Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides

Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides

As a result of thermolysin hydrolysis of a coat protein (CP) of Potato Virus M Ukrainian Strain VI (PVM), the heptapeptide ²⁹AADFEGK³⁵ was found to be recognised by two PVM specific monoclonal antibodies (MAbs) M6D5 and M9G1. This heptapeptide represents the C-terminal part of tryptic tetradecapepti...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Біополімери і клітина
Datum:2001
Hauptverfasser: Viter, S.S., Tkachenko, T.Yu., Kolomietz, L.P., Radavsky, Yu.L.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2001
Schlagworte:
Структура та функції біополімерів
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155846
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides / S.S. Viter, T.Yu. Tkachenko, L.P. Kolomietz, Yu.L. Radavsky // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 5. — С. 417-422. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155846
record_format dspace
spelling Viter, S.S.
Tkachenko, T.Yu.
Kolomietz, L.P.
Radavsky, Yu.L.
2019-06-17T14:05:59Z
2019-06-17T14:05:59Z
2001
Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides / S.S. Viter, T.Yu. Tkachenko, L.P. Kolomietz, Yu.L. Radavsky // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 5. — С. 417-422. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.
0233-7657
DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005CE
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155846
577.112.5.083.3
As a result of thermolysin hydrolysis of a coat protein (CP) of Potato Virus M Ukrainian Strain VI (PVM), the heptapeptide ²⁹AADFEGK³⁵ was found to be recognised by two PVM specific monoclonal antibodies (MAbs) M6D5 and M9G1. This heptapeptide represents the C-terminal part of tryptic tetradecapeptide ²²EARPLPTAADFEGK³⁵ (P14) which was also recognised by the same MAbs. The peptides represented sequences of tryptic (P14), thermolysinic (P7) fragments and three heptapeptides containing alanine substitutions for Asp³¹ and Glu³³, were synthesised to determine the contribution of dicarbonic amino acids in the antigen-antibody interaction. All synthetic heptapeptides were recognised by both MAbs weakly in indirect ELISA. These peptides were also used as inhibitors of MAb-CP and MAb-P14 reactions in inhibition ELISA. The results of inhibition ELISA have shown the following: 1) the same concentrations of peptides were more effective to inhibit the interaction of MAbs with P14 than with CP; 2) substitutions of charged amino acids decreased noticeably the ability of peptides to inhibit the antigen-antibody interaction, especially the substitution of Asp³¹ ; 3) heptapeptides containing alanine substitutions suppressed more effectively the interaction of MAb M6D5 with antigens and were less effective to inhibit the reaction of MAb M9G1 with the same antigens. Thus, the difference in Asp³¹ and Glu³³ contributions to the antigen-antibody complex formation has been found.
После гидролиза белка оболочки (БО) украинского штамма Ul М-вируса картофеля (PVM) термолизином выделен фрагмент 29AADFEGK³⁵ , распознаваемый двумя моноклональными антителами (MKA) M6D5 и M9G1, специфичными к PVM. Этот гептапептид представляет собой С-концевой участок триптического тетрадекапептида ²²EARPLPTAADFEG³⁵ (П 14), распознаваемый этими же MKA. Для определения вклада отрицательно заряженных дикарбоновых аминокислот в формирование комплекса антиген–антитело синтезированы синтетические пептиды, повторяющие последовательности триптического (П14) и термолизинового (П7) фрагментов, а также гептапептиды, содержащие замены Asp³¹ и Glu³³ на аланин. Все синтетические гептапептиды слабо взаимодействовали с обоими MKA в непрямом ИФА. Эти пептиды были использованы в качестве ингибиторов реакций МКА-БО и МКА-П 14. Результаты ингибирования ИФА показали, что: 1) одинаковые концентрации пептидов эффективнее ингибировали взаимодействие MKA с П14, чем с Бр; 2) замена заряженных аминокислот, особенно замена Asp³¹ и Glu³³ вносят различный вклад в формирование комплекса антиген–антитело.
