Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів
Кіназа рибосомного білка S6 (S6K) задіяна в сигнальних механізмах регуляції проліферації, диференціації та клітинного росту. На сьогодні відомо дві форми S6K (S6K1 та 2), які мають цитоплазматичний та ядерний сплайсингові варіанти. Відомо лише декілька фізіологічних субстратів S6K і партнерів її бі...
Saved in:
| Published in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Date: | 2002 |
| Main Authors: | , , , , , , , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2002
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155812 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів / О.М. Живолуп, І.О. Немазаний, Н.В. Побійгайло, Г.Г. Панасюк, С.С. Пальчевський, О.П. Кухаренко, Л.О. Савінскька, Г.В. Овчаренко, М.І. Вудмаска, І.Т. Гут, Г.Х. Мацука, В.В. Фідлненко, // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 2. — С. 102-109. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155812 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Живолуп, О.М. Немазаний, І.О. Побігайло, Н.В. Панасюк, Г.Г. Пальчевський, С.С. Кухаренко, О.П. Савінська, Л.О. Овчаренко, Г.В. Вудмаска, М.І. Гут, І.Т. Мацука, Г.Х. Філоненко, В.В. 2019-06-17T13:05:07Z 2019-06-17T13:05:07Z 2002 Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів / О.М. Живолуп, І.О. Немазаний, Н.В. Побійгайло, Г.Г. Панасюк, С.С. Пальчевський, О.П. Кухаренко, Л.О. Савінскька, Г.В. Овчаренко, М.І. Вудмаска, І.Т. Гут, Г.Х. Мацука, В.В. Фідлненко, // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 2. — С. 102-109. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005EF https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155812 577.113.5 Кіназа рибосомного білка S6 (S6K) задіяна в сигнальних механізмах регуляції проліферації, диференціації та клітинного росту. На сьогодні відомо дві форми S6K (S6K1 та 2), які мають цитоплазматичний та ядерний сплайсингові варіанти. Відомо лише декілька фізіологічних субстратів S6K і партнерів її білково-білкової взаємодії. Для пошуу нових партнерів взаємодії з S6K1 та 2 нами використано дріжджову двогібридну систему. За допомогою аналізу шести створених "bait"-конструктів виявлено, що тільки повнорозмірна форма S6K1 відповідала вимогам двогібридного скринінгу. Великомасштабний скринінг кДНКової бібліотеки ембріона миші дозволив нам виявити 26 позитивних клонів, 13 з яких підтверджено методом статевого злиття. Рестрикційні дослідження і аналіз послідовностей даних клонів показали, що всі вони містять кДНК розміром близько 4000 п. н. з однаковою картиною рестрикції та послідовностями на 5'- та 3'-кінцях. Порівняння отриманих послідовностей з геномными та білковими банками даних засвідчило, що кДНК одержаних клонів кодує фрагмент нового білка. Первинна структура даного білка та особливості його взаємодії з S6K знаходяться в процесі вивчення. Киназа рибосомного белка S6 (S6K) причастна к сигнальным механизмам регуляции пролиферации, дифференциации и клеточного роста. На сегодня известны две ее формы (S6K1 и S6K2), имеющие цитоплазматический и ядерный варианты сплайсинга. Известно лишь нескольки физиологических субстратов S6K и партнеров ее белково-белкового взаимодействия. Для поиска новых партнеров взаимодействия с S6K1 и 2 нами использована дрожжевая двугибридная система. С помощью анализа шести созданных "bait"-конструктов выявлено, что только полноразмерная форма S6K1 отвечала требованиям двугибридного скрининга. Крупномасштабный скрининг кДНКовой библиотеки эмбриона мыши позволил нам выявить 26 позитивных клонов, 13 из которых подтверджены методом полового слияния. Рестрикционные исследования и анализ последовательностей данных клонов показали, что все они содержат кДНК размером около 4000 п. н. с одинаковой картиной рестрикции и последовательностями на 5'- и 3'-концах. Сравнение полученных последовательностей с геномными и белковыми банками данных свидетельствует о том, что кДНК полученных клонов кодирует фрагмент нового белка. Первичная структура данного белка и особенности его взаимодействия с S6K находятся в процессе изучения. The kinase of the ribosomal protein S6 (S6K) is involved in the signalling pathways which regulate the cell proliferation, differentiation and growth. The family of S6K consists of two forms (S6K1 and 2), which have cytoplasmic and nuclear splicing variants. The activity of S6K is regulated by phosphorylation/dephosphorylation events and specific protein-protein interactions. We have employed yeast two-hybrid system in search of novel S6K binding partners. Among six created «bait» constructs, only the full length S6K1 meets the requiments of the yeast two-hybrid screening. The large-scale screening of mouse embryo cDNA library allowed us to identify 26 positive clones and 13 of them were confirmed in mating analysis. The restriction and sequence analysis of these clones showed that all of them contain cDNAs of approximetly 4000 bp with the same restriction pattern and sequence at 5' and 3' ends. Comparison of the sequences obtained with the genomic and protein databases has shown that identified cDNA codes a fragment of novel protein. The primary structure of this protein and specificity of its interaction with S6K. are currently under investigation. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Матеріали конференції Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів Use of yeast two-hybrid system in search of S6K1 and S6K2 binding partners Использование дрожжевой двугибридной системы для поиска S6K1 и S6K2 связывающих партнеров Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів |
| spellingShingle |
Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів Живолуп, О.М. Немазаний, І.О. Побігайло, Н.В. Панасюк, Г.Г. Пальчевський, С.С. Кухаренко, О.П. Савінська, Л.О. Овчаренко, Г.В. Вудмаска, М.І. Гут, І.Т. Мацука, Г.Х. Філоненко, В.В. Матеріали конференції |
| title_short |
Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів |
| title_full |
Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів |
| title_fullStr |
Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів |
| title_full_unstemmed |
Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів |
| title_sort |
використання дріжджової двогібридної системи для пошуку s6k1 та s6k2 зв'язуючих партнерів |
| author |
Живолуп, О.М. Немазаний, І.О. Побігайло, Н.В. Панасюк, Г.Г. Пальчевський, С.С. Кухаренко, О.П. Савінська, Л.О. Овчаренко, Г.В. Вудмаска, М.І. Гут, І.Т. Мацука, Г.Х. Філоненко, В.В. |
| author_facet |
Живолуп, О.М. Немазаний, І.О. Побігайло, Н.В. Панасюк, Г.Г. Пальчевський, С.С. Кухаренко, О.П. Савінська, Л.О. Овчаренко, Г.В. Вудмаска, М.І. Гут, І.Т. Мацука, Г.Х. Філоненко, В.В. |
| topic |
Матеріали конференції |
| topic_facet |
Матеріали конференції |
| publishDate |
2002 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Біополімери і клітина |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Use of yeast two-hybrid system in search of S6K1 and S6K2 binding partners Использование дрожжевой двугибридной системы для поиска S6K1 и S6K2 связывающих партнеров |
| description |
Кіназа рибосомного білка S6 (S6K) задіяна в сигнальних механізмах регуляції проліферації, диференціації та клітинного росту. На сьогодні відомо дві форми S6K (S6K1 та 2), які мають цитоплазматичний та ядерний сплайсингові варіанти. Відомо лише декілька фізіологічних субстратів S6K і партнерів її білково-білкової взаємодії. Для пошуу нових партнерів взаємодії з S6K1 та 2 нами використано дріжджову двогібридну систему. За допомогою аналізу шести створених "bait"-конструктів виявлено, що тільки повнорозмірна форма S6K1 відповідала вимогам двогібридного скринінгу. Великомасштабний скринінг кДНКової бібліотеки ембріона миші дозволив нам виявити 26 позитивних клонів, 13 з яких підтверджено методом статевого злиття. Рестрикційні дослідження і аналіз послідовностей даних клонів показали, що всі вони містять кДНК розміром близько 4000 п. н. з однаковою картиною рестрикції та послідовностями на 5'- та 3'-кінцях. Порівняння отриманих послідовностей з геномными та білковими банками даних засвідчило, що кДНК одержаних клонів кодує фрагмент нового білка. Первинна структура даного білка та особливості його взаємодії з S6K знаходяться в процесі вивчення.
Киназа рибосомного белка S6 (S6K) причастна к сигнальным механизмам регуляции пролиферации, дифференциации и клеточного роста. На сегодня известны две ее формы (S6K1 и S6K2), имеющие цитоплазматический и ядерный варианты сплайсинга. Известно лишь нескольки физиологических субстратов S6K и партнеров ее белково-белкового взаимодействия. Для поиска новых партнеров взаимодействия с S6K1 и 2 нами использована дрожжевая двугибридная система. С помощью анализа шести созданных "bait"-конструктов выявлено, что только полноразмерная форма S6K1 отвечала требованиям двугибридного скрининга. Крупномасштабный скрининг кДНКовой библиотеки эмбриона мыши позволил нам выявить 26 позитивных клонов, 13 из которых подтверджены методом полового слияния. Рестрикционные исследования и анализ последовательностей данных клонов показали, что все они содержат кДНК размером около 4000 п. н. с одинаковой картиной рестрикции и последовательностями на 5'- и 3'-концах. Сравнение полученных последовательностей с геномными и белковыми банками данных свидетельствует о том, что кДНК полученных клонов кодирует фрагмент нового белка. Первичная структура данного белка и особенности его взаимодействия с S6K находятся в процессе изучения.
The kinase of the ribosomal protein S6 (S6K) is involved in the signalling pathways which regulate the cell proliferation, differentiation and growth. The family of S6K consists of two forms (S6K1 and 2), which have cytoplasmic and nuclear splicing variants. The activity of S6K is regulated by phosphorylation/dephosphorylation events and specific protein-protein interactions. We have employed yeast two-hybrid system in search of novel S6K binding partners. Among six created «bait» constructs, only the full length S6K1 meets the requiments of the yeast two-hybrid screening. The large-scale screening of mouse embryo cDNA library allowed us to identify 26 positive clones and 13 of them were confirmed in mating analysis. The restriction and sequence analysis of these clones showed that all of them contain cDNAs of approximetly 4000 bp with the same restriction pattern and sequence at 5' and 3' ends. Comparison of the sequences obtained with the genomic and protein databases has shown that identified cDNA codes a fragment of novel protein. The primary structure of this protein and specificity of its interaction with S6K. are currently under investigation.
|
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155812 |
| citation_txt |
Використання дріжджової двогібридної системи для пошуку S6K1 та S6K2 зв'язуючих партнерів / О.М. Живолуп, І.О. Немазаний, Н.В. Побійгайло, Г.Г. Панасюк, С.С. Пальчевський, О.П. Кухаренко, Л.О. Савінскька, Г.В. Овчаренко, М.І. Вудмаска, І.Т. Гут, Г.Х. Мацука, В.В. Фідлненко, // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 2. — С. 102-109. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT živolupom vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT nemazaniiío vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT pobígailonv vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT panasûkgg vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT palʹčevsʹkiiss vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT kuharenkoop vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT savínsʹkalo vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT ovčarenkogv vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT vudmaskamí vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT gutít vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT macukagh vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT fílonenkovv vikoristannâdríždžovoídvogíbridnoísistemidlâpošukus6k1tas6k2zvâzuûčihpartnerív AT živolupom useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT nemazaniiío useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT pobígailonv useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT panasûkgg useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT palʹčevsʹkiiss useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT kuharenkoop useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT savínsʹkalo useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT ovčarenkogv useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT vudmaskamí useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT gutít useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT macukagh useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT fílonenkovv useofyeasttwohybridsysteminsearchofs6k1ands6k2bindingpartners AT živolupom ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT nemazaniiío ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT pobígailonv ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT panasûkgg ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT palʹčevsʹkiiss ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT kuharenkoop ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT savínsʹkalo ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT ovčarenkogv ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT vudmaskamí ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT gutít ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT macukagh ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov AT fílonenkovv ispolʹzovaniedrožževoidvugibridnoisistemydlâpoiskas6k1is6k2svâzyvaûŝihpartnerov |
| first_indexed |
2025-12-07T13:10:13Z |
| last_indexed |
2025-12-07T13:10:13Z |
| _version_ |
1850855143160938496 |