S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу

За допомогою атомно-силової мікроскопії візуалізовано суперспіральну ДНК pGEMEX довжиною 3993 пари нуклеотидів, іммобілізовану на різних субстратах (свіжосколотій слюді, стандартній амінослюді і модифікованій амінослюді – з підвищеною та зниженою поверхневою щільністю аміногруп у порівнянні зі станд...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Біополімери і клітина
Date:2005
Main Authors: Лиманська, О.Ю., Лиманська, Л.О., Лиманський, О.П.
Format: Article
Language:Ukrainian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2005
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155875
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу / О.Ю. Лиманська, Л.О. Лиманська, О.П. Лиманський // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 6. — С. 515-524. — Бібліогр.: 29 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155875
record_format dspace
spelling Лиманська, О.Ю.
Лиманська, Л.О.
Лиманський, О.П.
2019-06-17T14:47:06Z
2019-06-17T14:47:06Z
2005
S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу / О.Ю. Лиманська, Л.О. Лиманська, О.П. Лиманський // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 6. — С. 515-524. — Бібліогр.: 29 назв. — укр.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00070F
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155875
577.2:577.32
За допомогою атомно-силової мікроскопії візуалізовано суперспіральну ДНК pGEMEX довжиною 3993 пари нуклеотидів, іммобілізовану на різних субстратах (свіжосколотій слюді, стандартній амінослюді і модифікованій амінослюді – з підвищеною та зниженою поверхневою щільністю аміногруп у порівнянні зі стандартною). На модифікованій амінослюді з підвищеною щільністю заряду візуалізовано молекули ДНК з надзвичайно високим рівнем суперспіралізації. Вимірювання контурної довжини поодиноких надсуперспіральних молекул ДНК дозволило визначити відстань між парами нуклеотидів уздовж осі подвійної спіралі, яка варіювала від Н- 1,94 до 2,19 Å для різних молекул. Такі стиснуті подібно до пружини суперспіральні молекули ДНК зі зменшеною міжнуклеотидною відстанню порівняно з відомими формами ДНК віднесено до нової форми ДНК – S-ДНК.
С использованием атомно-силовой микроскопии визуализиро­вана суперспирализованная ДНК pGEMEX длиной 3993 пары нуклеотидов, иммобилизованная на различных субстратах (свежесколотой слюде, стандартной аминослюде и модифици­рованной аминослюде — с повышенной и пониженной поверхно­стной плотностью аминогрупп по сравнению со стандарт­ной). На модифицированной аминослюде, характеризующейся повышенной поверхностной плотностью заряда, визуализиро­ ваны молекулы ДНК с чрезвычайно высоким уровнем суперспирализации. Измерение контурной длины единичных суперспирализованных молекул ДНК позволило определить расстояние между нуклеотидами вдоль оси двойной спирали, варьирующее от Н-1,94 до 2,19 Å для разных молекул Такие сжатые подобно пружине суперспиральные молекулы ДНК с уменьшен­ным межнуклеотидным расстоянием по сравнению с извест­ными формами ДНК были отнесены к новой форме ДНК – S-ДНК.
The supercoiled pGEMEX DNA with length of 3993 nucleotides was immobilized on different substrates (freshly cleaved mica, standard aminomica, modified aminomica with increased and decreased aminogroups surface density comparing with standard aminomica) and studied by the atomic force microscopy. The DNA molecules with extremely high level of supercoiling were visualized on the modified aminomica with increased surface charge density. The rise per nucleotide pair was determined by measurement of a contour length of single oversupercoiled DNA molecules. The rise value per nucleotide pair varied from H=1.94 Å up to H=2.19 Å for different molecules. These spring-like compressed supercoiled DNA molecules with decreased rise in comparison with well known DNA forms were referred to the new DNA form, called S-DNA.
Роботу виконано за часткової підтримки Японського товариства розвитку науки (Токіо). Автори висловлюють щиру подяку д-ру А. Сиволобу (Київський Національний університет імені Тараса Шевченка) за критичні зауваж
uk
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Структура та функції біополімерів
S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу
S-Форма ДНК — сверхсуперспирализованная макромолекула с межнуклеотидным расстоянием ~2 А вдоль оси дуплекса
S-DNA is oversupercoiled macromolecule with ~2 Å rise per nucleotide pair
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу
spellingShingle S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу
Лиманська, О.Ю.
Лиманська, Л.О.
Лиманський, О.П.
Структура та функції біополімерів
title_short S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу
title_full S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу
title_fullStr S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу
title_full_unstemmed S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу
title_sort s-форма днк – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 å уздовж осі дуплексу
author Лиманська, О.Ю.
Лиманська, Л.О.
Лиманський, О.П.
author_facet Лиманська, О.Ю.
Лиманська, Л.О.
