Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии
На основе базовой модели гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе разработана обобщенная статистико-термодинамическая модель для интерпретации данных ЯМР-спектроскопии, В предложенной модели, в отличие от базовой, учтены краевые эффекты, пи е. зависимость химического сдвига протоно...
Saved in:
| Published in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Date: | 2001 |
| Main Authors: | , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Russian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2001
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155886 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии / Д.А. Веселков, М.П. Евстигнеев, Д.Б. Дэвис, В.В. Кодинцев, А.Н. Веселков // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 6. — С. 501-511. — Бібліогр.: 17 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-155886 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Веселков, Д.А. Евстигнеев, М.П. Дэвис, Д.Б. Кодинцев, В.В. Веселков, А.Н. 2019-06-17T14:59:50Z 2019-06-17T14:59:50Z 2001 Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии / Д.А. Веселков, М.П. Евстигнеев, Д.Б. Дэвис, В.В. Кодинцев, А.Н. Веселков // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 6. — С. 501-511. — Бібліогр.: 17 назв. — рос. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005D8 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155886 541.49+539.1.12.43 На основе базовой модели гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе разработана обобщенная статистико-термодинамическая модель для интерпретации данных ЯМР-спектроскопии, В предложенной модели, в отличие от базовой, учтены краевые эффекты, пи е. зависимость химического сдвига протонов от положения молекулы в агрегате – внутри, на краях или в гетеростыке. Обе модели апробированы на примере гетероассоциации акридинового красителя профлавина (PF) и фенантридинового красителя бромистого этидия (ЕВ) в водном растворе. Параметры ассоциации молекул рассчитывали по данным 1Н-ЯМР спектроскопии (500 МГц). Исследованы экспериментальные концентрационные и температурные зависимости протонных химических сдвигов взаимодействующих ароматических молекул. Установлено, что рассчитанные параметры по базовой и обобщенной моделям отличаются приблизительно на 30 % и существенно зависят от величины равновесной константы гетероассоциации Кс – при высоких значениях Кс погрешность базовой модели возрастает. Анализ структурных и термодинамических характеристик комплексообразования PF и ЕВ позволяет сделать вывод о преимущественном вкладе дисперсионных взаимодействий в стабилизацию гетерокомплекса PF–EB. On the ground of the basic hetero-association model derived previously, a generalized statistical-thermodynamical model of hetero-association of aromatic molecules has been developed for the NMR data interpretation. In the proposed model, unlike the basic one, the edge effects are taken into consideration, i.e. the dependence of the proton chemical shift on the position of the molecule situated inside, at the edge of the aggregate or in the hetero-stack. Both basic and generalized models were used for the analysis of hetero-association of acridine dye, proflavine (PF), and phenan-thridinium dye, ethidium bromide (EB), in aqueous solution. The calculation of the association parameters of the molecules has been carried out using H-NMR (500 MHz) experimental data. The experimental concentration and temperature dependence s of the proton chemical shifts of interacting aromatic molecules have been studied. The parameters calculated according to the basic and generalized models are found to differ approximately by 30 % and depend substantially on the magnitude of the equilibrium hetero-association constant KC – the larger the KC value the higher the discrepancy between two models. The analysis of the structural and thermodynamical characteristics of the PF-EB complexation indicates the major role of dispersive interactions in stabilization of the PF-EB hetero-comptex. KEY WORDS: statistical-thermodynamical model, proflavine, ethidium bromide, hetero-association, thermodynamics. На основі базової моделі гетероасоціації ароматичних молекул у водному розчині розроблено узагальнену статистико-термодинамічну модель для інтерпретації даних ЯМР-спектроскопії. В розглянутій моделі, на відміну від базової, враховано крайові ефекти, тобто залежність хімічного зсуву протонів від положення молекули в агрегаті – всередині, скраю або в гетеростику. Базова і узагальнена моделі апробовано на прикладі гетероасоціації акридинового барвника профлавіну (PF) и фенантридинового барвника бромистого етидію (ЕВ) у водному розчині. Розрахунок параметрів асоціації молекул здійснено за даними 1Н-ЯМРспектроскопії (500 МГц). Досліджено експериментальні концентраційні і температурні залежності протонних хімічних зсувів взаємодіючих ароматичних молекул. Встановлено, що розраховані параметри за базовою та узагальненою моделями відрізняються приблизно на 30 % і суттєво залежать від величини рівноважної константи гетероасоціації – при великих значеннях Кc похибка базової моделі зростає. Аналіз структурних і термодинамічних характеристик комплексоутворення PF і ЕВ дозволяє зробити висновок щодо переважного внеску дисперсійних взаємодій у стабілізацію гетерокомплексу PF–EB. