Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибриногена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС,...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Дата: | 1994 |
| Автори: | , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1994
|
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155613 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862636355685711872 |
|---|---|
| author | Карабут, Л.В. Щечкин, И.Е. Серейская, А.А. |
| author_facet | Карабут, Л.В. Щечкин, И.Е. Серейская, А.А. |
| citation_txt | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибриногена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС, расстояние между донорскими и акцепторными атомами находится в пределах 2.0 – 2,2 Å. Конформационные расчеты свидетельствуют о том, что подобные взаимодействия могут обеспечить образование энергетически выгодного и стерически разрешенного комплекса рекогниции фибриноген – тромбин вне границ активного центра последнего. Предлагается гипотеза об усилении каталитического процесса вследствие конформационных изменений, сопровождающих формирование комплекса узнавания.
Комплекс впізнавання фібриногена тромбіном, що складається з додаткового центра (ДЦ) зв'язування ферменту та комплементарного йому сайта (КС) на Аа-ланцюзі фібриногена, вивчали за допомогою молекулярного моделювання та конформаційного аналізу. Показано утворення чотирьох іводневих зв'язків між ДЦ та КС, відстань між донорськими та акцепторними атомами лежить у межах 2,0–2,2 Å. Конформаційні розрахунки стверджують, що ці взаємодії спроможні забезпечити створення енергетично вигідного та стерично дозволеного комплексу рекогніції фібриноген – тромбін поза межами активного центру останнього. Пропонується гіпотеза щодо підсилення каталітичного процесу внаслідок конформаційних змін, які супроводжують формування комплексу рекогніції.
Fibrinogen-thrombin recognition complex consisting of enzyme additional binding exosite (ABE) and complementary site (CS) ir fibrinogen Aa-chain has been investigated by means of molecular modelling and conformational computer simulations. It is revealed that four hydrogen bonds between ABE and CS occur the distance between donor and acceptor atoms being 2.0–2.2 A. Energy estimations show that these interactions can ensure creation of energetically reliable complex of the thrombin with fibrinogen beyond the enzyme active center. Hypothesis is proposed that conformational changes arising in consequence of recognition complex formation may lead to promotion of catalytical process.
|
| first_indexed | 2025-11-30T21:02:20Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155613 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-30T21:02:20Z |
| publishDate | 1994 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Карабут, Л.В. Щечкин, И.Е. Серейская, А.А. 2019-06-17T08:38:23Z 2019-06-17T08:38:23Z 1994 Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0003C8 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155613 577.344 Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибриногена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС, расстояние между донорскими и акцепторными атомами находится в пределах 2.0 – 2,2 Å. Конформационные расчеты свидетельствуют о том, что подобные взаимодействия могут обеспечить образование энергетически выгодного и стерически разрешенного комплекса рекогниции фибриноген – тромбин вне границ активного центра последнего. Предлагается гипотеза об усилении каталитического процесса вследствие конформационных изменений, сопровождающих формирование комплекса узнавания. Комплекс впізнавання фібриногена тромбіном, що складається з додаткового центра (ДЦ) зв'язування ферменту та комплементарного йому сайта (КС) на Аа-ланцюзі фібриногена, вивчали за допомогою молекулярного моделювання та конформаційного аналізу. Показано утворення чотирьох іводневих зв'язків між ДЦ та КС, відстань між донорськими та акцепторними атомами лежить у межах 2,0–2,2 Å. Конформаційні розрахунки стверджують, що ці взаємодії спроможні забезпечити створення енергетично вигідного та стерично дозволеного комплексу рекогніції фібриноген – тромбін поза межами активного центру останнього. Пропонується гіпотеза щодо підсилення каталітичного процесу внаслідок конформаційних змін, які супроводжують формування комплексу рекогніції. Fibrinogen-thrombin recognition complex consisting of enzyme additional binding exosite (ABE) and complementary site (CS) ir fibrinogen Aa-chain has been investigated by means of molecular modelling and conformational computer simulations. It is revealed that four hydrogen bonds between ABE and CS occur the distance between donor and acceptor atoms being 2.0–2.2 A. Energy estimations show that these interactions can ensure creation of energetically reliable complex of the thrombin with fibrinogen beyond the enzyme active center. Hypothesis is proposed that conformational changes arising in consequence of recognition complex formation may lead to promotion of catalytical process. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином Моделювання комплексу впізнавання фібриногена тромбіном Modelling of thrombin-fibrinogen recognition complex Article published earlier |
| spellingShingle | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином Карабут, Л.В. Щечкин, И.Е. Серейская, А.А. |
| title | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_alt | Моделювання комплексу впізнавання фібриногена тромбіном Modelling of thrombin-fibrinogen recognition complex |
| title_full | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_fullStr | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_full_unstemmed | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_short | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_sort | моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155613 |
| work_keys_str_mv | AT karabutlv modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom AT ŝečkinie modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom AT sereiskaâaa modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom AT karabutlv modelûvannâkompleksuvpíznavannâfíbrinogenatrombínom AT ŝečkinie modelûvannâkompleksuvpíznavannâfíbrinogenatrombínom AT sereiskaâaa modelûvannâkompleksuvpíznavannâfíbrinogenatrombínom AT karabutlv modellingofthrombinfibrinogenrecognitioncomplex AT ŝečkinie modellingofthrombinfibrinogenrecognitioncomplex AT sereiskaâaa modellingofthrombinfibrinogenrecognitioncomplex |