Після гідролізу білка оболонки (БО) українського штаму Vl M-вірусу картоплі (PVM) термолізином виділено фрагмент 29AADFEGK³⁵ , який розпізнавався двома моноклональними антитілами (MKA) M6D5 та M9G1, специфічними до PVM. Цей гептапептцд є С-кіщевою частиною триптичного тетрадекапептиду ²²EARPLPTAADFEGK³⁵ (П14), який розпізнавався тими самими MKA. Для визначення внеску негативно заряджених дикарбонових амінокислот у формування комплексу антиген–антитіло синтезовано синтетичні пептиди, що повторюють послідовності триптичного (П14) та термолізинового (П7) фрагментів, а дгакож гептапептиди, які містили заміни Asp³¹ та Glu³³ на аланін. Усі синтетичні гептапептиди слабко взаємодіяли з обома MKA в непрямому ІФА. Ці пептиди використовували як інгібітори взаємодії MKA-БО і МКА-П14. Результати інгібування ІФА показали, що: 1) однакові концентрації пептидів ефективніше інгибують взаємодію MKA з П14, ніж із БО; 2) заміна заряджених амінокислот, особливо заміна Asp³¹ , значно зменшує здатність пептидів пригнічувати взаємодію антиген–антитіло; 3) гептапептиди, що містять заміни амінокислот на аланін, ефективніше пригнічують взаємодію MKA M6D5 з антигенами та набагато слабше інгібують реакщір MKA M9G1 з тими самими антигенами. Таким чином, Asp³¹ та Glu³³ по-різному впливають на формування комплексу антиген–антитіло.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Структура та функції біополімерів
Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides
Характеристика епітопів М-вірусу картоплі з використанням синтетичних пептидів
Характеристика эпитопов М-вируса картофеля с использованием синтетических пептидов
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides
spellingShingle Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides
Viter, S.S.
Tkachenko, T.Yu.
Kolomietz, L.P.
Radavsky, Yu.L.
Структура та функції біополімерів
title_short Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides
title_full Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides
title_fullStr Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides
title_full_unstemmed Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides
title_sort characterization of potato virus m epitopes with the use of synthetic peptides
author Viter, S.S.
Tkachenko, T.Yu.
Kolomietz, L.P.
Radavsky, Yu.L.
author_facet Viter, S.S.
Tkachenko, T.Yu.
Kolomietz, L.P.
Radavsky, Yu.L.
topic Структура та функції біополімерів
topic_facet Структура та функції біополімерів
publishDate 2001
language Russian
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Характеристика епітопів М-вірусу картоплі з використанням синтетичних пептидів
Характеристика эпитопов М-вируса картофеля с использованием синтетических пептидов
description As a result of thermolysin hydrolysis of a coat protein (CP) of Potato Virus M Ukrainian Strain VI (PVM), the heptapeptide ²⁹AADFEGK³⁵ was found to be recognised by two PVM specific monoclonal antibodies (MAbs) M6D5 and M9G1. This heptapeptide represents the C-terminal part of tryptic tetradecapeptide ²²EARPLPTAADFEGK³⁵ (P14) which was also recognised by the same MAbs. The peptides represented sequences of tryptic (P14), thermolysinic (P7) fragments and three heptapeptides containing alanine substitutions for Asp³¹ and Glu³³, were synthesised to determine the contribution of dicarbonic amino acids in the antigen-antibody interaction. All synthetic heptapeptides were recognised by both MAbs weakly in indirect ELISA. These peptides were also used as inhibitors of MAb-CP and MAb-P14 reactions in inhibition ELISA. The results of inhibition ELISA have shown the following: 1) the same concentrations of peptides were more effective to inhibit the interaction of MAbs with P14 than with CP; 2) substitutions of charged amino acids decreased noticeably the ability of peptides to inhibit the antigen-antibody interaction, especially the substitution of Asp³¹ ; 3) heptapeptides containing alanine substitutions suppressed more effectively the interaction of MAb M6D5 with antigens and were less effective to inhibit the