Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК
Методом аналізу затримки смуги в полікриламідному гелі делеційних мутантів з'ясовано роль окремих доменів тирозил-тРНК синтетази (TyrRS) у взаємодії з тРНК Ідентифіковано сайт TyrRS, відповідальний за зв'язування гомологічної тРНКTyr. Цей сайт формується, в основному, каталітичним модулем...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Datum: | 2005 |
| Hauptverfasser: | , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Ukrainian |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2005
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155850 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК / П.В. Футерник, К. Ольжак, А. Пшикорська, О.І. Корнелюк, Б.С. Негруцький // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 5. — С. 400-406. — Бібліогр.: 29 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155850 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Футерник, П.В. Ольжак, К. Пшикорська, А. Корнелюк, О.І. Негруцький, Б.С. 2019-06-17T14:26:43Z 2019-06-17T14:26:43Z 2005 Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК / П.В. Футерник, К. Ольжак, А. Пшикорська, О.І. Корнелюк, Б.С. Негруцький // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 5. — С. 400-406. — Бібліогр.: 29 назв. — укр. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000702 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155850 577.152.611:577.217.535 Методом аналізу затримки смуги в полікриламідному гелі делеційних мутантів з'ясовано роль окремих доменів тирозил-тРНК синтетази (TyrRS) у взаємодії з тРНК Ідентифіковано сайт TyrRS, відповідальний за зв'язування гомологічної тРНКTyr. Цей сайт формується, в основному, каталітичним модулем TyrRS (TyrRS-ΔС). Проте специфічність зв'язування повнорозмірної TyrRS виявилася суттєво вищою у порівнянні із зв'язуванням тРНКTyr каталітичним модулем TyrRSΔC. Окремий С-модуль також зберігає здатність до зв'язування тРНКTyr, однак з досить низькою спорідненістю. Отже, припускається можливість залучення цитокінподібного С-модуля ТугRS до зв'язування тРНК у повнорозмірній ТугRS. Досліджено формування неканонічного потрійного комплексу тРНКTyr з еЕРІА*GDP. Ми детектували також формування неканонічного четвертинного комплексу еЕР1А*GDP*тРНКTyr*TyrRS. Найвірогідніше, що основний внесок до цієї взаємодії робить каталітичний домен TyrRS, тому що TyrRS-ΔC також здатна формувати четвертинний комплекс. Ці дані свідчать на користь існування універсального механізму каналю- вання тРНК, оскільки є вже третім прикладом формування таких незвичних комплексів з різними тРНК. Методом анализа задержки полосы в полиакриламидном геле делеционных мутантов определена роль отдельных доменов тирозил-тРНК синтетазы (TyrRS) во взаимодействии с тРНК Определен сайт TyrRS, ответственный за связывание гомологичной тРНКTyr, формирующийся, в основном, каталиическим модулем TyrRS (TyrRS-ΔC). Тем не менее, сродство к тРНК полноразмерной TyrRS оказалось выше, чем каталитического модуля TyrRS-AC. Отдельный С-модуль также сохраняет способность к связыванию тРНКTyr, но с достаточно низким сродством, что предполагает возможность вовлечения и цитокиноподобного С-модуля TyrRS в связывание тРНК в полноразмерной TyrRS. Показано сформирование неканонического тройного комплекса тРНКTyr с eEF1A*GDP. Мы детектировали также формирование неканонического четвертичного комплекса eEFlA*GDP*mPHK *TyrRS. Наиболее вероно, что основной вклад в это взаимодействие вносит каталиический домен TyrRS, поскольку TyrRS-ΔC также способна формировать четвертичный комплекс. Эти данные свидетельствуют в пользу существования универсального механизма ченнелинга тРНК. A role of different domains of bovine tyrosil-tRNA synthetase (TyrRS) in the interaction with homologous tRNA has been determined by the method of tRNA band retardation in polyacrylamide gel. The site of TyrRS responsible for the binding of tRNATyr is found to be formed mostly by the catalytic domain of TyrRS (TyrRS-ΔC). At the same time, the full-length TyrRS is found to bind tRNA stronger than TyrRS-DC. Cytokine-like C-domain of TyrRS also has tRNA-binding properties but much weaker than TyrRS-ΔC suggesting its possible involvement in tRNA binding as well. The formation of non-canonical ternary complex of tRNATyr and eEF1A*GDP has been shown. Also, the formation of quaternary complex of eEF1A*GDP*tRNATyr*TyrRS is detected. The catalytic domain of TyrRS appears to be responsible for this interaction, because