Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии
Методом одномерной и двухмерной (2M-TOCSY и 2M-NOESY) гомоядерной ПМР-спектроскопии и гетероядерной 2М-¹H- ³¹Р-ЯМР-спектроскопии (500 МГц) исследовано комплексообразование антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водно-солевом растворе. По измеренным концентрационным и...
Saved in:
| Published in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Date: | 1999 |
| Main Authors: | , , , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Russian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1999
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156341 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, С.Ф. Барановский, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, П.А. Болотин, Л.Н. Дымант, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1999. — Т. 15, № 2. — С. 154-162. — Бібліогр.: 34 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862578857428647936 |
|---|---|
| author | Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Барановский, С.Ф. Осетров, С.Г. Пахомов, В.И. Болотин, П.А. Дымант, Л.Н. Дэвис, Д.Б. |
| author_facet | Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Барановский, С.Ф. Осетров, С.Г. Пахомов, В.И. Болотин, П.А. Дымант, Л.Н. Дэвис, Д.Б. |
| citation_txt | Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, С.Ф. Барановский, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, П.А. Болотин, Л.Н. Дымант, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1999. — Т. 15, № 2. — С. 154-162. — Бібліогр.: 34 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Методом одномерной и двухмерной (2M-TOCSY и 2M-NOESY) гомоядерной ПМР-спектроскопии и гетероядерной 2М-¹H- ³¹Р-ЯМР-спектроскопии (500 МГц) исследовано комплексообразование антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водно-солевом растворе. По измеренным концентрационным и температурным зависимостям протонных химических сдвигов молекул рассчитаны равновесные константы реакций, относительное содержание различных типов комплексов в зависимости от концентраций и температуры и термодинамические параметры ΔH и ΔS комплексообразования молекул. Анализ полученных результатов позволяет сделать вывод о том, что местами преимущественной посадки дауномицина являются триплеттне нуклеотидные последовательности. Связывание второй молекулы дауномицина. как с одоцепочечной, так и с дуплексной формой тетрамера носит выраженный антикооперативный характер. Построена наиболее вероятная пространственная структура комплекса 1:2 антибиотика с дезокситетрануклеотидом по расчетным значениям предельных значений химических сдвигов протонов дауномицина в составе комплекса и данным 2M-NOE.
Методом одновимірної і двовимірної (2M-TOCSY і 2M-NOESУ) гомоядерної ПМР-спектроскопіі та гетероядерної 2М- ¹Н- ³¹ Р-ЯМР-спектроскопії (500 МГц) досліджено комплексоутво рення антибіотика дауноміцина з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водно-сольовому розчині. За виміряними концентраційними і температурними залежностями протонних хімічних зсувів молекул розраховано рівноважні константи реакцій, відносний вміст різних типів комплексів у залежності від концентрацій і температури та термодинамічні параметри ΔH і ΔS комплексоутворення молекул. Аналіз отриманих результатів дозволяє зробити висновок стосовно того, що місцями переважної посадки дауноміцина с триплетні нуклеотидні послідовності. Зв'язування другої молекули дауноміцина як з одноланцюговою, так і з дуплексною формою тетрамера має виражений антикооперативний характер. Побудовано найвірогіднішу просторову структуру комплексу 1:2 антибіотика з дезокситетрануклеотидом за розрахунковими значеннями граничних значень хімічних зсувів протонів дауноміцина у складі комплексу і даними 2M-NOE.
