянский А Д. , Задорожный Б. А. О внутримолекулярной структуре сывороточного альбумина млекопитающих / / Биофизика. — 1 9 9 0 . — 3 5 , № 5 . — С. 762—764 . 16. Коноиіенко С. В., Абдель Рахман Сравнительная характе­ ристика некоторых физико-химических и структурно-фун­ кциональных свойств гемоглобина в ряду позвоночных / / Журн. эволюц. биохимии и ф и з и о л о г и и . — 1 9 9 4 . — 3 0 , № 5 , - С . 6 8 3 - 6 8 9 . 17. Berzhansky М. К, Konoshenko S. V., Kunevich А. К , Ostolovsky Е. М. H-NMR-relaxation at T-»R transition of haemoglobin / / Proc. of XV Int. conf. of magnetic resonance in biol. systems.—Jerusalem, 1992 .—P. 219. 18. Коноиіенко С. В. Внутримолекулярная подвижность и сро­ дство к кислороду гемоглобинов среднеазиатской черепахи Testudo horsfieldi и ужа водяного Natrix tessellata II Биополимеры и клетка.—1993.—9, № 6 .—С. 47—50. 19. Коношенко С. В., Байола Иссо. Сравнительная харак­ теристика внутримолекулярной подвижности и сродства к кислороду гемоглобинов в ряду позвоночных / / Там же .— 1994 .—10, № 2 .—С. 7 2 — 7 4 . 20. Peruts М. Mechanism of cooperativity and allosteric regulation in protein / / N a t u r e . — 1 9 9 0 . — 3 4 7 , N 6290 .—P. 241—242. Поступила в редакцию 25.11.97 437