reaction of MAb M9G1 with the same antigens. Thus, the difference in Asp³¹ and Glu³³ contributions to the antigen-antibody complex formation has been found. После гидролиза белка оболочки (БО) украинского штамма Ul М-вируса картофеля (PVM) термолизином выделен фрагмент 29AADFEGK³⁵ , распознаваемый двумя моноклональными антителами (MKA) M6D5 и M9G1, специфичными к PVM. Этот гептапептид представляет собой С-концевой участок триптического тетрадекапептида ²²EARPLPTAADFEG³⁵ (П 14), распознаваемый этими же MKA. Для определения вклада отрицательно заряженных дикарбоновых аминокислот в формирование комплекса антиген–антитело синтезированы синтетические пептиды, повторяющие последовательности триптического (П14) и термолизинового (П7) фрагментов, а также гептапептиды, содержащие замены Asp³¹ и Glu³³ на аланин. Все синтетические гептапептиды слабо взаимодействовали с обоими MKA в непрямом ИФА. Эти пептиды были использованы в качестве ингибиторов реакций МКА-БО и МКА-П 14. Результаты ингибирования ИФА показали, что: 1) одинаковые концентрации пептидов эффективнее ингибировали взаимодействие MKA с П14, чем с Бр; 2) замена заряженных аминокислот, особенно замена Asp³¹ и Glu³³ вносят различный вклад в формирование комплекса антиген–антитело. Після гідролізу білка оболонки (БО) українського штаму Vl M-вірусу картоплі (PVM) термолізином виділено фрагмент 29AADFEGK³⁵ , який розпізнавався двома моноклональними антитілами (MKA) M6D5 та M9G1, специфічними до PVM. Цей гептапептцд є С-кіщевою частиною триптичного тетрадекапептиду ²²EARPLPTAADFEGK³⁵ (П14), який розпізнавався тими самими MKA. Для визначення внеску негативно заряджених дикарбонових амінокислот у формування комплексу антиген–антитіло синтезовано синтетичні пептиди, що повторюють послідовності триптичного (П14) та термолізинового (П7) фрагментів, а дгакож гептапептиди, які містили заміни Asp³¹ та Glu³³ на аланін. Усі синтетичні гептапептиди слабко взаємодіяли з обома MKA в непрямому ІФА. Ці пептиди використовували як інгібітори взаємодії MKA-БО і МКА-П14. Результати інгібування ІФА показали, що: 1) однакові концентрації пептидів ефективніше інгибують взаємодію MKA з П14, ніж із БО; 2) заміна заряджених амінокислот, особливо заміна Asp³¹ , значно зменшує здатність пептидів пригнічувати взаємодію антиген–антитіло; 3) гептапептиди, що містять заміни амінокислот на аланін, ефективніше пригнічують взаємодію MKA M6D5 з антигенами та набагато слабше інгібують реакщір MKA M9G1 з тими самими антигенами. Таким чином, Asp³¹ та Glu³³ по-різному впливають на формування комплексу антиген–антитіло.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155846
citation_txt Characterization of Potato Virus M epitopes with the use of synthetic peptides / S.S. Viter, T.Yu. Tkachenko, L.P. Kolomietz, Yu.L. Radavsky // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 5. — С. 417-422. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT viterss characterizationofpotatovirusmepitopeswiththeuseofsyntheticpeptides
AT tkachenkotyu characterizationofpotatovirusmepitopeswiththeuseofsyntheticpeptides
AT kolomietzlp characterizationofpotatovirusmepitopeswiththeuseofsyntheticpeptides
AT radavskyyul characterizationofpotatovirusmepitopeswiththeuseofsyntheticpeptides
AT viterss harakteristikaepítopívmvírusukartoplízvikoristannâmsintetičnihpeptidív
AT tkachenkotyu harakteristikaepítopívmvírusukartoplízvikoristannâmsintetičnihpeptidív
AT kolomietzlp harakteristikaepítopívmvírusukartoplízvikoristannâmsintetičnihpeptidív
AT radavskyyul harakteristikaepítopívmvírusukartoplízvikoristannâmsintetičnihpeptidív
AT viterss harakteristikaépitopovmvirusakartofelâsispolʹzovaniemsintetičeskihpeptidov
AT tkachenkotyu harakteristikaépitopovmvirusakartofelâsispolʹzovaniemsintetičeskihpeptidov
AT kolomietzlp harakteristikaépitopovmvirusakartofelâsispolʹzovaniemsintetičeskihpeptidov
AT radavskyyul harakteristikaépitopovmvirusakartofelâsispolʹzovaniemsintetičeskihpeptidov
first_indexed 2025-12-07T18:28:15Z
last_indexed 2025-12-07T18:28:15Z
_version_ 1850875152503406592

Ähnliche Einträge