Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum

Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum

Для проверки наличия модифицированных оснований в ДНК цианофага LPP-3 и цианобактерии P. boryanum использовали метод HPLC с помощью установки «System GOLD». Анализ профиля элюции гидролизатов позволил идентифицировать, кроме канонических оснований присутствие в ДНК P. boryanum 5-метилцитозина в конц...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1993
Hauptverfasser: Менджул, М.И., Сырчин, С.А., Аверкиев, А.А., Ребентиш, Б.А.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1993
Schlagworte:
Структура и функции биополимеров
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156250
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum / М.И. Менджул, С.А. Сырчин, А.А. Аверкиев, Б.А. Ребентиш // Биополимеры и клетка. — 1993. — Т. 9, № 5. — С. 54-61. — Бібліогр.: 26 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156250
record_format dspace
spelling Менджул, М.И.
Сырчин, С.А.
Аверкиев, А.А.
Ребентиш, Б.А.
2019-06-18T10:22:42Z
2019-06-18T10:22:42Z
1993
Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum / М.И. Менджул, С.А. Сырчин, А.А. Аверкиев, Б.А. Ребентиш // Биополимеры и клетка. — 1993. — Т. 9, № 5. — С. 54-61. — Бібліогр.: 26 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000372
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156250
578.2.81 1:577.113
Для проверки наличия модифицированных оснований в ДНК цианофага LPP-3 и цианобактерии P. boryanum использовали метод HPLC с помощью установки «System GOLD». Анализ профиля элюции гидролизатов позволил идентифицировать, кроме канонических оснований присутствие в ДНК P. boryanum 5-метилцитозина в концентрации 1,2 % и N-6-метиладенина — 4 5 %. ДНК LPP-3 содержит 0,8% 5-метилцитозина и не включает N-6-метиладенина. 5-Метилцитозин удалось обнаружить только модифицированным методом гидролиза, ДНК фтористоводородной кислотой. Для выявления сайтспецифического метилирования ДНК цианофага LPP-3 и ДНК P. boryanum подвергали ферментативному гидролизу рестриктазами-изошизомерами, по-разному реагирующими на метилирование остатков цитозина и аденина в сайтах узнавания. Установлено метилирование по аденину в GАТС-последовательностях ДНК P. boryanum и по второму иитозину CC(AIT )G G-последовательностей как в ДНК P. boryanum, так и в ДНК LPP-3. Делается вывод о наличии у P. boryanum систем рестрикции – модификации dam- и dcmІ -подобного типа. Защита вирусного генома от систем рестрикции-модификации хозяина осуществляется метилированием последовательности CmC(A/T)GG и контрселекцией по сайту BamHI. По данным, рестрикционного анализа, контр се лекции, очевидно, подвержена и последовательность GG(CIG)CC.
Для перевірки наявності модифікованих основ у ДНК ціанофага LPP-3 і ціанобактерії P. boryanum використано метод HPLC за допомогою установки "System GOLD". Аналіз профілю елюції гідролізатів дозволив ідентифікувати, окрім канонічних основ, присутність у ДНК P. boryanum 5-мєтилцитозипу в концентрації 1,2% та N-6-метиладеніну – 4,5 %. ДНК LPP-3 містить 0,8% 5-метилцитозину і не включає N-6-метиладеніну. 5-Метилцитозии вдалося виявити лише модифікованим методом гідролізу ДНК фтористоводневою кислотою. Для виявлення сайтспсцифічпого метилювання ДНК ціанофага LPP-3 і ДНК P. boryanum піддавали ферментативному гідролізу рестриктазами-ізошизомерами, по-різному реагуючими на метилювання залишків цитозину і аденіну в сайтах пізнавання. Встановленно метилювання по аденіну в GATC-послідовностях ДНК P. boryanum та по другому цитозину GC (А/Т) GG-послідовностей як у ДНК P. boryanum, так і в ДНК LPP-3. Зроблено висновок про наявність у P. boryanum систем рестрикції – модифікації dam- і dcml-подібного типу. Захист вірусного генома від систем рестрикції – модифікації хазяїна здійснюється метилюванпям послідовності CmC (А/Т) GG і контрселекцією за сайтом BamHI. Коптрселекції, скоріш за все, піддається і послідовність GG(C/G)CC, що підтверджується даними рестрикційного аналізу.
HPLC method was used to study some peculiarities of cyanobacterium Plecloneina boryanum and cyanophage LPP-3 DNA composition. The elution profile analysis of the products of DNA acid hydrolysis enable to identify in DNA P. boryanum apart of canonical bases the presence of 4.5 % N-6-melhyladenine and 1.2 % 5-methyl-cytosine, DNA LPP-3 have 0,8 % 5-methyIcytosine and no N-6-methyladenine. The presence of 5-methylcytosine was detected only due to the application of the modified hydrolysis method HF. The restriction endonucleases-isoshisomers, DNA hydrolysis of which depend on presence of methylated bases in the recognition sites, were used to detect site-specific methylation. The comparison of the products of the DNA LPP-3 and P. boryanum fermentative hydrolysis by Mspl and Hpall; Sau3A, Mbol and Dpnl; Apyl and Mval restrictases enable to determined that DNA LPP-3 and P. boryanum has a high methylation degree of the inner cytosine in the CC(A/T)GG site and P. boryanum on the adenine in the GATC site; CCGG site wasn't methylated in both DNA. Proceeding from the data obtained a conclusion can be drown on the presence of dam- and dcml-like restriction–modification systems in P. boryanum. Defence of viral DNA against host R-M systems occur by cytosine methylation in sequence CmC(A/T)GG and counter-selection BamHI sites.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Структура и функции биополимеров
Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum
Способи захисту ДНК ціанофага LPP-3 від систем рестрикції - модифікації ціанобактерії Plectonema boryanum
The way of defence of cyanophage LPP-3 DNA against restriction-modification systems in the cells cyanobacterium Plectonema boryanum
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum
spellingShingle Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum
Менджул, М.И.
Сырчин, С.А.
Аверкиев, А.А.
Ребентиш, Б.А.
Структура и функции биополимеров
title_short Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum
title_full Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum
title_fullStr Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum
title_full_unstemmed Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum
title_sort способы защиты днк цианофага lpp-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии plectonema boryanum
author Менджул, М.И.
Сырчин, С.А.
Аверкиев, А.А.
Ребентиш, Б.А.
author_facet Менджул, М.И.
Сырчин, С.А.
Аверкиев, А.А.
Ребентиш, Б.А.
topic Структура и функции биополимеров
topic_facet Структура и функции биополимеров
publishDate 1993
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Способи захисту ДНК ціанофага LPP-3 від систем рестрикції - модифікації ціанобактерії Plectonema boryanum
The way of defence of cyanophage LPP-3 DNA against restriction-modification systems in the cells cyanobacterium Plectonema boryanum
description Для проверки наличия модифицированных оснований в ДНК цианофага LPP-3 и цианобактерии P. boryanum использовали метод HPLC с помощью установки «System GOLD». Анализ профиля элюции гидролизатов позволил идентифицировать, кроме канонических оснований присутствие в ДНК P. boryanum 5-метилцитозина в концентрации 1,2 % и N-6-метиладенина — 4 5 %. ДНК LPP-3 содержит 0,8% 5-метилцитозина и не включает N-6-метиладенина. 5-Метилцитозин удалось обнаружить только модифицированным методом гидролиза, ДНК фтористоводородной кислотой. Для выявления сайтспецифического метилирования ДНК цианофага LPP-3 и ДНК P. boryanum подвергали ферментативному гидролизу рестриктазами-изошизомерами, по-разному реагирующими на метилирование остатков цитозина и аденина в сайтах узнавания. Установлено метилирование по аденину в GАТС-последовательностях ДНК P. boryanum и по второму иитозину CC(AIT )G G-последовательностей как в ДНК P. boryanum, так и в ДНК LPP-3. Делается вывод о наличии у P. boryanum систем рестрикции – модификации dam- и dcmІ -подобного типа. Защита вирусного генома от систем рестрикции-модификации хозяина осуществляется метилированием последовательности CmC(A/T)GG и контрселекцией по сайту BamHI. По данным, рестрикционного анализа, контр се лекции, очевидно, подвержена и последовательность GG(CIG)CC. Для перевірки наявності модифікованих основ у ДНК ціанофага LPP-3 і ціанобактерії P. boryanum використано метод HPLC за допомогою установки "System GOLD". Аналіз профілю елюції гідролізатів дозволив ідентифікувати, окрім канонічних основ, присутність у ДНК P. boryanum 5-мєтилцитозипу в концентрації 1,2% та N-6-метиладеніну – 4,5 %. ДНК LPP-3 містить 0,8% 5-метилцитозину і не включає N-6-метиладеніну. 