One-dimentional and two-dimentional (2D-TOCSY and 2D-NCJESY) homonuclear H NMR spectroscopy and heteronuclear 2D- ¹H-³¹P-NMR spectroscopy have been used to investigate the comple-xation of the antibiotic daunomycin with deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous salt solution. The equilibrium reaction constants, relative content of different types of complexes as a function of concentration and temperature of solution and thermo-dynamical parameters ΔH and ΔS of complexation of the molecules have been calculated using experimental concentrational and temperature dependences of the proton chemical shifts of the interacting molecules. Analysis of the results has shown that the most favourable binding sites for daunomycin are triplet nucleotidc sequences. Binding of the second daunomycin molecule with both single-stranded and duplex forms of the tetranucleotide is highly anticooperative. The most favourable structure of 1:2 antibiotic-deoxy-tetranudeotide complex has been constructed using the calculated limiting proton chemical shifts of daunomycin protons in the' intercalated complex and 2D-NOE data.
|
| first_indexed | 2025-11-26T17:54:08Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156341 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-26T17:54:08Z |
| publishDate | 1999 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Барановский, С.Ф. Осетров, С.Г. Пахомов, В.И. Болотин, П.А. Дымант, Л.Н. Дэвис, Д.Б. 2019-06-18T11:45:53Z 2019-06-18T11:45:53Z 1999 Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, С.Ф. Барановский, С.Г. Осетров, В.И. Пахомов, П.А. Болотин, Л.Н. Дымант, Д.Б. Дэвис // Биополимеры и клетка. — 1999. — Т. 15, № 2. — С. 154-162. — Бібліогр.: 34 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000514 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156341 577.113 Методом одномерной и двухмерной (2M-TOCSY и 2M-NOESY) гомоядерной ПМР-спектроскопии и гетероядерной 2М-¹H- ³¹Р-ЯМР-спектроскопии (500 МГц) исследовано комплексообразование антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водно-солевом растворе. По измеренным концентрационным и температурным зависимостям протонных химических сдвигов молекул рассчитаны равновесные константы реакций, относительное содержание различных типов комплексов в зависимости от концентраций и температуры и термодинамические параметры ΔH и ΔS комплексообразования молекул. Анализ полученных результатов позволяет сделать вывод о том, что местами преимущественной посадки дауномицина являются триплеттне нуклеотидные последовательности. Связывание второй молекулы дауномицина. как с одоцепочечной, так и с дуплексной формой тетрамера носит выраженный антикооперативный характер. Построена наиболее вероятная пространственная структура комплекса 1:2 антибиотика с дезокситетрануклеотидом по расчетным значениям предельных значений химических сдвигов протонов дауномицина в составе комплекса и данным 2M-NOE. Методом одновимірної і двовимірної (2M-TOCSY і 2M-NOESУ) гомоядерної ПМР-спектроскопіі та гетероядерної 2М- ¹Н- ³¹ Р-ЯМР-спектроскопії (500 МГц) досліджено комплексоутво рення антибіотика дауноміцина з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водно-сольовому розчині. За виміряними концентраційними і температурними залежностями протонних хімічних зсувів молекул розраховано рівноважні константи реакцій, відносний вміст різних типів комплексів у залежності від концентрацій і температури та термодинамічні параметри ΔH і ΔS комплексоутворення молекул. Аналіз отриманих результатів дозволяє зробити висновок стосовно того, що місцями переважної посадки дауноміцина с триплетні нуклеотидні послідовності. Зв'язування другої молекули дауноміцина як з одноланцюговою, так і з дуплексною формою тетрамера має виражений антикооперативний характер. Побудовано найвірогіднішу просторову структуру комплексу 1:2 антибіотика з дезокситетрануклеотидом за розрахунковими значеннями граничних значень хімічних зсувів протонів дауноміцина у складі комплексу і даними 2M-NOE. One-dimentional and two-dimentional (2D-TOCSY and 2D-NCJESY) homonuclear H NMR spectroscopy and heteronuclear 2D- ¹H-³¹P-NMR spectroscopy have been used to investigate the comple-xation of the antibiotic daunomycin with deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous salt solution. The equilibrium reaction constants, relative content of different types of complexes as a function of concentration and temperature of solution and thermo-dynamical parameters ΔH and ΔS of complexation of the molecules have been calculated using experimental concentrational and temperature dependences of the proton chemical shifts of the interacting molecules. Analysis of the results has shown that the most favourable binding sites for daunomycin are triplet nucleotidc sequences. Binding of the second daunomycin molecule with both single-stranded and duplex forms of the tetranucleotide is highly anticooperative. The most favourable structure of 1:2 antibiotic-deoxy-tetranudeotide complex has been constructed using the calculated limiting proton chemical shifts of daunomycin protons in the' intercalated complex and 2D-NOE data. Авторы выражают благодарность Объе-диненному исследовательскому центру Лондонско-го университета за предоставленную возможность в Беркбек колледже использовать для измерений ЯМР-спектрометр 500 МГц. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии Аналіз взаємодії антибіотика дауноміцина з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині методом ЯМР-спектроскопії NMR analysis of the interaction of antibiotic daunomycin with deoxytetranucleotide, 5'-d(TpGpCpA), in aqueous solution Article published earlier |
| spellingShingle | Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Барановский, С.Ф. Осетров, С.Г. Пахомов, В.И. Болотин, П.А. Дымант, Л.Н. Дэвис, Д.Б. Структура и функции биополимеров |
| title | Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии |
| title_alt | Аналіз взаємодії антибіотика дауноміцина з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині методом ЯМР-спектроскопії NMR analysis of the interaction of antibiotic daunomycin with deoxytetranucleotide, 5'-d(TpGpCpA), in aqueous solution |
| title_full | Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии |
| title_fullStr | Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии |
| title_full_unstemmed | Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии |
| title_short | Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии |
| title_sort | анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(tpgpcpa) в водном растворе методом ямр-спектроскопии |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156341 |
| work_keys_str_mv | AT veselkovan analizvzaimodeistviâantibiotikadaunomicinasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodomâmrspektroskopii AT itonrdž analizvzaimodeistviâantibiotikadaunomicinasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodomâmrspektroskopii AT baranovskiisf analizvzaimodeistviâantibiotikadaunomicinasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodomâmrspektroskopii AT osetrovsg analizvzaimodeistviâantibiotikadaunomicinasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodomâmrspektroskopii AT pahomovvi analizvzaimodeistviâantibiotikadaunomicinasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodomâmrspektroskopii AT bolotinpa analizvzaimodeistviâantibiotikadaunomicinasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodomâmrspektroskopii AT dymantln analizvzaimodeistviâantibiotikadaunomicinasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodomâmrspektroskopii AT dévisdb analizvzaimodeistviâantibiotikadaunomicinasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvoremetodomâmrspektroskopii AT veselkovan analízvzaêmodííantibíotikadaunomícinazdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodomâmrspektroskopíí AT itonrdž analízvzaêmodííantibíotikadaunomícinazdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodomâmrspektroskopíí AT baranovskiisf analízvzaêmodííantibíotikadaunomícinazdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodomâmrspektroskopíí AT osetrovsg analízvzaêmodííantibíotikadaunomícinazdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodomâmrspektroskopíí AT pahomovvi analízvzaêmodííantibíotikadaunomícinazdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodomâmrspektroskopíí AT bolotinpa analízvzaêmodííantibíotikadaunomícinazdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodomâmrspektroskopíí AT dymantln analízvzaêmodííantibíotikadaunomícinazdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodomâmrspektroskopíí AT dévisdb analízvzaêmodííantibíotikadaunomícinazdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčinímetodomâmrspektroskopíí AT veselkovan nmranalysisoftheinteractionofantibioticdaunomycinwithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT itonrdž nmranalysisoftheinteractionofantibioticdaunomycinwithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT baranovskiisf nmranalysisoftheinteractionofantibioticdaunomycinwithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT osetrovsg nmranalysisoftheinteractionofantibioticdaunomycinwithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT pahomovvi nmranalysisoftheinteractionofantibioticdaunomycinwithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT bolotinpa nmranalysisoftheinteractionofantibioticdaunomycinwithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT dymantln nmranalysisoftheinteractionofantibioticdaunomycinwithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT dévisdb nmranalysisoftheinteractionofantibioticdaunomycinwithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution |