Регуляція прототропної таутомерії основ ДНК протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження
Напівемпіричними квантово-хімічними розрахунками (AMI) вперше встановлено, що одноразове протонування основ ДНК, яке не заважає їхньому Вотсон-Криківському спарюванню, суттєво змінює в той чи інший бік (у залежності від його місця) прототропну таутомерну рівновагу останніх. Так, протонування атомів...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Datum: | 2002 |
| Hauptverfasser: | , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Ukrainisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2002
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155813 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Регуляція прототропної таутомерії основ 
 ДНК протонуванням: 
 результати квантово-хімічного дослідження / А.Л. Потягайло, Д.М. Говорун, // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 2. — С. 
 174-176. — Бібліогр.: 6 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862729199322660864 |
|---|---|
| author | Потягайло, А.Л. Говорун, Д.М. |
| author_facet | Потягайло, А.Л. Говорун, Д.М. |
| citation_txt | Регуляція прототропної таутомерії основ 
 ДНК протонуванням: 
 результати квантово-хімічного дослідження / А.Л. Потягайло, Д.М. Говорун, // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 2. — С. 
 174-176. — Бібліогр.: 6 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Біополімери і клітина |
| description | Напівемпіричними квантово-хімічними розрахунками (AMI) вперше встановлено, що одноразове протонування основ ДНК, яке не заважає їхньому Вотсон-Криківському спарюванню, суттєво змінює в той чи інший бік (у залежності від його місця) прототропну таутомерну рівновагу останніх. Так, протонування атомів N3 Ade, О6 і N7 Gua, О2 Cyt і 04 Thy стабілізує канонічну таутомерну форму; високоенергетичні неканонічні таутомери – імінний Ade і енольні Gua і Thy – стабілізуються протонуванням атомів N7 Ade, N3 Gua і О2 Thy. Висловлено припущення, що фіксація канонічних таутомеріє основ ДНК вибірковим протонуванням бічними залишками лізину, аргініну і гістидину може використовуватися ДНК-полімеразою для мінімізації спонтанних помилок біосинтезу ДНК, спричинених прототропною таутомерією основ, на стадії, що передує їхньому спарюванню в центрі розпізнавання правильних пар полімерази.
Полуэмпирическими квантово-химическими расчетами (AMI) впервые установлено, что одноразовое протонирование оснований ДНК, не мешающее их Уотсон-Криковскому спариванию, существенно изменяет в ту или иную сторону (в зависимости от его места) прототропное таутомерное равновесие последних. Так, протонирование атомов N3 Ade, О6 N7 Gua, О2 Cyt и О4 Thy стабилизирует каноническую таутомерную форму; высокоэнергетические неканонические таутомеры – иминный Ade и енольные Gua и Thy – стабилизируются протонированием атомов N7 Ade, N3 Gua и О2 Thy. Высказано предположение, что стабилизация канонических таутомеров оснований ДНК адресным протонированием боковыми остатками лизина, аргинина и гистидина используется ДНК-полимеразой для минимизации спонтанных ошибок биосинтеза ДНК, вызванных прототропной таутомерией оснований, на стадии, предшествующей их спариванию в центре узнавания правильных пар полимеразы.
By means of semi-empirical quantum chemical calculations (AMI) it was first established that a single profanation of DNA bases, that doesn't disrupt Watson-Crick base pairing, substantially changed their tautomeric equilibrium in both directions depending on a profanation site. The profanation of N3 Ade, O6 and N7 Gua, O2 Cyt and O4 Thy atoms stabilizes the canonical tautomeric form, while the high-energy non-canonical tautomers (iminic Ade and enolic Gua) are stabilized by the profanation of N7 Ade, N3 Gua and O2 Thy atoms. The stabilization of DNA base canonical tautomers by selected profanation with the Lys, Arg and His side chains was supposed to be used by DNA-polymerase in DNA synthesis to minimize spontaneous mismatches caused by prototropic tautomerism of the bases at the stage previous to their pairing in polymerase sites for matched pairs recognition.
|
| first_indexed | 2025-12-07T19:13:18Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155813 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T19:13:18Z |
| publishDate | 2002 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Потягайло, А.Л. Говорун, Д.М. 2019-06-17T13:08:14Z 2019-06-17T13:08:14Z 2002 Регуляція прототропної таутомерії основ 
 ДНК протонуванням: 
 результати квантово-хімічного дослідження / А.Л. Потягайло, Д.М. Говорун, // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 2. — С. 
