Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином

Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином

Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибрино­гена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС,...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Биополимеры и клетка
Date:1994
Main Authors: Карабут, Л.В., Щечкин, И.Е., Серейская, А.А.
Format: Article
Language:Russian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1994
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155613
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155613
record_format dspace
spelling Карабут, Л.В.
Щечкин, И.Е.
Серейская, А.А.
2019-06-17T08:38:23Z
2019-06-17T08:38:23Z
1994
Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0003C8
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155613
577.344
Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибрино­гена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС, расстояние меж­ду донорскими и акцепторными атомами находится в пределах 2.0 – 2,2 Å. Конформационные расчеты свидетельствуют о том, что подобные взаимодействия могут обес­печить образование энергетически выгодного и стерически разрешенного комплекса рекогниции фибриноген – тромбин вне границ активного центра последнего. Предлагается гипотеза об усилении каталитического процесса вследствие конформационных изменений, сопровождающих формирование комплекса узнавания.
Комплекс впізнавання фібриногена тромбіном, що складається з додаткового центра (ДЦ) зв'язування ферменту та комплементарного йому сайта (КС) на Аа-ланцюзі фібриногена, вивчали за допомогою молекулярного моделювання та конформаційного аналізу. Показано утворення чотирьох іводневих зв'язків між ДЦ та КС, відстань між донорськими та акцепторними атомами лежить у межах 2,0–2,2 Å. Конформаційні розрахунки стверджують, що ці взаємодії спроможні забезпечити створення енергетич­но вигідного та стерично дозволеного комплексу рекогніції фібриноген – тромбін поза межами активного центру останнього. Пропонується гіпотеза щодо підсилення каталітичного процесу внаслідок конформаційних змін, які супроводжують формування комплексу рекогніції.
Fibrinogen-thrombin recognition complex consisting of enzyme additional binding exosite (ABE) and complementary site (CS) ir fibrinogen Aa-chain has been investigated by means of molecular modelling and conformational computer simulations. It is revealed that four hydrogen bonds between ABE and CS occur the distance between donor and acceptor atoms being 2.0–2.2 A. Energy estimations show that these interactions can ensure creation of energetically reliable complex of the thrombin with fibrinogen beyond the enzyme active center. Hypothesis is proposed that conformational changes arising in consequence of recognition complex formation may lead to promotion of catalytical process.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
Моделювання комплексу впізнавання фібриногена тромбіном
Modelling of thrombin-fibrinogen recognition complex
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
spellingShingle Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
Карабут, Л.В.
Щечкин, И.Е.
Серейская, А.А.
title_short Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
title_full Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
title_fullStr Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
title_full_unstemmed Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
title_sort моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
author Карабут, Л.В.
Щечкин, И.Е.
Серейская, А.А.
author_facet Карабут, Л.В.
Щечкин, И.Е.
Серейская, А.А.
publishDate 1994
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Моделювання комплексу впізнавання фібриногена тромбіном
Modelling of thrombin-fibrinogen recognition complex
description Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибрино­гена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС, расстояние меж­ду донорскими и акцепторными атомами находится в пределах 2.0 – 2,2 Å. Конформационные расчеты свидетельствуют о том, что подобные взаимодействия могут обес­печить образование энергетически выгодного и стерически разрешенного комплекса рекогниции фибриноген – тромбин вне границ активного центра последнего. Предлагается гипотеза об усилении каталитического процесса вследствие конформационных изменений, сопровождающих формирование комплекса узнавания. Комплекс впізнавання фібриногена тромбіном, що складається з додаткового центра (ДЦ) зв'язування ферменту та комплементарного йому сайта (КС) на Аа-ланцюзі фібриногена, вивчали за допомогою молекулярного моделювання та конформаційного аналізу. Показано утворення чотирьох іводневих зв'язків між ДЦ та КС, відстань між донорськими та акцепторними атомами лежить у межах 2,0–2,2 Å. Конформаційні розрахунки стверджують, що ці взаємодії спроможні забезпечити створення енергетич­но вигідного та стерично дозволеного комплексу рекогніції фібриноген – тромбін поза межами активного центру останнього. Пропонується гіпотеза щодо підсилення каталітичного процесу внаслідок конформаційних змін, які супроводжують формування комплексу рекогніції. Fibrinogen-thrombin recognition complex consisting of enzyme additional binding exosite (ABE) and complementary site (CS) ir fibrinogen Aa-chain has been investigated by means of molecular modelling and conformational computer simulations. It is revealed that four hydrogen bonds between ABE and CS occur the distance between donor and acceptor atoms being 2.0–2.2 A. Energy estimations show that these interactions can ensure creation of energetically reliable complex of the thrombin with fibrinogen beyond the enzyme active center. Hypothesis is proposed that conformational changes arising in consequence of recognition complex formation may lead to promotion of catalytical process.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155613
citation_txt Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT karabutlv modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom
AT ŝečkinie modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom
AT sereiskaâaa modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom
AT karabutlv modelûvannâkompleksuvpíznavannâfíbrinogenatrombínom
AT ŝečkinie modelûvannâkompleksuvpíznavannâfíbrinogenatrombínom
AT sereiskaâaa modelûvannâkompleksuvpíznavannâfíbrinogenatrombínom
AT karabutlv modellingofthrombinfibrinogenrecognitioncomplex
AT ŝečkinie modellingofthrombinfibrinogenrecognitioncomplex
AT sereiskaâaa modellingofthrombinfibrinogenrecognitioncomplex
first_indexed 2025-11-30T21:02:20Z
last_indexed 2025-11-30T21:02:20Z
_version_ 1850858513462460416

Similar Items