Предсказание вторичной структуры белков модифицированным GUHA- методом

• Published in: Биополимеры и клетка
• Date: 1993
• Main Authors: Братусь, А.В., Мальченко, С.З., Чащин, Н.А.
• Format: Article
• Language: Russian
• Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1993
• Subjects: Структура и функции биополимеров
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156251
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Предсказание вторичной структуры белков модифицированным GUHA- методом / А.В. Братусь, С.З. Мальченко, Н.А. Чащин // Биополимеры и клетка. — 1993. — Т. 9, № 5. — С. 61-66. — Бібліогр.: 3 назв. — рос.

В работе предложен новый метод предсказания вторичной структуры белка, основанный на известном в области экспертных систем GUHA-методе. Облучение и предсказание базируются на информации о вторичной структуре 108 белков (около 20 000 аминокислотных остатков) с рентгеноструктурным разрешением менее 0,2 нм. Средняя точность предсказания по использованному в работе банку данных составила для α-спирали – 74 %, β-складки – 67 %, нерегулярной структуры — 71 % и общая – 68 % У роботі запропоновано новий метод передбачення вторинної структури білка, що базується на відомому в галузі експертних систем GUHA-методі. Навчання та передбачення грунтуються на інформації про вторинну структуру 108 білків (біля 20000 амінокислотних залишків) з рентгенострухтурним розділенням менше 0,2 нм. Середня точність передбачення з використаного в роботі банку даних складає для α-спіралі - 74 %, β-складки – 67 %, нерегулярної структури – 71 %; загальна – 68% A new method for protein secondary structure prediction is described in the present article. This method based on GUHA-method has been known in the field X-ray resolution less than 0,2 nm was used for learning and prediction of protein secondary structure. Average accuracy of prediction for α-helix is 74 %, β- strand is 67 %, coil is 71 % and for three states simultaneously is 68 % of successful prediction.