Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання
Вперше візуалізовано хрестоподібну структуру суперспіральної ДНК плазміди pUC8, іммобілізованої на аміномодифікованій слюді у буферному розчині, після висушування зразка методом атомно-силової мікроскопії (АСМ). На основі АСМ зображенння ДНК, отриманого у повітрі, встановлено, що хрест утворюють ін...
Saved in:
| Published in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Date: | 2002 |
| Main Author: | |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2002
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156302 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання / О.П. Лиманський // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 5. — С. 401-405. — Бібліогр.: 21 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156302 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Лиманський, О.П. 2019-06-18T11:15:53Z 2019-06-18T11:15:53Z 2002 Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання / О.П. Лиманський // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 5. — С. 401-405. — Бібліогр.: 21 назв. — укр. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.00061D https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156302 577.213/217:57.086.2 Вперше візуалізовано хрестоподібну структуру суперспіральної ДНК плазміди pUC8, іммобілізованої на аміномодифікованій слюді у буферному розчині, після висушування зразка методом атомно-силової мікроскопії (АСМ). На основі АСМ зображенння ДНК, отриманого у повітрі, встановлено, що хрест утворюють інвертовані повтори довжиною 15 нуклеотидів. Шляхом комп'ютерного моделювання доведено, що хрестоподібну структуру утворено шпильками довжиною 11 нуклеотидів та петлями розміром 4 нуклеотидш Визначено вільну енергію шпильки (-17,8 ккал/моль). Впервые визуализирована крестообразная структура в суперспиральной ДНК плазмиды pUC8, иммобилизованной на амино-модифщированной слюде в буферном растворе, после высушивания образца, методом атомно-силовой микроскопии (АСМ). На основании АСМ изображения ДНК, полученного в воздухе, установлено, что крест образуют инвертированные повторы длиной 15 нуклеотидов. С использованием компьютерного моделирования доказано, что крестообразная структура образована шпильками длиной 11 нуклеотидов и петлями размером 4 нуклеотида. Определена свободная энергия шпильки (-17,8 ккал/моль). The cruciform structure in supercoiled pUCS plasmid DNA immobilized on aminomodified mica in buffer solution after sample drying was imaged by atomic force microscopy (APM). The cruciform structure was formed by 15 nucleotides inverted repeats as shown from AFM images of DNA. The computer modelling has revealed the cruciform structure to be formed by 11 nucleotides hairpins and 4 bases loops. Free energy of the hairpin was determined to be -17.8 kcal/mol. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Структура та функції біополімерів Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання Изучение крестообразной структуры суперспиральной ДНК плазмиды pUC8 с помощью атомно-силовой микроскопии и компьютерного моделирования Study of cruciform structure in supercoiled pUC8 plasmid DNA by atomic force microscopy and computer modelling Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання |
| spellingShingle |
Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання Лиманський, О.П. Структура та функції біополімерів |
| title_short |
Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання |
| title_full |
Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання |
| title_fullStr |
Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання |
| title_full_unstemmed |
Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання |
| title_sort |
вивчення хрестоподібної структури суперспіральної днк плазміди puc8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання |
| author |
Лиманський, О.П. |
| author_facet |
Лиманський, О.П. |
| topic |
Структура та функції біополімерів |
| topic_facet |
Структура та функції біополімерів |
| publishDate |
2002 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Біополімери і клітина |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Изучение крестообразной структуры суперспиральной ДНК плазмиды pUC8 с помощью атомно-силовой микроскопии и компьютерного моделирования Study of cruciform structure in supercoiled pUC8 plasmid DNA by atomic force microscopy and computer modelling |
| description |
Вперше візуалізовано хрестоподібну структуру суперспіральної ДНК плазміди pUC8, іммобілізованої на аміномодифікованій слюді у буферному розчині, після висушування зразка методом атомно-силової мікроскопії (АСМ). На основі АСМ зображенння ДНК, отриманого у повітрі, встановлено, що хрест утворюють інвертовані повтори довжиною 15 нуклеотидів. Шляхом комп'ютерного моделювання доведено, що хрестоподібну структуру утворено шпильками довжиною 11 нуклеотидів та петлями розміром 4 нуклеотидш Визначено вільну енергію шпильки (-17,8 ккал/моль).
Впервые визуализирована крестообразная структура в суперспиральной ДНК плазмиды pUC8, иммобилизованной на амино-модифщированной слюде в буферном растворе, после высушивания образца, методом атомно-силовой микроскопии (АСМ). На основании АСМ изображения ДНК, полученного в воздухе, установлено, что крест образуют инвертированные повторы длиной 15 нуклеотидов. С использованием компьютерного моделирования доказано, что крестообразная структура образована шпильками длиной 11 нуклеотидов и петлями размером 4 нуклеотида. Определена свободная энергия шпильки (-17,8 ккал/моль).
The cruciform structure in supercoiled pUCS plasmid DNA immobilized on aminomodified mica in buffer solution after sample drying was imaged by atomic force microscopy (APM). The cruciform structure was formed by 15 nucleotides inverted repeats as shown from AFM images of DNA. The computer modelling has revealed the cruciform structure to be formed by 11 nucleotides hairpins and 4 bases loops. Free energy of the hairpin was determined to be -17.8 kcal/mol.
|
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156302 |
| citation_txt |
Вивчення хрестоподібної структури суперспіральної ДНК плазміди pUC8 за допомогою атомно-силової мікроскопії та комп'ютерного моделювання / О.П. Лиманський // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 5. — С. 401-405. — Бібліогр.: 21 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT limansʹkiiop vivčennâhrestopodíbnoístrukturisuperspíralʹnoídnkplazmídipuc8zadopomogoûatomnosilovoímíkroskopíítakompûternogomodelûvannâ AT limansʹkiiop izučeniekrestoobraznoistrukturysuperspiralʹnoidnkplazmidypuc8spomoŝʹûatomnosilovoimikroskopiiikompʹûternogomodelirovaniâ AT limansʹkiiop studyofcruciformstructureinsupercoiledpuc8plasmiddnabyatomicforcemicroscopyandcomputermodelling |
| first_indexed |
2025-12-07T16:13:53Z |
| last_indexed |
2025-12-07T16:13:53Z |
| _version_ |
1850866698365698048 |