5-Метилцитозии вдалося виявити лише модифікованим методом гідролізу ДНК фтористоводневою кислотою. Для виявлення сайтспсцифічпого метилювання ДНК ціанофага LPP-3 і ДНК P. boryanum піддавали ферментативному гідролізу рестриктазами-ізошизомерами, по-різному реагуючими на метилювання залишків цитозину і аденіну в сайтах пізнавання. Встановленно метилювання по аденіну в GATC-послідовностях ДНК P. boryanum та по другому цитозину GC (А/Т) GG-послідовностей як у ДНК P. boryanum, так і в ДНК LPP-3. Зроблено висновок про наявність у P. boryanum систем рестрикції – модифікації dam- і dcml-подібного типу. Захист вірусного генома від систем рестрикції – модифікації хазяїна здійснюється метилюванпям послідовності CmC (А/Т) GG і контрселекцією за сайтом BamHI. Коптрселекції, скоріш за все, піддається і послідовність GG(C/G)CC, що підтверджується даними рестрикційного аналізу. HPLC method was used to study some peculiarities of cyanobacterium Plecloneina boryanum and cyanophage LPP-3 DNA composition. The elution profile analysis of the products of DNA acid hydrolysis enable to identify in DNA P. boryanum apart of canonical bases the presence of 4.5 % N-6-melhyladenine and 1.2 % 5-methyl-cytosine, DNA LPP-3 have 0,8 % 5-methyIcytosine and no N-6-methyladenine. The presence of 5-methylcytosine was detected only due to the application of the modified hydrolysis method HF. The restriction endonucleases-isoshisomers, DNA hydrolysis of which depend on presence of methylated bases in the recognition sites, were used to detect site-specific methylation. The comparison of the products of the DNA LPP-3 and P. boryanum fermentative hydrolysis by Mspl and Hpall; Sau3A, Mbol and Dpnl; Apyl and Mval restrictases enable to determined that DNA LPP-3 and P. boryanum has a high methylation degree of the inner cytosine in the CC(A/T)GG site and P. boryanum on the adenine in the GATC site; CCGG site wasn't methylated in both DNA. Proceeding from the data obtained a conclusion can be drown on the presence of dam- and dcml-like restriction–modification systems in P. boryanum. Defence of viral DNA against host R-M systems occur by cytosine methylation in sequence CmC(A/T)GG and counter-selection BamHI sites.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156250
citation_txt Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum / М.И. Менджул, С.А. Сырчин, А.А. Аверкиев, Б.А. Ребентиш // Биополимеры и клетка. — 1993. — Т. 9, № 5. — С. 54-61. — Бібліогр.: 26 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT mendžulmi sposobyzaŝitydnkcianofagalpp3otsistemrestrikciimodifikaciicianobakteriiplectonemaboryanum
AT syrčinsa sposobyzaŝitydnkcianofagalpp3otsistemrestrikciimodifikaciicianobakteriiplectonemaboryanum
AT averkievaa sposobyzaŝitydnkcianofagalpp3otsistemrestrikciimodifikaciicianobakteriiplectonemaboryanum
AT rebentišba sposobyzaŝitydnkcianofagalpp3otsistemrestrikciimodifikaciicianobakteriiplectonemaboryanum
AT mendžulmi sposobizahistudnkcíanofagalpp3vídsistemrestrikcíímodifíkacíícíanobakterííplectonemaboryanum
AT syrčinsa sposobizahistudnkcíanofagalpp3vídsistemrestrikcíímodifíkacíícíanobakterííplectonemaboryanum
AT averkievaa sposobizahistudnkcíanofagalpp3vídsistemrestrikcíímodifíkacíícíanobakterííplectonemaboryanum
AT rebentišba sposobizahistudnkcíanofagalpp3vídsistemrestrikcíímodifíkacíícíanobakterííplectonemaboryanum
AT mendžulmi thewayofdefenceofcyanophagelpp3dnaagainstrestrictionmodificationsystemsinthecellscyanobacteriumplectonemaboryanum
AT syrčinsa thewayofdefenceofcyanophagelpp3dnaagainstrestrictionmodificationsystemsinthecellscyanobacteriumplectonemaboryanum
AT averkievaa thewayofdefenceofcyanophagelpp3dnaagainstrestrictionmodificationsystemsinthecellscyanobacteriumplectonemaboryanum
AT rebentišba thewayofdefenceofcyanophagelpp3dnaagainstrestrictionmodificationsystemsinthecellscyanobacteriumplectonemaboryanum
first_indexed 2025-11-30T14:49:57Z
last_indexed 2025-11-30T14:49:57Z
_version_ 1850857975406657536

Ähnliche Einträge