the TyrRS-DC also is found to form the complex with eEF1A*GDP*tRNATyr. These data support the universality of the tRNA channeling mechanism. Роботу виконано за підтримки Державного Фонду Фундаментальних Досліджень (проекти 05.07.00002 і 05.07.00003). uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Структура та функції біополімерів Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК Исследование неканонических комплексов эукариотного фактора элонгации 1А с тРНКTyr и тирозил-тРНК синтетазой. Роль отдельных доменов синтетазы во взаимодействии с тРНК Investigation of non-canonical complexes of eukaryotic elongation factor 1A with tRNATyr and tyrosyl-tRNA synthetase. Role of different domains of the synthetase in interaction with tRNA Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК |
| spellingShingle |
Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК Футерник, П.В. Ольжак, К. Пшикорська, А. Корнелюк, О.І. Негруцький, Б.С. Структура та функції біополімерів |
| title_short |
Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК |
| title_full |
Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК |
| title_fullStr |
Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК |
| title_full_unstemmed |
Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК |
| title_sort |
дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1а з трнктyr та тирозил-трнк синтетазою. роль окремих доменів синтетази у взаємодії з трнк |
| author |
Футерник, П.В. Ольжак, К. Пшикорська, А. Корнелюк, О.І. Негруцький, Б.С. |
| author_facet |
Футерник, П.В. Ольжак, К. Пшикорська, А. Корнелюк, О.І. Негруцький, Б.С. |
| topic |
Структура та функції біополімерів |
| topic_facet |
Структура та функції біополімерів |
| publishDate |
2005 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Біополімери і клітина |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Исследование неканонических комплексов эукариотного фактора элонгации 1А с тРНКTyr и тирозил-тРНК синтетазой. Роль отдельных доменов синтетазы во взаимодействии с тРНК Investigation of non-canonical complexes of eukaryotic elongation factor 1A with tRNATyr and tyrosyl-tRNA synthetase. Role of different domains of the synthetase in interaction with tRNA |
| description |
Методом аналізу затримки смуги в полікриламідному гелі делеційних мутантів з'ясовано роль окремих доменів тирозил-тРНК синтетази (TyrRS) у взаємодії з тРНК Ідентифіковано сайт TyrRS, відповідальний за зв'язування гомологічної тРНКTyr. Цей сайт формується, в основному, каталітичним модулем TyrRS (TyrRS-ΔС). Проте специфічність зв'язування повнорозмірної TyrRS виявилася суттєво вищою у порівнянні із зв'язуванням тРНКTyr каталітичним модулем TyrRSΔC. Окремий С-модуль також зберігає здатність до зв'язування тРНКTyr, однак з досить низькою спорідненістю. Отже, припускається можливість залучення цитокінподібного С-модуля ТугRS до зв'язування тРНК у повнорозмірній ТугRS. Досліджено формування неканонічного потрійного комплексу тРНКTyr з еЕРІА*GDP. Ми детектували також формування неканонічного четвертинного комплексу еЕР1А*GDP*тРНКTyr*TyrRS. Найвірогідніше, що основний внесок до цієї взаємодії робить каталітичний домен TyrRS, тому що TyrRS-ΔC також здатна формувати четвертинний комплекс. Ці дані свідчать на користь існування універсального механізму каналю- вання тРНК, оскільки є вже третім прикладом формування таких незвичних комплексів з різними тРНК.
Методом анализа задержки полосы в полиакриламидном геле делеционных мутантов определена роль отдельных доменов тирозил-тРНК синтетазы (TyrRS) во взаимодействии с тРНК Определен сайт TyrRS, ответственный за связывание гомологичной тРНКTyr, формирующийся, в основном, каталиическим модулем TyrRS (TyrRS-ΔC). Тем не менее, сродство к тРНК полноразмерной TyrRS оказалось выше, чем каталитического модуля TyrRS-AC. Отдельный С-модуль также сохраняет способность к связыванию тРНКTyr, но с достаточно низким сродством, что предполагает возможность вовлечения и цитокиноподобного С-модуля TyrRS в связывание тРНК в полноразмерной TyrRS. Показано сформирование неканонического тройного комплекса тРНКTyr с eEF1A*GDP. Мы детектировали также формирование неканонического четвертичного комплекса eEFlA*GDP*mPHK *TyrRS. Наиболее вероно, что основной вклад в это взаимодействие вносит каталиический домен TyrRS, поскольку TyrRS-ΔC также способна формировать четвертичный комплекс. Эти данные свидетельствуют в пользу существования универсального механизма ченнелинга тРНК.
A role of different domains of bovine tyrosil-tRNA synthetase (TyrRS) in the interaction with homologous tRNA has been determined by the method of tRNA band retardation in polyacrylamide gel. The site of TyrRS responsible for the binding of tRNATyr is found to be formed mostly by the catalytic domain of TyrRS (TyrRS-ΔC). At the same time, the full-length TyrRS is found to bind tRNA stronger than TyrRS-DC. Cytokine-like C-domain of TyrRS also has tRNA-binding properties but much weaker than TyrRS-ΔC suggesting its possible involvement in tRNA binding as well. The formation of non-canonical ternary complex of tRNATyr and eEF1A*GDP has been shown. Also, the formation of quaternary complex of eEF1A*GDP*tRNATyr*TyrRS is detected. The catalytic domain of TyrRS appears to be responsible for this interaction, because the TyrRS-DC also is found to form the complex with eEF1A*GDP*tRNATyr. These data support the universality of the tRNA channeling mechanism.
|
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155850 |
| citation_txt |
Дослідження неканонічних комплексів еукаріотного фактора елонгації 1А з тРНКТyr та тирозил-тРНК синтетазою. Роль окремих доменів синтетази у взаємодії з тРНК / П.В. Футерник, К. Ольжак, А. Пшикорська, О.І. Корнелюк, Б.С. Негруцький // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 5. — С. 400-406. — Бібліогр.: 29 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT futernikpv doslídžennânekanoníčnihkompleksíveukaríotnogofaktoraelongacíí1aztrnktyrtatiroziltrnksintetazoûrolʹokremihdomenívsintetaziuvzaêmodííztrnk AT olʹžakk doslídžennânekanoníčnihkompleksíveukaríotnogofaktoraelongacíí1aztrnktyrtatiroziltrnksintetazoûrolʹokremihdomenívsintetaziuvzaêmodííztrnk AT pšikorsʹkaa doslídžennânekanoníčnihkompleksíveukaríotnogofaktoraelongacíí1aztrnktyrtatiroziltrnksintetazoûrolʹokremihdomenívsintetaziuvzaêmodííztrnk AT kornelûkoí doslídžennânekanoníčnihkompleksíveukaríotnogofaktoraelongacíí1aztrnktyrtatiroziltrnksintetazoûrolʹokremihdomenívsintetaziuvzaêmodííztrnk AT negrucʹkiibs doslídžennânekanoníčnihkompleksíveukaríotnogofaktoraelongacíí1aztrnktyrtatiroziltrnksintetazoûrolʹokremihdomenívsintetaziuvzaêmodííztrnk AT futernikpv issledovanienekanoničeskihkompleksovéukariotnogofaktoraélongacii1astrnktyritiroziltrnksintetazoirolʹotdelʹnyhdomenovsintetazyvovzaimodeistviistrnk AT olʹžakk issledovanienekanoničeskihkompleksovéukariotnogofaktoraélongacii1astrnktyritiroziltrnksintetazoirolʹotdelʹnyhdomenovsintetazyvovzaimodeistviistrnk AT pšikorsʹkaa issledovanienekanoničeskihkompleksovéukariotnogofaktoraélongacii1astrnktyritiroziltrnksintetazoirolʹotdelʹnyhdomenovsintetazyvovzaimodeistviistrnk AT kornelûkoí issledovanienekanoničeskihkompleksovéukariotnogofaktoraélongacii1astrnktyritiroziltrnksintetazoirolʹotdelʹnyhdomenovsintetazyvovzaimodeistviistrnk AT negrucʹkiibs issledovanienekanoničeskihkompleksovéukariotnogofaktoraélongacii1astrnktyritiroziltrnksintetazoirolʹotdelʹnyhdomenovsintetazyvovzaimodeistviistrnk AT futernikpv investigationofnoncanonicalcomplexesofeukaryoticelongationfactor1awithtrnatyrandtyrosyltrnasynthetaseroleofdifferentdomainsofthesynthetaseininteractionwithtrna AT olʹžakk investigationofnoncanonicalcomplexesofeukaryoticelongationfactor1awithtrnatyrandtyrosyltrnasynthetaseroleofdifferentdomainsofthesynthetaseininteractionwithtrna AT pšikorsʹkaa investigationofnoncanonicalcomplexesofeukaryoticelongationfactor1awithtrnatyrandtyrosyltrnasynthetaseroleofdifferentdomainsofthesynthetaseininteractionwithtrna AT kornelûkoí investigationofnoncanonicalcomplexesofeukaryoticelongationfactor1awithtrnatyrandtyrosyltrnasynthetaseroleofdifferentdomainsofthesynthetaseininteractionwithtrna AT negrucʹkiibs investigationofnoncanonicalcomplexesofeukaryoticelongationfactor1awithtrnatyrandtyrosyltrnasynthetaseroleofdifferentdomainsofthesynthetaseininteractionwithtrna |
| first_indexed |
2025-12-01T10:51:08Z |
| last_indexed |
2025-12-01T10:51:08Z |
| _version_ |
1850859995935014913 |