 174-176. — Бібліогр.: 6 назв. — укр. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005FC https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155813 573.3 Напівемпіричними квантово-хімічними розрахунками (AMI) вперше встановлено, що одноразове протонування основ ДНК, яке не заважає їхньому Вотсон-Криківському спарюванню, суттєво змінює в той чи інший бік (у залежності від його місця) прототропну таутомерну рівновагу останніх. Так, протонування атомів N3 Ade, О6 і N7 Gua, О2 Cyt і 04 Thy стабілізує канонічну таутомерну форму; високоенергетичні неканонічні таутомери – імінний Ade і енольні Gua і Thy – стабілізуються протонуванням атомів N7 Ade, N3 Gua і О2 Thy. Висловлено припущення, що фіксація канонічних таутомеріє основ ДНК вибірковим протонуванням бічними залишками лізину, аргініну і гістидину може використовуватися ДНК-полімеразою для мінімізації спонтанних помилок біосинтезу ДНК, спричинених прототропною таутомерією основ, на стадії, що передує їхньому спарюванню в центрі розпізнавання правильних пар полімерази. Полуэмпирическими квантово-химическими расчетами (AMI) впервые установлено, что одноразовое протонирование оснований ДНК, не мешающее их Уотсон-Криковскому спариванию, существенно изменяет в ту или иную сторону (в зависимости от его места) прототропное таутомерное равновесие последних. Так, протонирование атомов N3 Ade, О6 N7 Gua, О2 Cyt и О4 Thy стабилизирует каноническую таутомерную форму; высокоэнергетические неканонические таутомеры – иминный Ade и енольные Gua и Thy – стабилизируются протонированием атомов N7 Ade, N3 Gua и О2 Thy. Высказано предположение, что стабилизация канонических таутомеров оснований ДНК адресным протонированием боковыми остатками лизина, аргинина и гистидина используется ДНК-полимеразой для минимизации спонтанных ошибок биосинтеза ДНК, вызванных прототропной таутомерией оснований, на стадии, предшествующей их спариванию в центре узнавания правильных пар полимеразы. By means of semi-empirical quantum chemical calculations (AMI) it was first established that a single profanation of DNA bases, that doesn't disrupt Watson-Crick base pairing, substantially changed their tautomeric equilibrium in both directions depending on a profanation site. The profanation of N3 Ade, O6 and N7 Gua, O2 Cyt and O4 Thy atoms stabilizes the canonical tautomeric form, while the high-energy non-canonical tautomers (iminic Ade and enolic Gua) are stabilized by the profanation of N7 Ade, N3 Gua and O2 Thy atoms. The stabilization of DNA base canonical tautomers by selected profanation with the Lys, Arg and His side chains was supposed to be used by DNA-polymerase in DNA synthesis to minimize spontaneous mismatches caused by prototropic tautomerism of the bases at the stage previous to their pairing in polymerase sites for matched pairs recognition. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Короткі повідомлення Регуляція прототропної таутомерії основ ДНК протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження Регуляция прототропной таутомерии оснований ДНК протонированием: результаты квантово-химического исследования Regulation of DNA base prototropic tautomerism by prolonation: quantum chemical data Article published earlier |
| spellingShingle | Регуляція прототропної таутомерії основ ДНК протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження Потягайло, А.Л. Говорун, Д.М. Короткі повідомлення |
| title | Регуляція прототропної таутомерії основ ДНК протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження |
| title_alt | Регуляция прототропной таутомерии оснований ДНК протонированием: результаты квантово-химического исследования Regulation of DNA base prototropic tautomerism by prolonation: quantum chemical data |
| title_full | Регуляція прототропної таутомерії основ ДНК протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження |
| title_fullStr | Регуляція прототропної таутомерії основ ДНК протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження |
| title_full_unstemmed | Регуляція прототропної таутомерії основ ДНК протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження |
| title_short | Регуляція прототропної таутомерії основ ДНК протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження |
| title_sort | регуляція прототропної таутомерії основ днк протонуванням: результати квантово-хімічного дослідження |
| topic | Короткі повідомлення |
| topic_facet | Короткі повідомлення |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155813 |
| work_keys_str_mv | AT potâgailoal regulâcíâprototropnoítautomerííosnovdnkprotonuvannâmrezulʹtatikvantovohímíčnogodoslídžennâ AT govorundm regulâcíâprototropnoítautomerííosnovdnkprotonuvannâmrezulʹtatikvantovohímíčnogodoslídžennâ AT potâgailoal regulâciâprototropnoitautomeriiosnovaniidnkprotonirovaniemrezulʹtatykvantovohimičeskogoissledovaniâ AT govorundm regulâciâprototropnoitautomeriiosnovaniidnkprotonirovaniemrezulʹtatykvantovohimičeskogoissledovaniâ AT potâgailoal regulationofdnabaseprototropictautomerismbyprolonationquantumchemicaldata AT govorundm regulationofdnabaseprototropictautomerismbyprolonationquantumchemicaldata |