Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии
Методом геномной дактилоскопии с зондом на основе фага М13 проведен анализ линий мышей BALB/c, C57B1/6 и выведенной на их основе линии CC57W/Mv. Показано, что все три изученные линии представляют собой генетически однородные, четко дифференцированные друг от друга группы. Генетические дистанции меж...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Дата: | 1995 |
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1995
|
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155652 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии / М.В. Дыбков, Г.Д. Телегеев, М.Р. Столина, С.С. Малюта // Биополимеры и клетка. — 1995. — Т. 11, № 1. — С. 66-69. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1859589155004088320 |
|---|---|
| author | Дыбков, М.В. Телегеев, Г.Д. Столина, М.Р. Малюта, С.С. |
| author_facet | Дыбков, М.В. Телегеев, Г.Д. Столина, М.Р. Малюта, С.С. |
| citation_txt | Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии / М.В. Дыбков, Г.Д. Телегеев, М.Р. Столина, С.С. Малюта // Биополимеры и клетка. — 1995. — Т. 11, № 1. — С. 66-69. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Методом геномной дактилоскопии с зондом на основе фага М13 проведен анализ линий мышей BALB/c, C57B1/6 и выведенной на их основе линии CC57W/Mv. Показано, что все три изученные линии представляют собой генетически однородные, четко дифференцированные друг от друга группы. Генетические дистанции между линиями составляют: для линий CC57W/Mv-C57Bl/6 – 0,144; CC57W/Mv-BALB/c– 0,182; C57Bl/6-BALB/c – 0,395.
Методом геномної дактилоскопії з використанням зонду на основі фага М13 проаналізовано лінії мишей BALB/c, C57B1/6 та виведену на їх основі лінію CC57W/Mv. Показано, що всі три вивчені лінії мишей є генетично однорідними, чітко диференційованими одна від одної групами. Генетичні дистанції між лініями складають: для ліній CC57W/Mv-C57Bl/6 –0,144; CC57W/Mv-BALB/c– 0,182; C57Bl/6-BALB/c – 0,395.
Using the method DNA fingerprints with phage DNA as a probe were made analysis mouse strains BALB/c, C57B1/6, the progenitors of CC57W/Mv inbred mouse strain. It was show that everyone mouse strain are genetics homogeneous and differentiation each from other groups. Genetic distance between mouse strains are 0.144 for strains CC57W/Mv-C57Bl/6; 0.182 for strains CC57W/Mv-BALB/c and 0.395 for strains C57B1/6-BALB/C.
|
| first_indexed | 2025-11-27T13:08:50Z |
| format | Article |
| fulltext |
УДК 575.1:577.2
М. В. Дыбков, Г. Д. Телегеев^ М. Р. Столина, С. С. Малюта
ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ
И СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ЛИНИЙ МЫШЕЙ CC57W/Mv,
С57В1/6 И BALB/c МЕТОДОМ ГЕНОМНОЙ ДАКТИЛОСКОПИИ
Методом геномной дактилоскопии с зондом на основе фага М13 проведен анализ
линий мышей BALB/c, C57BIJ6 и выведенной на их основе линии CC57W/Mv. Пока
зано, что все три изученные линии представляют собой генетически однородные, чет
ко дифференцированные друг от друга группы. Генетические дистанции между линия
ми составляют: для линий CC57W/Mv-C57Bl/6 — 0,144; CC57W/Mv-BALB/c— 0,182;
C57Bl/6-BALB/c — 0,395.
Введение. После открытия в 1980-м г. гипервариабельных участков ге
нома (ГУГ) [1] и появления первых работ по их изучению возникли
новые перспективы для эффективного генетического маркирования ор
ганизмов. Высокая гетерозиготность локусов, кодоминантный характер
наследования, значительное количество и диспергированность в гено
ме — все это позволило использовать ГУГ в качестве высокюинформа-
тивных генетических маркеров. Помимо этого, геномные профили, т. е,
картины, выявляемые при геномной дактилоскопии, характеризуются
соматической и онтогенетической стабильностью, а также высокой ин
дивидуальной специфичностью [2]. Открытие того факта, что зонды,
содержащие последовательность гена III фага М13, выявляют гипер-
вариабелыные участки генома многих организмов, послужило новым
стимулом для развития геномной дактилоскопии ввиду доступности
данного зонда и его универсальности [3, 4].