Лиманський, О.П.
topic Структура та функції біополімерів
topic_facet Структура та функції біополімерів
publishDate 2005
language Ukrainian
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt S-Форма ДНК — сверхсуперспирализованная макромолекула с межнуклеотидным расстоянием ~2 А вдоль оси дуплекса
S-DNA is oversupercoiled macromolecule with ~2 Å rise per nucleotide pair
description За допомогою атомно-силової мікроскопії візуалізовано суперспіральну ДНК pGEMEX довжиною 3993 пари нуклеотидів, іммобілізовану на різних субстратах (свіжосколотій слюді, стандартній амінослюді і модифікованій амінослюді – з підвищеною та зниженою поверхневою щільністю аміногруп у порівнянні зі стандартною). На модифікованій амінослюді з підвищеною щільністю заряду візуалізовано молекули ДНК з надзвичайно високим рівнем суперспіралізації. Вимірювання контурної довжини поодиноких надсуперспіральних молекул ДНК дозволило визначити відстань між парами нуклеотидів уздовж осі подвійної спіралі, яка варіювала від Н- 1,94 до 2,19 Å для різних молекул. Такі стиснуті подібно до пружини суперспіральні молекули ДНК зі зменшеною міжнуклеотидною відстанню порівняно з відомими формами ДНК віднесено до нової форми ДНК – S-ДНК. С использованием атомно-силовой микроскопии визуализиро­вана суперспирализованная ДНК pGEMEX длиной 3993 пары нуклеотидов, иммобилизованная на различных субстратах (свежесколотой слюде, стандартной аминослюде и модифици­рованной аминослюде — с повышенной и пониженной поверхно­стной плотностью аминогрупп по сравнению со стандарт­ной). На модифицированной аминослюде, характеризующейся повышенной поверхностной плотностью заряда, визуализиро­ ваны молекулы ДНК с чрезвычайно высоким уровнем суперспирализации. Измерение контурной длины единичных суперспирализованных молекул ДНК позволило определить расстояние между нуклеотидами вдоль оси двойной спирали, варьирующее от Н-1,94 до 2,19 Å для разных молекул Такие сжатые подобно пружине суперспиральные молекулы ДНК с уменьшен­ным межнуклеотидным расстоянием по сравнению с извест­ными формами ДНК были отнесены к новой форме ДНК – S-ДНК. The supercoiled pGEMEX DNA with length of 3993 nucleotides was immobilized on different substrates (freshly cleaved mica, standard aminomica, modified aminomica with increased and decreased aminogroups surface density comparing with standard aminomica) and studied by the atomic force microscopy. The DNA molecules with extremely high level of supercoiling were visualized on the modified aminomica with increased surface charge density. The rise per nucleotide pair was determined by measurement of a contour length of single oversupercoiled DNA molecules. The rise value per nucleotide pair varied from H=1.94 Å up to H=2.19 Å for different molecules. These spring-like compressed supercoiled DNA molecules with decreased rise in comparison with well known DNA forms were referred to the new DNA form, called S-DNA.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155875
fulltext
citation_txt S-Форма ДНК – надсуперспіральна макромолекула з міжнуклеотидною відстанню ~2 Å уздовж осі дуплексу / О.Ю. Лиманська, Л.О. Лиманська, О.П. Лиманський // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 6. — С. 515-524. — Бібліогр.: 29 назв. — укр.
work_keys_str_mv AT limansʹkaoû sformadnknadsuperspíralʹnamakromolekulazmížnukleotidnoûvídstannû2auzdovžosídupleksu
AT limansʹkalo sformadnknadsuperspíralʹnamakromolekulazmížnukleotidnoûvídstannû2auzdovžosídupleksu
AT limansʹkiiop sformadnknadsuperspíralʹnamakromolekulazmížnukleotidnoûvídstannû2auzdovžosídupleksu
AT limansʹkaoû sformadnksverhsuperspiralizovannaâmakromolekulasmežnukleotidnymrasstoâniem2avdolʹosidupleksa
AT limansʹkalo sformadnksverhsuperspiralizovannaâmakromolekulasmežnukleotidnymrasstoâniem2avdolʹosidupleksa
AT limansʹkiiop sformadnksverhsuperspiralizovannaâmakromolekulasmežnukleotidnymrasstoâniem2avdolʹosidupleksa
AT limansʹkaoû sdnaisoversupercoiledmacromoleculewith2arisepernucleotidepair
AT limansʹkalo sdnaisoversupercoiledmacromoleculewith2arisepernucleotidepair
AT limansʹkiiop sdnaisoversupercoiledmacromoleculewith2arisepernucleotidepair
first_indexed 2025-11-24T12:56:35Z
last_indexed 2025-11-24T12:56:35Z
_version_ 1850846753707786240