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Структура та функції біополімерів Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии Узагальнена статистико-термодинамічна модель гетероасоціації ароматичних молекул у водному розчині для аналізу даних 1 Н-ЯМРспектроскопії A generalized statistical-thermodynamical model of hetero-association of aromatic molecules in aqueous solution for the NMR data interpretation Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии |
| spellingShingle |
Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии Веселков, Д.А. Евстигнеев, М.П. Дэвис, Д.Б. Кодинцев, В.В. Веселков, А.Н. Структура та функції біополімерів |
| title_short |
Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии |
| title_full |
Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии |
| title_fullStr |
Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии |
| title_full_unstemmed |
Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии |
| title_sort |
обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ямр-спектроскопии |
| author |
Веселков, Д.А. Евстигнеев, М.П. Дэвис, Д.Б. Кодинцев, В.В. Веселков, А.Н. |
| author_facet |
Веселков, Д.А. Евстигнеев, М.П. Дэвис, Д.Б. Кодинцев, В.В. Веселков, А.Н. |
| topic |
Структура та функції біополімерів |
| topic_facet |
Структура та функції біополімерів |
| publishDate |
2001 |
| language |
Russian |
| container_title |
Біополімери і клітина |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Узагальнена статистико-термодинамічна модель гетероасоціації ароматичних молекул у водному розчині для аналізу даних 1 Н-ЯМРспектроскопії A generalized statistical-thermodynamical model of hetero-association of aromatic molecules in aqueous solution for the NMR data interpretation |
| description |
На основе базовой модели гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе разработана обобщенная статистико-термодинамическая модель для интерпретации данных ЯМР-спектроскопии, В предложенной модели, в отличие от базовой, учтены краевые эффекты, пи е. зависимость химического сдвига протонов от положения молекулы в агрегате – внутри, на краях или в гетеростыке. Обе модели апробированы на примере гетероассоциации акридинового красителя профлавина (PF) и фенантридинового красителя бромистого этидия (ЕВ) в водном растворе. Параметры ассоциации молекул рассчитывали по данным 1Н-ЯМР спектроскопии (500 МГц). Исследованы экспериментальные концентрационные и температурные зависимости протонных химических сдвигов взаимодействующих ароматических молекул. Установлено, что рассчитанные параметры по базовой и обобщенной моделям отличаются приблизительно на 30 % и существенно зависят от величины равновесной константы гетероассоциации Кс – при высоких значениях Кс погрешность базовой модели возрастает. Анализ структурных и термодинамических характеристик комплексообразования PF и ЕВ позволяет сделать вывод о преимущественном вкладе дисперсионных взаимодействий в стабилизацию гетерокомплекса PF–EB.
On the ground of the basic hetero-association model derived previously, a generalized statistical-thermodynamical model of hetero-association of aromatic molecules has been developed for the NMR data interpretation. In the proposed model, unlike the basic one, the edge effects are taken into consideration, i.e. the dependence of the proton chemical shift on the position of the molecule situated inside, at the edge of the aggregate or in the hetero-stack. Both basic and generalized models were used for the analysis of hetero-association of acridine dye, proflavine (PF), and phenan-thridinium dye, ethidium bromide (EB), in aqueous solution. The calculation of the association parameters of the molecules has been carried out using H-NMR (500 MHz) experimental data. The experimental concentration and temperature dependence s of the proton chemical shifts of interacting aromatic molecules have been studied. The parameters calculated according to the basic and generalized models are found to differ approximately by 30 % and depend substantially on the magnitude of the equilibrium hetero-association constant KC – the larger the KC value the higher the discrepancy between two models. The analysis of the structural and thermodynamical characteristics of the PF-EB complexation indicates the major role of dispersive interactions in stabilization of the PF-EB hetero-comptex. KEY WORDS: statistical-thermodynamical model, proflavine, ethidium bromide, hetero-association, thermodynamics.
На основі базової моделі гетероасоціації ароматичних молекул у водному розчині розроблено узагальнену статистико-термодинамічну модель для інтерпретації даних ЯМР-спектроскопії. В розглянутій моделі, на відміну від базової, враховано крайові ефекти, тобто залежність хімічного зсуву протонів від положення молекули в агрегаті – всередині, скраю або в гетеростику. Базова і узагальнена моделі апробовано на прикладі гетероасоціації акридинового барвника профлавіну (PF) и фенантридинового барвника бромистого етидію (ЕВ) у водному розчині. Розрахунок параметрів асоціації молекул здійснено за даними 1Н-ЯМРспектроскопії (500 МГц). Досліджено експериментальні концентраційні і температурні залежності протонних хімічних зсувів взаємодіючих ароматичних молекул. Встановлено, що розраховані параметри за базовою та узагальненою моделями відрізняються приблизно на 30 % і суттєво залежать від величини рівноважної константи гетероасоціації – при великих значеннях Кc похибка базової моделі зростає. Аналіз структурних і термодинамічних характеристик комплексоутворення PF і ЕВ дозволяє зробити висновок щодо переважного внеску дисперсійних взаємодій у стабілізацію гетерокомплексу PF–EB.
|
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/155886 |
| citation_txt |
Обобщенная статистико-термодинамическая модель гетероассоциации ароматических молекул в водном растворе для анализа данных ЯМР-спектроскопии / Д.А. Веселков, М.П. Евстигнеев, Д.Б. Дэвис, В.В. Кодинцев, А.Н. Веселков // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 6. — С. 501-511. — Бібліогр.: 17 назв. — рос. |
| work_keys_str_mv |
AT veselkovda obobŝennaâstatistikotermodinamičeskaâmodelʹgeteroassociaciiaromatičeskihmolekulvvodnomrastvoredlâanalizadannyhâmrspektroskopii AT evstigneevmp obobŝennaâstatistikotermodinamičeskaâmodelʹgeteroassociaciiaromatičeskihmolekulvvodnomrastvoredlâanalizadannyhâmrspektroskopii AT dévisdb obobŝennaâstatistikotermodinamičeskaâmodelʹgeteroassociaciiaromatičeskihmolekulvvodnomrastvoredlâanalizadannyhâmrspektroskopii AT kodincevvv obobŝennaâstatistikotermodinamičeskaâmodelʹgeteroassociaciiaromatičeskihmolekulvvodnomrastvoredlâanalizadannyhâmrspektroskopii AT veselkovan obobŝennaâstatistikotermodinamičeskaâmodelʹgeteroassociaciiaromatičeskihmolekulvvodnomrastvoredlâanalizadannyhâmrspektroskopii AT veselkovda uzagalʹnenastatistikotermodinamíčnamodelʹgeteroasocíacííaromatičnihmolekuluvodnomurozčinídlâanalízudanih1nâmrspektroskopíí AT evstigneevmp uzagalʹnenastatistikotermodinamíčnamodelʹgeteroasocíacííaromatičnihmolekuluvodnomurozčinídlâanalízudanih1nâmrspektroskopíí AT dévisdb uzagalʹnenastatistikotermodinamíčnamodelʹgeteroasocíacííaromatičnihmolekuluvodnomurozčinídlâanalízudanih1nâmrspektroskopíí AT kodincevvv uzagalʹnenastatistikotermodinamíčnamodelʹgeteroasocíacííaromatičnihmolekuluvodnomurozčinídlâanalízudanih1nâmrspektroskopíí AT veselkovan uzagalʹnenastatistikotermodinamíčnamodelʹgeteroasocíacííaromatičnihmolekuluvodnomurozčinídlâanalízudanih1nâmrspektroskopíí AT veselkovda ageneralizedstatisticalthermodynamicalmodelofheteroassociationofaromaticmoleculesinaqueoussolutionforthenmrdatainterpretation AT evstigneevmp ageneralizedstatisticalthermodynamicalmodelofheteroassociationofaromaticmoleculesinaqueoussolutionforthenmrdatainterpretation AT dévisdb ageneralizedstatisticalthermodynamicalmodelofheteroassociationofaromaticmoleculesinaqueoussolutionforthenmrdatainterpretation AT kodincevvv ageneralizedstatisticalthermodynamicalmodelofheteroassociationofaromaticmoleculesinaqueoussolutionforthenmrdatainterpretation AT veselkovan ageneralizedstatisticalthermodynamicalmodelofheteroassociationofaromaticmoleculesinaqueoussolutionforthenmrdatainterpretation |
| first_indexed |
2025-12-01T18:23:08Z |
| last_indexed |
2025-12-01T18:23:08Z |
| _version_ |
1850860790772400128 |