Одна из областей применения геномной дактилоскопии •— проведе
ние контроля и оценки генетической однородности изучаемых групп ор
ганизмов и, в частности, линейных объектов. Показано, что при ис
пользовании геномной дактилоскопии значительно повышается эффек
тивность инбредной селекции в сторону одного из родителей, т. е. этот
метод позволяет снизить число возвратных скрещиваний, необходимых
для достижения нужной степени гомозиготности [5]. Геномная дакти
лоскопия позволяет контролировать чистоту линий, которые поддержи
ваются в разных лабораториях, и предупреждать возможные ошибки
при проведении экспериментов [6]. С помощью этого метода возмо
жен анализ практически любых биологических объектов — животных,
растений, клеточных линий и др. В настоящее время большое внима
ние уделяется созданию программ обработки и интерпретации геном
ных профилей и созданию на их основе баз данных с характеристиче
скими описаниями эталонных линий, популяций, видов и т. п. На се
годняшний день накоплена обширная библиотека геномных профилей
большого числа инбредных линий мышей и крыс і[7]. і
В настоящей работе методом геномной дактилоскопии с зондом
на основе фага М13 проанализированы линии BALB/c, C57B1/6 и вы
веденная на их основе линия CC57W/Mv, поддерживаемые в Ин-те
молекуляр. биологии и генетики НАН Украины, поскольку данные ли
нии мышей предполагается использовать в модельной системе для изу
чения генетических и молекулярно-биологических эффектов хрониче
ского низкодозового облучения.
© М. В. Дыбков, Г. Д. Телегеев, М. Р. Столина, С. С. Малюта, 1995
66 ISSN 0233-7&57. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1995. Т. 11. Hi 1
Материалы и методы. О б ъ е к т ы и с с л е д о в а н и я . Объекта-1
ми исследования служили инбредные линии мышей BALB/c и С57В1/6,
а также выведенная на их основе линия CC57W/Mv, поддерживаемые
в виварии ИМБиГ НАН Украины в течение более 20 поколений по
средством братско-сестринских скрещиваний.
В ы д е л е н и е ДНК. Для анализа были взяты ткани хвоста мы
шей линий BALB/c, C57B1/6 и CC57W/M.V. Образцы ткани заморажи
вали и хранили до выделения ДНК. Ткани механически измельчали и
тыслн. / 2 3 4 S Б 7 8 9 10 11 12 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
(7) и МІЗ/Clul (12)
суспендировали в лизирующем буфере с протеиназой К (50 мМ трис-
НС1, рН 8,0; 150 мМ NaCl; 10 мМ ЭДТА; 1 % DS-Na; 50 мкг/мл про-
теИ'Назы К), а затем инкубировали при 37 °С в течение ночи. После
этого образцы подвергали фенол-хлороформной обработке [8] и после
осаждения спиртом растворяли в ТЕ-буфере.
Р е с т р и к ц и я и ф р а к ц и о н и р о в а н и е ДНК. По 10 мкг
каждого образца ДНК обрабатывали рестриктазой BspRI в течение
4 ч. Рестрикты переосаждали с ацетатом аммония и растворяли в ди
стиллированной воде. Фракционирование осуществляли в 0,95 %-м ага-
роз«ом геле в течение 36—48 ч при 1,5—2 В/см. После этого ДНК
электрофоретически переносили на капроновые мембраны «Хийу Ка-
лур» (Таллинн) и фиксировали прогревом в вакууме в течение 2 ч
при 80 °С. «ИЙ
Г и б р и д и з а ц и я . Зонд с высокой удельной активностью полу
чали достройкой на однонитчатой форме фага М13 при помощи прай-
мера, «отжигающегося» вблизи гена III. Гибридизацию осуществляли,
как описано в [9]. После отмывки фильтры экспонировали в течение
3—14 сут с пленкой РМ-1 в кассетах с усиливающими экранами.
Результаты и обсуждение. На рисунке представлен один из геном
ных профилей трех вышеперечисленных линий. В изучаемой области
10—2 тыс. п. н. выявлено 12 маркерных полос для линии BALB/c, 9
маркерных полос для линии С57В1/6 и 12 — для линии CC57W/Mv.
При анализе гибридизациоиных картин не было выявлено каких-либо
индивидуальных и половых отличий внутри каждой из линий мышей.
При сравнительном анализе изучаемых линий обнаружено 7 маркер
ных полос, общих для всех трех линий мышей. Данные маркеры, ве
роятно, ютиосятся к таковым, характеризующим ту или иную группу
организмов. Наряду с ними отмечены и те полосы, которые позволяют
провести четкую дифференциацию всех трех линий мышей относитель
н ы 0233-7657. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1995. Т. П. № 15* 67
но друг друга. На рисунке показаны три маркерные полосы, общие
для линий BALB/c и CX57W/Mv и отсутствующие у линии С57В1/6,
а также две маркерные полосы, общие для линий С57В1/6 и CC57W/Mv
и отсутствующие у линии BALB/c. Показательно, что три отличающи
еся маркерные полосы прослеживаются в высокомолекулярной области
геномного дактоотпечаша. Во многих работах [2, 10] указывается на
то, что высокомолекулярные маркеры характеризуются более высоким
уровнем гетерозиготности в популяции и различия, описанные по мар
керам данной группы, наиболее достоверны. При попарном сравнении
линий мышей были выявлены 9 общих маркерных полос для пары
CC57W/Mv^C57Bl/6; 10 —для пары CC57W/Mv-BALB/c и 7 — для
Нары C57Bl/6-BALB/c. Схожесть линий оценивали по частоте совпаде
ния маркерных полос (частоту находили по формуле S = 2-n\, 2/(л1 +
+л2) , где п\, 2 — число общих полос для двух объектов, п\ и я2—
общее число полос у объектов 1 и 2 соответственно). Данная величина
равна: для пар BALB/c-CC57W/Mv — 0,83; C57Bl/6-CC57W/Mv — 0,86;
BALB/c-C57Bl/6 — 0,67. Высокая частота совпадения маркерных полос
родительских линий мышей BALB/C-C57B1/6 (0,67) по сравнению с
природными популяциями (по разным оценкам, 0,2—0,5), вероятно,
вызвана инбридингом лабораторных животных. Оценку генетических
расстояний между линиями проводили по Ней [И] . Они составили:
между линиями мышей CC57W/Mv-C57Bl/6 —0,144; CC57W/Mv-
BALB/c — 0,182; C57Bl/6-BALB/c —0,395. Как и ожидалось, генети
ческие дистанции для пар родительская — дочерняя линии меньше, чем
для родительской пары. Столь значительная дистанция между роди
тельскими линиями объясняется тем, что данные линии были выведе
ны из различных лабораторных стоков мышей [12] и подвеглись
сильному разнонаправленному искусственному отбору длительным
инбридингом.
Из изложенного выше следует, что проанализированные линии яв
ляются высокооднородными, четко дифференцированными друг от дру
га генетическими группами. Полученные при геномной дактилоскопии
характеристики позволяют осуществлять эффективный контроль состо
яния линий мышей в модельной системе.
М. В. Дибков, Г. Д. Телегеев, М. Р. Сталіна, С. С. Мамота
ВИВЧЕННЯ ГЕНЕТИЧНОЇ СТРУКТУРИ ТА ПОРІВНЯЛЬНИЙ АНАЛІЗ ЛІНІЙ
МИШЕЙ CC57W/MV, С57В1/6 1 BALB/c МЕТОДОМ ГЕНОМНОІ ДАКТИЛОСКОПІЇ
Р е з ю м е
Методом геномної дактилоскопії з використанням зонду на основі фага М13 проана
лізовано лінії мишей BALB/c, C57B1/6 та виведену на їх основі лінію CC57W/Mv.
Показано, що всі три вивчені лінії мишей є генетично однорідними, чітко дифе
ренційованими одна від одної групами. Генетичні дистанції між лініями складають:
для ліній CC57W/Mv-C57Bl/6 —0,144; CC57W/Mv-BALB/c— 0,182; C57Bl/6-BALB/c —
0,395.
М. V. Dybkov, G. D. Telegeev, M. R. Slolina, S. S. Malyuta
STUDY GENETIC STRUCTURE AND COMPARATIVE ANALYSIS MOUSE
STRAINS CC57W/Mv, C57BI/6, BALB/c USING METHOD DNA FINGERPRINTING
S u m m a r y
Using the method DNA fingerprints with phage DNA as a probe were made analysis
mouse strains BALB/c, C57B1/6, the progenitors of CC57W/Mv inbred mouse strain.
It was show that everyone mouse strain are genetics homogeneous and differen
tiation each from other groups. Genetic distance between mouse strains are 0.144 for
strains CC57W/Mv-C57Bl/6; 0.182 for strains CC57W/Mv-BALB/c and 0.395 for strains
C57BI/6-BALB/C.
68 ISSN 0233-7667. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1995. Т. II. № !
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Wyman A., White R. A highly polymorphic locus in human DNA // Proc. Nat. Acad.
Sci. USA.—1980,— 77.—P. 6754—6758.
2. Jeffreys A. J., Wilson V., Wong Z. et al. Highly variable minisatellites and DNA
fingerprints // Biochem. Soc. Symp.—1988.—53.—P. 165—180.
3. Рысков А. П., Джинчарадзе А. Г., Просняк M. И. и др. Геномная «дактилоскопия»
организмов различных таксономических групп: использование в качестве гибриди-
зационной пробы ДНК фага М13 // Генетика.— 1988.— 24, № 2.— С. 227—238.
4. Vassart G., Georges М., Monster R. et al. A sequense in M13 phage detects hyper-
variable minisatellites in human and animal DNA // Science.— 1987.—235, N 4789—
P. 683—684.
5. Hiller J., Scaap Т., Haberfeld A. et al. DNA fingerprints applied to gene introgres-
sion in breeding programs // Genetics.—1990.—124, N 3.—P. 783—789.
6. Samani N. J., Swales J. P., Jeffreys A. J. et al. DNA fingerprinting of spontaneous
ly hypertensive and Wistar—Kyoto rate: implications for hypertension research // J.
Hypertens—1989.—7, N 10.—P. 809—816.
7. Deeny A. A., McDonald B. DNA fingerprinting — a step forward in genetic moni
toring // Lab. Anim.— 1992.— 26, N 2,—P. 141.
8. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекуляр
ное клонирование.— М. : Мир, 1984.— 480 с.
9. Westneat D. F., Noon W. A., Reeve H. К., Aquadro С. F. Improved hybridization
conditions for DNA «fingerprints» probed with M13 // Nucl. Acids Res.— 1988.—
16. N 9.—P. 4161.
10. Jeffreys A. J., Morton D. B. DNA fingerprints of dog and cats // Anim. Gen.—
1987.—18, N 1.—P. 1 — 15.
11. Nei M. Molecular population genetics and evolution.— Amsterdam : North-Holland
publ., 1975.—288 p.
12. Малашенко А. М., Бландова З. К. Генетическая коллекция мышей (основа созда
ния криоэмбриотеки).— Пущино, 1985.— 48 с.
Ин-т молекуляр. биологии и генетики Полечено 19.07.94
НАН Украины, Киев
ISSN (Ж;)-ЯІ37. БИОПОЛИМЕРЫ И КЛЕТКА. 1995. Т. II. № 1 69
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155652 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-27T13:08:50Z |
| publishDate | 1995 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Дыбков, М.В. Телегеев, Г.Д. Столина, М.Р. Малюта, С.С. 2019-06-17T09:47:39Z 2019-06-17T09:47:39Z 1995 Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии / М.В. Дыбков, Г.Д. Телегеев, М.Р. Столина, С.С. Малюта // Биополимеры и клетка. — 1995. — Т. 11, № 1. — С. 66-69. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0003D5 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155652 575.1:577.2 Методом геномной дактилоскопии с зондом на основе фага М13 проведен анализ линий мышей BALB/c, C57B1/6 и выведенной на их основе линии CC57W/Mv. Показано, что все три изученные линии представляют собой генетически однородные, четко дифференцированные друг от друга группы. Генетические дистанции между линиями составляют: для линий CC57W/Mv-C57Bl/6 – 0,144; CC57W/Mv-BALB/c– 0,182; C57Bl/6-BALB/c – 0,395. Методом геномної дактилоскопії з використанням зонду на основі фага М13 проаналізовано лінії мишей BALB/c, C57B1/6 та виведену на їх основі лінію CC57W/Mv. Показано, що всі три вивчені лінії мишей є генетично однорідними, чітко диференційованими одна від одної групами. Генетичні дистанції між лініями складають: для ліній CC57W/Mv-C57Bl/6 –0,144; CC57W/Mv-BALB/c– 0,182; C57Bl/6-BALB/c – 0,395. Using the method DNA fingerprints with phage DNA as a probe were made analysis mouse strains BALB/c, C57B1/6, the progenitors of CC57W/Mv inbred mouse strain. It was show that everyone mouse strain are genetics homogeneous and differentiation each from other groups. Genetic distance between mouse strains are 0.144 for strains CC57W/Mv-C57Bl/6; 0.182 for strains CC57W/Mv-BALB/c and 0.395 for strains C57B1/6-BALB/C. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии Вивчення генетичної структури та порівняльний аналіз ліній мишей CC57W/MV, С57В1/6 1 BALB/c методом геномноі дактилоскопії Study genetic structure and comparative analysis mouse strains CC57W/Mv, C57B1/6, BALB/c using method DNA fingerprinting Article published earlier |
| spellingShingle | Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии Дыбков, М.В. Телегеев, Г.Д. Столина, М.Р. Малюта, С.С. |
| title | Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии |
| title_alt | Вивчення генетичної структури та порівняльний аналіз ліній мишей CC57W/MV, С57В1/6 1 BALB/c методом геномноі дактилоскопії Study genetic structure and comparative analysis mouse strains CC57W/Mv, C57B1/6, BALB/c using method DNA fingerprinting |
| title_full | Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии |
| title_fullStr | Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии |
| title_full_unstemmed | Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии |
| title_short | Изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей CC57W/Mv, С57В1/6 И BALB/c методом геномной дактилоскопии |
| title_sort | изучение генетической структуры и сравнительный анализ линий мышей cc57w/mv, с57в1/6 и balb/c методом геномной дактилоскопии |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155652 |
| work_keys_str_mv | AT dybkovmv izučeniegenetičeskoistrukturyisravnitelʹnyianalizliniimyšeicc57wmvs57v16ibalbcmetodomgenomnoidaktiloskopii AT telegeevgd izučeniegenetičeskoistrukturyisravnitelʹnyianalizliniimyšeicc57wmvs57v16ibalbcmetodomgenomnoidaktiloskopii AT stolinamr izučeniegenetičeskoistrukturyisravnitelʹnyianalizliniimyšeicc57wmvs57v16ibalbcmetodomgenomnoidaktiloskopii AT malûtass izučeniegenetičeskoistrukturyisravnitelʹnyianalizliniimyšeicc57wmvs57v16ibalbcmetodomgenomnoidaktiloskopii AT dybkovmv vivčennâgenetičnoístrukturitaporívnâlʹniianalízlíníimišeicc57wmvs57v161balbcmetodomgenomnoídaktiloskopíí AT telegeevgd vivčennâgenetičnoístrukturitaporívnâlʹniianalízlíníimišeicc57wmvs57v161balbcmetodomgenomnoídaktiloskopíí AT stolinamr vivčennâgenetičnoístrukturitaporívnâlʹniianalízlíníimišeicc57wmvs57v161balbcmetodomgenomnoídaktiloskopíí AT malûtass vivčennâgenetičnoístrukturitaporívnâlʹniianalízlíníimišeicc57wmvs57v161balbcmetodomgenomnoídaktiloskopíí AT dybkovmv studygeneticstructureandcomparativeanalysismousestrainscc57wmvc57b16balbcusingmethoddnafingerprinting AT telegeevgd studygeneticstructureandcomparativeanalysismousestrainscc57wmvc57b16balbcusingmethoddnafingerprinting AT stolinamr studygeneticstructureandcomparativeanalysismousestrainscc57wmvc57b16balbcusingmethoddnafingerprinting AT malûtass studygeneticstructureandcomparativeanalysismousestrainscc57wmvc57b16balbcusingmethoddnafingerprinting |